FuNGI

A0A1Y1S4R4

Protein Details

Accession

A0A1Y1S4R4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
199-232	RSINQIKNKVNNRPPKHGRYKSEQHNDQKRHRLT	Hydrophilic
254-277	DHYRSSCPKLARRPEPKRVNATTK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13975 gag-asp_proteas PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSKSSNHKHVRVKAHDEPPYDNIGNMQRTEQADQEFEGIIKNFAKAQNLREYNGNQKGREALEWLESLIVYEEEWSSQKLLKQIAVLLKGKAKIWFKALENDEITNFEEFKVRFKAKYGNQEDKNIETINLFKILSDGPRNTLSEWILLIKWKNKNANLEFDVIRSAVNQHVYSQYHEVFDRCENILEMAEKAEENNIRSINQIKNKVNNRPPKHGRYKSEQHNDQKRHRLTDQKEESRNKGNSQVRCYECGGDHYRSSCPKLARRPEPKRVNATTKMKDDDHIKDNHRSVNNLELEVSDKEVENTGSGIVIKDKHVFALIDTGANCSFIAPRVVDALNLEKISCDQIRVKTASQELSWLKYKIRLTVQVGQDQFDHEVYVFNEMNQDVILGMDFLRKADGLVDAVGSTVRLNSLTFNMIDRNQLIRSHDDLDLKEKEERTIRVIVQGVGRSEYLRDDLVGVPSLVSKESPYLTIKVLKRTMIQRDDIIGTIKFVDVGIKEVQHLEIDKYVNRDIYSALLSYDQKLRSLDGFRKLPEHAIRVIPNVSSTFIRQYRLNQEKISEVVKQTKELVDRDRIQESCSQWNFPLVLVKKKNGKWRMCVDFKKLNDVTTDEKCSPPLIEDCLDALAGATVFSTLDLDSGYHQIRMDRDSSKYTAFTTPIGRFEYKVMPFGLKNAPACFQSIMFNVLQKFINKTCIVYLDDIIIYSHGIEQHVQHVREILLELANYGLRLNFDKCEFALEEVSFLGFTIGNNSVRPNDSKKKTILAAIAQCNTHKKLHSILGMLGYFRSFIHGFTSRTRHMYQIINQKSELNIPMIQKQLTDLTTAVFSEGFLQLPDINKPFIIETDASGIGIGGVLKQSQNNSEKCIRFVSRTLRPDEQKWSATDLEALSIIYCIKKFQHYLHGRFTLRTDHKPLLQLQSMKDPVGKYARWRMFLNQFSFDTVHIPGRDNNMADYLSRTVNSLEKVSNEEISRIISAHRECGHACPAVTYVHMKNNNLGLIPVRRIKEVLDNCKQCIHNNRGRVHEMRAISRGEPFGMIGIDCMGPLPKTAHGNKFIILCTDYATGWVEGISTKNKSADNVKRLLWKNIFTRFGPPSEIRCDCGREFTSSLIRDLARDWNCKMRYSAPYAPYSNGRIERTNQSIILKLSKLLEGKFDWDELLELALFSQRITPNARSGISPYQLVFGREVFERVNTLTLDDKELYELKRAQFMSNLERIMTKNELHEQQLEARNKGRSPADDLKENDLVVYKTKEITNNKFGQKFIGPFTVVKTHGHGTCSIRSIETGCVIKAARKDLKPINQADLDRVESVMEAGNGASHGGGMLPFNPIVRLKTMRRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.79
3	0.72
4	0.68
5	0.61
6	0.6
7	0.52
8	0.42
9	0.37
10	0.38
11	0.38
12	0.34
13	0.32
14	0.3
15	0.33
16	0.35
17	0.34
18	0.3
19	0.28
20	0.27
21	0.28
22	0.23
23	0.2
24	0.21
25	0.17
26	0.17
27	0.17
28	0.17
29	0.19
30	0.21
31	0.29
32	0.29
33	0.35
34	0.42
35	0.45
36	0.46
37	0.48
38	0.5
39	0.52
40	0.58
41	0.58
42	0.48
43	0.47
44	0.5
45	0.45
46	0.43
47	0.36
48	0.28
49	0.26
50	0.26
51	0.24
52	0.19
53	0.17
54	0.16
55	0.14
56	0.12
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.1
61	0.11
62	0.12
63	0.13
64	0.16
65	0.19
66	0.22
67	0.25
68	0.25
69	0.26
70	0.3
71	0.34
72	0.38
73	0.37
74	0.36
75	0.38
76	0.38
77	0.38
78	0.4
79	0.38
80	0.35
81	0.38
82	0.41
83	0.39
84	0.46
85	0.47
86	0.47
87	0.45
88	0.43
89	0.39
90	0.35
91	0.34
92	0.26
93	0.23
94	0.17
95	0.2
96	0.19
97	0.23
98	0.3
99	0.31
100	0.31
101	0.34
102	0.43
103	0.45
104	0.56
105	0.59
106	0.61
107	0.62
108	0.69
109	0.68
110	0.62
111	0.58
112	0.48
113	0.39
114	0.3
115	0.28
116	0.23
117	0.22
118	0.19
119	0.15
120	0.16
121	0.17
122	0.21
123	0.25
124	0.24
125	0.26
126	0.29
127	0.31
128	0.3
129	0.32
130	0.28
131	0.23
132	0.22
133	0.2
134	0.18
135	0.21
136	0.25
137	0.29
138	0.34
139	0.4
140	0.47
141	0.5
142	0.6
143	0.59
144	0.63
145	0.58
146	0.56
147	0.49
148	0.42
149	0.39
150	0.29
151	0.24
152	0.16
153	0.15
154	0.14
155	0.18
156	0.17
157	0.18
158	0.23
159	0.25
160	0.28
161	0.31
162	0.29
163	0.27
164	0.28
165	0.27
166	0.24
167	0.26
168	0.25
169	0.21
170	0.21
171	0.19
172	0.19
173	0.2
174	0.18
175	0.15
176	0.13
177	0.13
178	0.11
179	0.11
180	0.16
181	0.16
182	0.17
183	0.21
184	0.21
185	0.21
186	0.23
187	0.29
188	0.31
189	0.37
190	0.44
191	0.45
192	0.54
193	0.62
194	0.7
195	0.73
196	0.76
197	0.75
198	0.77
199	0.8
200	0.81
201	0.85
202	0.83
203	0.81
204	0.8
205	0.83
206	0.82
207	0.84
208	0.83
209	0.82
210	0.84
211	0.86
212	0.85
213	0.86
214	0.8
215	0.76
216	0.73
217	0.72
218	0.68
219	0.7
220	0.71
221	0.7
222	0.74
223	0.73
224	0.73
225	0.72
226	0.69
227	0.61
228	0.6
229	0.58
230	0.56
231	0.56
232	0.6
233	0.53
234	0.54
235	0.53
236	0.46
237	0.4
238	0.4
239	0.39
240	0.34
241	0.33
242	0.32
243	0.35
244	0.36
245	0.4
246	0.38
247	0.39
248	0.44
249	0.52
250	0.6
251	0.65
252	0.72
253	0.77
254	0.83
255	0.86
256	0.85
257	0.84
258	0.82
259	0.8
260	0.78
261	0.78
262	0.74
263	0.69
264	0.66
265	0.58
266	0.54
267	0.52
268	0.48
269	0.45
270	0.45
271	0.44
272	0.47
273	0.49
274	0.53
275	0.49
276	0.45
277	0.41
278	0.42
279	0.4
280	0.33
281	0.29
282	0.22
283	0.24
284	0.22
285	0.22
286	0.14
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.13
291	0.1
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.12
300	0.15
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.18
307	0.16
308	0.15
309	0.15
310	0.17
311	0.15
312	0.16
313	0.15
314	0.1
315	0.1
316	0.09
317	0.11
318	0.09
319	0.1
320	0.12
321	0.13
322	0.12
323	0.13
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.15
328	0.12
329	0.13
330	0.17
331	0.16
332	0.15
333	0.17
334	0.21
335	0.27
336	0.3
337	0.3
338	0.3
339	0.33
340	0.32
341	0.28
342	0.31
343	0.27
344	0.28
345	0.31
346	0.28
347	0.26
348	0.29
349	0.31
350	0.3
351	0.33
352	0.35
353	0.37
354	0.43
355	0.46
356	0.46
357	0.45
358	0.4
359	0.36
360	0.31
361	0.26
362	0.19
363	0.16
364	0.09
365	0.11
366	0.1
367	0.15
368	0.13
369	0.12
370	0.14
371	0.13
372	0.13
373	0.11
374	0.11
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.15
409	0.16
410	0.16
411	0.18
412	0.19
413	0.2
414	0.22
415	0.24
416	0.25
417	0.25
418	0.25
419	0.28
420	0.28
421	0.26
422	0.28
423	0.25
424	0.25
425	0.27
426	0.27
427	0.26
428	0.28
429	0.26
430	0.27
431	0.27
432	0.26
433	0.24
434	0.25
435	0.22
436	0.18
437	0.18
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.11
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.1
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.08
453	0.07
454	0.06
455	0.07
456	0.08
457	0.1
458	0.12
459	0.13
460	0.15
461	0.22
462	0.24
463	0.29
464	0.31
465	0.3
466	0.32
467	0.37
468	0.43
469	0.39
470	0.39
471	0.33
472	0.33
473	0.33
474	0.29
475	0.25
476	0.17
477	0.13
478	0.12
479	0.11
480	0.08
481	0.07
482	0.08
483	0.06
484	0.09
485	0.1
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.1
491	0.11
492	0.09
493	0.11
494	0.12
495	0.13
496	0.15
497	0.16
498	0.17
499	0.16
500	0.16
501	0.13
502	0.13
503	0.13
504	0.1
505	0.09
506	0.1
507	0.11
508	0.12
509	0.16
510	0.15
511	0.16
512	0.16
513	0.17
514	0.17
515	0.22
516	0.25
517	0.27
518	0.29
519	0.29
520	0.31
521	0.3
522	0.32
523	0.31
524	0.28
525	0.24
526	0.25
527	0.25
528	0.24
529	0.25
530	0.19
531	0.17
532	0.15
533	0.14
534	0.11
535	0.11
536	0.16
537	0.16
538	0.19
539	0.19
540	0.23
541	0.32
542	0.37
543	0.39
544	0.34
545	0.34
546	0.33
547	0.33
548	0.31
549	0.23
550	0.18
551	0.23
552	0.23
553	0.23
554	0.23
555	0.24
556	0.25
557	0.25
558	0.27
559	0.26
560	0.28
561	0.3
562	0.32
563	0.3
564	0.28
565	0.3
566	0.29
567	0.31
568	0.29
569	0.28
570	0.24
571	0.26
572	0.25
573	0.2
574	0.24
575	0.17
576	0.25
577	0.26
578	0.29
579	0.35
580	0.39
581	0.48
582	0.51
583	0.53
584	0.51
585	0.57
586	0.61
587	0.62
588	0.61
589	0.59
590	0.57
591	0.53
592	0.55
593	0.48
594	0.41
595	0.33
596	0.32
597	0.3
598	0.25
599	0.29
600	0.22
601	0.22
602	0.21
603	0.2
604	0.18
605	0.15
606	0.13
607	0.12
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.08
614	0.07
615	0.05
616	0.04
617	0.03
618	0.03
619	0.02
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.04
627	0.05
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.09
632	0.1
633	0.11
634	0.13
635	0.15
636	0.14
637	0.15
638	0.18
639	0.19
640	0.19
641	0.18
642	0.19
643	0.18
644	0.17
645	0.16
646	0.18
647	0.18
648	0.19
649	0.21
650	0.2
651	0.19
652	0.2
653	0.24
654	0.2
655	0.21
656	0.19
657	0.17
658	0.17
659	0.2
660	0.2
661	0.17
662	0.17
663	0.16
664	0.17
665	0.16
666	0.17
667	0.14
668	0.12
669	0.11
670	0.11
671	0.12
672	0.11
673	0.13
674	0.12
675	0.13
676	0.13
677	0.12
678	0.15
679	0.13
680	0.18
681	0.16
682	0.16
683	0.15
684	0.16
685	0.17
686	0.15
687	0.15
688	0.11
689	0.1
690	0.1
691	0.09
692	0.07
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.06
699	0.06
700	0.13
701	0.18
702	0.18
703	0.17
704	0.17
705	0.17
706	0.17
707	0.17
708	0.11
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.04
717	0.05
718	0.07
719	0.08
720	0.09
721	0.09
722	0.1
723	0.1
724	0.12
725	0.12
726	0.11
727	0.12
728	0.11
729	0.11
730	0.1
731	0.1
732	0.07
733	0.07
734	0.06
735	0.04
736	0.04
737	0.06
738	0.09
739	0.09
740	0.1
741	0.11
742	0.12
743	0.13
744	0.16
745	0.2
746	0.28
747	0.31
748	0.35
749	0.36
750	0.38
751	0.37
752	0.38
753	0.33
754	0.29
755	0.3
756	0.29
757	0.3
758	0.27
759	0.27
760	0.27
761	0.27
762	0.24
763	0.2
764	0.18
765	0.2
766	0.24
767	0.25
768	0.23
769	0.22
770	0.22
771	0.21
772	0.2
773	0.16
774	0.11
775	0.1
776	0.08
777	0.1
778	0.08
779	0.08
780	0.12
781	0.16
782	0.18
783	0.22
784	0.28
785	0.26
786	0.3
787	0.31
788	0.28
789	0.28
790	0.3
791	0.33
792	0.38
793	0.4
794	0.38
795	0.37
796	0.36
797	0.33
798	0.31
799	0.25
800	0.17
801	0.16
802	0.16
803	0.19
804	0.2
805	0.2
806	0.17
807	0.17
808	0.17
809	0.14
810	0.14
811	0.11
812	0.09
813	0.1
814	0.1
815	0.09
816	0.06
817	0.06
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.06
822	0.07
823	0.08
824	0.09
825	0.11
826	0.11
827	0.11
828	0.1
829	0.11
830	0.11
831	0.1
832	0.12
833	0.09
834	0.09
835	0.12
836	0.12
837	0.11
838	0.11
839	0.1
840	0.07
841	0.07
842	0.06
843	0.03
844	0.03
845	0.04
846	0.05
847	0.06
848	0.07
849	0.13
850	0.2
851	0.2
852	0.25
853	0.32
854	0.33
855	0.34
856	0.38
857	0.34
858	0.3
859	0.35
860	0.38
861	0.39
862	0.42
863	0.46
864	0.48
865	0.49
866	0.5
867	0.51
868	0.48
869	0.42
870	0.38
871	0.37
872	0.31
873	0.28
874	0.26
875	0.19
876	0.15
877	0.13
878	0.11
879	0.07
880	0.07
881	0.07
882	0.06
883	0.06
884	0.07
885	0.08
886	0.12
887	0.14
888	0.17
889	0.27
890	0.35
891	0.4
892	0.46
893	0.52
894	0.49
895	0.48
896	0.47
897	0.46
898	0.42
899	0.42
900	0.41
901	0.36
902	0.38
903	0.41
904	0.42
905	0.38
906	0.38
907	0.36
908	0.32
909	0.37
910	0.35
911	0.32
912	0.31
913	0.26
914	0.25
915	0.27
916	0.27
917	0.24
918	0.33
919	0.37
920	0.38
921	0.39
922	0.41
923	0.45
924	0.5
925	0.49
926	0.42
927	0.38
928	0.37
929	0.36
930	0.31
931	0.24
932	0.19
933	0.19
934	0.16
935	0.18
936	0.18
937	0.22
938	0.24
939	0.22
940	0.21
941	0.19
942	0.18
943	0.17
944	0.17
945	0.14
946	0.13
947	0.12
948	0.13
949	0.12
950	0.15
951	0.16
952	0.16
953	0.15
954	0.15
955	0.19
956	0.2
957	0.22
958	0.2
959	0.19
960	0.17
961	0.18
962	0.17
963	0.13
964	0.12
965	0.14
966	0.15
967	0.19
968	0.2
969	0.21
970	0.21
971	0.24
972	0.27
973	0.23
974	0.23
975	0.18
976	0.18
977	0.17
978	0.17
979	0.18
980	0.17
981	0.23
982	0.27
983	0.27
984	0.28
985	0.3
986	0.3
987	0.26
988	0.23
989	0.19
990	0.19
991	0.23
992	0.25
993	0.23
994	0.23
995	0.24
996	0.25
997	0.31
998	0.36
999	0.41
1000	0.45
1001	0.46
1002	0.47
1003	0.53
1004	0.52
1005	0.48
1006	0.49
1007	0.49
1008	0.46
1009	0.51
1010	0.55
1011	0.54
1012	0.59
1013	0.56
1014	0.51
1015	0.48
1016	0.44
1017	0.39
1018	0.38
1019	0.35
1020	0.3
1021	0.3
1022	0.26
1023	0.21
1024	0.18
1025	0.15
1026	0.12
1027	0.11
1028	0.1
1029	0.07
1030	0.08
1031	0.07
1032	0.06
1033	0.07
1034	0.06
1035	0.06
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.11
1039	0.18
1040	0.24
1041	0.3
1042	0.34
1043	0.36
1044	0.37
1045	0.37
1046	0.34
1047	0.3
1048	0.25
1049	0.19
1050	0.17
1051	0.17
1052	0.14
1053	0.13
1054	0.15
1055	0.12
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.11
1061	0.14
1062	0.14
1063	0.16
1064	0.19
1065	0.2
1066	0.22
1067	0.32
1068	0.39
1069	0.41
1070	0.43
1071	0.45
1072	0.51
1073	0.53
1074	0.59
1075	0.54
1076	0.5
1077	0.51
1078	0.54
1079	0.55
1080	0.47
1081	0.5
1082	0.45
1083	0.42
1084	0.42
1085	0.38
1086	0.35
1087	0.39
1088	0.39
1089	0.36
1090	0.36
1091	0.39
1092	0.34
1093	0.38
1094	0.35
1095	0.32
1096	0.32
1097	0.32
1098	0.37
1099	0.33
1100	0.33
1101	0.3
1102	0.28
1103	0.24
1104	0.24
1105	0.3
1106	0.28
1107	0.31
1108	0.32
1109	0.38
1110	0.4
1111	0.41
1112	0.42
1113	0.4
1114	0.41
1115	0.45
1116	0.5
1117	0.46
1118	0.5
1119	0.5
1120	0.5
1121	0.47
1122	0.44
1123	0.43
1124	0.4
1125	0.38
1126	0.36
1127	0.39
1128	0.43
1129	0.44
1130	0.44
1131	0.4
1132	0.36
1133	0.37
1134	0.35
1135	0.35
1136	0.29
1137	0.25
1138	0.24
1139	0.25
1140	0.26
1141	0.23
1142	0.25
1143	0.22
1144	0.25
1145	0.24
1146	0.23
1147	0.19
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.13
1151	0.13
1152	0.08
1153	0.07
1154	0.07
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.07
1158	0.13
1159	0.13
1160	0.16
1161	0.22
1162	0.24
1163	0.28
1164	0.32
1165	0.33
1166	0.28
1167	0.33
1168	0.36
1169	0.33
1170	0.32
1171	0.27
1172	0.28
1173	0.29
1174	0.29
1175	0.25
1176	0.19
1177	0.19
1178	0.18
1179	0.2
1180	0.16
1181	0.15
1182	0.16
1183	0.16
1184	0.18
1185	0.15
1186	0.16
1187	0.19
1188	0.2
1189	0.23
1190	0.22
1191	0.21
1192	0.21
1193	0.25
1194	0.25
1195	0.26
1196	0.3
1197	0.27
1198	0.33
1199	0.34
1200	0.33
1201	0.34
1202	0.37
1203	0.37
1204	0.38
1205	0.37
1206	0.31
1207	0.32
1208	0.32
1209	0.31
1210	0.31
1211	0.25
1212	0.25
1213	0.31
1214	0.34
1215	0.34
1216	0.35
1217	0.33
1218	0.38
1219	0.45
1220	0.45
1221	0.41
1222	0.43
1223	0.45
1224	0.43
1225	0.47
1226	0.43
1227	0.37
1228	0.42
1229	0.49
1230	0.49
1231	0.52
1232	0.54
1233	0.54
1234	0.51
1235	0.48
1236	0.39
1237	0.32
1238	0.28
1239	0.25
1240	0.26
1241	0.21
1242	0.22
1243	0.25
1244	0.33
1245	0.39
1246	0.46
1247	0.51
1248	0.56
1249	0.62
1250	0.62
1251	0.59
1252	0.57
1253	0.54
1254	0.49
1255	0.44
1256	0.41
1257	0.35
1258	0.33
1259	0.37
1260	0.38
1261	0.34
1262	0.32
1263	0.31
1264	0.32
1265	0.32
1266	0.33
1267	0.34
1268	0.33
1269	0.36
1270	0.38
1271	0.35
1272	0.3
1273	0.29
1274	0.29
1275	0.27
1276	0.28
1277	0.24
1278	0.21
1279	0.23
1280	0.23
1281	0.26
1282	0.28
1283	0.35
1284	0.37
1285	0.38
1286	0.46
1287	0.52
1288	0.61
1289	0.65
1290	0.64
1291	0.62
1292	0.6
1293	0.59
1294	0.55
1295	0.5
1296	0.44
1297	0.36
1298	0.32
1299	0.25
1300	0.19
1301	0.19
1302	0.16
1303	0.11
1304	0.09
1305	0.08
1306	0.08
1307	0.08
1308	0.08
1309	0.07
1310	0.05
1311	0.05
1312	0.05
1313	0.06
1314	0.06
1315	0.07
1316	0.09
1317	0.1
1318	0.11
1319	0.14
1320	0.15
1321	0.17
1322	0.23
1323	0.29

A0A1Y1S4R4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer