Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2J3E1

Protein Details
Accession A0A1Y2J3E1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124SNASRPQKRNQFFRTKPCRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-21RGGR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSSRQTNELEQTQAPRRRGGRADGNSRRPSRPAQASHVEEWRLSINTRMDGEGSFPPAPPTTPVIVPLASESSSSRVARDDVRPREKERSSHRPEAARAGRSSYSNASRPQKRNQFFRTKPCRFFTEPSGCVKGDRCNFIHETPKDGGIPTGLTVPAEAMSEGEAESAADSSVQGEHAPSTAATSEAPSVCTETEEPKKNFYPVTWRVVGGGVTLGGQREICENFMAGRCTEGADCRYAHPDTSEEECVFDYPEPPLFSPISPISPMVVPYSFIYPMLSPVQPLALPALSGPLPVSPLSATQPVPTPKGRHSAKNSMTGLTVYTAAPPSMMSSHPYSPHRVVDGTTLLDRELPVGHYHVDNMWSARTVVRPLSTPPTPVHAPGEVSVAKLFAAEMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.5
4 0.54
5 0.56
6 0.57
7 0.58
8 0.6
9 0.68
10 0.71
11 0.78
12 0.79
13 0.79
14 0.74
15 0.68
16 0.65
17 0.64
18 0.64
19 0.6
20 0.58
21 0.62
22 0.64
23 0.64
24 0.64
25 0.56
26 0.46
27 0.41
28 0.37
29 0.29
30 0.24
31 0.26
32 0.23
33 0.25
34 0.27
35 0.26
36 0.23
37 0.22
38 0.24
39 0.21
40 0.23
41 0.2
42 0.19
43 0.21
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.22
48 0.2
49 0.19
50 0.21
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.16
56 0.13
57 0.14
58 0.13
59 0.14
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.2
65 0.24
66 0.32
67 0.38
68 0.43
69 0.52
70 0.56
71 0.6
72 0.67
73 0.66
74 0.65
75 0.65
76 0.66
77 0.66
78 0.7
79 0.7
80 0.67
81 0.65
82 0.67
83 0.64
84 0.58
85 0.5
86 0.45
87 0.42
88 0.37
89 0.38
90 0.33
91 0.32
92 0.31
93 0.38
94 0.43
95 0.51
96 0.55
97 0.62
98 0.67
99 0.68
100 0.73
101 0.75
102 0.77
103 0.74
104 0.79
105 0.81
106 0.79
107 0.79
108 0.73
109 0.71
110 0.65
111 0.63
112 0.61
113 0.59
114 0.53
115 0.51
116 0.51
117 0.44
118 0.4
119 0.38
120 0.36
121 0.31
122 0.33
123 0.29
124 0.3
125 0.33
126 0.34
127 0.42
128 0.34
129 0.35
130 0.32
131 0.32
132 0.28
133 0.25
134 0.23
135 0.14
136 0.14
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.12
181 0.19
182 0.26
183 0.27
184 0.3
185 0.31
186 0.31
187 0.31
188 0.27
189 0.29
190 0.26
191 0.3
192 0.28
193 0.26
194 0.26
195 0.26
196 0.25
197 0.16
198 0.11
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.19
231 0.2
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.1
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.1
263 0.12
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.07
284 0.09
285 0.11
286 0.14
287 0.15
288 0.14
289 0.21
290 0.23
291 0.26
292 0.3
293 0.31
294 0.32
295 0.41
296 0.44
297 0.47
298 0.52
299 0.58
300 0.58
301 0.64
302 0.61
303 0.53
304 0.5
305 0.41
306 0.34
307 0.24
308 0.21
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.13
319 0.17
320 0.21
321 0.27
322 0.3
323 0.34
324 0.36
325 0.38
326 0.37
327 0.34
328 0.31
329 0.29
330 0.29
331 0.26
332 0.24
333 0.21
334 0.18
335 0.19
336 0.17
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.15
343 0.14
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.16
352 0.17
353 0.18
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.23
358 0.26
359 0.33
360 0.33
361 0.34
362 0.32
363 0.35
364 0.35
365 0.36
366 0.35
367 0.3
368 0.3
369 0.28
370 0.32
371 0.26
372 0.25
373 0.22
374 0.19
375 0.16
376 0.14