Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IHF9

Protein Details
Accession A0A1Y2IHF9    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-57AVVRDPRKETKVKRLPPLRPQRTELHydrophilic
170-198AELDARRRHEREEKRRREKEKEEKEKAGHBasic
579-601EVVEERPKKKPRKAVPKKVVVEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-197RRRHEREEKRRREKEKEEKEKAG
584-596RPKKKPRKAVPKK
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 14.333, nucl 6, mito_nucl 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024657  COMPASS_Set1_N-SET  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR003616  Post-SET_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR044570  Set1-like  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR037841  SET_SETD1A/B  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0140999  F:histone H3K4 trimethyltransferase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051568  P:histone H3-K4 methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11764  N-SET  
PF00076  RRM_1  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50868  POST_SET  
PS50102  RRM  
PS50280  SET  
CDD cd19169  SET_SETD1  
Amino Acid Sequences MDQGEEPRVKGKGKGKEIIVRYAGEVIEGEHEAVVRDPRKETKVKRLPPLRPQRTELLACKYEYDANSTGPPPPVSVLILGISPLMPNQHIRRHFGVHGTITSFEPQIDKSSGGALGIVFIRYTTHEEAKKCVQSEHGKKLSLAVPGVGEGEELRVVFDGEGKLLKAVLAELDARRRHEREEKRRREKEKEEKEKAGHASSHLKATPTSSASQTPVHANNPWRSGLQPGPRPQHALPRPPPPNAGLPMRPQGATPMAISPAPDKGSPLPNATPTGPRNGAVPPPSRGRRPAPALFRARNLHAIKAVPAPEIRPPIHLFPNGIEAGPVLPPSLRLGFDERDIPTPFLPSRSPSPVSRRPGQWGRNAKKVDYDVVKAELAKNGFEHIAIDGHVASVREDEVRKFVEGFEVDQILRDRHSWYVTFKTSDSARRASLVLNTSGRKLANYSVTVTVRPAPNHIPSAHKTQWTDSELVEQAEKTILRDLRALLEKDVVERLVASQVRRLVLDHKSKKGVRAADLGADGHAPAVNDGLEGGKLLDKTGLRGLSFRKQKKRVREETAAAAAVESPAPSKADEEGEDEVVEERPKKKPRKAVPKKVVVEDKVIESEDEDAVALVPAVPPPRKRALSEASELDIPVKKKVKSQVLEDGATVPVPSKKSKKAHKDATLATREASTFEEVVHEVLPETLPSYEPPSVAQLRITPGLDSRPSTPASPTPAPAPPEMVVVNVPAIDPIAEGICDDDEDMYFAKLALERSLFGKSSEPEPDAEPEAEGPSPFRKHVTGSARTEGYYKISHTEKSAYVAQYVSRGVLNTAAVEAEQAPPQPAIQSSRSNRANARRRAQGLEEINQVQRAMALSKGEAAAPDSVKYNQLQTRKKHLRFARSPIHDWGLYAMEKISRGEMVIEYVGEVIRAQVADKREKAYERQGIGSSYLFRIDEDLVVDATKKGNLGRLINHSCDPNCTAKIITISGEKKIVIYAKQDIELGSEITYDYHFPIEQDKIPCLCGSAKCRGTLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.59
3 0.64
4 0.66
5 0.66
6 0.6
7 0.51
8 0.44
9 0.41
10 0.34
11 0.26
12 0.22
13 0.15
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.13
21 0.19
22 0.2
23 0.22
24 0.27
25 0.33
26 0.41
27 0.5
28 0.55
29 0.59
30 0.66
31 0.72
32 0.78
33 0.81
34 0.83
35 0.85
36 0.88
37 0.87
38 0.83
39 0.79
40 0.75
41 0.73
42 0.7
43 0.66
44 0.63
45 0.56
46 0.5
47 0.47
48 0.43
49 0.4
50 0.34
51 0.34
52 0.28
53 0.26
54 0.3
55 0.29
56 0.3
57 0.29
58 0.28
59 0.23
60 0.23
61 0.22
62 0.19
63 0.19
64 0.16
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.16
75 0.22
76 0.3
77 0.34
78 0.4
79 0.44
80 0.48
81 0.49
82 0.47
83 0.47
84 0.41
85 0.4
86 0.35
87 0.33
88 0.29
89 0.28
90 0.23
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.16
98 0.18
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.1
110 0.15
111 0.18
112 0.25
113 0.3
114 0.31
115 0.37
116 0.44
117 0.48
118 0.44
119 0.41
120 0.42
121 0.48
122 0.55
123 0.6
124 0.58
125 0.54
126 0.53
127 0.56
128 0.52
129 0.45
130 0.36
131 0.27
132 0.21
133 0.2
134 0.21
135 0.15
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.1
158 0.12
159 0.2
160 0.23
161 0.27
162 0.33
163 0.34
164 0.39
165 0.47
166 0.56
167 0.6
168 0.68
169 0.75
170 0.8
171 0.88
172 0.9
173 0.9
174 0.9
175 0.9
176 0.89
177 0.89
178 0.86
179 0.84
180 0.78
181 0.75
182 0.68
183 0.61
184 0.51
185 0.44
186 0.43
187 0.37
188 0.4
189 0.34
190 0.31
191 0.27
192 0.29
193 0.29
194 0.24
195 0.25
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.27
204 0.3
205 0.33
206 0.36
207 0.37
208 0.37
209 0.33
210 0.3
211 0.32
212 0.35
213 0.37
214 0.39
215 0.44
216 0.49
217 0.5
218 0.55
219 0.51
220 0.55
221 0.53
222 0.55
223 0.53
224 0.57
225 0.6
226 0.57
227 0.58
228 0.5
229 0.49
230 0.44
231 0.43
232 0.36
233 0.36
234 0.39
235 0.38
236 0.35
237 0.29
238 0.28
239 0.25
240 0.22
241 0.19
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.23
253 0.24
254 0.27
255 0.26
256 0.27
257 0.3
258 0.29
259 0.32
260 0.28
261 0.32
262 0.29
263 0.27
264 0.26
265 0.26
266 0.29
267 0.27
268 0.29
269 0.27
270 0.34
271 0.38
272 0.4
273 0.44
274 0.44
275 0.47
276 0.51
277 0.54
278 0.53
279 0.57
280 0.62
281 0.59
282 0.6
283 0.55
284 0.5
285 0.52
286 0.46
287 0.39
288 0.33
289 0.31
290 0.28
291 0.28
292 0.27
293 0.2
294 0.19
295 0.18
296 0.2
297 0.25
298 0.23
299 0.23
300 0.24
301 0.27
302 0.31
303 0.31
304 0.27
305 0.23
306 0.27
307 0.23
308 0.21
309 0.17
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.08
318 0.1
319 0.09
320 0.11
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.2
325 0.2
326 0.22
327 0.23
328 0.23
329 0.19
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.18
335 0.21
336 0.25
337 0.28
338 0.3
339 0.38
340 0.44
341 0.49
342 0.51
343 0.49
344 0.52
345 0.57
346 0.58
347 0.59
348 0.61
349 0.6
350 0.63
351 0.62
352 0.54
353 0.5
354 0.46
355 0.43
356 0.35
357 0.32
358 0.25
359 0.25
360 0.25
361 0.21
362 0.2
363 0.18
364 0.15
365 0.14
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.14
397 0.15
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.14
404 0.13
405 0.16
406 0.21
407 0.22
408 0.23
409 0.21
410 0.23
411 0.24
412 0.29
413 0.29
414 0.26
415 0.24
416 0.24
417 0.24
418 0.22
419 0.23
420 0.19
421 0.18
422 0.19
423 0.19
424 0.19
425 0.2
426 0.19
427 0.16
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.15
432 0.17
433 0.19
434 0.19
435 0.19
436 0.19
437 0.2
438 0.19
439 0.18
440 0.19
441 0.18
442 0.2
443 0.22
444 0.22
445 0.24
446 0.24
447 0.32
448 0.32
449 0.32
450 0.3
451 0.29
452 0.33
453 0.31
454 0.3
455 0.21
456 0.22
457 0.2
458 0.19
459 0.18
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.07
465 0.11
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.16
471 0.19
472 0.2
473 0.15
474 0.17
475 0.16
476 0.16
477 0.16
478 0.12
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.09
483 0.11
484 0.1
485 0.12
486 0.14
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.15
491 0.21
492 0.31
493 0.33
494 0.34
495 0.4
496 0.41
497 0.44
498 0.45
499 0.4
500 0.32
501 0.32
502 0.29
503 0.24
504 0.24
505 0.2
506 0.15
507 0.13
508 0.1
509 0.06
510 0.06
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.08
525 0.07
526 0.09
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.13
531 0.17
532 0.22
533 0.31
534 0.38
535 0.45
536 0.53
537 0.59
538 0.68
539 0.76
540 0.76
541 0.76
542 0.74
543 0.67
544 0.62
545 0.58
546 0.47
547 0.36
548 0.27
549 0.19
550 0.13
551 0.1
552 0.06
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.09
561 0.11
562 0.12
563 0.12
564 0.12
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.19
572 0.28
573 0.36
574 0.42
575 0.51
576 0.61
577 0.7
578 0.79
579 0.82
580 0.83
581 0.85
582 0.82
583 0.78
584 0.74
585 0.64
586 0.56
587 0.46
588 0.37
589 0.28
590 0.25
591 0.19
592 0.13
593 0.13
594 0.09
595 0.08
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.04
601 0.03
602 0.03
603 0.05
604 0.08
605 0.1
606 0.12
607 0.16
608 0.23
609 0.25
610 0.26
611 0.31
612 0.34
613 0.36
614 0.38
615 0.35
616 0.3
617 0.29
618 0.27
619 0.23
620 0.2
621 0.17
622 0.19
623 0.23
624 0.22
625 0.26
626 0.34
627 0.41
628 0.41
629 0.45
630 0.49
631 0.48
632 0.48
633 0.43
634 0.37
635 0.28
636 0.25
637 0.2
638 0.11
639 0.1
640 0.11
641 0.16
642 0.2
643 0.29
644 0.37
645 0.47
646 0.57
647 0.64
648 0.72
649 0.75
650 0.76
651 0.74
652 0.74
653 0.69
654 0.59
655 0.49
656 0.4
657 0.32
658 0.26
659 0.22
660 0.15
661 0.11
662 0.1
663 0.11
664 0.1
665 0.11
666 0.1
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.05
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.11
677 0.12
678 0.12
679 0.13
680 0.17
681 0.18
682 0.18
683 0.18
684 0.16
685 0.18
686 0.2
687 0.2
688 0.15
689 0.14
690 0.18
691 0.19
692 0.18
693 0.18
694 0.19
695 0.2
696 0.2
697 0.22
698 0.21
699 0.27
700 0.27
701 0.25
702 0.25
703 0.28
704 0.3
705 0.28
706 0.27
707 0.2
708 0.21
709 0.2
710 0.17
711 0.13
712 0.11
713 0.11
714 0.08
715 0.07
716 0.05
717 0.05
718 0.04
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.06
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.07
736 0.08
737 0.09
738 0.11
739 0.11
740 0.11
741 0.13
742 0.16
743 0.15
744 0.14
745 0.17
746 0.17
747 0.2
748 0.23
749 0.22
750 0.21
751 0.22
752 0.24
753 0.23
754 0.22
755 0.18
756 0.15
757 0.16
758 0.15
759 0.13
760 0.13
761 0.15
762 0.17
763 0.18
764 0.19
765 0.19
766 0.21
767 0.3
768 0.36
769 0.39
770 0.42
771 0.46
772 0.44
773 0.44
774 0.42
775 0.35
776 0.3
777 0.24
778 0.2
779 0.2
780 0.21
781 0.22
782 0.23
783 0.26
784 0.23
785 0.26
786 0.3
787 0.26
788 0.25
789 0.24
790 0.22
791 0.21
792 0.2
793 0.17
794 0.12
795 0.12
796 0.11
797 0.12
798 0.12
799 0.09
800 0.09
801 0.08
802 0.07
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.09
807 0.09
808 0.1
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.13
813 0.16
814 0.19
815 0.28
816 0.31
817 0.4
818 0.44
819 0.46
820 0.51
821 0.57
822 0.63
823 0.63
824 0.65
825 0.64
826 0.65
827 0.65
828 0.62
829 0.6
830 0.55
831 0.5
832 0.48
833 0.43
834 0.4
835 0.37
836 0.33
837 0.24
838 0.2
839 0.17
840 0.13
841 0.11
842 0.11
843 0.1
844 0.12
845 0.13
846 0.12
847 0.11
848 0.12
849 0.14
850 0.14
851 0.14
852 0.15
853 0.16
854 0.18
855 0.19
856 0.24
857 0.26
858 0.35
859 0.42
860 0.46
861 0.56
862 0.65
863 0.68
864 0.71
865 0.73
866 0.75
867 0.75
868 0.78
869 0.77
870 0.73
871 0.73
872 0.69
873 0.66
874 0.55
875 0.47
876 0.4
877 0.33
878 0.26
879 0.22
880 0.18
881 0.15
882 0.15
883 0.16
884 0.15
885 0.11
886 0.11
887 0.13
888 0.12
889 0.13
890 0.12
891 0.11
892 0.1
893 0.11
894 0.1
895 0.08
896 0.08
897 0.06
898 0.07
899 0.07
900 0.07
901 0.11
902 0.16
903 0.24
904 0.27
905 0.3
906 0.34
907 0.38
908 0.43
909 0.49
910 0.52
911 0.47
912 0.48
913 0.47
914 0.43
915 0.42
916 0.38
917 0.31
918 0.24
919 0.23
920 0.19
921 0.17
922 0.18
923 0.17
924 0.16
925 0.14
926 0.14
927 0.13
928 0.13
929 0.14
930 0.12
931 0.12
932 0.12
933 0.12
934 0.12
935 0.18
936 0.23
937 0.26
938 0.31
939 0.39
940 0.44
941 0.46
942 0.47
943 0.47
944 0.42
945 0.43
946 0.41
947 0.37
948 0.33
949 0.31
950 0.3
951 0.27
952 0.3
953 0.27
954 0.25
955 0.28
956 0.29
957 0.3
958 0.31
959 0.28
960 0.26
961 0.28
962 0.29
963 0.24
964 0.27
965 0.31
966 0.32
967 0.33
968 0.34
969 0.3
970 0.29
971 0.27
972 0.23
973 0.16
974 0.13
975 0.12
976 0.12
977 0.13
978 0.11
979 0.11
980 0.12
981 0.12
982 0.12
983 0.18
984 0.22
985 0.27
986 0.29
987 0.33
988 0.32
989 0.34
990 0.33
991 0.3
992 0.31
993 0.32
994 0.35
995 0.4
996 0.42