FuNGI

A0A1Y2IRW2

Protein Details

Accession

A0A1Y2IRW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
986-1008	AGTPKRGKRSSQPRWKKEQMTSV	Hydrophilic
1203-1239	ADAEGEGKKPKKKRAKSAPKAKDRKSKEEIEKRLEGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
990-995	KRGKRS
1209-1234	GKKPKKKRAKSAPKAKDRKSKEEIEK

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MHDFLRRRSEYTILPTPVPEDSTDETRLLFTDSTSQDLVAVMEACLHNLHDVPRAKQIFEGLRQSGRGDKLIDARLYNHFISAYIEMATSKDSAHRAVWLEDAWALYNDMEQSREHIQPNANTYALMLIAWLRFNPDTPNGVNLGSDAHDPISLLRNIIHRQIAPALVVSDRAFTTDEEATEAIKALSRAAVQMGLSSVVNELGLADSLGRQQDDPLENVPEAVPVVKVKTLPDIEVKRAEDGSVTALEPHAPIKLEGEVPFNLETLRRHLGNVILHRRILAEDVGLRQRLLEQSVYNVAVERMKRQAELFDQLGLPKQGLHSTDLKTWMWHWHVKLESRIEAEIKNLEIEERIIDRLKRKHKDHVQLTPLLNLLKPEKLSLITILEVMHLHGSGGVQDGMKTARALLSVGRAVESEIKAEMAKKHNVPLPTAASVGDGNVFSSVGYRELHDQRVAARKLIEDAEDWTNAEWTQLVRVKVGSFLVDCLMDVATVQRSMKDPRTGEIIYEEQPAFFHSYEYQRGHKLGVIKFNPAVAERMSKDPIAETLHPRHLPMLVKPKPWLSYNNGGYLYNRTWAMRFKESREQELYLRHASDAGRLELVFAGLDVLGSTPWKVNRRVFDVVLEVWNSGKRYPKIPPAVPDEPEPERPPNMEFDNKAKAVYIERQKAWQQAKASNHSDRCSVNYKVEIARAFLGDTIYFPHNVDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLLLFGEAKPLGARGLRWLKIHLANLVGYDKASFDERVQYVHDHLDDIYDSAERPLEGRQWWTKADDPWQCLATCIELRSALESPDPEAYECALPVHQDGTCNGLQHYAALGGDAVGAAQVNLAAAERPSDVYTYVAQMVEQSIQADLERGDKAPHYAKLLAGKISRKVVKQTVMTTVYGVTFIGARDQIERQLKDRGDIPPEECWLAAAYLAKKVLASIGDLFTGAKEIQNWLNLCARLIAKSIPQDRLISAFQAETAGTPKRGKRSSQPRWKKEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRAVKRKQVMTSLQSVFISDPNVPSTVNAAKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRSQGLTFASVHDSYWTHAGSIDQMNAIIRDTFIALHSSDVLSALAQEFRERYANYKVPLSALTGAAFKHLKLNPEQLDISPEDIEALSDESVVRAAEAEEQAEESQALLGDEDDADVELAADAEAADAEGEGKKPKKKRAKSAPKAKDRKSKEEIEKRLEGKFVNLVDVLPPLPEKGKFDVKAIKDSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.42
3	0.4
4	0.37
5	0.33
6	0.26
7	0.22
8	0.23
9	0.27
10	0.29
11	0.27
12	0.26
13	0.25
14	0.25
15	0.22
16	0.18
17	0.14
18	0.2
19	0.2
20	0.24
21	0.23
22	0.23
23	0.2
24	0.2
25	0.2
26	0.13
27	0.12
28	0.08
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.12
33	0.13
34	0.12
35	0.14
36	0.16
37	0.2
38	0.25
39	0.27
40	0.36
41	0.38
42	0.37
43	0.36
44	0.42
45	0.4
46	0.42
47	0.47
48	0.41
49	0.42
50	0.43
51	0.43
52	0.42
53	0.38
54	0.35
55	0.3
56	0.3
57	0.34
58	0.39
59	0.39
60	0.34
61	0.35
62	0.37
63	0.4
64	0.36
65	0.3
66	0.24
67	0.22
68	0.24
69	0.21
70	0.17
71	0.12
72	0.13
73	0.12
74	0.12
75	0.13
76	0.1
77	0.1
78	0.13
79	0.14
80	0.17
81	0.17
82	0.21
83	0.22
84	0.23
85	0.25
86	0.21
87	0.2
88	0.19
89	0.19
90	0.16
91	0.14
92	0.13
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.13
97	0.13
98	0.12
99	0.15
100	0.19
101	0.24
102	0.25
103	0.28
104	0.32
105	0.35
106	0.41
107	0.4
108	0.36
109	0.31
110	0.29
111	0.25
112	0.19
113	0.14
114	0.09
115	0.08
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.12
120	0.13
121	0.14
122	0.18
123	0.2
124	0.23
125	0.24
126	0.27
127	0.24
128	0.24
129	0.23
130	0.19
131	0.16
132	0.13
133	0.13
134	0.11
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.12
139	0.16
140	0.15
141	0.15
142	0.17
143	0.22
144	0.25
145	0.29
146	0.31
147	0.25
148	0.28
149	0.3
150	0.28
151	0.23
152	0.21
153	0.18
154	0.14
155	0.16
156	0.13
157	0.13
158	0.11
159	0.12
160	0.13
161	0.12
162	0.16
163	0.15
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.11
178	0.12
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.07
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.09
199	0.1
200	0.17
201	0.19
202	0.21
203	0.21
204	0.22
205	0.22
206	0.22
207	0.21
208	0.15
209	0.13
210	0.11
211	0.1
212	0.08
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.19
218	0.2
219	0.21
220	0.29
221	0.31
222	0.33
223	0.39
224	0.39
225	0.34
226	0.33
227	0.31
228	0.23
229	0.2
230	0.18
231	0.13
232	0.12
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.12
243	0.15
244	0.15
245	0.18
246	0.17
247	0.18
248	0.19
249	0.17
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.17
254	0.21
255	0.19
256	0.19
257	0.21
258	0.25
259	0.29
260	0.36
261	0.39
262	0.37
263	0.37
264	0.36
265	0.35
266	0.31
267	0.27
268	0.19
269	0.12
270	0.12
271	0.16
272	0.2
273	0.2
274	0.19
275	0.17
276	0.19
277	0.19
278	0.19
279	0.17
280	0.13
281	0.16
282	0.19
283	0.19
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.17
288	0.17
289	0.17
290	0.2
291	0.2
292	0.21
293	0.21
294	0.25
295	0.24
296	0.28
297	0.26
298	0.23
299	0.22
300	0.21
301	0.23
302	0.2
303	0.16
304	0.12
305	0.12
306	0.13
307	0.14
308	0.16
309	0.19
310	0.21
311	0.24
312	0.27
313	0.27
314	0.25
315	0.25
316	0.28
317	0.28
318	0.3
319	0.28
320	0.3
321	0.34
322	0.37
323	0.41
324	0.39
325	0.37
326	0.34
327	0.35
328	0.3
329	0.26
330	0.24
331	0.2
332	0.17
333	0.14
334	0.12
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.09
340	0.11
341	0.13
342	0.16
343	0.23
344	0.32
345	0.41
346	0.48
347	0.51
348	0.6
349	0.67
350	0.75
351	0.76
352	0.76
353	0.72
354	0.7
355	0.66
356	0.57
357	0.49
358	0.39
359	0.31
360	0.24
361	0.2
362	0.16
363	0.15
364	0.14
365	0.14
366	0.14
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.11
371	0.12
372	0.11
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.1
400	0.11
401	0.14
402	0.14
403	0.11
404	0.1
405	0.11
406	0.11
407	0.13
408	0.17
409	0.19
410	0.23
411	0.24
412	0.28
413	0.31
414	0.32
415	0.31
416	0.3
417	0.29
418	0.25
419	0.24
420	0.2
421	0.17
422	0.16
423	0.14
424	0.11
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.14
436	0.17
437	0.19
438	0.19
439	0.19
440	0.22
441	0.31
442	0.31
443	0.26
444	0.24
445	0.22
446	0.24
447	0.24
448	0.21
449	0.12
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.14
454	0.12
455	0.12
456	0.11
457	0.1
458	0.08
459	0.06
460	0.11
461	0.14
462	0.15
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.16
467	0.16
468	0.12
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.1
484	0.14
485	0.19
486	0.24
487	0.24
488	0.24
489	0.3
490	0.29
491	0.27
492	0.26
493	0.23
494	0.19
495	0.22
496	0.2
497	0.14
498	0.14
499	0.15
500	0.14
501	0.12
502	0.12
503	0.11
504	0.14
505	0.2
506	0.23
507	0.24
508	0.23
509	0.24
510	0.24
511	0.23
512	0.27
513	0.24
514	0.3
515	0.28
516	0.29
517	0.28
518	0.28
519	0.27
520	0.21
521	0.19
522	0.12
523	0.14
524	0.14
525	0.16
526	0.17
527	0.17
528	0.16
529	0.15
530	0.16
531	0.16
532	0.17
533	0.19
534	0.22
535	0.27
536	0.27
537	0.27
538	0.25
539	0.25
540	0.24
541	0.24
542	0.31
543	0.29
544	0.31
545	0.32
546	0.34
547	0.34
548	0.34
549	0.33
550	0.28
551	0.33
552	0.33
553	0.36
554	0.34
555	0.32
556	0.31
557	0.3
558	0.25
559	0.18
560	0.16
561	0.13
562	0.13
563	0.18
564	0.22
565	0.25
566	0.27
567	0.3
568	0.38
569	0.4
570	0.43
571	0.42
572	0.39
573	0.34
574	0.35
575	0.34
576	0.27
577	0.25
578	0.2
579	0.19
580	0.17
581	0.19
582	0.17
583	0.14
584	0.12
585	0.12
586	0.12
587	0.1
588	0.1
589	0.06
590	0.04
591	0.04
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.05
600	0.09
601	0.13
602	0.17
603	0.21
604	0.24
605	0.3
606	0.33
607	0.32
608	0.29
609	0.27
610	0.23
611	0.21
612	0.18
613	0.12
614	0.1
615	0.11
616	0.1
617	0.1
618	0.15
619	0.15
620	0.18
621	0.22
622	0.29
623	0.34
624	0.35
625	0.38
626	0.41
627	0.42
628	0.41
629	0.39
630	0.35
631	0.31
632	0.32
633	0.3
634	0.23
635	0.21
636	0.21
637	0.2
638	0.19
639	0.19
640	0.19
641	0.18
642	0.2
643	0.25
644	0.24
645	0.23
646	0.2
647	0.18
648	0.18
649	0.23
650	0.26
651	0.26
652	0.27
653	0.3
654	0.32
655	0.38
656	0.38
657	0.35
658	0.31
659	0.32
660	0.36
661	0.4
662	0.42
663	0.41
664	0.41
665	0.38
666	0.38
667	0.32
668	0.32
669	0.3
670	0.27
671	0.23
672	0.22
673	0.23
674	0.21
675	0.24
676	0.2
677	0.16
678	0.15
679	0.14
680	0.12
681	0.11
682	0.1
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.1
691	0.11
692	0.12
693	0.11
694	0.13
695	0.15
696	0.15
697	0.15
698	0.15
699	0.19
700	0.21
701	0.25
702	0.23
703	0.23
704	0.25
705	0.25
706	0.24
707	0.21
708	0.18
709	0.13
710	0.13
711	0.1
712	0.08
713	0.07
714	0.07
715	0.05
716	0.04
717	0.04
718	0.06
719	0.05
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.08
725	0.09
726	0.07
727	0.08
728	0.13
729	0.19
730	0.22
731	0.22
732	0.24
733	0.27
734	0.3
735	0.31
736	0.25
737	0.2
738	0.17
739	0.18
740	0.17
741	0.13
742	0.09
743	0.08
744	0.07
745	0.07
746	0.08
747	0.08
748	0.08
749	0.13
750	0.13
751	0.14
752	0.16
753	0.16
754	0.16
755	0.17
756	0.17
757	0.12
758	0.11
759	0.11
760	0.1
761	0.09
762	0.08
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.06
769	0.07
770	0.1
771	0.11
772	0.16
773	0.19
774	0.21
775	0.23
776	0.25
777	0.27
778	0.26
779	0.33
780	0.33
781	0.33
782	0.33
783	0.33
784	0.3
785	0.27
786	0.25
787	0.2
788	0.16
789	0.14
790	0.12
791	0.11
792	0.11
793	0.13
794	0.13
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.11
802	0.11
803	0.12
804	0.11
805	0.1
806	0.09
807	0.08
808	0.07
809	0.08
810	0.09
811	0.08
812	0.08
813	0.09
814	0.13
815	0.14
816	0.14
817	0.13
818	0.13
819	0.13
820	0.12
821	0.12
822	0.08
823	0.07
824	0.06
825	0.06
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.03
830	0.02
831	0.03
832	0.02
833	0.02
834	0.02
835	0.02
836	0.02
837	0.03
838	0.03
839	0.03
840	0.04
841	0.05
842	0.06
843	0.07
844	0.07
845	0.08
846	0.09
847	0.1
848	0.1
849	0.11
850	0.1
851	0.09
852	0.09
853	0.1
854	0.09
855	0.09
856	0.07
857	0.06
858	0.06
859	0.07
860	0.07
861	0.06
862	0.08
863	0.09
864	0.09
865	0.1
866	0.1
867	0.14
868	0.17
869	0.19
870	0.2
871	0.2
872	0.22
873	0.27
874	0.28
875	0.28
876	0.28
877	0.29
878	0.29
879	0.35
880	0.37
881	0.33
882	0.37
883	0.38
884	0.39
885	0.4
886	0.39
887	0.39
888	0.38
889	0.36
890	0.31
891	0.26
892	0.21
893	0.17
894	0.15
895	0.08
896	0.06
897	0.06
898	0.07
899	0.07
900	0.08
901	0.1
902	0.11
903	0.18
904	0.24
905	0.25
906	0.26
907	0.33
908	0.33
909	0.32
910	0.36
911	0.33
912	0.3
913	0.32
914	0.32
915	0.27
916	0.29
917	0.27
918	0.23
919	0.19
920	0.15
921	0.13
922	0.11
923	0.12
924	0.11
925	0.13
926	0.13
927	0.13
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.09
932	0.1
933	0.1
934	0.1
935	0.1
936	0.11
937	0.11
938	0.09
939	0.1
940	0.09
941	0.07
942	0.07
943	0.1
944	0.12
945	0.17
946	0.18
947	0.19
948	0.24
949	0.23
950	0.22
951	0.23
952	0.22
953	0.18
954	0.19
955	0.18
956	0.16
957	0.24
958	0.28
959	0.28
960	0.3
961	0.3
962	0.29
963	0.31
964	0.29
965	0.22
966	0.19
967	0.15
968	0.13
969	0.13
970	0.12
971	0.09
972	0.11
973	0.12
974	0.15
975	0.19
976	0.23
977	0.31
978	0.36
979	0.39
980	0.46
981	0.55
982	0.63
983	0.7
984	0.78
985	0.77
986	0.83
987	0.88
988	0.85
989	0.81
990	0.79
991	0.74
992	0.69
993	0.64
994	0.57
995	0.49
996	0.41
997	0.34
998	0.27
999	0.21
1000	0.17
1001	0.13
1002	0.11
1003	0.1
1004	0.17
1005	0.2
1006	0.18
1007	0.18
1008	0.21
1009	0.3
1010	0.38
1011	0.41
1012	0.42
1013	0.47
1014	0.54
1015	0.57
1016	0.61
1017	0.58
1018	0.55
1019	0.6
1020	0.54
1021	0.48
1022	0.4
1023	0.36
1024	0.29
1025	0.24
1026	0.22
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.13
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.16
1034	0.18
1035	0.19
1036	0.21
1037	0.21
1038	0.21
1039	0.22
1040	0.24
1041	0.22
1042	0.25
1043	0.24
1044	0.22
1045	0.24
1046	0.25
1047	0.26
1048	0.24
1049	0.23
1050	0.17
1051	0.18
1052	0.18
1053	0.18
1054	0.16
1055	0.15
1056	0.14
1057	0.12
1058	0.12
1059	0.1
1060	0.12
1061	0.1
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.12
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.14
1068	0.12
1069	0.14
1070	0.13
1071	0.15
1072	0.19
1073	0.17
1074	0.17
1075	0.18
1076	0.17
1077	0.16
1078	0.19
1079	0.17
1080	0.13
1081	0.13
1082	0.14
1083	0.16
1084	0.17
1085	0.17
1086	0.14
1087	0.14
1088	0.15
1089	0.14
1090	0.15
1091	0.11
1092	0.08
1093	0.08
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.1
1098	0.1
1099	0.1
1100	0.11
1101	0.11
1102	0.1
1103	0.1
1104	0.09
1105	0.07
1106	0.08
1107	0.08
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.11
1111	0.11
1112	0.14
1113	0.19
1114	0.19
1115	0.22
1116	0.29
1117	0.35
1118	0.35
1119	0.38
1120	0.37
1121	0.34
1122	0.34
1123	0.33
1124	0.26
1125	0.22
1126	0.2
1127	0.18
1128	0.17
1129	0.2
1130	0.19
1131	0.16
1132	0.22
1133	0.23
1134	0.26
1135	0.3
1136	0.39
1137	0.37
1138	0.41
1139	0.43
1140	0.35
1141	0.37
1142	0.34
1143	0.32
1144	0.23
1145	0.2
1146	0.16
1147	0.15
1148	0.14
1149	0.1
1150	0.11
1151	0.08
1152	0.08
1153	0.08
1154	0.08
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.07
1158	0.06
1159	0.07
1160	0.11
1161	0.11
1162	0.12
1163	0.12
1164	0.14
1165	0.14
1166	0.14
1167	0.13
1168	0.09
1169	0.09
1170	0.09
1171	0.08
1172	0.07
1173	0.07
1174	0.07
1175	0.07
1176	0.07
1177	0.06
1178	0.06
1179	0.06
1180	0.05
1181	0.06
1182	0.05
1183	0.05
1184	0.04
1185	0.04
1186	0.04
1187	0.04
1188	0.04
1189	0.04
1190	0.04
1191	0.03
1192	0.05
1193	0.06
1194	0.08
1195	0.15
1196	0.22
1197	0.3
1198	0.38
1199	0.49
1200	0.59
1201	0.68
1202	0.78
1203	0.82
1204	0.88
1205	0.91
1206	0.94
1207	0.95
1208	0.95
1209	0.95
1210	0.93
1211	0.92
1212	0.89
1213	0.88
1214	0.84
1215	0.84
1216	0.84
1217	0.84
1218	0.83
1219	0.81
1220	0.81
1221	0.74
1222	0.69
1223	0.62
1224	0.52
1225	0.45
1226	0.42
1227	0.35
1228	0.29
1229	0.27
1230	0.24
1231	0.21
1232	0.22
1233	0.19
1234	0.14
1235	0.14
1236	0.13
1237	0.16
1238	0.18
1239	0.21
1240	0.26
1241	0.35
1242	0.35
1243	0.41
1244	0.48
1245	0.48
1246	0.54
1247	0.52
1248	0.49
1249	0.42

A0A1Y2IRW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer