Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IPW4

Protein Details
Accession A0A1Y2IPW4    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-209REEPRPKKEIPKRKNKHAPTEMBasic
359-393RGAVRKAIEKKQKKVSQKEKKRRPQVGGPPPRMSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-219SDKGKGREEPRPKKEIPKRKNKHAPTEMSSKRPVPRMK
326-327KR
330-331GK
357-416GGRGAVRKAIEKKQKKVSQKEKKRRPQVGGPPPRMSREAGPSRKRTHGGEGGPRKRSRTS
Subcellular Location(s) mito 19, mito_nucl 13.833, cyto_mito 10.333, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MPRRPRPATRRVPSHIAAAASKSSVTAASAHGKSVSRKPSRKHFEEEEVSDSESSGSGSQHSESSPEESDASQSGSENSAEEFEEMDAEPDAPRVAQWVDEEELDALSDEASNSESDEEEEGEEVDHKRLEESLKTLPFGALRKAQKALAKVESDDESDEGGSSDYEPESEAESMSTSGARSDKGKGREEPRPKKEIPKRKNKHAPTEMSSKRPVPRMKLTTESKPPPRDPRFLPITGEFDRKRFHTQYGFLAEMHEQELKTLKENLKRARKLLANSPRDLREEREAEVQRLERAVKRAESMVNRDRQEKVQLEALSKVAKEEREKRQQGKKAWYMKDSDKKALLLRAKYEALASEGGRGAVRKAIEKKQKKVSQKEKKRRPQVGGPPPRMSREAGPSRKRTHGGEGGPRKRSRTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.62
3 0.53
4 0.45
5 0.38
6 0.32
7 0.25
8 0.23
9 0.17
10 0.15
11 0.12
12 0.12
13 0.1
14 0.13
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.24
19 0.27
20 0.31
21 0.38
22 0.44
23 0.47
24 0.54
25 0.61
26 0.69
27 0.76
28 0.77
29 0.77
30 0.74
31 0.73
32 0.73
33 0.69
34 0.62
35 0.54
36 0.49
37 0.41
38 0.34
39 0.25
40 0.17
41 0.14
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.17
58 0.17
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.06
80 0.06
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.22
121 0.22
122 0.23
123 0.23
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.22
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.27
132 0.3
133 0.3
134 0.32
135 0.33
136 0.3
137 0.29
138 0.27
139 0.27
140 0.25
141 0.23
142 0.2
143 0.16
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.14
170 0.19
171 0.24
172 0.29
173 0.33
174 0.38
175 0.46
176 0.56
177 0.61
178 0.61
179 0.63
180 0.6
181 0.65
182 0.7
183 0.72
184 0.71
185 0.72
186 0.72
187 0.76
188 0.85
189 0.81
190 0.81
191 0.78
192 0.74
193 0.67
194 0.7
195 0.62
196 0.56
197 0.52
198 0.46
199 0.41
200 0.43
201 0.42
202 0.37
203 0.43
204 0.43
205 0.44
206 0.48
207 0.48
208 0.47
209 0.52
210 0.53
211 0.51
212 0.53
213 0.54
214 0.57
215 0.58
216 0.57
217 0.52
218 0.53
219 0.51
220 0.47
221 0.45
222 0.37
223 0.37
224 0.34
225 0.38
226 0.31
227 0.28
228 0.29
229 0.28
230 0.33
231 0.29
232 0.31
233 0.29
234 0.31
235 0.34
236 0.36
237 0.35
238 0.28
239 0.27
240 0.23
241 0.19
242 0.18
243 0.14
244 0.1
245 0.1
246 0.13
247 0.12
248 0.14
249 0.2
250 0.23
251 0.28
252 0.35
253 0.44
254 0.51
255 0.53
256 0.53
257 0.54
258 0.54
259 0.51
260 0.54
261 0.55
262 0.5
263 0.5
264 0.52
265 0.48
266 0.47
267 0.45
268 0.39
269 0.36
270 0.33
271 0.32
272 0.37
273 0.36
274 0.34
275 0.36
276 0.33
277 0.27
278 0.27
279 0.27
280 0.21
281 0.24
282 0.26
283 0.23
284 0.24
285 0.26
286 0.29
287 0.31
288 0.35
289 0.39
290 0.43
291 0.43
292 0.45
293 0.45
294 0.42
295 0.46
296 0.4
297 0.35
298 0.34
299 0.34
300 0.33
301 0.32
302 0.31
303 0.25
304 0.22
305 0.22
306 0.18
307 0.21
308 0.27
309 0.34
310 0.42
311 0.51
312 0.59
313 0.66
314 0.73
315 0.77
316 0.78
317 0.79
318 0.78
319 0.78
320 0.75
321 0.7
322 0.66
323 0.68
324 0.69
325 0.64
326 0.61
327 0.54
328 0.51
329 0.5
330 0.52
331 0.49
332 0.43
333 0.41
334 0.4
335 0.39
336 0.36
337 0.33
338 0.26
339 0.22
340 0.21
341 0.18
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.14
349 0.16
350 0.2
351 0.27
352 0.36
353 0.46
354 0.55
355 0.62
356 0.7
357 0.77
358 0.8
359 0.84
360 0.86
361 0.86
362 0.89
363 0.92
364 0.92
365 0.95
366 0.95
367 0.93
368 0.9
369 0.89
370 0.89
371 0.89
372 0.89
373 0.86
374 0.83
375 0.77
376 0.73
377 0.65
378 0.57
379 0.51
380 0.5
381 0.53
382 0.56
383 0.62
384 0.66
385 0.7
386 0.74
387 0.73
388 0.66
389 0.65
390 0.63
391 0.62
392 0.64
393 0.69
394 0.7
395 0.75
396 0.74