FuNGI

A0A1Y2IYD5

Protein Details

Accession

A0A1Y2IYD5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
492-522	ETPEEKKARKQAVKAERQARRVEKKATKESF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-116	K
277-281	KRRRK
488-521	RKKGETPEEKKARKQAVKAERQARRVEKKATKES

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSIFRQPGAQHFQVVHRSQRDPLIHDPEASKHVLKPVQRSNLKGKSRADLEQLLSPAELDHDKARPNIGEAALYGIYYDDTEYDYMQHLKPVGLQEEGVDSIWLEAPVKPKGKGKAKDPISLLELPEDTLASKSELPRNYEAQENIPSSIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVEDDLEDDFFGELVKDGERAPDEPLEFEFKEEGLQEGDDGAAGAGDAGEAAEEDESWEARFARFKQAQKSAPRDDASDLDAYSEGGDTIGTLPRLPVIGGKRRRKGASDASGYSMSSSSMWRNEHLTVLDERFDQIQLEYEDSDEEEEPSLDDLDEAPDLIASREDFESMMDEFLEKYEVISGKMRPVLPGTATEKLETIRKALGEAKIRDDAGESDAEDDDILMPLDIDDKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARNNKPVPKIRLDPKTGMPSVEGGQPSKTKTTKRPDSSATDEDEEDSRPVRVTVARKKGETPEEKKARKQAVKAERQARRVEKKATKESFSKEVKRTVQSLADKEKMKVQKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.52
4	0.51
5	0.49
6	0.46
7	0.47
8	0.47
9	0.53
10	0.51
11	0.47
12	0.52
13	0.52
14	0.47
15	0.48
16	0.47
17	0.42
18	0.42
19	0.4
20	0.33
21	0.27
22	0.33
23	0.35
24	0.38
25	0.43
26	0.49
27	0.56
28	0.59
29	0.62
30	0.65
31	0.7
32	0.72
33	0.7
34	0.64
35	0.62
36	0.61
37	0.59
38	0.55
39	0.5
40	0.46
41	0.43
42	0.41
43	0.33
44	0.29
45	0.25
46	0.19
47	0.16
48	0.14
49	0.12
50	0.15
51	0.17
52	0.2
53	0.22
54	0.25
55	0.23
56	0.25
57	0.28
58	0.25
59	0.22
60	0.19
61	0.22
62	0.18
63	0.17
64	0.14
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.05
70	0.07
71	0.08
72	0.08
73	0.09
74	0.12
75	0.15
76	0.15
77	0.17
78	0.16
79	0.16
80	0.19
81	0.22
82	0.21
83	0.18
84	0.18
85	0.16
86	0.17
87	0.18
88	0.15
89	0.11
90	0.08
91	0.08
92	0.09
93	0.09
94	0.08
95	0.1
96	0.13
97	0.2
98	0.23
99	0.25
100	0.3
101	0.39
102	0.48
103	0.52
104	0.55
105	0.58
106	0.6
107	0.64
108	0.6
109	0.54
110	0.49
111	0.45
112	0.39
113	0.31
114	0.26
115	0.2
116	0.18
117	0.15
118	0.11
119	0.09
120	0.1
121	0.09
122	0.12
123	0.15
124	0.21
125	0.25
126	0.29
127	0.32
128	0.35
129	0.35
130	0.37
131	0.34
132	0.31
133	0.33
134	0.3
135	0.27
136	0.24
137	0.22
138	0.17
139	0.18
140	0.15
141	0.11
142	0.1
143	0.09
144	0.1
145	0.11
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.17
151	0.17
152	0.15
153	0.16
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.05
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.08
181	0.09
182	0.1
183	0.11
184	0.13
185	0.13
186	0.14
187	0.15
188	0.18
189	0.17
190	0.17
191	0.15
192	0.12
193	0.13
194	0.12
195	0.12
196	0.07
197	0.07
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.04
203	0.03
204	0.03
205	0.02
206	0.02
207	0.02
208	0.02
209	0.02
210	0.02
211	0.02
212	0.02
213	0.02
214	0.02
215	0.02
216	0.03
217	0.03
218	0.04
219	0.04
220	0.05
221	0.05
222	0.06
223	0.1
224	0.11
225	0.21
226	0.27
227	0.3
228	0.37
229	0.44
230	0.5
231	0.54
232	0.6
233	0.54
234	0.53
235	0.5
236	0.44
237	0.38
238	0.33
239	0.27
240	0.21
241	0.16
242	0.12
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.08
260	0.12
261	0.21
262	0.3
263	0.38
264	0.42
265	0.47
266	0.49
267	0.48
268	0.49
269	0.49
270	0.48
271	0.45
272	0.41
273	0.39
274	0.38
275	0.35
276	0.29
277	0.21
278	0.13
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.15
286	0.16
287	0.16
288	0.16
289	0.16
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.12
294	0.12
295	0.12
296	0.11
297	0.09
298	0.07
299	0.1
300	0.09
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.06
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.09
342	0.09
343	0.11
344	0.14
345	0.14
346	0.16
347	0.21
348	0.21
349	0.18
350	0.19
351	0.19
352	0.17
353	0.21
354	0.22
355	0.23
356	0.23
357	0.23
358	0.22
359	0.21
360	0.25
361	0.2
362	0.18
363	0.15
364	0.15
365	0.16
366	0.2
367	0.24
368	0.28
369	0.29
370	0.31
371	0.32
372	0.32
373	0.3
374	0.27
375	0.22
376	0.16
377	0.15
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.08
391	0.08
392	0.11
393	0.14
394	0.15
395	0.21
396	0.25
397	0.26
398	0.27
399	0.31
400	0.28
401	0.31
402	0.35
403	0.3
404	0.28
405	0.28
406	0.24
407	0.21
408	0.22
409	0.17
410	0.14
411	0.19
412	0.18
413	0.21
414	0.23
415	0.25
416	0.27
417	0.34
418	0.41
419	0.46
420	0.54
421	0.61
422	0.69
423	0.72
424	0.78
425	0.8
426	0.77
427	0.74
428	0.73
429	0.71
430	0.7
431	0.7
432	0.65
433	0.62
434	0.63
435	0.57
436	0.49
437	0.41
438	0.34
439	0.3
440	0.31
441	0.26
442	0.19
443	0.22
444	0.24
445	0.26
446	0.31
447	0.34
448	0.36
449	0.44
450	0.54
451	0.61
452	0.65
453	0.69
454	0.68
455	0.71
456	0.72
457	0.67
458	0.61
459	0.52
460	0.46
461	0.41
462	0.36
463	0.3
464	0.23
465	0.2
466	0.16
467	0.14
468	0.14
469	0.15
470	0.19
471	0.27
472	0.36
473	0.45
474	0.49
475	0.51
476	0.55
477	0.61
478	0.65
479	0.66
480	0.63
481	0.63
482	0.69
483	0.73
484	0.75
485	0.77
486	0.77
487	0.74
488	0.74
489	0.73
490	0.73
491	0.79
492	0.81
493	0.82
494	0.79
495	0.78
496	0.8
497	0.8
498	0.78
499	0.76
500	0.77
501	0.75
502	0.77
503	0.82
504	0.79
505	0.75
506	0.73
507	0.71
508	0.7
509	0.71
510	0.7
511	0.65
512	0.68
513	0.69
514	0.67
515	0.64
516	0.59
517	0.59
518	0.57
519	0.6
520	0.59
521	0.59
522	0.56
523	0.55
524	0.59

A0A1Y2IYD5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer