Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ITV5

Protein Details
Accession A0A1Y2ITV5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-217LDHPHPHPSHHQHQHHHQQQBasic
255-277FYPYTPNEVKHRKRTTRAQLKVLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, extr 5, mito 2, cyto 2, plas 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MFVPAIHHPSLHICPLSHLSITTIIINIVQTIINPSVALSVASATAISPSSRPFLAPPPPHLPSSSSSHLVLFPRLPSQSRASLPLLSSPRHPSPPLSLLARLLAHARPLARLPQMLSHTRPPHSPSSADPALNPPQHDLSRPHPTHPALYHVVPHHSLPHNAVHHHPFPIPAQSSPNALDHHPHHHHHHQQQQLHPLDHPHPHPSHHQHQHHHQQQQQQQQQQQHHHHPQHNQTCVPALIPPGMDPSQVDIRTFYPYTPNEVKHRKRTTRAQLKVLEGVYKYDTKPNASLRKKLAAELDMTPRGVQVWFQNRRAKTKQQVKKAEAAAAAAGPSTSPTDDGDEDEGSSALASNAPSGPRLSSEGVPTGEDGTDANPSEDPSSALASSPRAVPPKRSEDTAPENRSSPTAIPPPPPPPHPTDDASATSTSAPNAQLDPNGDRAFPQADSRRGSLAHSSPAWSASSPSVSTAPPSAPTPSSSALGSPSPANHANNSHVRVSTHPPSAGSPYSHNHLAPTDVYSQRRTSLPPSLSSSLSGHGMGLSMMSSLRRRGAGGYDPNIRRRSTDMGGHRIVAHPYISVAQSANGAHHHLYADGDDAAHPQQQIRRPMLSQRMTAPFGANTPGSHAMHSPQSLHPHTHSQPILPSQAHRAEASQQYDVSPIQVSMSHSQGYNPPMGNGNGHGYDIFAPRHSIDGSALGLTHAHAQMSMMHPGSPSMEHDGFSMGMGSMPDTSARHYAISQRPMPAPIPGPLPSPNFSFGNPFGPAAGAANSSSSNSSTSNSASGTPPNVFSPPLLSLRRTSESGVSDGDTEESSGAPLSRFGSIASINGSEASWTSAYPSEGEEGDIAASRRLSCASEFLGMFSEMDVGSNGGTPAPHGMQEQHQLRHSNSSSHLSPHSYPQGQTHSPDALAAAAQQQQQQQQMQGSSDADGYPSPSSASTISAGSNHGNDGSHQHTLSHDTTSVGSASGANHMQGQAHLRTNTSSELAYALQGDHQPSHVYQQHPQAATSKEDNNLQYPVYEPQMTDAGDANSGESMSYGYAQDQSHHAHRDYAKIGHFPTVYEGYVYPHNGAEGQIPEEDASAMNDAYAAGAIELTHMCVPASEFMGGGYMQYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.33
4 0.28
5 0.25
6 0.22
7 0.23
8 0.24
9 0.2
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.11
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.18
41 0.25
42 0.34
43 0.38
44 0.43
45 0.48
46 0.5
47 0.51
48 0.5
49 0.45
50 0.39
51 0.41
52 0.39
53 0.34
54 0.32
55 0.32
56 0.35
57 0.34
58 0.33
59 0.28
60 0.25
61 0.27
62 0.3
63 0.31
64 0.31
65 0.34
66 0.37
67 0.37
68 0.4
69 0.38
70 0.38
71 0.36
72 0.4
73 0.39
74 0.34
75 0.36
76 0.38
77 0.41
78 0.43
79 0.44
80 0.39
81 0.42
82 0.45
83 0.46
84 0.42
85 0.38
86 0.34
87 0.36
88 0.33
89 0.26
90 0.24
91 0.2
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.2
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.3
102 0.34
103 0.38
104 0.4
105 0.44
106 0.47
107 0.47
108 0.49
109 0.48
110 0.49
111 0.48
112 0.45
113 0.39
114 0.42
115 0.45
116 0.41
117 0.37
118 0.36
119 0.41
120 0.41
121 0.39
122 0.33
123 0.34
124 0.35
125 0.38
126 0.37
127 0.36
128 0.44
129 0.45
130 0.44
131 0.46
132 0.47
133 0.49
134 0.46
135 0.45
136 0.39
137 0.38
138 0.4
139 0.36
140 0.37
141 0.32
142 0.31
143 0.32
144 0.31
145 0.31
146 0.29
147 0.34
148 0.33
149 0.34
150 0.39
151 0.38
152 0.37
153 0.38
154 0.36
155 0.31
156 0.29
157 0.35
158 0.32
159 0.27
160 0.29
161 0.28
162 0.3
163 0.3
164 0.31
165 0.25
166 0.24
167 0.28
168 0.26
169 0.34
170 0.37
171 0.39
172 0.43
173 0.51
174 0.6
175 0.63
176 0.68
177 0.67
178 0.68
179 0.69
180 0.71
181 0.67
182 0.59
183 0.52
184 0.49
185 0.45
186 0.45
187 0.42
188 0.4
189 0.36
190 0.38
191 0.46
192 0.49
193 0.55
194 0.59
195 0.64
196 0.64
197 0.73
198 0.81
199 0.79
200 0.79
201 0.73
202 0.72
203 0.71
204 0.74
205 0.72
206 0.68
207 0.66
208 0.66
209 0.69
210 0.69
211 0.7
212 0.69
213 0.71
214 0.73
215 0.73
216 0.73
217 0.76
218 0.75
219 0.72
220 0.62
221 0.53
222 0.48
223 0.41
224 0.34
225 0.25
226 0.18
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.16
235 0.22
236 0.22
237 0.22
238 0.19
239 0.2
240 0.25
241 0.25
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.3
246 0.34
247 0.37
248 0.41
249 0.51
250 0.58
251 0.62
252 0.71
253 0.72
254 0.74
255 0.81
256 0.83
257 0.83
258 0.82
259 0.79
260 0.74
261 0.69
262 0.66
263 0.56
264 0.48
265 0.38
266 0.33
267 0.28
268 0.25
269 0.23
270 0.24
271 0.25
272 0.25
273 0.3
274 0.36
275 0.44
276 0.46
277 0.51
278 0.5
279 0.57
280 0.54
281 0.52
282 0.47
283 0.38
284 0.36
285 0.33
286 0.35
287 0.28
288 0.28
289 0.25
290 0.21
291 0.2
292 0.17
293 0.14
294 0.16
295 0.25
296 0.31
297 0.38
298 0.45
299 0.47
300 0.55
301 0.6
302 0.62
303 0.62
304 0.66
305 0.68
306 0.71
307 0.78
308 0.73
309 0.75
310 0.68
311 0.61
312 0.51
313 0.43
314 0.33
315 0.23
316 0.19
317 0.12
318 0.09
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.08
334 0.08
335 0.06
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.18
351 0.18
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.12
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.1
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.14
376 0.19
377 0.19
378 0.25
379 0.31
380 0.38
381 0.39
382 0.4
383 0.38
384 0.39
385 0.47
386 0.51
387 0.48
388 0.41
389 0.41
390 0.39
391 0.38
392 0.33
393 0.24
394 0.2
395 0.23
396 0.24
397 0.25
398 0.28
399 0.35
400 0.36
401 0.38
402 0.37
403 0.35
404 0.36
405 0.37
406 0.36
407 0.31
408 0.31
409 0.3
410 0.29
411 0.24
412 0.21
413 0.17
414 0.16
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.13
423 0.14
424 0.17
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.16
429 0.16
430 0.14
431 0.19
432 0.19
433 0.23
434 0.26
435 0.27
436 0.26
437 0.25
438 0.26
439 0.25
440 0.21
441 0.2
442 0.18
443 0.18
444 0.17
445 0.18
446 0.17
447 0.13
448 0.12
449 0.1
450 0.11
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.11
462 0.13
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.1
472 0.09
473 0.11
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.16
478 0.2
479 0.24
480 0.26
481 0.24
482 0.22
483 0.22
484 0.23
485 0.27
486 0.27
487 0.25
488 0.22
489 0.22
490 0.22
491 0.25
492 0.24
493 0.19
494 0.17
495 0.17
496 0.2
497 0.2
498 0.19
499 0.16
500 0.15
501 0.15
502 0.12
503 0.13
504 0.15
505 0.17
506 0.19
507 0.21
508 0.21
509 0.22
510 0.22
511 0.21
512 0.2
513 0.24
514 0.24
515 0.24
516 0.28
517 0.28
518 0.28
519 0.28
520 0.25
521 0.18
522 0.18
523 0.15
524 0.1
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.05
529 0.04
530 0.03
531 0.03
532 0.04
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.09
539 0.11
540 0.16
541 0.18
542 0.21
543 0.28
544 0.3
545 0.35
546 0.37
547 0.35
548 0.3
549 0.3
550 0.31
551 0.25
552 0.3
553 0.29
554 0.32
555 0.33
556 0.32
557 0.3
558 0.26
559 0.24
560 0.18
561 0.13
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.05
584 0.06
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.12
590 0.18
591 0.23
592 0.24
593 0.25
594 0.25
595 0.3
596 0.38
597 0.37
598 0.33
599 0.32
600 0.34
601 0.33
602 0.33
603 0.28
604 0.19
605 0.17
606 0.17
607 0.13
608 0.09
609 0.11
610 0.15
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.16
616 0.17
617 0.16
618 0.14
619 0.2
620 0.21
621 0.22
622 0.23
623 0.27
624 0.28
625 0.32
626 0.3
627 0.25
628 0.25
629 0.26
630 0.28
631 0.21
632 0.21
633 0.2
634 0.22
635 0.22
636 0.2
637 0.19
638 0.2
639 0.24
640 0.26
641 0.22
642 0.19
643 0.18
644 0.19
645 0.18
646 0.14
647 0.1
648 0.07
649 0.07
650 0.09
651 0.11
652 0.11
653 0.13
654 0.13
655 0.13
656 0.13
657 0.17
658 0.17
659 0.17
660 0.15
661 0.15
662 0.16
663 0.17
664 0.16
665 0.14
666 0.15
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.09
671 0.11
672 0.13
673 0.12
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.12
678 0.12
679 0.1
680 0.09
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.08
689 0.07
690 0.07
691 0.06
692 0.07
693 0.09
694 0.11
695 0.13
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.12
701 0.1
702 0.1
703 0.13
704 0.14
705 0.14
706 0.14
707 0.15
708 0.14
709 0.13
710 0.12
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.08
720 0.1
721 0.11
722 0.11
723 0.12
724 0.2
725 0.25
726 0.31
727 0.31
728 0.33
729 0.33
730 0.34
731 0.34
732 0.29
733 0.24
734 0.2
735 0.21
736 0.18
737 0.2
738 0.21
739 0.23
740 0.23
741 0.23
742 0.24
743 0.22
744 0.21
745 0.23
746 0.21
747 0.22
748 0.21
749 0.19
750 0.16
751 0.15
752 0.14
753 0.11
754 0.1
755 0.07
756 0.06
757 0.07
758 0.07
759 0.08
760 0.09
761 0.08
762 0.09
763 0.09
764 0.1
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.12
769 0.14
770 0.14
771 0.15
772 0.16
773 0.15
774 0.16
775 0.16
776 0.16
777 0.15
778 0.14
779 0.15
780 0.15
781 0.2
782 0.21
783 0.21
784 0.23
785 0.27
786 0.3
787 0.29
788 0.27
789 0.26
790 0.26
791 0.26
792 0.24
793 0.19
794 0.17
795 0.16
796 0.15
797 0.11
798 0.09
799 0.08
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.08
807 0.08
808 0.09
809 0.09
810 0.1
811 0.1
812 0.11
813 0.11
814 0.11
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.08
819 0.08
820 0.09
821 0.08
822 0.07
823 0.09
824 0.1
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.11
829 0.11
830 0.12
831 0.1
832 0.09
833 0.09
834 0.1
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.09
839 0.1
840 0.11
841 0.12
842 0.11
843 0.13
844 0.14
845 0.16
846 0.16
847 0.16
848 0.17
849 0.16
850 0.15
851 0.12
852 0.11
853 0.08
854 0.08
855 0.08
856 0.06
857 0.06
858 0.06
859 0.06
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.08
864 0.09
865 0.1
866 0.1
867 0.12
868 0.16
869 0.25
870 0.3
871 0.31
872 0.35
873 0.37
874 0.38
875 0.44
876 0.42
877 0.37
878 0.35
879 0.37
880 0.34
881 0.34
882 0.35
883 0.31
884 0.31
885 0.34
886 0.38
887 0.35
888 0.35
889 0.36
890 0.41
891 0.39
892 0.4
893 0.37
894 0.3
895 0.27
896 0.26
897 0.22
898 0.14
899 0.12
900 0.11
901 0.1
902 0.12
903 0.14
904 0.17
905 0.2
906 0.23
907 0.27
908 0.29
909 0.29
910 0.28
911 0.28
912 0.27
913 0.26
914 0.23
915 0.19
916 0.18
917 0.15
918 0.13
919 0.11
920 0.12
921 0.11
922 0.1
923 0.1
924 0.09
925 0.11
926 0.11
927 0.13
928 0.12
929 0.12
930 0.13
931 0.13
932 0.15
933 0.15
934 0.15
935 0.13
936 0.13
937 0.13
938 0.13
939 0.17
940 0.18
941 0.2
942 0.19
943 0.19
944 0.2
945 0.25
946 0.26
947 0.23
948 0.2
949 0.18
950 0.18
951 0.19
952 0.18
953 0.12
954 0.11
955 0.1
956 0.1
957 0.13
958 0.13
959 0.12
960 0.13
961 0.13
962 0.13
963 0.14
964 0.18
965 0.19
966 0.24
967 0.24
968 0.24
969 0.25
970 0.26
971 0.27
972 0.23
973 0.19
974 0.14
975 0.15
976 0.14
977 0.14
978 0.12
979 0.1
980 0.12
981 0.14
982 0.15
983 0.14
984 0.15
985 0.17
986 0.17
987 0.24
988 0.27
989 0.28
990 0.32
991 0.4
992 0.47
993 0.45
994 0.46
995 0.44
996 0.41
997 0.42
998 0.42
999 0.36
1000 0.32
1001 0.37
1002 0.38
1003 0.35
1004 0.34
1005 0.3
1006 0.25
1007 0.24
1008 0.24
1009 0.23
1010 0.21
1011 0.18
1012 0.19
1013 0.23
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.2
1017 0.17
1018 0.17
1019 0.17
1020 0.15
1021 0.12
1022 0.11
1023 0.1
1024 0.08
1025 0.07
1026 0.06
1027 0.08
1028 0.08
1029 0.09
1030 0.13
1031 0.14
1032 0.16
1033 0.19
1034 0.24
1035 0.29
1036 0.33
1037 0.33
1038 0.36
1039 0.38
1040 0.43
1041 0.44
1042 0.44
1043 0.41
1044 0.41
1045 0.41
1046 0.4
1047 0.38
1048 0.32
1049 0.33
1050 0.31
1051 0.27
1052 0.24
1053 0.23
1054 0.2
1055 0.24
1056 0.26
1057 0.21
1058 0.18
1059 0.19
1060 0.18
1061 0.18
1062 0.19
1063 0.17
1064 0.17
1065 0.16
1066 0.17
1067 0.16
1068 0.16
1069 0.16
1070 0.12
1071 0.11
1072 0.11
1073 0.1
1074 0.09
1075 0.09
1076 0.08
1077 0.08
1078 0.07
1079 0.06
1080 0.04
1081 0.05
1082 0.05
1083 0.06
1084 0.07
1085 0.09
1086 0.09
1087 0.09
1088 0.09
1089 0.1
1090 0.12
1091 0.13
1092 0.15
1093 0.13
1094 0.12
1095 0.12
1096 0.13
1097 0.13