Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IHD0

Protein Details
Accession A0A1Y2IHD0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-108AEETKRQIRREERKKKKTEEFEKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-101RQIRREERKKKKT
Subcellular Location(s) mito 11, mito_nucl 10.166, cyto_mito 8.666, nucl 8, cyto_nucl 7.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPGTHLLPPNLLKLFAPRPPLPYTRPLDKDIDRVRPKKVDGVGQLLAQLREARTQGMMESGNTGGERDGMEGMEEGEEPTFTYAEETKRQIRREERKKKKTEEFEKAKENYKPSEDPEAIGDPYKTLFIARLNKNATENDLRREFESFGNIERVRVVRDKNGRSRGYAFIVFERERDMKGNTTAVFPTLTHPACACVFALASSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.37
4 0.33
5 0.37
6 0.42
7 0.46
8 0.44
9 0.47
10 0.49
11 0.51
12 0.53
13 0.52
14 0.54
15 0.51
16 0.57
17 0.55
18 0.59
19 0.59
20 0.58
21 0.61
22 0.6
23 0.59
24 0.56
25 0.53
26 0.49
27 0.43
28 0.46
29 0.41
30 0.36
31 0.37
32 0.31
33 0.28
34 0.21
35 0.2
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.14
40 0.12
41 0.13
42 0.12
43 0.13
44 0.12
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.06
70 0.08
71 0.11
72 0.14
73 0.17
74 0.24
75 0.29
76 0.32
77 0.37
78 0.45
79 0.53
80 0.61
81 0.69
82 0.73
83 0.78
84 0.84
85 0.85
86 0.84
87 0.83
88 0.81
89 0.8
90 0.77
91 0.72
92 0.71
93 0.65
94 0.62
95 0.54
96 0.48
97 0.4
98 0.36
99 0.33
100 0.28
101 0.33
102 0.28
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.21
107 0.2
108 0.17
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.06
114 0.07
115 0.12
116 0.21
117 0.23
118 0.29
119 0.31
120 0.33
121 0.35
122 0.34
123 0.33
124 0.33
125 0.32
126 0.31
127 0.33
128 0.33
129 0.31
130 0.33
131 0.3
132 0.23
133 0.25
134 0.2
135 0.18
136 0.24
137 0.23
138 0.21
139 0.22
140 0.22
141 0.21
142 0.25
143 0.26
144 0.27
145 0.36
146 0.44
147 0.51
148 0.59
149 0.57
150 0.57
151 0.58
152 0.54
153 0.5
154 0.45
155 0.37
156 0.31
157 0.36
158 0.32
159 0.29
160 0.3
161 0.27
162 0.25
163 0.26
164 0.26
165 0.24
166 0.26
167 0.3
168 0.26
169 0.27
170 0.26
171 0.24
172 0.22
173 0.18
174 0.18
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.23
180 0.22
181 0.23
182 0.2
183 0.13
184 0.13