Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ITB2

Protein Details
Accession A0A1Y2ITB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-41KEKAVPDAKRRKVSRSSKRSTPESEHydrophilic
374-393EQLKEARRRARDGRKWILIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-35DAKRRKVSRSSKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
Amino Acid Sequences MPAISRTSEFCEFVREKEKAVPDAKRRKVSRSSKRSTPESERLETLNKEYVKEAYAVLNHINTLARMLVSVRKAYLNVDSRSPPMLRPTSRTIDISGENQSWSDLRNLTNEERDQIDLQARVILSRCKDRVAQLEELEKSKPPIGIGRAELAASQQNPLTRLLPARLRQDDSTAASDFVAAHHAGVTWYLSRRLTETSQFLRDMQEERMKRQLERSRTLGSGAAREAMFLGASEALPSPAESTASGSWLGGASNLASSFAASIGGPSSSFDPSHSSSTIKPSASAARDDWMSETDEEELELSASQIQQFEEENANILQSVQDTLASVQQAESRLMEISALQMELVAHLTKQTEQTEQLYEDAIATASMVEKGNEQLKEARRRARDGRKWILIFLIGASLSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.36
3 0.35
4 0.41
5 0.46
6 0.44
7 0.5
8 0.54
9 0.56
10 0.66
11 0.73
12 0.75
13 0.73
14 0.75
15 0.78
16 0.8
17 0.8
18 0.8
19 0.79
20 0.78
21 0.83
22 0.81
23 0.79
24 0.78
25 0.76
26 0.72
27 0.69
28 0.62
29 0.57
30 0.55
31 0.49
32 0.43
33 0.41
34 0.35
35 0.32
36 0.31
37 0.3
38 0.26
39 0.25
40 0.22
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.14
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.27
63 0.29
64 0.28
65 0.31
66 0.32
67 0.33
68 0.36
69 0.35
70 0.29
71 0.29
72 0.35
73 0.34
74 0.37
75 0.42
76 0.44
77 0.46
78 0.45
79 0.39
80 0.35
81 0.35
82 0.32
83 0.29
84 0.24
85 0.21
86 0.2
87 0.19
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.16
94 0.21
95 0.23
96 0.28
97 0.28
98 0.26
99 0.26
100 0.27
101 0.24
102 0.22
103 0.23
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.16
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.16
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.25
116 0.28
117 0.35
118 0.37
119 0.38
120 0.33
121 0.38
122 0.37
123 0.37
124 0.34
125 0.26
126 0.23
127 0.21
128 0.19
129 0.14
130 0.17
131 0.19
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.14
139 0.14
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.14
149 0.16
150 0.21
151 0.24
152 0.3
153 0.31
154 0.33
155 0.32
156 0.33
157 0.32
158 0.29
159 0.27
160 0.21
161 0.18
162 0.15
163 0.15
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.13
181 0.15
182 0.17
183 0.21
184 0.22
185 0.24
186 0.24
187 0.23
188 0.22
189 0.21
190 0.2
191 0.19
192 0.23
193 0.21
194 0.23
195 0.3
196 0.29
197 0.28
198 0.35
199 0.39
200 0.38
201 0.42
202 0.43
203 0.39
204 0.39
205 0.39
206 0.33
207 0.27
208 0.22
209 0.18
210 0.16
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.13
259 0.16
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.2
264 0.26
265 0.3
266 0.25
267 0.23
268 0.23
269 0.28
270 0.28
271 0.29
272 0.23
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.2
277 0.15
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.07
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.1
336 0.11
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.21
341 0.25
342 0.27
343 0.27
344 0.26
345 0.22
346 0.2
347 0.17
348 0.15
349 0.12
350 0.08
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.14
359 0.2
360 0.2
361 0.22
362 0.28
363 0.36
364 0.47
365 0.53
366 0.58
367 0.57
368 0.65
369 0.73
370 0.76
371 0.77
372 0.77
373 0.8
374 0.8
375 0.76
376 0.69
377 0.61
378 0.51
379 0.42
380 0.32
381 0.25
382 0.15
383 0.13
384 0.12
385 0.09
386 0.08
387 0.07