Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2IT47

Protein Details
Accession A0A1Y2IT47    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70QYWMVQWRNPQYKKHKTWDGDHydrophilic
206-231KESYWTANWRKPQQKKHKTWDEDGYVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18004  DEXHc_RAD54  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MPPFTSPSASTSAKRKLDYHDANPANRKRQALVLENDAGASGPSAMEGDQYWMVQWRNPQYKKHKTWDGDAVLVVSGGKCTLYDSDNRQIASGKPYGVEGTHKLAEGSEFTVGSREVEIDHRLSREDFLSGRCFGRGGIPEQSPLASKPGPAKQFIPLRPKALNGGKNPAYNAPSITAPEKRGIALEAVSLVTTDNLKQPQKAGHKESYWTANWRKPQQKKHKTWDEDGYVMHEGDKMTLVSDTGIVLGTKKWDGLPLYSSYRTFIGNKEVELDSEIARSKLPRIVGKAPELSADPEFSEPSSSQSRSSFLLDSSRTPQDVVSSPSVNSPASAKKFIPPASFYGATVKPKPKGPLHDPNAPGAVVMKAPSKEHQAKFNKKNLPVVPVVVDPVIARHLRPHQKEGVQFLYECVMGLRKHEGQGCILADEMGMGKTLQTIALVWTLLKQNPYAGAGPVVGKVLIVCPVSLLNNWKNEFHKWLGKDRVGIFVGDKDKSTIKQFLNSKIHQVLVIGYERLRSVINDLAYCNPPIGLIICDEGHRLKSANNKTSTMFEALRTPRRVILSGTPIQNELSEFHAMADFCNPGLLDDYSTFKRVYETPILKSRAPGCSDKDAELGEARSAQLTAIAKSFVLRREATMLKKYLPPKHEYVVFVTPTKLQLSIFEKMLSHDKLDNLVRNSTAESLAMINMLTKISNSPILLKATADQARMKALQGGDTVKRNAIEEALKLLPERAQVEDVSLSGKLSALATLLRALHKHTEEKCIIVSHYTSTLNIIEAYCKKKSYTYHRLDGSTPAPKRQEYVNDFNRSSQAKRFLFLLSSKAGGVGLNLIGASRLCLIDSDWNPSHDLQSMARIHRDGQKRPVYIYRFLTTGSIDEKIYQRQVTKLGLSDSLMGSGTSESKLDSFTRKDLLDIFTINKHTACNTHDLLDCPCEASSTESERISVDDLQEASSSSDEEDPVKGFMAASQVKAEDVNKVDKAYIKQKRAQLAALGEWTHINCLRPGAADRVQDDMLTHLIYSHNPSTKSSSSTPQTLAEKVFDAADRILAEQTCFTRDSIPGGSVSFLFERSSKSVVQDEEAMDEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.52
4 0.59
5 0.63
6 0.61
7 0.62
8 0.62
9 0.66
10 0.72
11 0.73
12 0.7
13 0.67
14 0.64
15 0.55
16 0.56
17 0.56
18 0.55
19 0.52
20 0.5
21 0.47
22 0.45
23 0.42
24 0.35
25 0.28
26 0.19
27 0.15
28 0.08
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.17
40 0.18
41 0.19
42 0.26
43 0.33
44 0.43
45 0.48
46 0.57
47 0.63
48 0.73
49 0.8
50 0.83
51 0.82
52 0.76
53 0.78
54 0.78
55 0.71
56 0.62
57 0.53
58 0.44
59 0.34
60 0.3
61 0.23
62 0.13
63 0.09
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.07
68 0.1
69 0.12
70 0.18
71 0.25
72 0.33
73 0.37
74 0.37
75 0.36
76 0.36
77 0.36
78 0.36
79 0.32
80 0.24
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.22
85 0.24
86 0.21
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.22
93 0.19
94 0.18
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.13
105 0.16
106 0.18
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.23
111 0.24
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.24
117 0.24
118 0.24
119 0.22
120 0.21
121 0.19
122 0.24
123 0.24
124 0.24
125 0.27
126 0.27
127 0.28
128 0.29
129 0.29
130 0.24
131 0.22
132 0.23
133 0.18
134 0.19
135 0.25
136 0.32
137 0.34
138 0.36
139 0.37
140 0.39
141 0.48
142 0.52
143 0.54
144 0.51
145 0.53
146 0.52
147 0.51
148 0.52
149 0.51
150 0.51
151 0.46
152 0.51
153 0.5
154 0.5
155 0.51
156 0.47
157 0.4
158 0.34
159 0.31
160 0.24
161 0.21
162 0.22
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.25
167 0.25
168 0.23
169 0.23
170 0.21
171 0.19
172 0.15
173 0.13
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.12
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.25
187 0.33
188 0.41
189 0.48
190 0.5
191 0.51
192 0.51
193 0.53
194 0.54
195 0.52
196 0.45
197 0.45
198 0.45
199 0.44
200 0.5
201 0.57
202 0.63
203 0.66
204 0.74
205 0.78
206 0.82
207 0.86
208 0.89
209 0.9
210 0.87
211 0.84
212 0.82
213 0.75
214 0.66
215 0.56
216 0.49
217 0.39
218 0.33
219 0.27
220 0.19
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.18
244 0.2
245 0.25
246 0.26
247 0.26
248 0.24
249 0.24
250 0.24
251 0.23
252 0.21
253 0.24
254 0.23
255 0.23
256 0.25
257 0.24
258 0.22
259 0.22
260 0.21
261 0.13
262 0.14
263 0.15
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.19
270 0.21
271 0.26
272 0.33
273 0.36
274 0.4
275 0.4
276 0.37
277 0.34
278 0.31
279 0.28
280 0.21
281 0.18
282 0.15
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.11
288 0.14
289 0.19
290 0.19
291 0.2
292 0.21
293 0.22
294 0.22
295 0.24
296 0.21
297 0.17
298 0.22
299 0.21
300 0.23
301 0.26
302 0.26
303 0.23
304 0.23
305 0.22
306 0.2
307 0.21
308 0.22
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.21
313 0.22
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.19
318 0.21
319 0.24
320 0.23
321 0.25
322 0.31
323 0.34
324 0.35
325 0.3
326 0.3
327 0.33
328 0.32
329 0.29
330 0.29
331 0.29
332 0.3
333 0.34
334 0.36
335 0.33
336 0.37
337 0.42
338 0.42
339 0.46
340 0.51
341 0.55
342 0.56
343 0.61
344 0.58
345 0.54
346 0.5
347 0.41
348 0.33
349 0.23
350 0.18
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.14
357 0.21
358 0.29
359 0.31
360 0.4
361 0.47
362 0.56
363 0.63
364 0.7
365 0.7
366 0.64
367 0.7
368 0.62
369 0.57
370 0.47
371 0.4
372 0.33
373 0.26
374 0.24
375 0.16
376 0.14
377 0.09
378 0.09
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.12
383 0.21
384 0.29
385 0.33
386 0.37
387 0.4
388 0.44
389 0.47
390 0.48
391 0.43
392 0.36
393 0.32
394 0.28
395 0.23
396 0.18
397 0.16
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.1
402 0.14
403 0.14
404 0.17
405 0.2
406 0.21
407 0.18
408 0.21
409 0.2
410 0.16
411 0.15
412 0.12
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.07
430 0.09
431 0.11
432 0.11
433 0.1
434 0.1
435 0.11
436 0.13
437 0.12
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.14
456 0.14
457 0.19
458 0.21
459 0.23
460 0.24
461 0.25
462 0.28
463 0.27
464 0.29
465 0.27
466 0.34
467 0.37
468 0.36
469 0.39
470 0.36
471 0.36
472 0.31
473 0.29
474 0.22
475 0.2
476 0.21
477 0.17
478 0.17
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.19
483 0.21
484 0.19
485 0.26
486 0.29
487 0.37
488 0.42
489 0.41
490 0.42
491 0.37
492 0.36
493 0.3
494 0.26
495 0.18
496 0.13
497 0.13
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.06
505 0.08
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.15
512 0.15
513 0.12
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.18
530 0.25
531 0.31
532 0.32
533 0.33
534 0.34
535 0.35
536 0.35
537 0.29
538 0.23
539 0.16
540 0.21
541 0.23
542 0.29
543 0.29
544 0.28
545 0.27
546 0.28
547 0.28
548 0.23
549 0.23
550 0.23
551 0.25
552 0.26
553 0.24
554 0.23
555 0.22
556 0.21
557 0.17
558 0.12
559 0.1
560 0.1
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.05
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.11
577 0.11
578 0.13
579 0.13
580 0.11
581 0.13
582 0.13
583 0.17
584 0.23
585 0.25
586 0.27
587 0.34
588 0.38
589 0.36
590 0.38
591 0.36
592 0.32
593 0.33
594 0.32
595 0.28
596 0.31
597 0.32
598 0.3
599 0.28
600 0.24
601 0.21
602 0.19
603 0.16
604 0.1
605 0.09
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.08
611 0.08
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.1
617 0.12
618 0.11
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.19
623 0.23
624 0.25
625 0.27
626 0.27
627 0.25
628 0.3
629 0.36
630 0.37
631 0.38
632 0.39
633 0.37
634 0.39
635 0.41
636 0.37
637 0.35
638 0.33
639 0.31
640 0.27
641 0.25
642 0.23
643 0.2
644 0.19
645 0.15
646 0.11
647 0.14
648 0.18
649 0.19
650 0.19
651 0.18
652 0.18
653 0.19
654 0.24
655 0.2
656 0.17
657 0.17
658 0.17
659 0.2
660 0.23
661 0.26
662 0.22
663 0.23
664 0.21
665 0.2
666 0.21
667 0.18
668 0.15
669 0.1
670 0.09
671 0.08
672 0.08
673 0.07
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.06
682 0.09
683 0.09
684 0.11
685 0.13
686 0.15
687 0.15
688 0.15
689 0.15
690 0.19
691 0.21
692 0.2
693 0.19
694 0.18
695 0.2
696 0.21
697 0.2
698 0.17
699 0.15
700 0.15
701 0.15
702 0.18
703 0.18
704 0.21
705 0.22
706 0.2
707 0.2
708 0.19
709 0.18
710 0.17
711 0.15
712 0.12
713 0.15
714 0.14
715 0.14
716 0.14
717 0.14
718 0.13
719 0.14
720 0.15
721 0.12
722 0.13
723 0.13
724 0.14
725 0.14
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.07
739 0.08
740 0.09
741 0.09
742 0.12
743 0.16
744 0.18
745 0.25
746 0.26
747 0.32
748 0.32
749 0.33
750 0.32
751 0.28
752 0.26
753 0.21
754 0.2
755 0.14
756 0.16
757 0.15
758 0.14
759 0.14
760 0.14
761 0.12
762 0.12
763 0.11
764 0.13
765 0.17
766 0.21
767 0.22
768 0.22
769 0.23
770 0.26
771 0.34
772 0.4
773 0.46
774 0.49
775 0.55
776 0.58
777 0.59
778 0.56
779 0.53
780 0.47
781 0.45
782 0.39
783 0.37
784 0.37
785 0.35
786 0.35
787 0.35
788 0.4
789 0.38
790 0.47
791 0.5
792 0.53
793 0.54
794 0.53
795 0.54
796 0.47
797 0.42
798 0.39
799 0.4
800 0.34
801 0.34
802 0.35
803 0.31
804 0.31
805 0.3
806 0.27
807 0.19
808 0.19
809 0.18
810 0.16
811 0.15
812 0.12
813 0.1
814 0.08
815 0.06
816 0.06
817 0.05
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.06
826 0.07
827 0.15
828 0.17
829 0.24
830 0.24
831 0.25
832 0.27
833 0.28
834 0.28
835 0.21
836 0.22
837 0.15
838 0.22
839 0.26
840 0.26
841 0.28
842 0.28
843 0.28
844 0.35
845 0.42
846 0.4
847 0.45
848 0.51
849 0.5
850 0.53
851 0.58
852 0.55
853 0.53
854 0.53
855 0.45
856 0.37
857 0.36
858 0.33
859 0.26
860 0.23
861 0.19
862 0.15
863 0.14
864 0.16
865 0.18
866 0.22
867 0.25
868 0.26
869 0.25
870 0.26
871 0.3
872 0.3
873 0.3
874 0.28
875 0.26
876 0.24
877 0.23
878 0.22
879 0.18
880 0.16
881 0.14
882 0.11
883 0.1
884 0.1
885 0.1
886 0.09
887 0.09
888 0.08
889 0.08
890 0.11
891 0.13
892 0.18
893 0.2
894 0.23
895 0.27
896 0.26
897 0.27
898 0.28
899 0.29
900 0.25
901 0.24
902 0.23
903 0.23
904 0.25
905 0.25
906 0.22
907 0.2
908 0.19
909 0.22
910 0.22
911 0.24
912 0.23
913 0.26
914 0.28
915 0.29
916 0.3
917 0.28
918 0.26
919 0.21
920 0.19
921 0.16
922 0.15
923 0.17
924 0.19
925 0.22
926 0.26
927 0.24
928 0.25
929 0.25
930 0.25
931 0.24
932 0.21
933 0.16
934 0.16
935 0.16
936 0.17
937 0.17
938 0.16
939 0.14
940 0.13
941 0.12
942 0.1
943 0.11
944 0.11
945 0.12
946 0.13
947 0.13
948 0.14
949 0.14
950 0.12
951 0.11
952 0.11
953 0.18
954 0.18
955 0.18
956 0.19
957 0.18
958 0.19
959 0.21
960 0.2
961 0.18
962 0.2
963 0.24
964 0.24
965 0.25
966 0.26
967 0.29
968 0.35
969 0.4
970 0.46
971 0.48
972 0.53
973 0.58
974 0.64
975 0.62
976 0.58
977 0.53
978 0.47
979 0.43
980 0.4
981 0.34
982 0.28
983 0.26
984 0.24
985 0.23
986 0.21
987 0.19
988 0.17
989 0.18
990 0.19
991 0.19
992 0.22
993 0.25
994 0.29
995 0.31
996 0.31
997 0.34
998 0.33
999 0.3
1000 0.28
1001 0.23
1002 0.19
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.1
1006 0.11
1007 0.13
1008 0.19
1009 0.23
1010 0.27
1011 0.28
1012 0.31
1013 0.37
1014 0.39
1015 0.43
1016 0.41
1017 0.43
1018 0.43
1019 0.46
1020 0.46
1021 0.45
1022 0.45
1023 0.43
1024 0.41
1025 0.35
1026 0.31
1027 0.27
1028 0.26
1029 0.21
1030 0.2
1031 0.17
1032 0.17
1033 0.15
1034 0.15
1035 0.17
1036 0.16
1037 0.17
1038 0.17
1039 0.19
1040 0.19
1041 0.19
1042 0.19
1043 0.2
1044 0.2
1045 0.24
1046 0.23
1047 0.23
1048 0.21
1049 0.21
1050 0.21
1051 0.18
1052 0.2
1053 0.16
1054 0.15
1055 0.15
1056 0.15
1057 0.2
1058 0.22
1059 0.25
1060 0.23
1061 0.26
1062 0.31
1063 0.31
1064 0.33
1065 0.32
1066 0.29
1067 0.29