Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IDX3

Protein Details
Accession A0A1Y2IDX3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1073-1092MKFTLFTKRGNKPQTRQIAIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences METATNGHVQARIDEEQARRAKRAALKELNTNEAGKEPSKALDSSLKRHTALIKRARQSVGAENHDQILKDIDSLSLEKYVDEIVGAVAEGISRCKTEKDVWSAVEIISALHRRFPKTFTPALISSLSASLTPPSRAALASLSPEQREKEDSSRVARQRPVLRVCAELALVGIIRDGPDRSGGEWIMKTIRDLLSNDPSLSSLPLLLVFLKSYSRPYLGIIPPAASKQVAASSEQGTLSEAASEEATQANGVGAFPPITIEGEELVEKEIRDRFKKMCEGYFENVAKKLVIEHDRLQEQDRRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLASCQSLSELLYLPMPTLKTATQKTESIQIGMNTGSSILGADGEDTTAGGKWEDEEERRFYEEIPDLKDYVPRSVLGLEGDGGEETDDGKERERIEKEMVEEEFRKLEEELADMKIDEDGQTASGERGKKQDEGTTEEDGDDAPTPTPGTPKDSPSSTPQLAPQGPSQLLTALLARLPDATNRSMIDQAAVDFAFLNSKAARKRLVKFMSQIPKSRTDLLPHYSRLIAILNRYMPDIGTDIVAMLDEEFRYLQRKKNVVKELSEVRLRNITFLSNLTKFRVVPPHVILHMFKVCLDDFSGTNVENLALLLEGCGRFLLRSEETRVPFAKMLELMRRKQSMAHLDQRQLLLLENAYYQCNPPERTARQVKERTPMELFIRHLIYDVLTKKTIDKVLKLLRKLDWNDQVVLRTLHKVFTKPWKIKYSHISLLAMLTYDLHRYHPAFSIGVVDQVLENIRRGLETNMYSMNQRRIASIKYLGELYIYRLINSSIIFDTLWTLVTFGHPEGRPTPGQLSPIDMPDDFFRIRLVCVLLDTCGMCFDRGPHEKKLDNFLTFFQMYILSKDPLPMDVEFMLNDSLEAVRPKLVIFKTYEEAATAVDEMFAVALQNAGIVTGDVGEDSGEESGEEDEEDERGEREDEEEEEMAQGDDEIHERAPSPEAVLLKSKQEFVGPTEEDEAEFAKELAKLVTDTSAESRKIDKKTALALWDTALPPPVVRKKKNEEYDEDGEGATGDANEDAGVMKFTLFTKRGNKPQTRQIAIPAESALAVQTRTAQMQDKVEQQHLKRLVLNYEQREEAEELKALEARSRQGPIKIRLAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.36
4 0.43
5 0.44
6 0.42
7 0.41
8 0.47
9 0.48
10 0.55
11 0.57
12 0.59
13 0.59
14 0.66
15 0.68
16 0.65
17 0.6
18 0.51
19 0.42
20 0.35
21 0.35
22 0.27
23 0.25
24 0.22
25 0.22
26 0.24
27 0.24
28 0.24
29 0.3
30 0.34
31 0.38
32 0.45
33 0.46
34 0.44
35 0.47
36 0.52
37 0.52
38 0.57
39 0.61
40 0.62
41 0.63
42 0.69
43 0.68
44 0.62
45 0.57
46 0.56
47 0.55
48 0.52
49 0.49
50 0.44
51 0.45
52 0.43
53 0.39
54 0.3
55 0.26
56 0.2
57 0.17
58 0.17
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.17
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.04
76 0.05
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.13
83 0.18
84 0.24
85 0.31
86 0.37
87 0.42
88 0.42
89 0.43
90 0.42
91 0.38
92 0.32
93 0.24
94 0.16
95 0.17
96 0.21
97 0.18
98 0.23
99 0.27
100 0.3
101 0.33
102 0.37
103 0.4
104 0.42
105 0.46
106 0.44
107 0.47
108 0.43
109 0.44
110 0.41
111 0.33
112 0.27
113 0.23
114 0.2
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.17
128 0.22
129 0.24
130 0.24
131 0.27
132 0.27
133 0.28
134 0.3
135 0.31
136 0.32
137 0.37
138 0.4
139 0.43
140 0.51
141 0.55
142 0.57
143 0.57
144 0.59
145 0.6
146 0.64
147 0.63
148 0.59
149 0.55
150 0.51
151 0.47
152 0.4
153 0.32
154 0.23
155 0.18
156 0.13
157 0.11
158 0.08
159 0.07
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.16
169 0.16
170 0.19
171 0.19
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.2
177 0.21
178 0.21
179 0.22
180 0.26
181 0.3
182 0.32
183 0.31
184 0.27
185 0.26
186 0.23
187 0.22
188 0.17
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.26
205 0.27
206 0.3
207 0.28
208 0.26
209 0.26
210 0.26
211 0.25
212 0.17
213 0.15
214 0.11
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.16
257 0.21
258 0.24
259 0.28
260 0.3
261 0.36
262 0.44
263 0.45
264 0.45
265 0.46
266 0.48
267 0.47
268 0.53
269 0.48
270 0.43
271 0.41
272 0.36
273 0.29
274 0.24
275 0.22
276 0.2
277 0.22
278 0.24
279 0.27
280 0.32
281 0.34
282 0.35
283 0.37
284 0.37
285 0.38
286 0.42
287 0.42
288 0.45
289 0.44
290 0.46
291 0.45
292 0.44
293 0.42
294 0.4
295 0.37
296 0.29
297 0.28
298 0.26
299 0.25
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.19
304 0.2
305 0.22
306 0.22
307 0.24
308 0.28
309 0.26
310 0.23
311 0.26
312 0.27
313 0.27
314 0.32
315 0.33
316 0.29
317 0.29
318 0.3
319 0.3
320 0.3
321 0.28
322 0.23
323 0.19
324 0.17
325 0.16
326 0.13
327 0.1
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.08
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.17
338 0.19
339 0.24
340 0.26
341 0.27
342 0.28
343 0.34
344 0.32
345 0.27
346 0.27
347 0.22
348 0.2
349 0.18
350 0.17
351 0.09
352 0.09
353 0.07
354 0.05
355 0.05
356 0.03
357 0.04
358 0.03
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.08
371 0.11
372 0.13
373 0.16
374 0.19
375 0.21
376 0.23
377 0.23
378 0.2
379 0.23
380 0.25
381 0.25
382 0.26
383 0.25
384 0.24
385 0.24
386 0.27
387 0.23
388 0.2
389 0.19
390 0.15
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.11
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.08
408 0.11
409 0.12
410 0.19
411 0.2
412 0.23
413 0.25
414 0.26
415 0.27
416 0.28
417 0.27
418 0.24
419 0.24
420 0.22
421 0.2
422 0.18
423 0.17
424 0.13
425 0.13
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.1
443 0.11
444 0.12
445 0.16
446 0.17
447 0.2
448 0.21
449 0.24
450 0.23
451 0.28
452 0.3
453 0.28
454 0.26
455 0.24
456 0.22
457 0.18
458 0.17
459 0.11
460 0.08
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.15
468 0.17
469 0.2
470 0.22
471 0.23
472 0.25
473 0.29
474 0.34
475 0.28
476 0.27
477 0.26
478 0.29
479 0.28
480 0.28
481 0.24
482 0.21
483 0.2
484 0.2
485 0.18
486 0.12
487 0.12
488 0.1
489 0.09
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.12
501 0.13
502 0.13
503 0.12
504 0.11
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.09
517 0.11
518 0.13
519 0.19
520 0.24
521 0.27
522 0.36
523 0.38
524 0.38
525 0.39
526 0.46
527 0.49
528 0.47
529 0.49
530 0.43
531 0.45
532 0.44
533 0.44
534 0.37
535 0.31
536 0.32
537 0.31
538 0.32
539 0.28
540 0.27
541 0.23
542 0.22
543 0.19
544 0.17
545 0.13
546 0.11
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.09
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.04
567 0.04
568 0.09
569 0.11
570 0.16
571 0.22
572 0.29
573 0.33
574 0.42
575 0.49
576 0.48
577 0.48
578 0.47
579 0.45
580 0.43
581 0.43
582 0.34
583 0.28
584 0.29
585 0.27
586 0.24
587 0.2
588 0.16
589 0.13
590 0.14
591 0.17
592 0.15
593 0.16
594 0.17
595 0.18
596 0.17
597 0.19
598 0.25
599 0.23
600 0.24
601 0.25
602 0.26
603 0.25
604 0.26
605 0.24
606 0.19
607 0.19
608 0.15
609 0.13
610 0.13
611 0.12
612 0.11
613 0.11
614 0.09
615 0.08
616 0.1
617 0.11
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.08
622 0.07
623 0.07
624 0.04
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.05
635 0.09
636 0.1
637 0.12
638 0.17
639 0.23
640 0.24
641 0.27
642 0.27
643 0.25
644 0.25
645 0.23
646 0.19
647 0.16
648 0.16
649 0.22
650 0.26
651 0.27
652 0.3
653 0.31
654 0.3
655 0.3
656 0.34
657 0.33
658 0.35
659 0.41
660 0.4
661 0.41
662 0.43
663 0.41
664 0.36
665 0.28
666 0.22
667 0.14
668 0.1
669 0.08
670 0.07
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.11
676 0.15
677 0.16
678 0.18
679 0.25
680 0.26
681 0.34
682 0.43
683 0.44
684 0.49
685 0.54
686 0.55
687 0.56
688 0.55
689 0.5
690 0.43
691 0.42
692 0.36
693 0.33
694 0.3
695 0.25
696 0.24
697 0.2
698 0.19
699 0.16
700 0.14
701 0.15
702 0.16
703 0.16
704 0.16
705 0.16
706 0.17
707 0.2
708 0.25
709 0.22
710 0.22
711 0.27
712 0.35
713 0.4
714 0.41
715 0.41
716 0.38
717 0.43
718 0.45
719 0.45
720 0.43
721 0.4
722 0.4
723 0.37
724 0.36
725 0.3
726 0.28
727 0.22
728 0.18
729 0.17
730 0.19
731 0.19
732 0.2
733 0.22
734 0.32
735 0.41
736 0.42
737 0.5
738 0.54
739 0.55
740 0.59
741 0.62
742 0.59
743 0.53
744 0.51
745 0.44
746 0.36
747 0.34
748 0.28
749 0.21
750 0.13
751 0.09
752 0.07
753 0.08
754 0.08
755 0.09
756 0.11
757 0.12
758 0.14
759 0.16
760 0.17
761 0.15
762 0.15
763 0.17
764 0.15
765 0.15
766 0.13
767 0.1
768 0.08
769 0.09
770 0.1
771 0.07
772 0.08
773 0.07
774 0.07
775 0.08
776 0.09
777 0.1
778 0.13
779 0.14
780 0.16
781 0.17
782 0.18
783 0.2
784 0.22
785 0.26
786 0.26
787 0.25
788 0.25
789 0.26
790 0.27
791 0.28
792 0.3
793 0.26
794 0.22
795 0.22
796 0.2
797 0.19
798 0.17
799 0.17
800 0.18
801 0.17
802 0.16
803 0.17
804 0.17
805 0.17
806 0.17
807 0.16
808 0.09
809 0.1
810 0.09
811 0.09
812 0.1
813 0.09
814 0.1
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.08
821 0.14
822 0.13
823 0.16
824 0.17
825 0.21
826 0.21
827 0.22
828 0.25
829 0.2
830 0.23
831 0.21
832 0.25
833 0.22
834 0.23
835 0.23
836 0.19
837 0.18
838 0.17
839 0.2
840 0.15
841 0.14
842 0.13
843 0.12
844 0.13
845 0.13
846 0.13
847 0.1
848 0.11
849 0.11
850 0.1
851 0.11
852 0.11
853 0.09
854 0.1
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.11
859 0.19
860 0.26
861 0.31
862 0.35
863 0.4
864 0.44
865 0.46
866 0.53
867 0.49
868 0.43
869 0.4
870 0.36
871 0.36
872 0.32
873 0.3
874 0.21
875 0.19
876 0.17
877 0.18
878 0.19
879 0.15
880 0.15
881 0.17
882 0.17
883 0.15
884 0.17
885 0.15
886 0.15
887 0.14
888 0.15
889 0.12
890 0.13
891 0.12
892 0.09
893 0.09
894 0.07
895 0.07
896 0.08
897 0.09
898 0.09
899 0.1
900 0.1
901 0.11
902 0.17
903 0.17
904 0.19
905 0.21
906 0.25
907 0.26
908 0.27
909 0.27
910 0.2
911 0.2
912 0.17
913 0.14
914 0.11
915 0.08
916 0.07
917 0.06
918 0.06
919 0.05
920 0.05
921 0.04
922 0.03
923 0.03
924 0.03
925 0.04
926 0.03
927 0.04
928 0.04
929 0.03
930 0.03
931 0.04
932 0.04
933 0.03
934 0.04
935 0.03
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.04
940 0.04
941 0.05
942 0.05
943 0.06
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.07
948 0.08
949 0.07
950 0.08
951 0.09
952 0.1
953 0.09
954 0.1
955 0.12
956 0.13
957 0.15
958 0.15
959 0.14
960 0.14
961 0.14
962 0.12
963 0.1
964 0.09
965 0.06
966 0.06
967 0.07
968 0.08
969 0.08
970 0.08
971 0.09
972 0.11
973 0.13
974 0.12
975 0.13
976 0.15
977 0.16
978 0.18
979 0.23
980 0.23
981 0.26
982 0.28
983 0.28
984 0.25
985 0.26
986 0.26
987 0.24
988 0.3
989 0.25
990 0.25
991 0.27
992 0.26
993 0.24
994 0.23
995 0.21
996 0.14
997 0.13
998 0.11
999 0.1
1000 0.1
1001 0.11
1002 0.1
1003 0.1
1004 0.1
1005 0.1
1006 0.13
1007 0.12
1008 0.13
1009 0.17
1010 0.22
1011 0.22
1012 0.23
1013 0.3
1014 0.34
1015 0.38
1016 0.42
1017 0.41
1018 0.4
1019 0.46
1020 0.48
1021 0.45
1022 0.4
1023 0.36
1024 0.32
1025 0.32
1026 0.29
1027 0.23
1028 0.2
1029 0.17
1030 0.15
1031 0.23
1032 0.32
1033 0.38
1034 0.43
1035 0.52
1036 0.6
1037 0.7
1038 0.79
1039 0.77
1040 0.75
1041 0.73
1042 0.72
1043 0.66
1044 0.57
1045 0.46
1046 0.36
1047 0.29
1048 0.22
1049 0.14
1050 0.09
1051 0.06
1052 0.05
1053 0.05
1054 0.05
1055 0.05
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.07
1059 0.06
1060 0.06
1061 0.08
1062 0.1
1063 0.17
1064 0.18
1065 0.25
1066 0.33
1067 0.42
1068 0.52
1069 0.61
1070 0.69
1071 0.68
1072 0.77
1073 0.8
1074 0.77
1075 0.7
1076 0.68
1077 0.66
1078 0.59
1079 0.53
1080 0.44
1081 0.34
1082 0.28
1083 0.26
1084 0.19
1085 0.12
1086 0.1
1087 0.09
1088 0.11
1089 0.13
1090 0.14
1091 0.17
1092 0.21
1093 0.24
1094 0.3
1095 0.34
1096 0.38
1097 0.41
1098 0.47
1099 0.52
1100 0.49
1101 0.54
1102 0.53
1103 0.52
1104 0.5
1105 0.49
1106 0.47
1107 0.49
1108 0.56
1109 0.53
1110 0.52
1111 0.51
1112 0.46
1113 0.46
1114 0.43
1115 0.36
1116 0.29
1117 0.25
1118 0.22
1119 0.22
1120 0.24
1121 0.2
1122 0.23
1123 0.23
1124 0.24
1125 0.27
1126 0.31
1127 0.33
1128 0.39
1129 0.47
1130 0.49