Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IHJ0

Protein Details
Accession A0A1Y2IHJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
498-519ALHSPPSKHRRNSSSRSQNPSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
450-463KERDRATLRARKRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MQTSTGLGTYASPNGYADDETTDDLLSVWASTPGPSSSSLRHAAIGESLSLSSSSSFSSAVRRNETTPAKRRHAGSDAATRRGRTDHDPWAVNGDPGEGGRAAHVRARTLDGEGSASPWRGVGRSTSTSHHPLKTRNGSASMAHETRPSMKRMLCHNDAMVVASDSDPIDDDESARHRRSVSQDREMLVVVHQVQPTDSLPGVSLKYGISLAELRRANQLWPSDPIHLRETLYIPVDKARNVRHLRSIELRNTEDTANQASIHSNDVDAVVRNDHVSSQSTPSQAQEQQYTLRRVPASQLAFFPPPSNHPSPSQPSTSSTANPLGSRTLPARKPASNRPPIPGFPRARQDAPLQNVIDLFSTSLHVTANHLRAYAQSQSSLFVGPGPIKQSQSLASRLSIDSNSASATASSEEGDWEHEMESLGSGGARRTRSRQSLGESSRTQAIRVGKERDRATLRARKRRSASPEERESVELDSAPFLSTSSPGASVTTNGIPPALHSPPSKHRRNSSSRSQNPSHSRLGSNGTNAAYRKVVPYVAVEDDDAGGAWGQSPPLGAVRTAQLEPSPSMQLPTLQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.14
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.16
23 0.19
24 0.2
25 0.26
26 0.29
27 0.28
28 0.29
29 0.28
30 0.26
31 0.26
32 0.23
33 0.18
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.18
46 0.25
47 0.3
48 0.36
49 0.38
50 0.39
51 0.47
52 0.56
53 0.58
54 0.61
55 0.64
56 0.65
57 0.68
58 0.69
59 0.66
60 0.62
61 0.58
62 0.54
63 0.55
64 0.53
65 0.56
66 0.55
67 0.49
68 0.46
69 0.42
70 0.4
71 0.36
72 0.38
73 0.39
74 0.43
75 0.45
76 0.43
77 0.47
78 0.43
79 0.37
80 0.3
81 0.22
82 0.16
83 0.14
84 0.15
85 0.09
86 0.08
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.21
98 0.18
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.12
109 0.14
110 0.18
111 0.22
112 0.24
113 0.27
114 0.31
115 0.38
116 0.42
117 0.44
118 0.42
119 0.44
120 0.51
121 0.57
122 0.56
123 0.52
124 0.5
125 0.46
126 0.43
127 0.42
128 0.39
129 0.31
130 0.28
131 0.26
132 0.24
133 0.3
134 0.31
135 0.29
136 0.28
137 0.28
138 0.33
139 0.4
140 0.47
141 0.43
142 0.42
143 0.39
144 0.36
145 0.34
146 0.3
147 0.22
148 0.15
149 0.12
150 0.09
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.15
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.25
166 0.34
167 0.42
168 0.44
169 0.47
170 0.5
171 0.49
172 0.5
173 0.45
174 0.37
175 0.26
176 0.22
177 0.15
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.1
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.1
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.21
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.24
207 0.19
208 0.23
209 0.24
210 0.25
211 0.26
212 0.28
213 0.26
214 0.25
215 0.24
216 0.21
217 0.21
218 0.18
219 0.18
220 0.15
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.2
226 0.21
227 0.28
228 0.32
229 0.34
230 0.37
231 0.38
232 0.39
233 0.42
234 0.44
235 0.39
236 0.4
237 0.39
238 0.33
239 0.33
240 0.3
241 0.23
242 0.2
243 0.16
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.13
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.18
274 0.17
275 0.21
276 0.25
277 0.28
278 0.25
279 0.25
280 0.24
281 0.23
282 0.24
283 0.25
284 0.22
285 0.2
286 0.21
287 0.2
288 0.21
289 0.21
290 0.2
291 0.15
292 0.16
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.23
297 0.27
298 0.31
299 0.34
300 0.33
301 0.28
302 0.28
303 0.3
304 0.29
305 0.25
306 0.22
307 0.22
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.16
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.2
316 0.2
317 0.26
318 0.29
319 0.31
320 0.36
321 0.45
322 0.52
323 0.54
324 0.54
325 0.54
326 0.53
327 0.52
328 0.52
329 0.51
330 0.45
331 0.4
332 0.44
333 0.43
334 0.4
335 0.4
336 0.41
337 0.38
338 0.38
339 0.39
340 0.33
341 0.29
342 0.28
343 0.26
344 0.21
345 0.14
346 0.11
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.09
354 0.14
355 0.17
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.2
361 0.21
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.12
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.13
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.16
378 0.19
379 0.22
380 0.24
381 0.22
382 0.2
383 0.22
384 0.22
385 0.22
386 0.18
387 0.16
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.1
392 0.09
393 0.07
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.11
415 0.15
416 0.17
417 0.22
418 0.3
419 0.36
420 0.41
421 0.44
422 0.46
423 0.53
424 0.55
425 0.57
426 0.51
427 0.47
428 0.48
429 0.43
430 0.37
431 0.31
432 0.33
433 0.33
434 0.38
435 0.43
436 0.41
437 0.49
438 0.5
439 0.52
440 0.51
441 0.48
442 0.51
443 0.53
444 0.59
445 0.62
446 0.66
447 0.68
448 0.69
449 0.73
450 0.73
451 0.75
452 0.75
453 0.74
454 0.76
455 0.71
456 0.67
457 0.6
458 0.52
459 0.43
460 0.34
461 0.25
462 0.17
463 0.15
464 0.13
465 0.12
466 0.1
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.12
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.14
482 0.13
483 0.14
484 0.19
485 0.18
486 0.2
487 0.21
488 0.28
489 0.38
490 0.48
491 0.55
492 0.57
493 0.63
494 0.69
495 0.77
496 0.79
497 0.8
498 0.82
499 0.81
500 0.83
501 0.78
502 0.78
503 0.76
504 0.74
505 0.7
506 0.63
507 0.55
508 0.5
509 0.52
510 0.45
511 0.4
512 0.38
513 0.32
514 0.33
515 0.32
516 0.31
517 0.27
518 0.24
519 0.24
520 0.22
521 0.22
522 0.19
523 0.21
524 0.22
525 0.23
526 0.23
527 0.2
528 0.19
529 0.18
530 0.17
531 0.13
532 0.1
533 0.07
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.11
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.17
546 0.21
547 0.21
548 0.22
549 0.2
550 0.22
551 0.24
552 0.25
553 0.26
554 0.22
555 0.23
556 0.23