Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1S7V1

Protein Details
Accession A0A1Y1S7V1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
352-372DYTIRFWIRPRQQNKEEEKETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito_nucl 8, mito 6.5, cyto 6.5, cyto_pero 5, pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045245  Pfs2-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MQNKQGGKFVYDGKRIQPIYERYAVDFNMPYIYSRFNGTADPFPIDSNLDVTSQLIQMRPASEMHPRESACTRYVQYCINKIRSPVCSLCWFPDGKKVLTGLQSGEITMWNGVTFNFDTILQAHSQAIKSMKWSRNNRLLLTGDASGVVKYWNTAMNNLNEVEVHQSPIKDISFSHDDSKFCTACDDATIKIVDVFESEVERTLRGHNWDVRKAQFHESMALIASGGKDNLLKLWDPRESACLSTFHYHKNTILSMSFFKENYLLSGGKDQVVKMLDLRMMKECFTYKDTGDVTALNVSSNLIFSGNGLGEINYWEEFNDEIIATSERRHDNTVWFVEMHPSGHCLVSGAADYTIRFWIRPRQQNKEEEKETQKEEGGTAIPGLLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.5
3 0.49
4 0.49
5 0.46
6 0.46
7 0.51
8 0.48
9 0.42
10 0.45
11 0.43
12 0.38
13 0.33
14 0.26
15 0.22
16 0.21
17 0.2
18 0.18
19 0.2
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.18
24 0.21
25 0.23
26 0.27
27 0.26
28 0.29
29 0.26
30 0.25
31 0.25
32 0.23
33 0.2
34 0.16
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.23
50 0.26
51 0.28
52 0.32
53 0.31
54 0.34
55 0.37
56 0.38
57 0.31
58 0.32
59 0.31
60 0.28
61 0.3
62 0.33
63 0.34
64 0.39
65 0.45
66 0.47
67 0.47
68 0.48
69 0.51
70 0.47
71 0.48
72 0.42
73 0.38
74 0.37
75 0.36
76 0.36
77 0.34
78 0.32
79 0.27
80 0.33
81 0.33
82 0.29
83 0.29
84 0.27
85 0.27
86 0.29
87 0.29
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.13
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.13
114 0.14
115 0.13
116 0.18
117 0.27
118 0.32
119 0.4
120 0.47
121 0.52
122 0.6
123 0.63
124 0.59
125 0.54
126 0.5
127 0.42
128 0.37
129 0.29
130 0.2
131 0.16
132 0.15
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.09
140 0.09
141 0.13
142 0.15
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.18
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.1
158 0.1
159 0.13
160 0.16
161 0.17
162 0.21
163 0.22
164 0.22
165 0.24
166 0.28
167 0.23
168 0.19
169 0.19
170 0.15
171 0.12
172 0.14
173 0.13
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.11
192 0.13
193 0.17
194 0.21
195 0.25
196 0.3
197 0.32
198 0.33
199 0.35
200 0.35
201 0.36
202 0.34
203 0.3
204 0.28
205 0.24
206 0.22
207 0.18
208 0.15
209 0.1
210 0.07
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.19
226 0.18
227 0.19
228 0.19
229 0.16
230 0.17
231 0.2
232 0.22
233 0.23
234 0.25
235 0.25
236 0.25
237 0.26
238 0.24
239 0.22
240 0.21
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.17
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.15
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.16
261 0.14
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.19
267 0.19
268 0.19
269 0.21
270 0.21
271 0.21
272 0.24
273 0.25
274 0.2
275 0.25
276 0.25
277 0.24
278 0.23
279 0.2
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.09
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.18
314 0.21
315 0.23
316 0.27
317 0.27
318 0.31
319 0.38
320 0.39
321 0.34
322 0.32
323 0.3
324 0.31
325 0.3
326 0.25
327 0.19
328 0.18
329 0.17
330 0.16
331 0.16
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.16
342 0.15
343 0.15
344 0.17
345 0.27
346 0.37
347 0.46
348 0.53
349 0.59
350 0.67
351 0.77
352 0.83
353 0.83
354 0.78
355 0.77
356 0.77
357 0.73
358 0.69
359 0.62
360 0.56
361 0.47
362 0.42
363 0.36
364 0.28
365 0.23
366 0.19