Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2J2C5

Protein Details
Accession A0A1Y2J2C5    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-98DEYVQEKKRAAKPKRRTKARRGGEDEDEEGGGRPQRKRKRASKRAPPEEIDLBasic
116-140EAILKPKRGGRAKRKRKDDDDLDKYBasic
353-374DVDIQRRKQNQERLKSLTRKMHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-92KKRAAKPKRRTKARRGGEDEDEEGGGRPQRKRKRASKRAP
120-132KPKRGGRAKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MPDKDEDLAAAIFGHSDSDLSSDEDDLDLNQRRGDSPAAESSGDSGDEYVQEKKRAAKPKRRTKARRGGEDEDEEGGGRPQRKRKRASKRAPPEEIDLSQYPPEVAKKMELDMKLEAILKPKRGGRAKRKRKDDDDLDKYADEEVSRLREAMLTAAADDDQANREKLPATSKLRLLPQVMEVLRKTSLAQSIIDNNLLEGVCRWLEPLPDHSLPALDIQKEFFPALKKMDFIDTNVLKDSKLGRVVLFYTKCKRVTPDVQRMANDLVSIWSRPIIKRSASYRDRVIPTAQMEGDGGAARGAGERLNAILARARESDKNRVRKNAVMIPQSQLGSYTVAPRANAGLAKNNVAVDVDIQRRKQNQERLKSLTRKMHGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.08
6 0.09
7 0.11
8 0.12
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.17
15 0.21
16 0.21
17 0.22
18 0.22
19 0.23
20 0.26
21 0.28
22 0.23
23 0.22
24 0.26
25 0.27
26 0.26
27 0.25
28 0.24
29 0.22
30 0.2
31 0.16
32 0.11
33 0.09
34 0.11
35 0.13
36 0.18
37 0.21
38 0.24
39 0.26
40 0.34
41 0.42
42 0.51
43 0.59
44 0.63
45 0.7
46 0.78
47 0.87
48 0.9
49 0.92
50 0.92
51 0.93
52 0.92
53 0.92
54 0.88
55 0.84
56 0.79
57 0.73
58 0.64
59 0.54
60 0.44
61 0.34
62 0.26
63 0.22
64 0.19
65 0.2
66 0.24
67 0.33
68 0.43
69 0.51
70 0.61
71 0.69
72 0.77
73 0.83
74 0.88
75 0.89
76 0.91
77 0.92
78 0.88
79 0.81
80 0.75
81 0.69
82 0.59
83 0.53
84 0.42
85 0.35
86 0.28
87 0.25
88 0.2
89 0.16
90 0.17
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.22
97 0.21
98 0.22
99 0.21
100 0.21
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.2
105 0.23
106 0.22
107 0.25
108 0.27
109 0.34
110 0.42
111 0.51
112 0.55
113 0.64
114 0.73
115 0.78
116 0.86
117 0.86
118 0.85
119 0.84
120 0.83
121 0.82
122 0.77
123 0.72
124 0.63
125 0.54
126 0.47
127 0.38
128 0.28
129 0.18
130 0.11
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.14
155 0.2
156 0.25
157 0.28
158 0.3
159 0.32
160 0.34
161 0.35
162 0.32
163 0.25
164 0.21
165 0.23
166 0.21
167 0.2
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.11
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.06
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.08
193 0.09
194 0.12
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.18
202 0.16
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.24
220 0.21
221 0.22
222 0.23
223 0.22
224 0.18
225 0.2
226 0.2
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.15
231 0.17
232 0.19
233 0.24
234 0.25
235 0.26
236 0.3
237 0.34
238 0.36
239 0.36
240 0.38
241 0.39
242 0.46
243 0.51
244 0.56
245 0.59
246 0.6
247 0.59
248 0.58
249 0.52
250 0.42
251 0.32
252 0.21
253 0.15
254 0.13
255 0.12
256 0.1
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.18
261 0.2
262 0.21
263 0.27
264 0.32
265 0.4
266 0.42
267 0.45
268 0.46
269 0.5
270 0.51
271 0.47
272 0.44
273 0.38
274 0.35
275 0.35
276 0.3
277 0.22
278 0.19
279 0.17
280 0.16
281 0.11
282 0.1
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.12
296 0.12
297 0.15
298 0.17
299 0.2
300 0.26
301 0.31
302 0.41
303 0.46
304 0.56
305 0.59
306 0.65
307 0.67
308 0.65
309 0.68
310 0.66
311 0.65
312 0.59
313 0.55
314 0.5
315 0.49
316 0.44
317 0.36
318 0.29
319 0.22
320 0.19
321 0.18
322 0.19
323 0.19
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.21
328 0.21
329 0.23
330 0.2
331 0.24
332 0.25
333 0.28
334 0.28
335 0.27
336 0.24
337 0.22
338 0.21
339 0.15
340 0.2
341 0.26
342 0.3
343 0.32
344 0.39
345 0.44
346 0.52
347 0.59
348 0.62
349 0.64
350 0.69
351 0.75
352 0.76
353 0.81
354 0.81
355 0.81
356 0.8
357 0.77