Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ID91

Protein Details
Accession A0A1Y2ID91    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-60MSSRHDYRRRDRSLGRDDRDRDRDRDRYSHRPPPPPRRSSRSRSPPRRGERDRRGTDRRDBasic
66-87REDDRRDRDRRDDRRDDRRDDRBasic
218-238AANIKKMRTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-95RDDRDRDRDRDRYSHRPPPPPRRSSRSRSPPRRGERDRRGTDRRDYHPRDREDDRRDRDRRDDRRDDRRDDRRGDERDRR
104-112GRREPPPPR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRHDYRRRDRSLGRDDRDRDRDRDRYSHRPPPPPRRSSRSRSPPRRGERDRRGTDRRDYHPRDREDDRRDRDRRDDRRDDRRDDRRGDERDRRDYDRYDRDGRREPPPPRADGDRERERQDRDRDGRPEHVSGHDSKPPVPGDGDRQHSMTGTPEVEPSGSRPRQDSEAPTDGAEEGEAMDGTNDDEAAMMAMMGLPATGFGTTKGKHVEGNQEGAANIKKMRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.77
3 0.76
4 0.74
5 0.75
6 0.78
7 0.73
8 0.68
9 0.66
10 0.68
11 0.65
12 0.7
13 0.68
14 0.69
15 0.72
16 0.76
17 0.76
18 0.78
19 0.82
20 0.83
21 0.86
22 0.85
23 0.85
24 0.83
25 0.84
26 0.82
27 0.83
28 0.83
29 0.83
30 0.85
31 0.86
32 0.88
33 0.89
34 0.91
35 0.9
36 0.9
37 0.89
38 0.89
39 0.87
40 0.86
41 0.84
42 0.79
43 0.78
44 0.76
45 0.72
46 0.72
47 0.72
48 0.73
49 0.74
50 0.72
51 0.69
52 0.67
53 0.69
54 0.67
55 0.7
56 0.67
57 0.68
58 0.69
59 0.68
60 0.71
61 0.73
62 0.73
63 0.73
64 0.77
65 0.75
66 0.81
67 0.83
68 0.8
69 0.79
70 0.79
71 0.77
72 0.71
73 0.68
74 0.66
75 0.65
76 0.66
77 0.65
78 0.63
79 0.64
80 0.64
81 0.63
82 0.58
83 0.56
84 0.56
85 0.54
86 0.53
87 0.53
88 0.51
89 0.52
90 0.56
91 0.55
92 0.53
93 0.53
94 0.5
95 0.51
96 0.51
97 0.48
98 0.43
99 0.43
100 0.43
101 0.41
102 0.47
103 0.45
104 0.45
105 0.47
106 0.49
107 0.49
108 0.51
109 0.5
110 0.5
111 0.47
112 0.5
113 0.51
114 0.5
115 0.52
116 0.47
117 0.43
118 0.35
119 0.32
120 0.27
121 0.26
122 0.26
123 0.24
124 0.22
125 0.21
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.21
132 0.26
133 0.3
134 0.27
135 0.27
136 0.27
137 0.26
138 0.25
139 0.19
140 0.16
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.2
149 0.21
150 0.21
151 0.23
152 0.25
153 0.29
154 0.31
155 0.32
156 0.3
157 0.32
158 0.32
159 0.3
160 0.28
161 0.24
162 0.21
163 0.17
164 0.09
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.02
186 0.02
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.06
191 0.11
192 0.12
193 0.16
194 0.2
195 0.2
196 0.23
197 0.27
198 0.35
199 0.33
200 0.37
201 0.34
202 0.31
203 0.3
204 0.3
205 0.29
206 0.21
207 0.2
208 0.17
209 0.19
210 0.25
211 0.35
212 0.4
213 0.46
214 0.54
215 0.64
216 0.73
217 0.8
218 0.84
219 0.8
220 0.77
221 0.74
222 0.73
223 0.7
224 0.68
225 0.66