FuNGI

A0A1Y1S639

Protein Details

Accession

A0A1Y1S639

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
141-160	QESHYTQQRKYCPRHRSYTH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 8, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13975 gag-asp_proteas PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MKRCFKEDEEAKEELQILVDQRYHHLFARCALFEKCLEKLTELTYNREMFGRLLVALEDLRAAMFPDLHGYREMHDRLIERTDMCINAPRRLGEFEKEDLFVNGLRTWMKEEWIRLGDKGFDAKIGILIALERNRVESWNQESHYTQQRKYCPRHRSYTHGPEECFDRTRTSNSNKGSQAKNAKDNIRMIQEEKIQCQKIGLGGLILEEPIQVVLDTGARLTYIRKEAQEKLKLPIEKVEATVHLANGRTVQINEQTETEMELVGISHTRYKVKALVLPGLTEDLIVGLDFMCNNGMVLDLKKGIISVDGYELLIEEFQDKEASRPENLLVDNLRQVVREPETLEDVVQGFKATNPILGNIDGQEHEIHLTSDKPVHFKPYGLPFKVLGELKQQIKDMLDQGLISRSSSKYGSPSFGVLKKNGAVRMVTDFRALNQITEKEVYPFPNVKDQLQGLHGRKVFSQIDLDKGFYQIRIRKEDRHKTGFVLPFGQYEYNRLPFGMANSPRSFQRAMDGMLRGLDCVRVFVDDVLIASSSLDDHVRDVKLVLERLQGSGAKINFEKSHFGLPQVNYLGMIISEHGIRADSSKIHIARMEEAPKNAKEARRLLWLLNWFRDFVPRMSDKVLPLTKKMKLEKGKFFWDQEDESMRKGIFEEIEKENLLRHVDPSKPFELQVDASKEGISGVLLQEGAIVGIYSHKLQGSELNYTIVEKEFYAIVRSIQHFHKLVWGSKIKLKTDSKNNSYNQPAEGSRMNRWKSILNEYEIELEHIEGIKNSLADYFSREGCEDCLRWSTEQGLFAILFGAPLSTEDKSEGMQFLEQWQIYLSKEGRVIVPRNKGKEVAWEIHERTMHAGETTMWLTISRYLTGKELRERLREVSMECQYCMVYKNRKSNYGFIGRGYYGKDFNDTLASDLVGPFVRKTDKGRMKVWVISFIDLWSRCIKLRALTTINSRTVLEAFESWIKENGKPRRFLSDNGGCYTSKEFKDYLKTNGIQTLALSAYNPRGNGIAERYNQRISLGMRITKDIPLDTAIERITQGLNETANRSTGYSPKEVVHQTSIFNLARKRVTISKQELKERNMKSQGINQKRENDKRVQHHWDVGEVVYVKVGAMPGKMDSRQLGPFRITKVLKESGVLEIENTRKRMWVNQRRVVPLKVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.28
3	0.21
4	0.17
5	0.19
6	0.21
7	0.19
8	0.23
9	0.27
10	0.28
11	0.31
12	0.34
13	0.32
14	0.35
15	0.41
16	0.38
17	0.38
18	0.37
19	0.35
20	0.34
21	0.35
22	0.33
23	0.29
24	0.29
25	0.27
26	0.28
27	0.29
28	0.34
29	0.33
30	0.36
31	0.39
32	0.39
33	0.38
34	0.37
35	0.34
36	0.25
37	0.25
38	0.21
39	0.14
40	0.14
41	0.13
42	0.13
43	0.12
44	0.11
45	0.09
46	0.08
47	0.08
48	0.07
49	0.08
50	0.07
51	0.08
52	0.08
53	0.14
54	0.15
55	0.17
56	0.19
57	0.19
58	0.2
59	0.28
60	0.3
61	0.25
62	0.28
63	0.28
64	0.29
65	0.33
66	0.33
67	0.25
68	0.27
69	0.28
70	0.25
71	0.25
72	0.3
73	0.29
74	0.32
75	0.34
76	0.32
77	0.32
78	0.36
79	0.38
80	0.35
81	0.37
82	0.35
83	0.35
84	0.34
85	0.32
86	0.28
87	0.26
88	0.22
89	0.2
90	0.16
91	0.16
92	0.16
93	0.16
94	0.21
95	0.2
96	0.23
97	0.24
98	0.26
99	0.31
100	0.34
101	0.35
102	0.31
103	0.31
104	0.3
105	0.28
106	0.29
107	0.22
108	0.19
109	0.18
110	0.17
111	0.16
112	0.14
113	0.12
114	0.08
115	0.09
116	0.13
117	0.14
118	0.16
119	0.15
120	0.17
121	0.18
122	0.2
123	0.21
124	0.23
125	0.28
126	0.33
127	0.35
128	0.35
129	0.36
130	0.41
131	0.5
132	0.49
133	0.46
134	0.47
135	0.55
136	0.62
137	0.7
138	0.73
139	0.73
140	0.74
141	0.8
142	0.78
143	0.78
144	0.78
145	0.79
146	0.8
147	0.75
148	0.68
149	0.6
150	0.59
151	0.54
152	0.46
153	0.37
154	0.32
155	0.29
156	0.34
157	0.4
158	0.42
159	0.46
160	0.47
161	0.54
162	0.55
163	0.59
164	0.57
165	0.58
166	0.61
167	0.6
168	0.63
169	0.62
170	0.61
171	0.59
172	0.6
173	0.56
174	0.52
175	0.48
176	0.42
177	0.4
178	0.44
179	0.41
180	0.42
181	0.45
182	0.41
183	0.38
184	0.37
185	0.33
186	0.27
187	0.25
188	0.2
189	0.12
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.07
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.08
209	0.13
210	0.17
211	0.2
212	0.24
213	0.29
214	0.37
215	0.46
216	0.53
217	0.5
218	0.51
219	0.55
220	0.53
221	0.49
222	0.48
223	0.43
224	0.35
225	0.35
226	0.31
227	0.25
228	0.27
229	0.27
230	0.21
231	0.19
232	0.18
233	0.16
234	0.16
235	0.16
236	0.14
237	0.13
238	0.15
239	0.2
240	0.21
241	0.22
242	0.21
243	0.21
244	0.19
245	0.2
246	0.18
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.1
255	0.12
256	0.14
257	0.15
258	0.17
259	0.21
260	0.23
261	0.27
262	0.26
263	0.3
264	0.29
265	0.28
266	0.26
267	0.23
268	0.2
269	0.16
270	0.12
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.06
285	0.07
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.14
310	0.16
311	0.16
312	0.17
313	0.18
314	0.2
315	0.2
316	0.21
317	0.18
318	0.18
319	0.19
320	0.19
321	0.19
322	0.15
323	0.16
324	0.17
325	0.18
326	0.19
327	0.18
328	0.17
329	0.2
330	0.2
331	0.2
332	0.16
333	0.14
334	0.12
335	0.11
336	0.1
337	0.07
338	0.07
339	0.1
340	0.08
341	0.11
342	0.11
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.12
348	0.13
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.13
360	0.14
361	0.17
362	0.17
363	0.23
364	0.23
365	0.23
366	0.27
367	0.33
368	0.4
369	0.38
370	0.39
371	0.34
372	0.35
373	0.39
374	0.34
375	0.24
376	0.22
377	0.26
378	0.27
379	0.28
380	0.27
381	0.24
382	0.24
383	0.24
384	0.2
385	0.17
386	0.14
387	0.12
388	0.12
389	0.14
390	0.13
391	0.11
392	0.12
393	0.11
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.16
398	0.18
399	0.2
400	0.18
401	0.2
402	0.22
403	0.26
404	0.28
405	0.24
406	0.24
407	0.24
408	0.27
409	0.25
410	0.22
411	0.18
412	0.17
413	0.22
414	0.22
415	0.2
416	0.19
417	0.17
418	0.17
419	0.22
420	0.21
421	0.16
422	0.16
423	0.17
424	0.17
425	0.18
426	0.18
427	0.15
428	0.16
429	0.17
430	0.19
431	0.21
432	0.2
433	0.27
434	0.28
435	0.26
436	0.27
437	0.26
438	0.23
439	0.24
440	0.3
441	0.24
442	0.29
443	0.29
444	0.27
445	0.27
446	0.31
447	0.28
448	0.22
449	0.24
450	0.19
451	0.23
452	0.23
453	0.24
454	0.19
455	0.2
456	0.19
457	0.16
458	0.2
459	0.2
460	0.24
461	0.3
462	0.33
463	0.4
464	0.5
465	0.59
466	0.61
467	0.62
468	0.59
469	0.54
470	0.59
471	0.53
472	0.44
473	0.37
474	0.3
475	0.25
476	0.25
477	0.24
478	0.16
479	0.16
480	0.18
481	0.17
482	0.17
483	0.16
484	0.15
485	0.14
486	0.16
487	0.2
488	0.2
489	0.22
490	0.23
491	0.25
492	0.24
493	0.27
494	0.25
495	0.17
496	0.18
497	0.15
498	0.16
499	0.18
500	0.18
501	0.15
502	0.16
503	0.16
504	0.13
505	0.11
506	0.1
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.06
511	0.07
512	0.06
513	0.07
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.05
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.09
530	0.1
531	0.12
532	0.13
533	0.13
534	0.13
535	0.14
536	0.14
537	0.15
538	0.13
539	0.12
540	0.15
541	0.14
542	0.12
543	0.12
544	0.14
545	0.14
546	0.15
547	0.16
548	0.14
549	0.18
550	0.17
551	0.19
552	0.22
553	0.21
554	0.23
555	0.21
556	0.2
557	0.15
558	0.14
559	0.12
560	0.07
561	0.07
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.05
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.12
574	0.13
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.16
579	0.19
580	0.23
581	0.19
582	0.2
583	0.23
584	0.22
585	0.25
586	0.25
587	0.24
588	0.24
589	0.26
590	0.27
591	0.3
592	0.31
593	0.28
594	0.28
595	0.33
596	0.3
597	0.3
598	0.28
599	0.23
600	0.22
601	0.25
602	0.23
603	0.17
604	0.2
605	0.18
606	0.19
607	0.21
608	0.22
609	0.19
610	0.24
611	0.27
612	0.23
613	0.25
614	0.29
615	0.3
616	0.34
617	0.37
618	0.38
619	0.44
620	0.5
621	0.54
622	0.54
623	0.56
624	0.53
625	0.51
626	0.45
627	0.4
628	0.33
629	0.27
630	0.28
631	0.22
632	0.2
633	0.21
634	0.18
635	0.15
636	0.15
637	0.14
638	0.1
639	0.11
640	0.14
641	0.14
642	0.16
643	0.16
644	0.15
645	0.15
646	0.15
647	0.16
648	0.12
649	0.12
650	0.14
651	0.18
652	0.21
653	0.25
654	0.25
655	0.24
656	0.24
657	0.22
658	0.21
659	0.18
660	0.2
661	0.2
662	0.19
663	0.18
664	0.18
665	0.17
666	0.15
667	0.13
668	0.08
669	0.05
670	0.04
671	0.05
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.03
678	0.03
679	0.02
680	0.03
681	0.04
682	0.04
683	0.05
684	0.06
685	0.06
686	0.07
687	0.11
688	0.13
689	0.15
690	0.16
691	0.16
692	0.16
693	0.16
694	0.16
695	0.12
696	0.1
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.09
702	0.08
703	0.09
704	0.12
705	0.14
706	0.16
707	0.17
708	0.21
709	0.2
710	0.2
711	0.25
712	0.25
713	0.26
714	0.29
715	0.31
716	0.29
717	0.33
718	0.38
719	0.33
720	0.39
721	0.41
722	0.42
723	0.49
724	0.56
725	0.56
726	0.6
727	0.6
728	0.57
729	0.57
730	0.51
731	0.41
732	0.36
733	0.31
734	0.26
735	0.28
736	0.25
737	0.27
738	0.34
739	0.34
740	0.33
741	0.34
742	0.35
743	0.34
744	0.39
745	0.37
746	0.31
747	0.31
748	0.3
749	0.31
750	0.26
751	0.24
752	0.16
753	0.12
754	0.1
755	0.09
756	0.08
757	0.06
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.08
765	0.12
766	0.13
767	0.13
768	0.14
769	0.14
770	0.14
771	0.16
772	0.19
773	0.15
774	0.15
775	0.18
776	0.18
777	0.19
778	0.19
779	0.21
780	0.19
781	0.2
782	0.18
783	0.16
784	0.14
785	0.14
786	0.13
787	0.09
788	0.07
789	0.05
790	0.05
791	0.03
792	0.05
793	0.07
794	0.07
795	0.07
796	0.08
797	0.09
798	0.1
799	0.11
800	0.11
801	0.1
802	0.1
803	0.1
804	0.11
805	0.15
806	0.14
807	0.13
808	0.13
809	0.13
810	0.13
811	0.18
812	0.17
813	0.15
814	0.17
815	0.17
816	0.19
817	0.24
818	0.29
819	0.31
820	0.4
821	0.43
822	0.46
823	0.48
824	0.47
825	0.41
826	0.45
827	0.44
828	0.38
829	0.36
830	0.38
831	0.38
832	0.39
833	0.39
834	0.3
835	0.27
836	0.24
837	0.21
838	0.15
839	0.14
840	0.11
841	0.13
842	0.13
843	0.1
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.13
848	0.14
849	0.13
850	0.13
851	0.14
852	0.18
853	0.23
854	0.27
855	0.29
856	0.35
857	0.39
858	0.42
859	0.44
860	0.43
861	0.43
862	0.4
863	0.36
864	0.36
865	0.38
866	0.34
867	0.31
868	0.29
869	0.25
870	0.24
871	0.26
872	0.26
873	0.28
874	0.35
875	0.44
876	0.47
877	0.55
878	0.58
879	0.6
880	0.61
881	0.6
882	0.54
883	0.45
884	0.46
885	0.38
886	0.37
887	0.33
888	0.28
889	0.22
890	0.21
891	0.22
892	0.18
893	0.19
894	0.2
895	0.18
896	0.17
897	0.15
898	0.14
899	0.12
900	0.11
901	0.12
902	0.1
903	0.1
904	0.09
905	0.12
906	0.14
907	0.16
908	0.22
909	0.32
910	0.39
911	0.44
912	0.48
913	0.51
914	0.53
915	0.56
916	0.52
917	0.5
918	0.42
919	0.38
920	0.35
921	0.29
922	0.31
923	0.25
924	0.26
925	0.2
926	0.2
927	0.2
928	0.22
929	0.23
930	0.23
931	0.26
932	0.31
933	0.32
934	0.35
935	0.42
936	0.45
937	0.45
938	0.41
939	0.37
940	0.31
941	0.28
942	0.25
943	0.19
944	0.13
945	0.14
946	0.17
947	0.18
948	0.18
949	0.23
950	0.24
951	0.26
952	0.35
953	0.42
954	0.45
955	0.49
956	0.5
957	0.54
958	0.55
959	0.54
960	0.55
961	0.54
962	0.51
963	0.49
964	0.49
965	0.39
966	0.39
967	0.41
968	0.38
969	0.3
970	0.29
971	0.27
972	0.29
973	0.39
974	0.41
975	0.41
976	0.43
977	0.43
978	0.42
979	0.45
980	0.41
981	0.32
982	0.28
983	0.25
984	0.17
985	0.15
986	0.13
987	0.12
988	0.16
989	0.18
990	0.18
991	0.16
992	0.17
993	0.18
994	0.21
995	0.24
996	0.26
997	0.28
998	0.33
999	0.36
1000	0.37
1001	0.36
1002	0.34
1003	0.32
1004	0.27
1005	0.31
1006	0.32
1007	0.32
1008	0.31
1009	0.35
1010	0.36
1011	0.34
1012	0.34
1013	0.26
1014	0.22
1015	0.19
1016	0.2
1017	0.18
1018	0.19
1019	0.17
1020	0.16
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.14
1024	0.12
1025	0.13
1026	0.13
1027	0.14
1028	0.16
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.19
1032	0.19
1033	0.19
1034	0.2
1035	0.23
1036	0.26
1037	0.27
1038	0.28
1039	0.28
1040	0.34
1041	0.35
1042	0.36
1043	0.37
1044	0.34
1045	0.31
1046	0.31
1047	0.37
1048	0.32
1049	0.34
1050	0.33
1051	0.33
1052	0.34
1053	0.34
1054	0.37
1055	0.38
1056	0.43
1057	0.49
1058	0.55
1059	0.59
1060	0.63
1061	0.72
1062	0.74
1063	0.72
1064	0.75
1065	0.69
1066	0.69
1067	0.67
1068	0.64
1069	0.58
1070	0.6
1071	0.65
1072	0.66
1073	0.69
1074	0.65
1075	0.68
1076	0.75
1077	0.8
1078	0.77
1079	0.75
1080	0.74
1081	0.75
1082	0.78
1083	0.77
1084	0.72
1085	0.7
1086	0.65
1087	0.58
1088	0.5
1089	0.42
1090	0.37
1091	0.29
1092	0.24
1093	0.17
1094	0.16
1095	0.13
1096	0.12
1097	0.13
1098	0.09
1099	0.09
1100	0.1
1101	0.13
1102	0.18
1103	0.19
1104	0.21
1105	0.22
1106	0.25
1107	0.32
1108	0.34
1109	0.35
1110	0.35
1111	0.38
1112	0.4
1113	0.46
1114	0.44
1115	0.4
1116	0.43
1117	0.45
1118	0.41
1119	0.39
1120	0.37
1121	0.32
1122	0.33
1123	0.29
1124	0.24
1125	0.24
1126	0.31
1127	0.35
1128	0.35
1129	0.31
1130	0.32
1131	0.34
1132	0.43
1133	0.48
1134	0.52
1135	0.57
1136	0.63
1137	0.7
1138	0.76
1139	0.79

A0A1Y1S639

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer