FuNGI

A0A1Y2IHU2

Protein Details

Accession

A0A1Y2IHU2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
268-309	SDEEDHERSKRRRKRKSREDDESPKRKRKRSKRSRSTSESDS	Basic
315-366	SESDSESERKKRKKKRKTRDASSESESDDEKERKWKKKSKKRSRDNSADEDE	Basic
371-405	SDEEEKRKSKSKGRSKSKNKGRSAKRRRHDSDSSA	Basic
422-461	SDSDRDRRSRSRSKSKSSSSKSKSKSKSKRSRSSSPAAHD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
275-302	RSKRRRKRKSREDDESPKRKRKRSKRSR
323-336	RKKRKKKRKTRDAS
344-358	EKERKWKKKSKKRSR
376-398	KRKSKSKGRSKSKNKGRSAKRRR
428-453	RRSRSRSKSKSSSSKSKSKSKSKRSR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNPLEQRLHQAALADPKKTLTQKECEALIPDPAARTGALNFLLGTGLLKAMKDTKGAVSFRAVMKKELDVKKDMSGEEAMILSYIQTAGNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLTQKQLIKAVKSVKFPTRKIYMLAHLEPSVEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACLRFIRDRSAPKQKGGEASSSSNLLYPISAAPSYPTAQQILSFLSKSRITETELNVEHVEMLLNVLVLDGEVERVPAFGATMWDTSEDPNAGASDEEDHERSKRRRKRKSREDDESPKRKRKRSKRSRSTSESDSQSESESESDSESERKKRKKKRKTRDASSESESDDEKERKWKKKSKKRSRDNSADEDEDVAMSDEEEKRKSKSKGRSKSKNKGRSAKRRRHDSDSSASESDSESESSSGSSSDSDSDRDRRSRSRSKSKSSSSKSKSKSKSKRSRSSSPAAHDFTALQDDYSGGGAYVYRAVRQERAAGGLSQSPCVRCPTFDFCKPGGPVNPQECTYYGGWLVATEVGKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.38
3	0.35
4	0.4
5	0.39
6	0.31
7	0.28
8	0.29
9	0.35
10	0.37
11	0.41
12	0.38
13	0.42
14	0.47
15	0.51
16	0.51
17	0.47
18	0.46
19	0.39
20	0.36
21	0.3
22	0.25
23	0.21
24	0.2
25	0.19
26	0.15
27	0.15
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.13
32	0.13
33	0.12
34	0.12
35	0.11
36	0.1
37	0.07
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.18
46	0.21
47	0.28
48	0.29
49	0.29
50	0.28
51	0.31
52	0.34
53	0.41
54	0.37
55	0.32
56	0.34
57	0.38
58	0.44
59	0.46
60	0.45
61	0.42
62	0.43
63	0.45
64	0.46
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.21
70	0.18
71	0.13
72	0.1
73	0.1
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.05
78	0.05
79	0.06
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.09
85	0.11
86	0.13
87	0.14
88	0.19
89	0.21
90	0.25
91	0.31
92	0.38
93	0.44
94	0.53
95	0.52
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.48
100	0.46
101	0.43
102	0.33
103	0.32
104	0.31
105	0.28
106	0.33
107	0.36
108	0.39
109	0.42
110	0.45
111	0.47
112	0.53
113	0.56
114	0.51
115	0.49
116	0.49
117	0.44
118	0.46
119	0.5
120	0.49
121	0.53
122	0.53
123	0.55
124	0.51
125	0.48
126	0.46
127	0.44
128	0.43
129	0.41
130	0.41
131	0.36
132	0.31
133	0.3
134	0.26
135	0.24
136	0.17
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.1
160	0.09
161	0.14
162	0.17
163	0.21
164	0.24
165	0.26
166	0.31
167	0.35
168	0.41
169	0.45
170	0.52
171	0.52
172	0.51
173	0.53
174	0.49
175	0.5
176	0.44
177	0.4
178	0.32
179	0.32
180	0.29
181	0.26
182	0.23
183	0.18
184	0.16
185	0.12
186	0.09
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.1
194	0.11
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.11
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.16
209	0.15
210	0.18
211	0.22
212	0.23
213	0.27
214	0.26
215	0.28
216	0.25
217	0.23
218	0.19
219	0.14
220	0.13
221	0.06
222	0.05
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.02
229	0.03
230	0.02
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.03
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.09
260	0.1
261	0.18
262	0.24
263	0.33
264	0.41
265	0.51
266	0.61
267	0.72
268	0.82
269	0.86
270	0.91
271	0.91
272	0.91
273	0.9
274	0.89
275	0.89
276	0.88
277	0.84
278	0.82
279	0.79
280	0.78
281	0.79
282	0.8
283	0.81
284	0.82
285	0.86
286	0.87
287	0.9
288	0.92
289	0.89
290	0.84
291	0.78
292	0.73
293	0.65
294	0.56
295	0.47
296	0.38
297	0.32
298	0.26
299	0.2
300	0.14
301	0.11
302	0.1
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.13
307	0.16
308	0.24
309	0.31
310	0.41
311	0.5
312	0.61
313	0.71
314	0.78
315	0.85
316	0.89
317	0.92
318	0.93
319	0.94
320	0.94
321	0.9
322	0.84
323	0.77
324	0.68
325	0.57
326	0.47
327	0.37
328	0.28
329	0.27
330	0.22
331	0.19
332	0.27
333	0.35
334	0.42
335	0.52
336	0.6
337	0.65
338	0.75
339	0.85
340	0.87
341	0.9
342	0.92
343	0.93
344	0.94
345	0.94
346	0.9
347	0.86
348	0.79
349	0.7
350	0.59
351	0.49
352	0.39
353	0.28
354	0.2
355	0.13
356	0.08
357	0.06
358	0.09
359	0.11
360	0.13
361	0.16
362	0.17
363	0.2
364	0.28
365	0.34
366	0.4
367	0.48
368	0.57
369	0.65
370	0.74
371	0.82
372	0.85
373	0.9
374	0.92
375	0.92
376	0.9
377	0.9
378	0.89
379	0.9
380	0.9
381	0.9
382	0.88
383	0.89
384	0.86
385	0.84
386	0.81
387	0.76
388	0.75
389	0.7
390	0.66
391	0.55
392	0.49
393	0.41
394	0.33
395	0.28
396	0.2
397	0.15
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.1
408	0.11
409	0.13
410	0.18
411	0.24
412	0.3
413	0.34
414	0.39
415	0.44
416	0.52
417	0.6
418	0.66
419	0.71
420	0.74
421	0.79
422	0.84
423	0.86
424	0.87
425	0.86
426	0.87
427	0.83
428	0.83
429	0.81
430	0.81
431	0.81
432	0.81
433	0.84
434	0.84
435	0.88
436	0.89
437	0.92
438	0.9
439	0.9
440	0.87
441	0.86
442	0.82
443	0.79
444	0.77
445	0.69
446	0.62
447	0.53
448	0.45
449	0.37
450	0.33
451	0.25
452	0.17
453	0.13
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.11
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.16
466	0.19
467	0.23
468	0.25
469	0.29
470	0.25
471	0.28
472	0.28
473	0.26
474	0.25
475	0.28
476	0.27
477	0.26
478	0.27
479	0.25
480	0.25
481	0.3
482	0.3
483	0.25
484	0.31
485	0.36
486	0.41
487	0.47
488	0.52
489	0.47
490	0.54
491	0.53
492	0.54
493	0.51
494	0.5
495	0.52
496	0.51
497	0.53
498	0.47
499	0.48
500	0.42
501	0.4
502	0.34
503	0.28
504	0.22
505	0.19
506	0.18
507	0.15
508	0.16
509	0.15

A0A1Y2IHU2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer