Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IFW9

Protein Details
Accession A0A1Y2IFW9    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
530-551SEALKRKDKERQERAMNRRRIRBasic
837-862DVKAYAKSNKYPPKKKADPRADNASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-406KGKERAREQPRKK
508-510GKG
516-516K
522-525RPKP
531-553EALKRKDKERQERAMNRRRIRGG
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 9, cysk 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSVLLPFHKSILEKIHDPAASELVLLARGLGLRRIVCKLLQIYDSPNNLVLLVNATQEEEAAIGEELGIMGCRNPGLRIVGFETGRKDRQDLYKKGGLISITSQIFTVDMLTSDIPTHLITGILILHAEKVTPTSAEAFIVRLYREKNKNGFLKAFSDQPEHITSGMSPLRTIMKELQLRTVHIYPRFHAEIKESLDRKTPDIVELHQDMTEAMSEIHHAIVQCMTTTLSELKRANTMLDLDDLTIDNAYFRSFDMVVRRMLDPVWHKVGPRTKQLVSDLATLRRLLTYLLTYDALAFHAYLETLIAANTTTDAGTSRQHQSPWMLTDAAHTIFTYAKRRCYVMNPVPKPAQSKPPQVVNLIDEEEEEQWAALDEMEAEARGESSRNAAGTNGKGKERAREQPRKKWLPEGMEPVLEELPKWSLLADILHEIEEEMMRLEPLLTSHSPGSNTVLIMASSLHTCTLIKDFLSTMDPSAPRGSQGRRMMEDKLRLYLWWKGKLSQRRSEGKGPIALPKGQDASRPKPDDGVSEALKRKDKERQERAMNRRRIRGGAPAAAVASTRDRTASGALPEGEIKKEADDIADFLSSQGVDLATQALASDTQLFSMDDDFDAHYGLLAPAQTVLVRPYSDDTDDQMLQEVKPRFIVMFEPNLEFIRRIEVYRNSNPGLGVRVYFMMYKLSCEEGKYLTGLRREKESFERLIKERGSMLMPIYEDRASAAGEAIIKSISSRIAGGRKEVSTEPARVIVDMREFRSSLPSLLHASGLLVLPVTLTVGDYILTPDICVERKSIPDLVSSFNSGRLYTQCELMSAHYKQPILLIEFEEHKSFSLEAVADVKAYAKSNKYPPKKKADPRADNASSAAQSIQSKLVLLTLTFPRVRILWSSSPYATAEIFNDLKMNVAQPDPAKAVLVGAEEDPDAGAGVNAAAEELLRSLPGITAKNVKHVMSRVRSVRELCELSLAEVQDILGVEPGKACYDFIHRGERN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.4
3 0.37
4 0.38
5 0.36
6 0.3
7 0.24
8 0.21
9 0.19
10 0.13
11 0.13
12 0.11
13 0.09
14 0.07
15 0.08
16 0.09
17 0.11
18 0.15
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.25
24 0.3
25 0.32
26 0.32
27 0.32
28 0.31
29 0.35
30 0.4
31 0.42
32 0.37
33 0.34
34 0.3
35 0.28
36 0.26
37 0.19
38 0.15
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.08
47 0.06
48 0.07
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.11
63 0.16
64 0.16
65 0.19
66 0.23
67 0.28
68 0.28
69 0.3
70 0.34
71 0.36
72 0.4
73 0.38
74 0.37
75 0.37
76 0.47
77 0.54
78 0.54
79 0.55
80 0.56
81 0.55
82 0.54
83 0.5
84 0.4
85 0.32
86 0.29
87 0.28
88 0.23
89 0.22
90 0.21
91 0.18
92 0.18
93 0.15
94 0.14
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.2
131 0.29
132 0.36
133 0.43
134 0.48
135 0.54
136 0.6
137 0.62
138 0.62
139 0.56
140 0.54
141 0.48
142 0.46
143 0.41
144 0.38
145 0.33
146 0.32
147 0.32
148 0.28
149 0.26
150 0.21
151 0.18
152 0.21
153 0.22
154 0.19
155 0.16
156 0.16
157 0.21
158 0.2
159 0.24
160 0.22
161 0.28
162 0.33
163 0.34
164 0.41
165 0.38
166 0.39
167 0.41
168 0.42
169 0.39
170 0.4
171 0.41
172 0.34
173 0.4
174 0.41
175 0.37
176 0.33
177 0.32
178 0.32
179 0.35
180 0.42
181 0.36
182 0.35
183 0.41
184 0.41
185 0.39
186 0.38
187 0.34
188 0.28
189 0.29
190 0.29
191 0.28
192 0.28
193 0.27
194 0.21
195 0.2
196 0.17
197 0.15
198 0.14
199 0.09
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.09
215 0.13
216 0.13
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.24
221 0.24
222 0.23
223 0.21
224 0.21
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.17
243 0.19
244 0.21
245 0.23
246 0.23
247 0.21
248 0.21
249 0.24
250 0.22
251 0.25
252 0.29
253 0.27
254 0.28
255 0.34
256 0.42
257 0.42
258 0.46
259 0.46
260 0.42
261 0.45
262 0.47
263 0.45
264 0.39
265 0.41
266 0.36
267 0.32
268 0.32
269 0.28
270 0.26
271 0.21
272 0.19
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.07
302 0.09
303 0.13
304 0.17
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.23
309 0.25
310 0.26
311 0.24
312 0.2
313 0.18
314 0.19
315 0.19
316 0.17
317 0.14
318 0.11
319 0.1
320 0.12
321 0.15
322 0.21
323 0.21
324 0.26
325 0.27
326 0.28
327 0.3
328 0.33
329 0.4
330 0.41
331 0.49
332 0.47
333 0.5
334 0.51
335 0.51
336 0.51
337 0.44
338 0.45
339 0.41
340 0.46
341 0.45
342 0.49
343 0.49
344 0.46
345 0.44
346 0.35
347 0.31
348 0.24
349 0.2
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.1
354 0.09
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.11
377 0.14
378 0.2
379 0.2
380 0.2
381 0.24
382 0.25
383 0.3
384 0.33
385 0.4
386 0.44
387 0.52
388 0.6
389 0.65
390 0.75
391 0.77
392 0.72
393 0.71
394 0.66
395 0.61
396 0.58
397 0.55
398 0.46
399 0.39
400 0.37
401 0.31
402 0.26
403 0.19
404 0.15
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.08
430 0.07
431 0.09
432 0.1
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.14
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.14
464 0.12
465 0.12
466 0.15
467 0.17
468 0.21
469 0.27
470 0.28
471 0.29
472 0.31
473 0.33
474 0.34
475 0.38
476 0.3
477 0.27
478 0.24
479 0.22
480 0.22
481 0.25
482 0.25
483 0.26
484 0.26
485 0.28
486 0.35
487 0.44
488 0.48
489 0.49
490 0.51
491 0.52
492 0.56
493 0.58
494 0.55
495 0.49
496 0.46
497 0.4
498 0.38
499 0.33
500 0.3
501 0.24
502 0.22
503 0.22
504 0.18
505 0.22
506 0.23
507 0.27
508 0.34
509 0.37
510 0.35
511 0.36
512 0.36
513 0.33
514 0.3
515 0.28
516 0.21
517 0.24
518 0.27
519 0.27
520 0.31
521 0.3
522 0.3
523 0.34
524 0.42
525 0.47
526 0.53
527 0.58
528 0.64
529 0.73
530 0.8
531 0.82
532 0.82
533 0.75
534 0.72
535 0.66
536 0.58
537 0.5
538 0.48
539 0.41
540 0.35
541 0.31
542 0.25
543 0.23
544 0.21
545 0.19
546 0.12
547 0.1
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.1
554 0.12
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.11
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.08
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.07
575 0.06
576 0.05
577 0.05
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.06
600 0.07
601 0.06
602 0.05
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.09
617 0.11
618 0.13
619 0.13
620 0.14
621 0.16
622 0.17
623 0.16
624 0.16
625 0.15
626 0.14
627 0.2
628 0.2
629 0.16
630 0.17
631 0.17
632 0.15
633 0.15
634 0.18
635 0.14
636 0.17
637 0.18
638 0.19
639 0.2
640 0.21
641 0.2
642 0.17
643 0.15
644 0.15
645 0.14
646 0.14
647 0.19
648 0.24
649 0.31
650 0.35
651 0.4
652 0.35
653 0.35
654 0.35
655 0.3
656 0.27
657 0.2
658 0.16
659 0.12
660 0.12
661 0.12
662 0.12
663 0.11
664 0.12
665 0.11
666 0.12
667 0.13
668 0.15
669 0.15
670 0.15
671 0.16
672 0.14
673 0.15
674 0.15
675 0.16
676 0.17
677 0.24
678 0.26
679 0.26
680 0.31
681 0.32
682 0.35
683 0.39
684 0.4
685 0.38
686 0.4
687 0.44
688 0.4
689 0.45
690 0.42
691 0.36
692 0.33
693 0.29
694 0.25
695 0.2
696 0.18
697 0.14
698 0.14
699 0.13
700 0.15
701 0.13
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.07
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.11
720 0.17
721 0.18
722 0.21
723 0.24
724 0.24
725 0.27
726 0.26
727 0.28
728 0.26
729 0.27
730 0.24
731 0.24
732 0.24
733 0.21
734 0.21
735 0.18
736 0.22
737 0.23
738 0.24
739 0.23
740 0.23
741 0.23
742 0.27
743 0.26
744 0.2
745 0.18
746 0.18
747 0.19
748 0.2
749 0.19
750 0.14
751 0.13
752 0.13
753 0.12
754 0.1
755 0.06
756 0.05
757 0.05
758 0.05
759 0.05
760 0.03
761 0.03
762 0.04
763 0.04
764 0.04
765 0.05
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.08
771 0.1
772 0.11
773 0.12
774 0.13
775 0.14
776 0.17
777 0.2
778 0.23
779 0.21
780 0.24
781 0.25
782 0.27
783 0.26
784 0.28
785 0.25
786 0.25
787 0.25
788 0.21
789 0.21
790 0.19
791 0.24
792 0.21
793 0.24
794 0.21
795 0.21
796 0.21
797 0.23
798 0.28
799 0.24
800 0.27
801 0.27
802 0.27
803 0.26
804 0.28
805 0.28
806 0.23
807 0.23
808 0.2
809 0.19
810 0.23
811 0.24
812 0.23
813 0.2
814 0.18
815 0.18
816 0.16
817 0.14
818 0.13
819 0.11
820 0.11
821 0.14
822 0.13
823 0.11
824 0.11
825 0.12
826 0.12
827 0.14
828 0.17
829 0.18
830 0.25
831 0.35
832 0.45
833 0.54
834 0.62
835 0.69
836 0.76
837 0.82
838 0.85
839 0.87
840 0.88
841 0.86
842 0.84
843 0.86
844 0.77
845 0.68
846 0.6
847 0.53
848 0.42
849 0.33
850 0.26
851 0.19
852 0.17
853 0.18
854 0.18
855 0.15
856 0.15
857 0.14
858 0.16
859 0.13
860 0.12
861 0.15
862 0.16
863 0.21
864 0.21
865 0.22
866 0.21
867 0.21
868 0.23
869 0.22
870 0.26
871 0.27
872 0.3
873 0.35
874 0.33
875 0.35
876 0.34
877 0.32
878 0.26
879 0.2
880 0.18
881 0.19
882 0.19
883 0.17
884 0.17
885 0.15
886 0.16
887 0.16
888 0.16
889 0.13
890 0.13
891 0.17
892 0.17
893 0.21
894 0.21
895 0.21
896 0.2
897 0.17
898 0.17
899 0.15
900 0.15
901 0.12
902 0.1
903 0.11
904 0.1
905 0.1
906 0.09
907 0.08
908 0.07
909 0.05
910 0.05
911 0.04
912 0.04
913 0.04
914 0.04
915 0.04
916 0.03
917 0.03
918 0.04
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.06
924 0.08
925 0.13
926 0.15
927 0.17
928 0.26
929 0.27
930 0.35
931 0.38
932 0.37
933 0.38
934 0.42
935 0.49
936 0.47
937 0.55
938 0.54
939 0.56
940 0.61
941 0.58
942 0.56
943 0.54
944 0.5
945 0.42
946 0.41
947 0.35
948 0.33
949 0.34
950 0.3
951 0.21
952 0.19
953 0.18
954 0.14
955 0.13
956 0.11
957 0.1
958 0.1
959 0.1
960 0.12
961 0.13
962 0.13
963 0.14
964 0.14
965 0.13
966 0.21
967 0.27
968 0.3