Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1S5Y3

Protein Details
Accession A0A1Y1S5Y3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-244KEMEAHARKKKRQLQEKKRERLDKSDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-239HARKKKRQLQEKKRER
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MPKEINRNSTRAFLVKMPKYLSNQIKECLENETIGHVKLDMTTSDTEAEIRFNRRFKPSQYKFMQRSMGKKDKQAVSXIEPQFMPKEINRNSTRAFLVKMPKYLSNQIKECLENETIGHVKLDMTTSDTEAEIRFNRRFKPSQYKFMQRSMGKKDKQAVSLEGNRIPLYELSRMMTVQPEMNDEYFQFKRALQQTSTHSTRMINHFEQLKRGEKYTGLKEMEAHARKKKRQLQEKKRERLDKSDAIDVLFKAFEKHGAWTVKDLADFTGQPVAYIQEIIGEIAVLDKKDYKNTYILKKQFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.44
3 0.47
4 0.46
5 0.47
6 0.49
7 0.56
8 0.58
9 0.57
10 0.55
11 0.54
12 0.54
13 0.5
14 0.46
15 0.41
16 0.34
17 0.26
18 0.23
19 0.25
20 0.22
21 0.21
22 0.2
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.16
36 0.17
37 0.22
38 0.26
39 0.29
40 0.34
41 0.4
42 0.45
43 0.5
44 0.57
45 0.59
46 0.64
47 0.68
48 0.73
49 0.7
50 0.71
51 0.72
52 0.64
53 0.65
54 0.65
55 0.67
56 0.6
57 0.61
58 0.62
59 0.58
60 0.58
61 0.54
62 0.48
63 0.46
64 0.49
65 0.46
66 0.38
67 0.37
68 0.33
69 0.3
70 0.29
71 0.23
72 0.26
73 0.26
74 0.34
75 0.34
76 0.39
77 0.41
78 0.43
79 0.45
80 0.39
81 0.39
82 0.37
83 0.44
84 0.44
85 0.47
86 0.46
87 0.47
88 0.49
89 0.56
90 0.58
91 0.57
92 0.55
93 0.54
94 0.54
95 0.5
96 0.46
97 0.41
98 0.34
99 0.26
100 0.23
101 0.25
102 0.22
103 0.21
104 0.2
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.16
118 0.17
119 0.22
120 0.26
121 0.29
122 0.34
123 0.4
124 0.45
125 0.5
126 0.57
127 0.59
128 0.64
129 0.68
130 0.73
131 0.7
132 0.71
133 0.72
134 0.64
135 0.65
136 0.65
137 0.67
138 0.6
139 0.61
140 0.62
141 0.57
142 0.55
143 0.49
144 0.42
145 0.37
146 0.39
147 0.36
148 0.29
149 0.27
150 0.24
151 0.22
152 0.2
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.16
171 0.15
172 0.16
173 0.15
174 0.14
175 0.2
176 0.25
177 0.28
178 0.24
179 0.29
180 0.32
181 0.39
182 0.41
183 0.34
184 0.3
185 0.28
186 0.32
187 0.33
188 0.34
189 0.27
190 0.29
191 0.35
192 0.35
193 0.38
194 0.37
195 0.38
196 0.33
197 0.34
198 0.32
199 0.29
200 0.34
201 0.34
202 0.38
203 0.32
204 0.31
205 0.31
206 0.33
207 0.39
208 0.39
209 0.39
210 0.4
211 0.48
212 0.53
213 0.62
214 0.67
215 0.68
216 0.73
217 0.8
218 0.83
219 0.85
220 0.91
221 0.91
222 0.91
223 0.9
224 0.83
225 0.8
226 0.77
227 0.73
228 0.66
229 0.62
230 0.53
231 0.45
232 0.43
233 0.34
234 0.27
235 0.2
236 0.17
237 0.13
238 0.12
239 0.15
240 0.14
241 0.16
242 0.22
243 0.25
244 0.26
245 0.28
246 0.31
247 0.29
248 0.29
249 0.26
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.18
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.07
267 0.06
268 0.09
269 0.11
270 0.09
271 0.1
272 0.15
273 0.18
274 0.26
275 0.29
276 0.3
277 0.37
278 0.44
279 0.53
280 0.58