Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ISJ5

Protein Details
Accession A0A1Y2ISJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-285GQTGAPKKKGRPSKRDKIRKAKEALABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-281PKKKGRPSKRDKIRKAK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MRGGERREDGIERQKAAEAESLFSVRVARARKTRSRYGALFGSEVTRMCAKLCLGSYTLGEARTRHLFAPAMATIAPEPSTSRGEITLQPNYFSSSLFVNPLREDFSTLAAAFSEQFREDVRPFELFKKLWVEQGWSWLHLRVHDGRARQAFLRITERVFAEHLSHSKTPLARVVALFSLYTFHYTQPSSSAPPVYSTSHIAIPTGKSLPGHVIYNLFHILPHSETNAQYPSRLPREVFVMDGQEASATLQASTGDVAVGQTGAPKKKGRPSKRDKIRKAKEALASLERYVDRNYVALPEPTALLRMEPPPTLDGEPIHTAHTLFAQAPTGSLENYLARKHELLAAVHSDAPGGSQDAALRRANEAVLARLKQIDEMAAEKGLEVGGEGGDKTGLIRVEKAVEELRQSVGVGASGGILGLLEGAGMDGTSSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.39
4 0.37
5 0.28
6 0.24
7 0.24
8 0.24
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.14
13 0.19
14 0.21
15 0.26
16 0.34
17 0.43
18 0.52
19 0.59
20 0.67
21 0.7
22 0.74
23 0.69
24 0.67
25 0.64
26 0.56
27 0.5
28 0.4
29 0.34
30 0.28
31 0.25
32 0.22
33 0.18
34 0.16
35 0.15
36 0.18
37 0.16
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.21
44 0.22
45 0.23
46 0.2
47 0.2
48 0.18
49 0.21
50 0.25
51 0.26
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.22
56 0.27
57 0.22
58 0.19
59 0.17
60 0.17
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.18
72 0.24
73 0.27
74 0.32
75 0.3
76 0.3
77 0.3
78 0.32
79 0.29
80 0.23
81 0.19
82 0.14
83 0.14
84 0.17
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.18
91 0.2
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.14
106 0.14
107 0.16
108 0.18
109 0.19
110 0.21
111 0.24
112 0.28
113 0.24
114 0.27
115 0.3
116 0.29
117 0.3
118 0.29
119 0.3
120 0.25
121 0.33
122 0.31
123 0.26
124 0.26
125 0.26
126 0.25
127 0.21
128 0.25
129 0.21
130 0.26
131 0.28
132 0.28
133 0.31
134 0.33
135 0.34
136 0.3
137 0.31
138 0.27
139 0.26
140 0.3
141 0.25
142 0.23
143 0.24
144 0.23
145 0.2
146 0.19
147 0.16
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.21
155 0.21
156 0.2
157 0.21
158 0.21
159 0.18
160 0.17
161 0.18
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.14
180 0.15
181 0.18
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.19
219 0.21
220 0.23
221 0.21
222 0.19
223 0.23
224 0.23
225 0.22
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.06
249 0.1
250 0.12
251 0.15
252 0.18
253 0.23
254 0.31
255 0.41
256 0.48
257 0.56
258 0.64
259 0.72
260 0.8
261 0.87
262 0.89
263 0.9
264 0.9
265 0.87
266 0.82
267 0.79
268 0.73
269 0.66
270 0.59
271 0.53
272 0.45
273 0.36
274 0.35
275 0.28
276 0.24
277 0.22
278 0.19
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.09
291 0.08
292 0.1
293 0.12
294 0.14
295 0.13
296 0.15
297 0.14
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.14
302 0.16
303 0.19
304 0.18
305 0.18
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.15
310 0.12
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.21
332 0.22
333 0.22
334 0.22
335 0.2
336 0.16
337 0.13
338 0.12
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.1
344 0.13
345 0.17
346 0.19
347 0.19
348 0.19
349 0.2
350 0.19
351 0.2
352 0.18
353 0.19
354 0.23
355 0.23
356 0.23
357 0.24
358 0.24
359 0.22
360 0.21
361 0.18
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.1
370 0.08
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.09
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.15
385 0.18
386 0.19
387 0.22
388 0.22
389 0.22
390 0.24
391 0.24
392 0.24
393 0.21
394 0.21
395 0.19
396 0.15
397 0.14
398 0.11
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.02
409 0.02
410 0.03
411 0.03
412 0.03