Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2I6E2

Protein Details
Accession A0A1Y2I6E2    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-324ITAPLPRRARNRREGEPDRRPWDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-239KKR
269-278RPRSPPSKMR
285-286KR
305-327PLPRRARNRREGEPDRRPWDKGK
337-357EPRSRREHGSRERTGGRRPPR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDTSPELLDASSSGTVLSYDDTVPYEDQVAAVPDVPEPSESGRSLADRIGNTKVYLLSDASKSRGGKRKHDDLEEEGREGDVDMDDLEPSPIRDNAILLQGTPISHLPTSNIFAYAKNFDTEPLGLEWVDDTTCVLVFETKSAARAAFRALQKSVAEEPSLDDGSVTAKPIPITIWPAEDRISATLGKGEGLKGILRMRWARVEDVKKKGAKAESQFYKKYGENAGKTFEDGPRPVKKRRGGDEQAEEEERARLDAELDNFLADDGEKRPRSPPSKMRADHITHKRGKTLLERTEGSLASRITAPLPRRARNRREGEPDRRPWDKGKDEDGYEERYEPRSRREHGSRERTGGRRPPRLKVTQEDLDAELDAFLNEKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.1
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.14
26 0.17
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.2
32 0.22
33 0.23
34 0.21
35 0.23
36 0.26
37 0.26
38 0.25
39 0.25
40 0.24
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.17
45 0.2
46 0.21
47 0.22
48 0.26
49 0.27
50 0.34
51 0.41
52 0.44
53 0.5
54 0.56
55 0.64
56 0.65
57 0.69
58 0.65
59 0.63
60 0.67
61 0.59
62 0.52
63 0.41
64 0.35
65 0.29
66 0.25
67 0.18
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.13
96 0.16
97 0.15
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.18
102 0.19
103 0.18
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.13
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.16
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.22
139 0.21
140 0.24
141 0.23
142 0.18
143 0.17
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.12
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.25
190 0.33
191 0.36
192 0.41
193 0.45
194 0.43
195 0.43
196 0.44
197 0.41
198 0.38
199 0.36
200 0.39
201 0.41
202 0.45
203 0.46
204 0.43
205 0.43
206 0.38
207 0.37
208 0.34
209 0.33
210 0.3
211 0.31
212 0.33
213 0.29
214 0.3
215 0.29
216 0.24
217 0.21
218 0.2
219 0.24
220 0.3
221 0.35
222 0.39
223 0.46
224 0.5
225 0.55
226 0.6
227 0.64
228 0.61
229 0.64
230 0.65
231 0.6
232 0.56
233 0.5
234 0.43
235 0.33
236 0.28
237 0.21
238 0.14
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.23
257 0.31
258 0.37
259 0.44
260 0.51
261 0.52
262 0.62
263 0.62
264 0.63
265 0.63
266 0.62
267 0.64
268 0.64
269 0.65
270 0.61
271 0.61
272 0.6
273 0.53
274 0.52
275 0.51
276 0.51
277 0.48
278 0.46
279 0.46
280 0.45
281 0.47
282 0.43
283 0.35
284 0.3
285 0.23
286 0.19
287 0.18
288 0.16
289 0.15
290 0.2
291 0.22
292 0.27
293 0.35
294 0.41
295 0.5
296 0.6
297 0.67
298 0.72
299 0.77
300 0.76
301 0.79
302 0.82
303 0.82
304 0.82
305 0.82
306 0.79
307 0.75
308 0.7
309 0.66
310 0.66
311 0.64
312 0.6
313 0.58
314 0.57
315 0.54
316 0.58
317 0.54
318 0.5
319 0.43
320 0.39
321 0.35
322 0.34
323 0.39
324 0.35
325 0.41
326 0.43
327 0.46
328 0.53
329 0.6
330 0.65
331 0.7
332 0.77
333 0.75
334 0.74
335 0.78
336 0.74
337 0.74
338 0.73
339 0.72
340 0.72
341 0.71
342 0.73
343 0.74
344 0.77
345 0.75
346 0.73
347 0.72
348 0.67
349 0.66
350 0.59
351 0.51
352 0.44
353 0.37
354 0.29
355 0.21
356 0.15
357 0.11