Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1S6G4

Protein Details
Accession A0A1Y1S6G4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-407AEIARIRRHKFTPKEIKRKMNSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-407RIRRHKFTPKEIKRKMNSK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPKIPSNYHSKATRAKECQHDATERQYDDGDYYNECRLEKEYVRALNATKMDKMMSKPLVGSHMLHNEGIVKMERSRSKFITASYSNEIIVWDLVKKEALIKLEYLNQINSVGIYENKAVVTQDRSILFTEMNKTNSNDYQSNLYNISTEVLEKPRFEFSKKVTNKFSSKIDQKQTVNHVDIGESKMAVGTTHSSIVCDLIKGINLYEKPGQCNQIQFNHSIGGILGIVGDGAVRIEDTRANSTVYSGKMPVNCIKFNNNKLICGGDKLTVFDMREMGRALREFKTSGPILSVDSTGTRTSCGTADCVIFNFVDEKLADVYYNQRMGLIHGLRYSGCGNYLVSGSDDGSVRVWKADANQRTLKTGRERRSSDGNRALQEKYGSVAEIARIRRHKFTPKEIKRKMNSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.67
3 0.7
4 0.73
5 0.73
6 0.7
7 0.69
8 0.62
9 0.63
10 0.63
11 0.53
12 0.48
13 0.41
14 0.36
15 0.31
16 0.31
17 0.24
18 0.19
19 0.22
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.24
25 0.29
26 0.29
27 0.33
28 0.36
29 0.38
30 0.4
31 0.41
32 0.39
33 0.38
34 0.4
35 0.36
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.28
40 0.3
41 0.32
42 0.3
43 0.29
44 0.28
45 0.29
46 0.31
47 0.29
48 0.28
49 0.25
50 0.28
51 0.28
52 0.27
53 0.25
54 0.24
55 0.22
56 0.22
57 0.18
58 0.15
59 0.15
60 0.23
61 0.29
62 0.32
63 0.38
64 0.38
65 0.42
66 0.42
67 0.42
68 0.43
69 0.4
70 0.4
71 0.39
72 0.37
73 0.32
74 0.29
75 0.28
76 0.19
77 0.17
78 0.13
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.23
91 0.26
92 0.24
93 0.22
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.16
98 0.11
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.14
109 0.13
110 0.16
111 0.16
112 0.18
113 0.18
114 0.19
115 0.17
116 0.16
117 0.2
118 0.2
119 0.22
120 0.23
121 0.23
122 0.26
123 0.28
124 0.3
125 0.26
126 0.23
127 0.25
128 0.24
129 0.25
130 0.22
131 0.2
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.14
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.23
143 0.24
144 0.25
145 0.27
146 0.27
147 0.36
148 0.41
149 0.45
150 0.45
151 0.5
152 0.51
153 0.5
154 0.5
155 0.47
156 0.5
157 0.52
158 0.52
159 0.52
160 0.5
161 0.51
162 0.52
163 0.49
164 0.43
165 0.36
166 0.31
167 0.24
168 0.24
169 0.21
170 0.16
171 0.11
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.08
192 0.08
193 0.11
194 0.15
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.23
199 0.21
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.28
204 0.26
205 0.25
206 0.23
207 0.21
208 0.17
209 0.14
210 0.08
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.03
224 0.05
225 0.07
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.16
236 0.16
237 0.19
238 0.23
239 0.25
240 0.25
241 0.26
242 0.32
243 0.36
244 0.39
245 0.46
246 0.41
247 0.38
248 0.37
249 0.37
250 0.3
251 0.26
252 0.24
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.15
260 0.16
261 0.14
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.15
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.18
271 0.18
272 0.24
273 0.22
274 0.2
275 0.18
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.11
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.15
308 0.17
309 0.19
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.19
314 0.27
315 0.23
316 0.21
317 0.2
318 0.22
319 0.2
320 0.23
321 0.22
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.18
342 0.27
343 0.31
344 0.37
345 0.44
346 0.44
347 0.5
348 0.51
349 0.51
350 0.52
351 0.56
352 0.58
353 0.61
354 0.64
355 0.63
356 0.73
357 0.72
358 0.71
359 0.71
360 0.68
361 0.63
362 0.62
363 0.58
364 0.5
365 0.46
366 0.36
367 0.29
368 0.24
369 0.2
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.22
374 0.25
375 0.31
376 0.37
377 0.41
378 0.47
379 0.53
380 0.59
381 0.62
382 0.7
383 0.73
384 0.77
385 0.84
386 0.87
387 0.9