FuNGI

A0A1Y2ISQ8

Protein Details

Accession

A0A1Y2ISQ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-112	TQTAVRSPPKRLKGRPDRRRKQMGSRASSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-104	SPPKRLKGRPDRRRKQ

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR047415 CID_Pcf11 IPR008942 ENTH_VHS IPR045154 PCF11-like
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID
CDD	cd16982 CID_Pcf11

Amino Acid Sequences

MKLPAFYLLDAISKNVYDPYARHFAPIVANLFIETYEAVDPTTRSKMEEMLLTWRTGAPNGRELFGVVPQLAIEQHIWGSGATQTAVRSPPKRLKGRPDRRRKQMGSRASSSSSSISQAQVLSELEFVLGQKERQLHSNPYDKGTQHHVTVLQQLRALVQVGVSQEELRQILTQLRSLSASAPPAPAPSVPVPAPSSYAAAPTFAPPPPVPPVSAPPQPSRPQQPSYPVLSEQPKAEPIDFSRFLSAQQASAPSTSAAPPVSDITNLFNALVKAGVVPSSGTPSGTPKGAGASSQPEERPQQAADARDAARDYRKLILSRKVQLASADIIRQRPPVVDLLYNNLPTQCKQCGIRFPSTSNGKKQFEDHLDMHFRQNRKASQAVGRGHSRSWFISLEDWIHGDAVDMKGKGRADGRTLSSKAAAAEDAAKREAELRAMHVVVPPGDEAKPISCPICKEHLKSEFLEDEEEWVWRNAIKKDDRIYHATCHAEAAASKSSLAVRLRNETSSRSRSRTPERLTPPKMLAQADTRMSESPSPSKLAGMKRKAEDEASQPAKSEPDAPQVKRQAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.15
4	0.15
5	0.16
6	0.21
7	0.27
8	0.27
9	0.28
10	0.28
11	0.29
12	0.32
13	0.35
14	0.31
15	0.24
16	0.24
17	0.23
18	0.22
19	0.19
20	0.15
21	0.09
22	0.09
23	0.08
24	0.09
25	0.09
26	0.1
27	0.11
28	0.15
29	0.2
30	0.19
31	0.2
32	0.21
33	0.24
34	0.25
35	0.27
36	0.25
37	0.28
38	0.29
39	0.27
40	0.27
41	0.25
42	0.24
43	0.24
44	0.28
45	0.23
46	0.29
47	0.31
48	0.3
49	0.29
50	0.29
51	0.27
52	0.23
53	0.22
54	0.14
55	0.12
56	0.11
57	0.12
58	0.11
59	0.11
60	0.09
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.18
74	0.23
75	0.25
76	0.33
77	0.42
78	0.5
79	0.59
80	0.63
81	0.7
82	0.75
83	0.83
84	0.86
85	0.88
86	0.89
87	0.9
88	0.93
89	0.88
90	0.88
91	0.86
92	0.86
93	0.82
94	0.76
95	0.7
96	0.62
97	0.57
98	0.47
99	0.4
100	0.31
101	0.26
102	0.23
103	0.19
104	0.18
105	0.17
106	0.15
107	0.15
108	0.14
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.12
119	0.16
120	0.17
121	0.22
122	0.27
123	0.31
124	0.36
125	0.45
126	0.43
127	0.42
128	0.46
129	0.41
130	0.4
131	0.41
132	0.37
133	0.29
134	0.3
135	0.28
136	0.25
137	0.33
138	0.34
139	0.28
140	0.26
141	0.25
142	0.23
143	0.22
144	0.21
145	0.12
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.11
154	0.11
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.13
159	0.14
160	0.16
161	0.15
162	0.16
163	0.16
164	0.16
165	0.17
166	0.14
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.12
174	0.14
175	0.13
176	0.15
177	0.14
178	0.17
179	0.17
180	0.17
181	0.19
182	0.16
183	0.16
184	0.13
185	0.15
186	0.13
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.13
191	0.12
192	0.15
193	0.13
194	0.16
195	0.19
196	0.2
197	0.19
198	0.18
199	0.22
200	0.25
201	0.29
202	0.3
203	0.29
204	0.35
205	0.38
206	0.41
207	0.44
208	0.44
209	0.44
210	0.43
211	0.46
212	0.44
213	0.44
214	0.41
215	0.34
216	0.33
217	0.33
218	0.32
219	0.26
220	0.23
221	0.22
222	0.21
223	0.2
224	0.17
225	0.16
226	0.22
227	0.22
228	0.21
229	0.2
230	0.19
231	0.19
232	0.22
233	0.2
234	0.13
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.1
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.08
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.08
279	0.11
280	0.12
281	0.14
282	0.14
283	0.15
284	0.17
285	0.18
286	0.18
287	0.14
288	0.17
289	0.17
290	0.19
291	0.17
292	0.2
293	0.18
294	0.18
295	0.18
296	0.15
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.17
301	0.19
302	0.22
303	0.26
304	0.33
305	0.35
306	0.38
307	0.41
308	0.38
309	0.35
310	0.33
311	0.3
312	0.24
313	0.2
314	0.18
315	0.15
316	0.16
317	0.17
318	0.17
319	0.16
320	0.14
321	0.14
322	0.14
323	0.14
324	0.15
325	0.14
326	0.19
327	0.21
328	0.21
329	0.2
330	0.19
331	0.18
332	0.16
333	0.2
334	0.16
335	0.16
336	0.19
337	0.22
338	0.3
339	0.34
340	0.4
341	0.38
342	0.38
343	0.43
344	0.49
345	0.5
346	0.5
347	0.53
348	0.49
349	0.48
350	0.48
351	0.47
352	0.43
353	0.45
354	0.38
355	0.35
356	0.38
357	0.38
358	0.42
359	0.4
360	0.37
361	0.35
362	0.4
363	0.36
364	0.36
365	0.37
366	0.34
367	0.37
368	0.43
369	0.43
370	0.41
371	0.42
372	0.39
373	0.37
374	0.36
375	0.31
376	0.24
377	0.23
378	0.19
379	0.16
380	0.17
381	0.18
382	0.17
383	0.16
384	0.15
385	0.13
386	0.12
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.1
391	0.12
392	0.11
393	0.12
394	0.15
395	0.15
396	0.17
397	0.18
398	0.19
399	0.2
400	0.24
401	0.28
402	0.32
403	0.33
404	0.32
405	0.29
406	0.28
407	0.25
408	0.21
409	0.17
410	0.11
411	0.16
412	0.16
413	0.18
414	0.17
415	0.17
416	0.16
417	0.18
418	0.18
419	0.16
420	0.15
421	0.15
422	0.18
423	0.18
424	0.19
425	0.18
426	0.19
427	0.15
428	0.16
429	0.13
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.13
436	0.14
437	0.16
438	0.16
439	0.18
440	0.22
441	0.3
442	0.33
443	0.35
444	0.42
445	0.47
446	0.48
447	0.47
448	0.48
449	0.42
450	0.38
451	0.37
452	0.28
453	0.25
454	0.22
455	0.21
456	0.17
457	0.15
458	0.14
459	0.13
460	0.18
461	0.19
462	0.27
463	0.32
464	0.37
465	0.44
466	0.52
467	0.55
468	0.56
469	0.56
470	0.52
471	0.53
472	0.49
473	0.41
474	0.35
475	0.3
476	0.24
477	0.22
478	0.22
479	0.19
480	0.17
481	0.16
482	0.16
483	0.17
484	0.21
485	0.23
486	0.24
487	0.24
488	0.31
489	0.34
490	0.37
491	0.39
492	0.39
493	0.45
494	0.5
495	0.53
496	0.51
497	0.55
498	0.59
499	0.67
500	0.7
501	0.69
502	0.7
503	0.73
504	0.78
505	0.77
506	0.74
507	0.68
508	0.64
509	0.62
510	0.53
511	0.47
512	0.42
513	0.43
514	0.4
515	0.38
516	0.34
517	0.3
518	0.31
519	0.31
520	0.31
521	0.3
522	0.29
523	0.31
524	0.3
525	0.32
526	0.36
527	0.42
528	0.48
529	0.5
530	0.55
531	0.57
532	0.61
533	0.6
534	0.57
535	0.52
536	0.47
537	0.49
538	0.47
539	0.42
540	0.39
541	0.38
542	0.36
543	0.33
544	0.32
545	0.26
546	0.31
547	0.4
548	0.42
549	0.5

A0A1Y2ISQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer