FuNGI

A0A1Y1S8N7

Protein Details

Accession

A0A1Y1S8N7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
352-374	VVERPKTTKTRPQTPKKRLDLLV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR005825 Ribosomal_L24/26_CS IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005840 C:ribosome GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF00467 KOW PF03439 Spt5-NGN
PROSITE	View protein in PROSITE PS01108 RIBOSOMAL_L24
CDD	cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MEAESSEEEINSDVTSEDLDGFVEPDYGRERRDLYGEKVSELEQKYAKYVEREDESTTEEIRPQIRPFPTSMDPLLFLVRVKFGKEKSIANRIIEQAKGVGDVTAVVQKDGLKGYIYVEAFKRTAVDEAVQRVKNVYKNKISAIPFSEMIDALSCRKDYIVNDYARVKSGKYKDDVVQVLENYEDCCQIKAVPRLNDRRRLFDPEEFRAQVTAKNGGFYYNRDFFRDGFLIKTVLKMSLDFDIQPTFDDLKQLDTERPVRLNDAVRVVKGDLKNFTGKVVSVAGSTCVVSDGTSTFDVDAGCLEKRVEVGDVFSYAGENGVVLQKEGNRVVLGIREMQDEVSVHINDLEGRVVERPKTTKTRPQTPKKRLDLLVNKNVRIVAGAYKGLVGIVKEVHRERCRVQLMSNLESVHVYKNDIREIAPTQQAQASATPGYKTPGSKTPGYTTPGYKTPGYTTPGYRTPGYAPPETEIQAASVYYGMKILIDGSEKTVSRMEESIYYTTDGREVAATEMVPVRPTNKYDPVFIFRGDHKEKNGVLIEFEEEIGKVELMGNEYVRVKLDDMAVKN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.08
3	0.08
4	0.08
5	0.07
6	0.08
7	0.07
8	0.08
9	0.08
10	0.1
11	0.09
12	0.11
13	0.16
14	0.18
15	0.19
16	0.21
17	0.24
18	0.24
19	0.32
20	0.35
21	0.36
22	0.44
23	0.43
24	0.41
25	0.4
26	0.39
27	0.39
28	0.36
29	0.35
30	0.29
31	0.29
32	0.3
33	0.33
34	0.34
35	0.31
36	0.33
37	0.35
38	0.37
39	0.38
40	0.38
41	0.36
42	0.37
43	0.34
44	0.32
45	0.26
46	0.24
47	0.25
48	0.25
49	0.27
50	0.26
51	0.32
52	0.33
53	0.34
54	0.34
55	0.37
56	0.37
57	0.38
58	0.37
59	0.31
60	0.29
61	0.28
62	0.27
63	0.21
64	0.18
65	0.15
66	0.18
67	0.17
68	0.19
69	0.23
70	0.23
71	0.31
72	0.33
73	0.4
74	0.42
75	0.51
76	0.52
77	0.5
78	0.52
79	0.49
80	0.49
81	0.42
82	0.35
83	0.27
84	0.23
85	0.21
86	0.16
87	0.12
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.11
92	0.1
93	0.1
94	0.11
95	0.11
96	0.13
97	0.14
98	0.13
99	0.11
100	0.11
101	0.13
102	0.17
103	0.17
104	0.18
105	0.18
106	0.21
107	0.2
108	0.2
109	0.19
110	0.15
111	0.16
112	0.15
113	0.16
114	0.16
115	0.22
116	0.29
117	0.29
118	0.28
119	0.29
120	0.32
121	0.35
122	0.39
123	0.41
124	0.4
125	0.42
126	0.45
127	0.51
128	0.48
129	0.46
130	0.43
131	0.38
132	0.32
133	0.3
134	0.28
135	0.21
136	0.19
137	0.16
138	0.13
139	0.11
140	0.12
141	0.11
142	0.1
143	0.11
144	0.13
145	0.13
146	0.21
147	0.27
148	0.26
149	0.29
150	0.33
151	0.33
152	0.33
153	0.33
154	0.25
155	0.26
156	0.31
157	0.33
158	0.32
159	0.36
160	0.36
161	0.42
162	0.43
163	0.37
164	0.34
165	0.28
166	0.26
167	0.22
168	0.19
169	0.13
170	0.12
171	0.12
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.19
177	0.25
178	0.31
179	0.36
180	0.43
181	0.54
182	0.6
183	0.67
184	0.62
185	0.62
186	0.59
187	0.6
188	0.56
189	0.52
190	0.52
191	0.46
192	0.5
193	0.44
194	0.41
195	0.34
196	0.31
197	0.26
198	0.22
199	0.23
200	0.18
201	0.18
202	0.18
203	0.19
204	0.19
205	0.2
206	0.24
207	0.24
208	0.25
209	0.26
210	0.27
211	0.25
212	0.29
213	0.28
214	0.22
215	0.17
216	0.17
217	0.16
218	0.15
219	0.16
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.11
237	0.12
238	0.13
239	0.14
240	0.13
241	0.15
242	0.18
243	0.18
244	0.2
245	0.18
246	0.19
247	0.21
248	0.22
249	0.2
250	0.23
251	0.22
252	0.2
253	0.21
254	0.2
255	0.21
256	0.2
257	0.2
258	0.16
259	0.17
260	0.19
261	0.18
262	0.19
263	0.14
264	0.13
265	0.12
266	0.11
267	0.09
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.11
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.1
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.05
337	0.06
338	0.08
339	0.1
340	0.11
341	0.14
342	0.16
343	0.21
344	0.29
345	0.33
346	0.4
347	0.46
348	0.56
349	0.64
350	0.72
351	0.78
352	0.8
353	0.85
354	0.83
355	0.82
356	0.74
357	0.74
358	0.73
359	0.71
360	0.7
361	0.64
362	0.58
363	0.51
364	0.49
365	0.38
366	0.29
367	0.21
368	0.15
369	0.13
370	0.13
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.1
376	0.07
377	0.06
378	0.08
379	0.09
380	0.14
381	0.17
382	0.25
383	0.28
384	0.31
385	0.32
386	0.38
387	0.42
388	0.39
389	0.38
390	0.37
391	0.39
392	0.38
393	0.38
394	0.3
395	0.25
396	0.25
397	0.24
398	0.2
399	0.15
400	0.15
401	0.16
402	0.18
403	0.2
404	0.2
405	0.2
406	0.2
407	0.22
408	0.24
409	0.26
410	0.24
411	0.23
412	0.24
413	0.24
414	0.21
415	0.19
416	0.17
417	0.14
418	0.15
419	0.14
420	0.13
421	0.15
422	0.17
423	0.17
424	0.19
425	0.25
426	0.29
427	0.31
428	0.34
429	0.37
430	0.39
431	0.42
432	0.41
433	0.38
434	0.37
435	0.38
436	0.39
437	0.34
438	0.31
439	0.31
440	0.33
441	0.33
442	0.33
443	0.32
444	0.34
445	0.38
446	0.4
447	0.37
448	0.33
449	0.33
450	0.37
451	0.38
452	0.35
453	0.31
454	0.3
455	0.33
456	0.32
457	0.28
458	0.21
459	0.17
460	0.15
461	0.13
462	0.11
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.09
473	0.1
474	0.13
475	0.18
476	0.18
477	0.2
478	0.22
479	0.21
480	0.22
481	0.22
482	0.21
483	0.2
484	0.23
485	0.24
486	0.22
487	0.23
488	0.21
489	0.2
490	0.2
491	0.16
492	0.13
493	0.12
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.11
498	0.12
499	0.15
500	0.15
501	0.15
502	0.15
503	0.17
504	0.2
505	0.24
506	0.29
507	0.35
508	0.37
509	0.41
510	0.46
511	0.49
512	0.47
513	0.44
514	0.42
515	0.37
516	0.45
517	0.46
518	0.45
519	0.43
520	0.48
521	0.46
522	0.49
523	0.49
524	0.4
525	0.35
526	0.32
527	0.3
528	0.24
529	0.24
530	0.18
531	0.13
532	0.14
533	0.14
534	0.12
535	0.1
536	0.11
537	0.12
538	0.14
539	0.16
540	0.15
541	0.17
542	0.19
543	0.19
544	0.19
545	0.19
546	0.18
547	0.19
548	0.24

A0A1Y1S8N7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer