FuNGI

A0A1W0E6N5

Protein Details

Accession

A0A1W0E6N5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
440-460	VDNCVKMKIVKKVSKNKPLIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13, cyto_nucl 11.5, nucl 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001233 RtcB IPR036025 RtcB-like_sf
Gene Ontology	GO:0005525 F:GTP binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008452 F:RNA ligase activity GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01139 RtcB

Amino Acid Sequences

MRLERHDDYILIENKHIIYMSKELQEILLNEKRDNDQSALSQIEEILKNSENKKLHLVGLSDMHAGYVFPVGSVVACEITENKGHISFSGIGGDINCGVRCLVTNLFYEDIKNDISKLADALYQAIPTVQNARVFLKDKKPLSQKEIKIILREGIKSLDNIKLYHEESILERVEIHKCEVKEETGNFIKMEGNIESNGSIKTDIEGITQKQIGKGIASIGSIGSGNHYLEIQKVDKVYDENSFLKKDQIVVFIHCGSRGLGHEINRNYNENNKEKDLFTEYSADKENIMLNCINAATNYAFVNREIISMIVKKVFKGFYGHSKIETLCDCGHNTIKIEKIENKEYIIHRKGASMVKKEEFMAVGGSMDTFSYILQGEECDKTFNSTCHGSGRVVPRTKANHLFKYEQVMENMEEIELRAETKRGIIEECGLCYKNIANVVDNCVKMKIVKKVSKNKPLIVIKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.26
4	0.18
5	0.16
6	0.21
7	0.25
8	0.26
9	0.26
10	0.25
11	0.26
12	0.28
13	0.26
14	0.27
15	0.28
16	0.27
17	0.27
18	0.3
19	0.33
20	0.33
21	0.36
22	0.3
23	0.27
24	0.27
25	0.3
26	0.28
27	0.25
28	0.22
29	0.19
30	0.22
31	0.2
32	0.19
33	0.19
34	0.21
35	0.26
36	0.28
37	0.35
38	0.32
39	0.33
40	0.38
41	0.38
42	0.38
43	0.36
44	0.36
45	0.31
46	0.31
47	0.31
48	0.25
49	0.22
50	0.19
51	0.15
52	0.13
53	0.1
54	0.09
55	0.07
56	0.06
57	0.06
58	0.06
59	0.06
60	0.07
61	0.07
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.08
66	0.1
67	0.12
68	0.12
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.17
74	0.17
75	0.16
76	0.16
77	0.15
78	0.13
79	0.13
80	0.14
81	0.11
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.12
89	0.12
90	0.13
91	0.15
92	0.17
93	0.18
94	0.18
95	0.18
96	0.16
97	0.16
98	0.14
99	0.13
100	0.11
101	0.11
102	0.12
103	0.11
104	0.11
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.12
109	0.12
110	0.11
111	0.1
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.13
116	0.13
117	0.14
118	0.16
119	0.18
120	0.22
121	0.25
122	0.3
123	0.34
124	0.4
125	0.4
126	0.47
127	0.54
128	0.55
129	0.59
130	0.63
131	0.58
132	0.59
133	0.65
134	0.58
135	0.52
136	0.48
137	0.44
138	0.37
139	0.35
140	0.27
141	0.21
142	0.2
143	0.18
144	0.19
145	0.2
146	0.18
147	0.17
148	0.19
149	0.2
150	0.2
151	0.21
152	0.18
153	0.15
154	0.15
155	0.19
156	0.16
157	0.13
158	0.12
159	0.13
160	0.16
161	0.16
162	0.17
163	0.17
164	0.17
165	0.19
166	0.2
167	0.2
168	0.21
169	0.21
170	0.24
171	0.23
172	0.24
173	0.22
174	0.21
175	0.2
176	0.16
177	0.18
178	0.12
179	0.11
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.1
193	0.1
194	0.12
195	0.15
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.14
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.12
225	0.11
226	0.14
227	0.16
228	0.17
229	0.19
230	0.18
231	0.19
232	0.18
233	0.19
234	0.16
235	0.18
236	0.17
237	0.17
238	0.19
239	0.19
240	0.18
241	0.15
242	0.14
243	0.1
244	0.11
245	0.1
246	0.13
247	0.14
248	0.16
249	0.22
250	0.23
251	0.27
252	0.28
253	0.29
254	0.25
255	0.29
256	0.33
257	0.33
258	0.35
259	0.33
260	0.33
261	0.32
262	0.34
263	0.33
264	0.27
265	0.23
266	0.25
267	0.22
268	0.22
269	0.24
270	0.22
271	0.16
272	0.16
273	0.18
274	0.13
275	0.15
276	0.13
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.07
282	0.09
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.12
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.11
296	0.12
297	0.15
298	0.15
299	0.15
300	0.18
301	0.18
302	0.18
303	0.2
304	0.22
305	0.27
306	0.34
307	0.35
308	0.32
309	0.34
310	0.33
311	0.32
312	0.3
313	0.24
314	0.18
315	0.2
316	0.2
317	0.2
318	0.22
319	0.21
320	0.22
321	0.21
322	0.24
323	0.24
324	0.27
325	0.31
326	0.34
327	0.38
328	0.37
329	0.36
330	0.37
331	0.4
332	0.45
333	0.42
334	0.4
335	0.35
336	0.35
337	0.38
338	0.4
339	0.43
340	0.4
341	0.42
342	0.4
343	0.41
344	0.41
345	0.37
346	0.3
347	0.23
348	0.18
349	0.12
350	0.1
351	0.09
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.1
364	0.12
365	0.13
366	0.14
367	0.14
368	0.19
369	0.21
370	0.2
371	0.22
372	0.23
373	0.24
374	0.25
375	0.28
376	0.24
377	0.28
378	0.36
379	0.41
380	0.43
381	0.43
382	0.47
383	0.5
384	0.57
385	0.61
386	0.6
387	0.59
388	0.6
389	0.63
390	0.57
391	0.6
392	0.57
393	0.5
394	0.43
395	0.38
396	0.33
397	0.3
398	0.28
399	0.19
400	0.15
401	0.12
402	0.12
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.11
408	0.13
409	0.15
410	0.16
411	0.18
412	0.18
413	0.24
414	0.25
415	0.28
416	0.3
417	0.28
418	0.27
419	0.26
420	0.26
421	0.22
422	0.26
423	0.25
424	0.25
425	0.27
426	0.34
427	0.39
428	0.38
429	0.35
430	0.31
431	0.3
432	0.29
433	0.34
434	0.36
435	0.41
436	0.48
437	0.57
438	0.67
439	0.77
440	0.83
441	0.84
442	0.8
443	0.79

A0A1W0E6N5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer