Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ITX1

Protein Details
Accession A0A1Y2ITX1    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-45RKPIERSMSNPIPRKRRPVKRRGRAKDEFESDDBasic
156-179APSPPLRSRKSHKSGKKAAPRATSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-38NPIPRKRRPVKRRGRAK
155-177RAPSPPLRSRKSHKSGKKAAPRA
273-286SRGRGRGGPSFRGR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MPTAVSAPSSDSRKPIERSMSNPIPRKRRPVKRRGRAKDEFESDDEIEREVRTDSETDDDHSSIDSESDSESSSDDLHADAHSEVVTPSTTQSPPPVEPPSLANGSSKDGAGTQATIFADSTNWAEMVADEAANGASSLPVIDFADMDSARLEPRAPSPPLRSRKSHKSGKKAAPRATSAPPPPAVPPPTEDASVAVAPAEEAVASSSREREPSQSSVANRSRNQSARQAYQQRLESDPSFVPKVGEFWGHDDRLLDKELRSLSGWWRGRWQSRGRGRGGPSFRGRGRGFFPQTGLSHEEGPRNSESSTVQDDVPPVERQWTHDGFEEMKKRDERRRAIQEQQQRQQEQQVHAGPVRGFGFRGRGFVSARGRGGFGRGGMVSPATSQRPLSNVAMGARVWYAQKPEKMWTKQHDISLYYDFATRPRPGVGPGVKVKLPGSKEPTIVRLPPRASAARAAAKSEPAVPAQDDGDKSFTVRLPVRNGKQKAVEEEIAVPEVQTTTIEEVSIDEIFTVRPHLAPNLRVDLVTSSSTAAEGSRQHPAPEKPSPPVRTSPTTSHAATEEALNPLEQIIVPAIPVDDGRTSPSPIIQEVILRHPPTTSEDGSSGTAPASMEEPRPQRPAPPVLHPLQTSFSPVPQTTPPPYGSPYAYGPALPPGVAVNHQGMAYEYATGRPVYIQPTPPPMFTPRPMMHTHHPSLSMPFVPSHLRHHSAASPDFMAHPHTPPVPSFVDPATGVPIFAPPRQGSRIEIRAPTDTTEGKKSLRPSHQRSTLSTSSVTASAEDTQQQESYFQSHNENTSGQDPASDQHHQQAPGPYPSMESGMVYAPYPQAYYYPEQYGYAPYVDMSQQSMSYEMYPPPEQHHHHSSHSHSHSHSQPVVYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.53
4 0.53
5 0.56
6 0.62
7 0.66
8 0.67
9 0.72
10 0.73
11 0.73
12 0.75
13 0.81
14 0.81
15 0.83
16 0.85
17 0.87
18 0.9
19 0.9
20 0.94
21 0.94
22 0.94
23 0.92
24 0.89
25 0.88
26 0.83
27 0.77
28 0.69
29 0.64
30 0.55
31 0.5
32 0.42
33 0.33
34 0.27
35 0.22
36 0.2
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.17
43 0.18
44 0.2
45 0.23
46 0.22
47 0.2
48 0.19
49 0.18
50 0.15
51 0.14
52 0.11
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.1
76 0.14
77 0.15
78 0.16
79 0.21
80 0.25
81 0.26
82 0.32
83 0.35
84 0.31
85 0.32
86 0.33
87 0.33
88 0.31
89 0.29
90 0.26
91 0.23
92 0.26
93 0.25
94 0.23
95 0.18
96 0.15
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.11
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.09
141 0.14
142 0.21
143 0.24
144 0.29
145 0.37
146 0.46
147 0.55
148 0.59
149 0.62
150 0.63
151 0.71
152 0.75
153 0.77
154 0.76
155 0.77
156 0.82
157 0.85
158 0.87
159 0.85
160 0.83
161 0.79
162 0.75
163 0.69
164 0.64
165 0.62
166 0.54
167 0.5
168 0.44
169 0.39
170 0.37
171 0.39
172 0.35
173 0.29
174 0.28
175 0.28
176 0.29
177 0.28
178 0.26
179 0.2
180 0.21
181 0.19
182 0.16
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.12
196 0.15
197 0.16
198 0.19
199 0.24
200 0.26
201 0.3
202 0.32
203 0.33
204 0.4
205 0.45
206 0.48
207 0.45
208 0.46
209 0.49
210 0.49
211 0.51
212 0.5
213 0.5
214 0.48
215 0.55
216 0.59
217 0.55
218 0.57
219 0.57
220 0.51
221 0.48
222 0.46
223 0.38
224 0.33
225 0.31
226 0.28
227 0.25
228 0.22
229 0.21
230 0.17
231 0.18
232 0.15
233 0.16
234 0.14
235 0.18
236 0.23
237 0.23
238 0.23
239 0.22
240 0.22
241 0.21
242 0.23
243 0.18
244 0.13
245 0.17
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.2
251 0.28
252 0.31
253 0.28
254 0.34
255 0.39
256 0.43
257 0.49
258 0.51
259 0.52
260 0.58
261 0.64
262 0.61
263 0.61
264 0.6
265 0.61
266 0.58
267 0.56
268 0.51
269 0.51
270 0.48
271 0.5
272 0.47
273 0.41
274 0.4
275 0.42
276 0.42
277 0.36
278 0.36
279 0.33
280 0.33
281 0.33
282 0.32
283 0.24
284 0.24
285 0.25
286 0.28
287 0.23
288 0.26
289 0.24
290 0.22
291 0.2
292 0.18
293 0.17
294 0.17
295 0.2
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.19
302 0.16
303 0.13
304 0.16
305 0.16
306 0.19
307 0.25
308 0.25
309 0.24
310 0.24
311 0.26
312 0.24
313 0.3
314 0.33
315 0.28
316 0.32
317 0.35
318 0.39
319 0.46
320 0.52
321 0.53
322 0.56
323 0.64
324 0.65
325 0.68
326 0.71
327 0.72
328 0.72
329 0.72
330 0.7
331 0.61
332 0.56
333 0.55
334 0.52
335 0.44
336 0.41
337 0.37
338 0.31
339 0.31
340 0.32
341 0.26
342 0.23
343 0.22
344 0.16
345 0.14
346 0.13
347 0.18
348 0.16
349 0.18
350 0.16
351 0.17
352 0.18
353 0.23
354 0.27
355 0.24
356 0.24
357 0.23
358 0.22
359 0.2
360 0.21
361 0.16
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.07
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.12
376 0.15
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.12
389 0.15
390 0.17
391 0.18
392 0.24
393 0.32
394 0.35
395 0.4
396 0.41
397 0.46
398 0.47
399 0.48
400 0.44
401 0.37
402 0.36
403 0.32
404 0.27
405 0.19
406 0.17
407 0.15
408 0.14
409 0.16
410 0.14
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.2
416 0.21
417 0.22
418 0.24
419 0.26
420 0.24
421 0.25
422 0.24
423 0.21
424 0.22
425 0.21
426 0.25
427 0.25
428 0.27
429 0.27
430 0.3
431 0.28
432 0.29
433 0.28
434 0.26
435 0.25
436 0.24
437 0.27
438 0.24
439 0.23
440 0.22
441 0.23
442 0.22
443 0.22
444 0.22
445 0.19
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.15
450 0.1
451 0.11
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.11
463 0.13
464 0.16
465 0.18
466 0.23
467 0.3
468 0.35
469 0.43
470 0.44
471 0.43
472 0.46
473 0.45
474 0.41
475 0.39
476 0.34
477 0.26
478 0.25
479 0.22
480 0.18
481 0.16
482 0.12
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.1
505 0.13
506 0.15
507 0.18
508 0.2
509 0.2
510 0.19
511 0.19
512 0.17
513 0.16
514 0.15
515 0.12
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.09
523 0.11
524 0.16
525 0.16
526 0.17
527 0.23
528 0.25
529 0.29
530 0.33
531 0.34
532 0.34
533 0.42
534 0.45
535 0.42
536 0.45
537 0.44
538 0.42
539 0.44
540 0.43
541 0.39
542 0.4
543 0.37
544 0.33
545 0.28
546 0.24
547 0.2
548 0.18
549 0.15
550 0.12
551 0.12
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.1
569 0.11
570 0.13
571 0.13
572 0.15
573 0.15
574 0.14
575 0.15
576 0.11
577 0.13
578 0.14
579 0.19
580 0.22
581 0.21
582 0.21
583 0.2
584 0.21
585 0.23
586 0.26
587 0.21
588 0.18
589 0.19
590 0.2
591 0.21
592 0.2
593 0.16
594 0.11
595 0.11
596 0.09
597 0.09
598 0.08
599 0.09
600 0.1
601 0.16
602 0.2
603 0.23
604 0.28
605 0.27
606 0.3
607 0.34
608 0.41
609 0.38
610 0.41
611 0.43
612 0.42
613 0.46
614 0.42
615 0.38
616 0.32
617 0.29
618 0.28
619 0.22
620 0.21
621 0.21
622 0.2
623 0.21
624 0.22
625 0.27
626 0.25
627 0.28
628 0.28
629 0.26
630 0.29
631 0.29
632 0.27
633 0.25
634 0.23
635 0.21
636 0.2
637 0.18
638 0.16
639 0.16
640 0.15
641 0.12
642 0.1
643 0.09
644 0.1
645 0.11
646 0.12
647 0.1
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.11
652 0.12
653 0.11
654 0.11
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.1
660 0.1
661 0.11
662 0.14
663 0.18
664 0.21
665 0.23
666 0.32
667 0.33
668 0.33
669 0.34
670 0.36
671 0.37
672 0.35
673 0.41
674 0.34
675 0.37
676 0.4
677 0.43
678 0.45
679 0.49
680 0.49
681 0.43
682 0.43
683 0.39
684 0.38
685 0.36
686 0.29
687 0.22
688 0.19
689 0.19
690 0.21
691 0.22
692 0.26
693 0.29
694 0.32
695 0.31
696 0.34
697 0.36
698 0.37
699 0.37
700 0.33
701 0.28
702 0.25
703 0.24
704 0.22
705 0.23
706 0.19
707 0.19
708 0.2
709 0.21
710 0.22
711 0.22
712 0.26
713 0.23
714 0.23
715 0.23
716 0.2
717 0.21
718 0.2
719 0.2
720 0.2
721 0.16
722 0.15
723 0.13
724 0.17
725 0.17
726 0.17
727 0.22
728 0.19
729 0.24
730 0.27
731 0.29
732 0.29
733 0.34
734 0.4
735 0.4
736 0.42
737 0.41
738 0.41
739 0.41
740 0.39
741 0.35
742 0.32
743 0.3
744 0.33
745 0.32
746 0.31
747 0.34
748 0.38
749 0.44
750 0.51
751 0.57
752 0.6
753 0.68
754 0.74
755 0.74
756 0.71
757 0.71
758 0.64
759 0.56
760 0.49
761 0.4
762 0.33
763 0.3
764 0.25
765 0.17
766 0.16
767 0.14
768 0.15
769 0.17
770 0.17
771 0.17
772 0.18
773 0.18
774 0.17
775 0.17
776 0.19
777 0.19
778 0.19
779 0.23
780 0.25
781 0.27
782 0.28
783 0.28
784 0.26
785 0.26
786 0.26
787 0.2
788 0.18
789 0.17
790 0.17
791 0.21
792 0.22
793 0.21
794 0.27
795 0.32
796 0.32
797 0.36
798 0.41
799 0.42
800 0.43
801 0.44
802 0.36
803 0.33
804 0.33
805 0.31
806 0.24
807 0.19
808 0.16
809 0.15
810 0.16
811 0.14
812 0.14
813 0.13
814 0.13
815 0.13
816 0.12
817 0.12
818 0.16
819 0.21
820 0.23
821 0.26
822 0.27
823 0.27
824 0.28
825 0.29
826 0.27
827 0.23
828 0.19
829 0.15
830 0.16
831 0.16
832 0.16
833 0.15
834 0.14
835 0.14
836 0.15
837 0.16
838 0.15
839 0.16
840 0.18
841 0.17
842 0.22
843 0.24
844 0.25
845 0.3
846 0.37
847 0.4
848 0.45
849 0.51
850 0.5
851 0.53
852 0.58
853 0.58
854 0.6
855 0.6
856 0.58
857 0.53
858 0.56
859 0.56
860 0.58
861 0.55