Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1S9M5

Protein Details
Accession A0A1Y1S9M5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-372YGEYVKESEKKKRNKKGMVKRSKKKHNFETVEEAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-363EKKKRNKKGMVKRSKKKH
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51134  ZF_TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
Amino Acid Sequences MQSQCTNCGSTEMQTDSTRGIICCEECGMIQEENMIVNTIQFEKVQNKSALHGQIVNVENKNVGTKYVDSCYYIKNTIKNICAKLSLNLKHADIAFRWYKLCLANNLTKGKSILYTLSACIYISCRQENTPHMLIDFSNVLRIDMYQIGKIYLKIRNTFDLETYKIQNSMTDMSMYLHRFASQLKFRNTKEIILLSTRILSRMRKDWIMEGRKPNNACGAAILLASRILNEPKDVNEVARVVHAAPSTISKRLAEIAATETAAMDVNEFNREWLVSESQPPVLNAREGGKETGETRRILVNKVKREEEIAENSSEVVNEMILEESEVENKTKMWEEMYGEYVKESEKKKRNKKGMVKRSKKKHNFETVEEAFKSLDKKVSSKLNYSAINELFEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.25
4 0.26
5 0.26
6 0.2
7 0.2
8 0.19
9 0.19
10 0.19
11 0.2
12 0.18
13 0.16
14 0.19
15 0.2
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.16
30 0.21
31 0.24
32 0.31
33 0.33
34 0.32
35 0.34
36 0.4
37 0.4
38 0.35
39 0.34
40 0.28
41 0.31
42 0.34
43 0.36
44 0.3
45 0.27
46 0.26
47 0.24
48 0.27
49 0.19
50 0.17
51 0.15
52 0.17
53 0.2
54 0.23
55 0.24
56 0.24
57 0.25
58 0.28
59 0.29
60 0.31
61 0.31
62 0.33
63 0.38
64 0.4
65 0.44
66 0.48
67 0.46
68 0.43
69 0.44
70 0.4
71 0.39
72 0.42
73 0.41
74 0.38
75 0.37
76 0.35
77 0.34
78 0.34
79 0.31
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.22
84 0.23
85 0.2
86 0.23
87 0.24
88 0.27
89 0.25
90 0.28
91 0.33
92 0.39
93 0.43
94 0.41
95 0.38
96 0.36
97 0.31
98 0.26
99 0.21
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.2
114 0.24
115 0.27
116 0.31
117 0.29
118 0.26
119 0.24
120 0.24
121 0.22
122 0.2
123 0.18
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.13
132 0.14
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.17
140 0.2
141 0.23
142 0.25
143 0.27
144 0.3
145 0.29
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.24
150 0.25
151 0.22
152 0.2
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.18
169 0.21
170 0.27
171 0.31
172 0.38
173 0.37
174 0.45
175 0.45
176 0.4
177 0.36
178 0.3
179 0.26
180 0.21
181 0.22
182 0.14
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.19
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.25
194 0.32
195 0.37
196 0.4
197 0.44
198 0.45
199 0.48
200 0.48
201 0.44
202 0.39
203 0.33
204 0.27
205 0.19
206 0.16
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.11
261 0.13
262 0.12
263 0.16
264 0.18
265 0.2
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.18
270 0.18
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.24
280 0.25
281 0.22
282 0.22
283 0.27
284 0.28
285 0.31
286 0.38
287 0.39
288 0.45
289 0.49
290 0.5
291 0.45
292 0.47
293 0.46
294 0.44
295 0.42
296 0.36
297 0.31
298 0.29
299 0.29
300 0.25
301 0.21
302 0.15
303 0.09
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.18
322 0.2
323 0.23
324 0.26
325 0.25
326 0.22
327 0.22
328 0.21
329 0.19
330 0.22
331 0.24
332 0.31
333 0.39
334 0.5
335 0.61
336 0.71
337 0.79
338 0.84
339 0.9
340 0.91
341 0.93
342 0.94
343 0.94
344 0.94
345 0.94
346 0.94
347 0.94
348 0.93
349 0.92
350 0.91
351 0.87
352 0.83
353 0.82
354 0.76
355 0.72
356 0.62
357 0.53
358 0.42
359 0.37
360 0.33
361 0.26
362 0.27
363 0.23
364 0.26
365 0.32
366 0.41
367 0.44
368 0.48
369 0.51
370 0.52
371 0.54
372 0.54
373 0.55
374 0.47