Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IQT1

Protein Details
Accession A0A1Y2IQT1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-261KAKSTAPKPKAKKEEKIYIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-69QKSRGGPASRGGRYYQRGGKSAPRDKE
78-106SEPKKRDGEGRGRGRGRGRGDRARGRGRQ
244-297KSTAPKPKAKKEEKIYIEIDARFERPSRGGRGRGERGGERAPRGGRGRGGRGRA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASKNPFALLDEDASRPASPSPAAPAKEAAPAPAPSTRGTQKSRGGPASRGGRYYQRGGKSAPRDKENGDAAAEDSEPKKRDGEGRGRGRGRGRGDRARGRGRQFDRHSATGKTDSEKKIHQGWGGDEPTSELNAEAGAATDAAAEKNEWTNSGEGDAWAAAAAETPADAAASGEKAEGRKPREPEEEDNTLTLDEYLKKKQSLDIVPKPEVRKVDDSDLKDAVIITKKDEDEDAYFVGKAKSTAPKPKAKKEEKIYIEIDARFERPSRGGRGRGERGGERAPRGGRGRGGRGRAANGNNSTPALNVADETAFPSLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.22
4 0.2
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.15
10 0.21
11 0.27
12 0.28
13 0.29
14 0.3
15 0.29
16 0.34
17 0.33
18 0.27
19 0.24
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.26
24 0.22
25 0.27
26 0.31
27 0.35
28 0.39
29 0.43
30 0.47
31 0.53
32 0.59
33 0.61
34 0.58
35 0.54
36 0.57
37 0.59
38 0.54
39 0.48
40 0.44
41 0.44
42 0.44
43 0.49
44 0.48
45 0.43
46 0.44
47 0.45
48 0.5
49 0.53
50 0.58
51 0.57
52 0.53
53 0.52
54 0.51
55 0.55
56 0.5
57 0.41
58 0.33
59 0.27
60 0.23
61 0.21
62 0.2
63 0.15
64 0.13
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.26
71 0.32
72 0.41
73 0.46
74 0.53
75 0.6
76 0.61
77 0.63
78 0.61
79 0.6
80 0.56
81 0.55
82 0.55
83 0.54
84 0.61
85 0.64
86 0.67
87 0.69
88 0.69
89 0.64
90 0.66
91 0.63
92 0.65
93 0.62
94 0.63
95 0.6
96 0.58
97 0.56
98 0.48
99 0.46
100 0.41
101 0.37
102 0.31
103 0.33
104 0.31
105 0.32
106 0.32
107 0.32
108 0.33
109 0.34
110 0.32
111 0.27
112 0.27
113 0.31
114 0.3
115 0.26
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.16
120 0.14
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.05
165 0.06
166 0.1
167 0.15
168 0.2
169 0.25
170 0.28
171 0.34
172 0.4
173 0.45
174 0.47
175 0.47
176 0.46
177 0.42
178 0.4
179 0.34
180 0.26
181 0.22
182 0.16
183 0.11
184 0.1
185 0.13
186 0.17
187 0.19
188 0.2
189 0.21
190 0.23
191 0.29
192 0.33
193 0.4
194 0.44
195 0.46
196 0.49
197 0.53
198 0.52
199 0.49
200 0.43
201 0.38
202 0.36
203 0.33
204 0.38
205 0.4
206 0.41
207 0.41
208 0.39
209 0.34
210 0.29
211 0.26
212 0.21
213 0.2
214 0.18
215 0.16
216 0.2
217 0.2
218 0.21
219 0.21
220 0.21
221 0.17
222 0.19
223 0.18
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.13
229 0.11
230 0.13
231 0.2
232 0.26
233 0.36
234 0.42
235 0.51
236 0.59
237 0.68
238 0.75
239 0.76
240 0.79
241 0.77
242 0.81
243 0.75
244 0.74
245 0.65
246 0.59
247 0.56
248 0.47
249 0.42
250 0.34
251 0.3
252 0.26
253 0.25
254 0.23
255 0.23
256 0.27
257 0.33
258 0.37
259 0.43
260 0.49
261 0.57
262 0.61
263 0.61
264 0.61
265 0.55
266 0.53
267 0.55
268 0.52
269 0.45
270 0.45
271 0.42
272 0.44
273 0.46
274 0.45
275 0.44
276 0.46
277 0.53
278 0.53
279 0.57
280 0.55
281 0.55
282 0.55
283 0.56
284 0.54
285 0.52
286 0.49
287 0.47
288 0.43
289 0.4
290 0.35
291 0.28
292 0.26
293 0.2
294 0.16
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.14