Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1W0E711

Protein Details
Accession A0A1W0E711    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-365NSKQKEFSIKRLKNKIENDYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 7, cyto 3, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
Amino Acid Sequences MVLRNRINNLYRVFIQFIQKQNEHGINLDLSKFLNKLEKTRRIFCNAEQQLDTIQTRKSLSNKNGEEILQIWENEGIKAIVAKRISKPNIIHVEKVKEMCNCEVEIERFSFESNYKQILVIDKLEDLKKLEENLKTCTIEVFEHKYRTFKPFICYIGIYLINAEIYIVDMLRFKSVLRESKLLRCGIPKILHCEECARLLTQEFGDIGCYINFPQTEKSIYVDWRIRPIIPIMIDVIVKSLKNTVEKLKENIPFEKYMETEEEDFLEVFKAQNCLQEHYEALSEILETRAYYARMCNESVEYILSDEQILIFLQSCPKTMADVDVCLPRLSAEIRPYMTDFLTILNSKQKEFSIKRLKNKIENDYEIPEEITRGKKFGILEKDKTSCESTFEISDVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.43
3 0.43
4 0.47
5 0.51
6 0.48
7 0.47
8 0.51
9 0.51
10 0.44
11 0.39
12 0.34
13 0.28
14 0.29
15 0.27
16 0.21
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.23
22 0.23
23 0.32
24 0.41
25 0.5
26 0.55
27 0.63
28 0.67
29 0.66
30 0.68
31 0.63
32 0.64
33 0.58
34 0.56
35 0.48
36 0.43
37 0.38
38 0.38
39 0.35
40 0.26
41 0.23
42 0.21
43 0.23
44 0.26
45 0.32
46 0.37
47 0.42
48 0.5
49 0.51
50 0.52
51 0.52
52 0.48
53 0.42
54 0.34
55 0.31
56 0.23
57 0.2
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.16
62 0.16
63 0.12
64 0.09
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.2
70 0.25
71 0.34
72 0.37
73 0.41
74 0.42
75 0.46
76 0.55
77 0.53
78 0.53
79 0.49
80 0.51
81 0.48
82 0.49
83 0.43
84 0.36
85 0.36
86 0.34
87 0.3
88 0.25
89 0.23
90 0.25
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.18
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.14
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.21
106 0.22
107 0.19
108 0.17
109 0.16
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.29
121 0.31
122 0.3
123 0.28
124 0.26
125 0.22
126 0.2
127 0.21
128 0.24
129 0.23
130 0.27
131 0.27
132 0.3
133 0.31
134 0.35
135 0.37
136 0.32
137 0.32
138 0.32
139 0.34
140 0.32
141 0.3
142 0.25
143 0.24
144 0.21
145 0.17
146 0.13
147 0.11
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.11
162 0.16
163 0.21
164 0.23
165 0.27
166 0.3
167 0.36
168 0.4
169 0.36
170 0.33
171 0.29
172 0.28
173 0.29
174 0.31
175 0.26
176 0.29
177 0.31
178 0.31
179 0.29
180 0.3
181 0.25
182 0.23
183 0.22
184 0.15
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.19
209 0.22
210 0.22
211 0.25
212 0.25
213 0.24
214 0.22
215 0.22
216 0.2
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.15
231 0.21
232 0.27
233 0.29
234 0.32
235 0.36
236 0.39
237 0.4
238 0.42
239 0.38
240 0.33
241 0.31
242 0.3
243 0.24
244 0.21
245 0.2
246 0.18
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.16
260 0.17
261 0.21
262 0.22
263 0.22
264 0.21
265 0.2
266 0.2
267 0.15
268 0.13
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.14
280 0.18
281 0.2
282 0.21
283 0.2
284 0.19
285 0.2
286 0.19
287 0.17
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.17
306 0.16
307 0.21
308 0.17
309 0.19
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.22
314 0.21
315 0.15
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.22
321 0.23
322 0.25
323 0.26
324 0.26
325 0.24
326 0.21
327 0.17
328 0.14
329 0.18
330 0.16
331 0.17
332 0.23
333 0.24
334 0.24
335 0.26
336 0.27
337 0.33
338 0.36
339 0.45
340 0.48
341 0.55
342 0.64
343 0.72
344 0.78
345 0.77
346 0.81
347 0.8
348 0.77
349 0.75
350 0.69
351 0.63
352 0.58
353 0.49
354 0.43
355 0.33
356 0.26
357 0.25
358 0.27
359 0.24
360 0.24
361 0.23
362 0.25
363 0.28
364 0.34
365 0.41
366 0.42
367 0.47
368 0.54
369 0.57
370 0.55
371 0.56
372 0.52
373 0.42
374 0.38
375 0.35
376 0.31
377 0.28
378 0.28