Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IRE4

Protein Details
Accession A0A1Y2IRE4    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSSLKNSLHRRTHKERSQLSHRTRLGHydrophilic
154-177VIPPESKKARRKSHSKKGKHVLFABasic
211-236DLGWKVPEQSKRKRRKSKASAEGEETHydrophilic
315-334KVDEKTWKPRVYKWRVERKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-172SKKARRKSHSKKGK
220-228SKRKRRKSK
322-334KPRVYKWRVERKR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSLKNSLHRRTHKERSQLSHRTRLGFLEKHKDYVLRARDYHSKQDRINLLREKAAMRNKDEFYFSMTREKTQGGVHVKDRGNEALPTDIVKVLKTQDENYLRTMRALGLKKIDRLKNQLMQLADLLKPGSLEAEDDAEELDEQELEVLREAGVIPPESKKARRKSHSKKGKHVLFAESEEEARRCASSARTASKSQEDDRMDVSQEQSVDLGWKVPEQSKRKRRKSKASAEGEETEMDVASIETAEQAKEHRTRLLKELSARLVRDRQLRYAERELEMQKALMGKGASRKLRGVERVDAEEDEDDDDEDRPLKKVDEKTWKPRVYKWRVERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.82
3 0.81
4 0.83
5 0.84
6 0.82
7 0.81
8 0.77
9 0.71
10 0.64
11 0.6
12 0.57
13 0.53
14 0.53
15 0.53
16 0.5
17 0.49
18 0.49
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.45
23 0.41
24 0.41
25 0.43
26 0.51
27 0.54
28 0.61
29 0.61
30 0.6
31 0.55
32 0.61
33 0.65
34 0.6
35 0.63
36 0.6
37 0.54
38 0.51
39 0.51
40 0.45
41 0.45
42 0.48
43 0.45
44 0.43
45 0.47
46 0.46
47 0.46
48 0.46
49 0.39
50 0.38
51 0.36
52 0.33
53 0.35
54 0.33
55 0.33
56 0.32
57 0.32
58 0.27
59 0.25
60 0.31
61 0.28
62 0.32
63 0.33
64 0.39
65 0.39
66 0.39
67 0.4
68 0.35
69 0.31
70 0.27
71 0.25
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.24
85 0.29
86 0.3
87 0.33
88 0.35
89 0.31
90 0.3
91 0.29
92 0.22
93 0.24
94 0.26
95 0.24
96 0.28
97 0.3
98 0.35
99 0.42
100 0.46
101 0.42
102 0.47
103 0.51
104 0.49
105 0.49
106 0.47
107 0.39
108 0.35
109 0.31
110 0.26
111 0.2
112 0.15
113 0.13
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.11
145 0.14
146 0.2
147 0.27
148 0.36
149 0.45
150 0.52
151 0.62
152 0.69
153 0.78
154 0.82
155 0.82
156 0.82
157 0.82
158 0.8
159 0.74
160 0.66
161 0.58
162 0.5
163 0.44
164 0.36
165 0.26
166 0.21
167 0.17
168 0.15
169 0.12
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.15
176 0.2
177 0.24
178 0.28
179 0.29
180 0.32
181 0.35
182 0.37
183 0.32
184 0.35
185 0.31
186 0.29
187 0.29
188 0.28
189 0.24
190 0.22
191 0.21
192 0.15
193 0.13
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.14
204 0.23
205 0.29
206 0.4
207 0.49
208 0.6
209 0.7
210 0.8
211 0.85
212 0.88
213 0.91
214 0.91
215 0.91
216 0.89
217 0.83
218 0.77
219 0.69
220 0.59
221 0.48
222 0.37
223 0.27
224 0.17
225 0.13
226 0.07
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.13
237 0.17
238 0.19
239 0.24
240 0.28
241 0.31
242 0.37
243 0.43
244 0.41
245 0.42
246 0.46
247 0.47
248 0.47
249 0.45
250 0.44
251 0.42
252 0.43
253 0.47
254 0.44
255 0.43
256 0.47
257 0.5
258 0.52
259 0.54
260 0.53
261 0.46
262 0.49
263 0.45
264 0.4
265 0.36
266 0.29
267 0.23
268 0.21
269 0.19
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.22
274 0.3
275 0.32
276 0.33
277 0.36
278 0.38
279 0.45
280 0.49
281 0.47
282 0.47
283 0.47
284 0.48
285 0.48
286 0.43
287 0.38
288 0.31
289 0.27
290 0.2
291 0.17
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.16
300 0.18
301 0.25
302 0.33
303 0.41
304 0.5
305 0.58
306 0.66
307 0.75
308 0.8
309 0.76
310 0.77
311 0.79
312 0.77
313 0.79
314 0.79