FuNGI

A0A1Y1S6E0

Protein Details

Accession

A0A1Y1S6E0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
339-359	VAFEREQERKKQKNREIEKEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MFDKPCSFKPDRVRGICYSPGNIVYMRLTNFQTFSDQEFYFSEKLNLIAAPNGTGKSSLANAIAFVFNGTTRTIGKTKDVLDFIKFKEEKAEIICVVAQKPNGVTDSIKKQKTGNYVEFRRVIQRKRAKAESIFYIDETQRNSADYGAFIGRMKIDCDNLTNFLPQERVAEFVRMSGDKMFNEVMKDVLMGEKWTIGEKLGEFEKTKKELDGTKTNLESSNKQFTLLEQKKTMLEKEVDKIREFEIKQREIRVLQYKEFYLRKKKEMEDMRGWKEVLDGVISTKDDNEKQIGALVEIVGAAEESTMMKEFYAKVEIYLRENVGLRELVGKMEEYRREYVAFEREQERKKQKNREIEKENEAVEEKRAILVEKIGEELRSYVGSFDRFVNEGVFEITIENQPVSRTNKMKELSLNEIRTNLTKSINECTEQTVRRFQLRDSAGSDALERIQRLKMTALQNKKLIEAHETERIRFNEKAGQRLMRLRSYHEDTYRAVEHLRRNQIGVEFYEPAFLHIEIDEEFRTEIEALLNFQALSSFLVKSNSDMKKMARILKDELRLGVNICTLTEETSLQSKFNSPEIDGSATDFITCNPIYKHFFNTYGRFNEIPISKKEINEKALLSKYPFVRKMIINQKLVEIKRNKYNSEAILKTDRIREMGIFRSSSPNTGDLERLESELKELKNKRNQIQAEMGHEMLKKQQIDERRATITQLNEKINEKYFVIKRCIDKHFTTSERSLYDLSSGRGDECRRLFKNALSKMTEFKLHRINYNQAKETEMNITNNKMQIETLKTATVALVEEVTRVRVKIREKGEMVGNYQAMMDEMEANESARNRKMTRRANLTQTQDGGSRLSLIQVGSQQSQDALFQFAVSNQIGSFREEINRNQANSLNEVMQRRSYLDEIVRGNDLDESVKQAYTTAERDWGRMAEEKKSYELALIGLEKKADKIRDAIRTGATNHVGPISSRFGQMLSRLGNQGELRVVCDSGAGRELAKFELQIWVRFKEGENLQQLTSFRQSGGEKSLSTMLFLLALQSGTDNFRLVDEINQGMDQNNEKRVFEILNLMTGQFFIITPKLISDIEYSENYNVLILYGGTGTKEVERL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.68
3	0.68
4	0.61
5	0.52
6	0.45
7	0.41
8	0.37
9	0.33
10	0.28
11	0.24
12	0.25
13	0.24
14	0.25
15	0.26
16	0.27
17	0.28
18	0.27
19	0.28
20	0.26
21	0.28
22	0.3
23	0.27
24	0.26
25	0.26
26	0.3
27	0.27
28	0.27
29	0.24
30	0.2
31	0.2
32	0.19
33	0.19
34	0.15
35	0.16
36	0.16
37	0.16
38	0.17
39	0.17
40	0.16
41	0.16
42	0.16
43	0.15
44	0.16
45	0.15
46	0.15
47	0.14
48	0.14
49	0.15
50	0.15
51	0.13
52	0.12
53	0.1
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.11
59	0.17
60	0.2
61	0.21
62	0.26
63	0.3
64	0.32
65	0.37
66	0.39
67	0.36
68	0.38
69	0.41
70	0.39
71	0.44
72	0.41
73	0.35
74	0.38
75	0.37
76	0.35
77	0.33
78	0.36
79	0.26
80	0.27
81	0.29
82	0.24
83	0.25
84	0.25
85	0.21
86	0.19
87	0.19
88	0.2
89	0.2
90	0.19
91	0.2
92	0.23
93	0.34
94	0.41
95	0.42
96	0.41
97	0.43
98	0.48
99	0.55
100	0.57
101	0.56
102	0.57
103	0.6
104	0.65
105	0.65
106	0.6
107	0.61
108	0.61
109	0.58
110	0.58
111	0.63
112	0.65
113	0.71
114	0.75
115	0.72
116	0.7
117	0.68
118	0.65
119	0.61
120	0.53
121	0.46
122	0.44
123	0.39
124	0.36
125	0.33
126	0.28
127	0.23
128	0.23
129	0.22
130	0.19
131	0.17
132	0.15
133	0.15
134	0.13
135	0.14
136	0.13
137	0.14
138	0.15
139	0.15
140	0.17
141	0.16
142	0.18
143	0.18
144	0.21
145	0.23
146	0.24
147	0.25
148	0.25
149	0.23
150	0.21
151	0.21
152	0.18
153	0.19
154	0.16
155	0.18
156	0.17
157	0.19
158	0.17
159	0.18
160	0.21
161	0.18
162	0.19
163	0.2
164	0.22
165	0.19
166	0.22
167	0.22
168	0.2
169	0.21
170	0.2
171	0.16
172	0.13
173	0.13
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.09
178	0.09
179	0.1
180	0.1
181	0.12
182	0.11
183	0.11
184	0.12
185	0.12
186	0.15
187	0.15
188	0.18
189	0.18
190	0.23
191	0.29
192	0.3
193	0.31
194	0.29
195	0.31
196	0.35
197	0.4
198	0.45
199	0.43
200	0.46
201	0.46
202	0.46
203	0.47
204	0.44
205	0.42
206	0.39
207	0.44
208	0.38
209	0.37
210	0.36
211	0.34
212	0.41
213	0.42
214	0.41
215	0.33
216	0.35
217	0.38
218	0.4
219	0.39
220	0.33
221	0.31
222	0.3
223	0.34
224	0.4
225	0.39
226	0.38
227	0.38
228	0.35
229	0.39
230	0.36
231	0.37
232	0.39
233	0.42
234	0.44
235	0.45
236	0.47
237	0.4
238	0.46
239	0.48
240	0.43
241	0.4
242	0.4
243	0.38
244	0.42
245	0.46
246	0.46
247	0.47
248	0.48
249	0.52
250	0.56
251	0.57
252	0.59
253	0.63
254	0.64
255	0.63
256	0.67
257	0.65
258	0.61
259	0.58
260	0.48
261	0.4
262	0.33
263	0.23
264	0.15
265	0.11
266	0.09
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.11
271	0.14
272	0.14
273	0.16
274	0.17
275	0.16
276	0.15
277	0.18
278	0.17
279	0.14
280	0.13
281	0.1
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.04
286	0.04
287	0.03
288	0.02
289	0.03
290	0.03
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.09
298	0.12
299	0.11
300	0.12
301	0.18
302	0.19
303	0.21
304	0.23
305	0.22
306	0.2
307	0.21
308	0.2
309	0.17
310	0.15
311	0.12
312	0.13
313	0.13
314	0.11
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.17
319	0.2
320	0.21
321	0.23
322	0.24
323	0.24
324	0.25
325	0.26
326	0.28
327	0.25
328	0.25
329	0.28
330	0.34
331	0.38
332	0.46
333	0.52
334	0.55
335	0.63
336	0.7
337	0.73
338	0.76
339	0.81
340	0.82
341	0.8
342	0.76
343	0.73
344	0.65
345	0.58
346	0.48
347	0.41
348	0.32
349	0.25
350	0.21
351	0.15
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.1
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.1
378	0.1
379	0.08
380	0.07
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.12
389	0.16
390	0.21
391	0.24
392	0.26
393	0.33
394	0.34
395	0.36
396	0.35
397	0.35
398	0.37
399	0.4
400	0.41
401	0.34
402	0.35
403	0.33
404	0.3
405	0.28
406	0.22
407	0.18
408	0.17
409	0.18
410	0.22
411	0.23
412	0.22
413	0.2
414	0.23
415	0.26
416	0.27
417	0.28
418	0.3
419	0.3
420	0.33
421	0.34
422	0.3
423	0.32
424	0.31
425	0.31
426	0.27
427	0.27
428	0.23
429	0.23
430	0.23
431	0.15
432	0.15
433	0.13
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.18
441	0.25
442	0.31
443	0.36
444	0.39
445	0.42
446	0.41
447	0.41
448	0.36
449	0.29
450	0.25
451	0.22
452	0.21
453	0.26
454	0.26
455	0.26
456	0.3
457	0.3
458	0.31
459	0.28
460	0.27
461	0.26
462	0.27
463	0.31
464	0.28
465	0.29
466	0.27
467	0.32
468	0.34
469	0.32
470	0.31
471	0.3
472	0.33
473	0.36
474	0.38
475	0.34
476	0.33
477	0.29
478	0.31
479	0.29
480	0.24
481	0.19
482	0.2
483	0.24
484	0.29
485	0.34
486	0.31
487	0.3
488	0.31
489	0.31
490	0.28
491	0.24
492	0.19
493	0.14
494	0.14
495	0.16
496	0.14
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.1
501	0.08
502	0.09
503	0.07
504	0.09
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.05
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.19
529	0.19
530	0.2
531	0.21
532	0.21
533	0.26
534	0.3
535	0.34
536	0.28
537	0.29
538	0.32
539	0.35
540	0.38
541	0.32
542	0.29
543	0.24
544	0.22
545	0.2
546	0.16
547	0.11
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.11
557	0.11
558	0.1
559	0.11
560	0.12
561	0.13
562	0.15
563	0.15
564	0.12
565	0.13
566	0.15
567	0.16
568	0.14
569	0.13
570	0.11
571	0.1
572	0.1
573	0.08
574	0.07
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.13
580	0.17
581	0.18
582	0.22
583	0.21
584	0.25
585	0.28
586	0.31
587	0.32
588	0.3
589	0.32
590	0.28
591	0.26
592	0.27
593	0.26
594	0.25
595	0.22
596	0.28
597	0.26
598	0.28
599	0.34
600	0.33
601	0.33
602	0.33
603	0.31
604	0.28
605	0.29
606	0.28
607	0.23
608	0.23
609	0.24
610	0.28
611	0.29
612	0.26
613	0.28
614	0.28
615	0.35
616	0.41
617	0.44
618	0.4
619	0.39
620	0.4
621	0.43
622	0.43
623	0.42
624	0.37
625	0.34
626	0.4
627	0.42
628	0.4
629	0.37
630	0.41
631	0.37
632	0.38
633	0.35
634	0.3
635	0.31
636	0.32
637	0.3
638	0.3
639	0.27
640	0.21
641	0.21
642	0.19
643	0.18
644	0.21
645	0.21
646	0.19
647	0.19
648	0.24
649	0.23
650	0.24
651	0.22
652	0.19
653	0.18
654	0.18
655	0.19
656	0.13
657	0.16
658	0.15
659	0.15
660	0.14
661	0.12
662	0.13
663	0.17
664	0.17
665	0.22
666	0.26
667	0.33
668	0.41
669	0.47
670	0.5
671	0.54
672	0.55
673	0.51
674	0.53
675	0.47
676	0.44
677	0.39
678	0.35
679	0.28
680	0.27
681	0.23
682	0.19
683	0.21
684	0.17
685	0.16
686	0.19
687	0.24
688	0.3
689	0.33
690	0.34
691	0.33
692	0.33
693	0.34
694	0.33
695	0.3
696	0.31
697	0.33
698	0.31
699	0.3
700	0.32
701	0.33
702	0.32
703	0.29
704	0.23
705	0.25
706	0.28
707	0.31
708	0.33
709	0.35
710	0.38
711	0.43
712	0.48
713	0.46
714	0.43
715	0.43
716	0.45
717	0.42
718	0.42
719	0.37
720	0.36
721	0.31
722	0.3
723	0.27
724	0.2
725	0.21
726	0.18
727	0.17
728	0.15
729	0.15
730	0.14
731	0.17
732	0.18
733	0.21
734	0.23
735	0.3
736	0.3
737	0.35
738	0.36
739	0.37
740	0.45
741	0.45
742	0.47
743	0.43
744	0.42
745	0.4
746	0.4
747	0.42
748	0.34
749	0.32
750	0.35
751	0.33
752	0.36
753	0.38
754	0.45
755	0.47
756	0.52
757	0.51
758	0.43
759	0.45
760	0.42
761	0.39
762	0.37
763	0.31
764	0.28
765	0.26
766	0.28
767	0.27
768	0.28
769	0.26
770	0.2
771	0.18
772	0.18
773	0.21
774	0.21
775	0.2
776	0.18
777	0.18
778	0.18
779	0.17
780	0.14
781	0.1
782	0.07
783	0.07
784	0.06
785	0.07
786	0.07
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.11
791	0.15
792	0.2
793	0.27
794	0.31
795	0.37
796	0.37
797	0.4
798	0.44
799	0.42
800	0.4
801	0.36
802	0.31
803	0.23
804	0.22
805	0.19
806	0.13
807	0.1
808	0.09
809	0.06
810	0.06
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.09
815	0.11
816	0.13
817	0.16
818	0.21
819	0.22
820	0.3
821	0.4
822	0.48
823	0.55
824	0.61
825	0.63
826	0.66
827	0.71
828	0.7
829	0.63
830	0.56
831	0.49
832	0.41
833	0.36
834	0.28
835	0.21
836	0.17
837	0.13
838	0.12
839	0.11
840	0.1
841	0.11
842	0.13
843	0.16
844	0.15
845	0.16
846	0.15
847	0.14
848	0.14
849	0.14
850	0.11
851	0.11
852	0.09
853	0.09
854	0.1
855	0.09
856	0.13
857	0.12
858	0.11
859	0.09
860	0.13
861	0.14
862	0.15
863	0.17
864	0.15
865	0.2
866	0.23
867	0.26
868	0.31
869	0.35
870	0.34
871	0.34
872	0.37
873	0.33
874	0.33
875	0.33
876	0.27
877	0.26
878	0.28
879	0.28
880	0.26
881	0.25
882	0.23
883	0.25
884	0.22
885	0.23
886	0.22
887	0.26
888	0.25
889	0.26
890	0.26
891	0.23
892	0.22
893	0.19
894	0.17
895	0.13
896	0.12
897	0.14
898	0.14
899	0.14
900	0.14
901	0.14
902	0.15
903	0.18
904	0.2
905	0.16
906	0.23
907	0.23
908	0.25
909	0.26
910	0.25
911	0.24
912	0.27
913	0.28
914	0.28
915	0.32
916	0.33
917	0.33
918	0.33
919	0.31
920	0.25
921	0.24
922	0.17
923	0.15
924	0.17
925	0.16
926	0.15
927	0.16
928	0.15
929	0.18
930	0.22
931	0.22
932	0.21
933	0.26
934	0.32
935	0.4
936	0.42
937	0.42
938	0.4
939	0.41
940	0.41
941	0.41
942	0.36
943	0.28
944	0.27
945	0.24
946	0.22
947	0.19
948	0.21
949	0.21
950	0.2
951	0.2
952	0.2
953	0.19
954	0.21
955	0.22
956	0.24
957	0.21
958	0.23
959	0.24
960	0.24
961	0.28
962	0.26
963	0.25
964	0.25
965	0.21
966	0.2
967	0.2
968	0.2
969	0.15
970	0.17
971	0.15
972	0.12
973	0.14
974	0.12
975	0.12
976	0.13
977	0.14
978	0.15
979	0.15
980	0.13
981	0.12
982	0.2
983	0.21
984	0.27
985	0.29
986	0.29
987	0.29
988	0.31
989	0.31
990	0.31
991	0.34
992	0.35
993	0.37
994	0.38
995	0.37
996	0.39
997	0.39
998	0.35
999	0.35
1000	0.28
1001	0.22
1002	0.25
1003	0.26
1004	0.26
1005	0.32
1006	0.3
1007	0.26
1008	0.28
1009	0.33
1010	0.28
1011	0.27
1012	0.24
1013	0.17
1014	0.15
1015	0.15
1016	0.13
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.09
1022	0.11
1023	0.12
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.13
1028	0.13
1029	0.16
1030	0.17
1031	0.18
1032	0.18
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.18
1036	0.2
1037	0.23
1038	0.24
1039	0.3
1040	0.31
1041	0.31
1042	0.31
1043	0.33
1044	0.31
1045	0.26
1046	0.3
1047	0.23
1048	0.24
1049	0.24
1050	0.24
1051	0.21
1052	0.2
1053	0.18
1054	0.1
1055	0.1
1056	0.09
1057	0.1
1058	0.11
1059	0.11
1060	0.12
1061	0.15
1062	0.14
1063	0.16
1064	0.16
1065	0.18
1066	0.21
1067	0.22
1068	0.24
1069	0.22
1070	0.22
1071	0.21
1072	0.18
1073	0.15
1074	0.11
1075	0.09
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.07
1079	0.08
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.09

A0A1Y1S6E0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer