Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2J510

Protein Details
Accession A0A1Y2J510    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-273SDAEKVKKVEKKKKTEKAAEPTPSHydrophilic
394-420IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-148KSKPKAKQTAAKAASPKPAAAKAA
255-268VKKVEKKKKTEKAA
322-330KEKNGKEPR
400-411GFRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAVVQEKTAVDGNLAATYTYIYAFLLKREHSKAAEALKKAVKDVVVLKEGVGSDGPSLDAIIKEWKELKEKSAAAKSSDSSDSDSDSDSDSSSEESSSDSSDSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSSSKSKPKAKQTAAKAASPKPAAAKAASPARSSKTLSSDKSDSSSDSDSDSSSSSDDDSDDEKTTKTTKTKTVEVKTPKKAESKKAKQSSSESSDSDSDSDSSSSSSSSSDSSSDSSDSSDSDSDSDDSDAEKVKKVEKKKKTEKAAEPTPSKADKDETQVTKKRRTDESGTSVATAVGDNARESEAPSQSATPKPNGNGKEKNGKEPRKSNTPFQRIKPEEVKFADERLKDNRFEARVRASMQKGRESGLADSSLQGASQSDYGARAARDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMESYSIKFND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.11
10 0.12
11 0.16
12 0.2
13 0.22
14 0.28
15 0.33
16 0.38
17 0.35
18 0.38
19 0.41
20 0.45
21 0.5
22 0.45
23 0.47
24 0.47
25 0.46
26 0.43
27 0.4
28 0.31
29 0.28
30 0.32
31 0.31
32 0.29
33 0.28
34 0.26
35 0.27
36 0.26
37 0.23
38 0.18
39 0.12
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.22
52 0.25
53 0.31
54 0.33
55 0.35
56 0.36
57 0.39
58 0.44
59 0.47
60 0.46
61 0.42
62 0.44
63 0.41
64 0.37
65 0.36
66 0.3
67 0.26
68 0.24
69 0.23
70 0.21
71 0.21
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.13
108 0.16
109 0.2
110 0.26
111 0.33
112 0.4
113 0.49
114 0.54
115 0.63
116 0.7
117 0.73
118 0.76
119 0.75
120 0.78
121 0.71
122 0.68
123 0.62
124 0.55
125 0.54
126 0.46
127 0.4
128 0.32
129 0.31
130 0.28
131 0.24
132 0.21
133 0.2
134 0.26
135 0.27
136 0.26
137 0.26
138 0.27
139 0.29
140 0.3
141 0.28
142 0.28
143 0.32
144 0.33
145 0.36
146 0.35
147 0.33
148 0.34
149 0.32
150 0.26
151 0.23
152 0.22
153 0.17
154 0.16
155 0.16
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.17
174 0.2
175 0.21
176 0.27
177 0.31
178 0.38
179 0.45
180 0.47
181 0.51
182 0.57
183 0.62
184 0.62
185 0.62
186 0.59
187 0.59
188 0.59
189 0.61
190 0.63
191 0.64
192 0.67
193 0.7
194 0.69
195 0.64
196 0.64
197 0.61
198 0.55
199 0.48
200 0.39
201 0.33
202 0.32
203 0.28
204 0.24
205 0.18
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.2
243 0.25
244 0.35
245 0.44
246 0.5
247 0.61
248 0.69
249 0.77
250 0.8
251 0.85
252 0.84
253 0.82
254 0.81
255 0.78
256 0.7
257 0.63
258 0.59
259 0.51
260 0.43
261 0.35
262 0.31
263 0.25
264 0.29
265 0.35
266 0.34
267 0.4
268 0.47
269 0.51
270 0.56
271 0.58
272 0.57
273 0.55
274 0.56
275 0.55
276 0.55
277 0.56
278 0.51
279 0.48
280 0.43
281 0.37
282 0.31
283 0.24
284 0.16
285 0.11
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.19
299 0.24
300 0.25
301 0.24
302 0.27
303 0.29
304 0.36
305 0.39
306 0.44
307 0.47
308 0.49
309 0.56
310 0.55
311 0.62
312 0.65
313 0.69
314 0.69
315 0.7
316 0.71
317 0.71
318 0.73
319 0.73
320 0.74
321 0.75
322 0.74
323 0.71
324 0.76
325 0.69
326 0.72
327 0.71
328 0.63
329 0.61
330 0.56
331 0.56
332 0.46
333 0.46
334 0.45
335 0.38
336 0.39
337 0.39
338 0.41
339 0.36
340 0.38
341 0.41
342 0.38
343 0.39
344 0.4
345 0.39
346 0.39
347 0.41
348 0.45
349 0.44
350 0.46
351 0.47
352 0.49
353 0.44
354 0.42
355 0.42
356 0.37
357 0.32
358 0.3
359 0.27
360 0.21
361 0.2
362 0.2
363 0.16
364 0.14
365 0.12
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.1
372 0.11
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.18
384 0.23
385 0.22
386 0.26
387 0.29
388 0.35
389 0.43
390 0.54
391 0.63
392 0.69
393 0.78
394 0.82
395 0.89
396 0.91
397 0.91
398 0.91
399 0.88
400 0.87
401 0.86
402 0.79
403 0.69
404 0.59
405 0.51
406 0.4
407 0.34
408 0.24
409 0.15