Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TGC6

Protein Details
Accession A0A1V8TGC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MTKHRKRRKTGRSNGIADTDBasic
56-81ADRVQRREAKRSRKAAEKARNREDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-11HRKRRKTG
61-76RREAKRSRKAAEKARN
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto_nucl 8, cyto 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MTKHRKRRKTGRSNGIADTDADAPKRGPRSEHPTPVEQKTVQDVQHTADTTVLSEADRVQRREAKRSRKAAEKARNREDEDSHVKAPNTVDIEKRKKQKGEEEVPEPVPEDNEVAPAPVTLSKGTESELESPAKTPRIKQKRPLVVVVGDRYNRERDAGTTNQTASSASAGKYIDHDPLYITNSNGDDFVVAASHGKVQVLSVQSSLAVASRDLEPAAQIVSVACTGLPHEIDLLNEKGEVATWDWETGAYDKDAKSVLPGATSFCRLTSVDGHAASASTRVIAATTDAGSVILAGSHELYRSKRILTEIISLPGGCYVVAHSAEHLCVGRRTSPETSIADMMWIETQMPGQIVTLDAALGHVSGKAKAKLRLRVAVGLSDGQILLYDNMSSLFSSQQDAEQLIPRKLHWHREAVNSVKFSADGNYLISGGKETVLVLWQLETGKKQFLPHLTSEIKRIVISPRGDRYAIQMGDNSIMVLSTSELKPIAVFAGIQMITRPRAAAKHSQRDYTPAATLHPQQPDQLLLTVPSTQPKTETDVSARPFLQTFDLANSRHISRQALTRNNVTDFNLGPDGTAIIPPDVTDIAITPNGQWLATVDDWYPPSADVAHWAGDKEQIDEEQRRRRESYLKFWQWDAHQQLWSLTTRIDGPHTRSSSVLPGIGEVFALSSDPAGNAVATVGEDSCVKIWRSKTRVRQTTGTKGKPEAIKETDWYCKRSTELPRQMPRLDSDAADLDDETLHSPSKAVMAYSQDGSLIAVCLRYDRVMAAPVVHLIDAFSGEIKSSNASLITGIPLNLAFLGRYIVALSTKVMRVWDLVEDRLQYNVAIYGSEILLQPLMAVNTEEKTIALFTPAVKLGKNDKKHKDDAPMQIRVYSVTDNTPIGAAVTLETGLVSLLAAGNPRRGYILIGEDASVRFLTGQRTGAKAEIVYAGAQDQALERPVRDVPNLVAAVTNGTEAMDQEAGAEDDRPVIRPEELARVLEEAGSVRDMWRAVAALCGRPPLKVQAPGVNAESTGAVVDAMEIDSDEESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.74
3 0.64
4 0.53
5 0.45
6 0.38
7 0.31
8 0.26
9 0.23
10 0.21
11 0.26
12 0.31
13 0.3
14 0.32
15 0.38
16 0.47
17 0.55
18 0.64
19 0.63
20 0.66
21 0.71
22 0.7
23 0.68
24 0.6
25 0.53
26 0.5
27 0.51
28 0.43
29 0.4
30 0.37
31 0.33
32 0.37
33 0.36
34 0.29
35 0.25
36 0.23
37 0.2
38 0.19
39 0.16
40 0.11
41 0.11
42 0.14
43 0.22
44 0.28
45 0.3
46 0.36
47 0.44
48 0.48
49 0.58
50 0.64
51 0.66
52 0.69
53 0.77
54 0.77
55 0.79
56 0.83
57 0.83
58 0.84
59 0.84
60 0.84
61 0.84
62 0.85
63 0.8
64 0.76
65 0.68
66 0.66
67 0.63
68 0.58
69 0.52
70 0.49
71 0.44
72 0.41
73 0.39
74 0.36
75 0.34
76 0.31
77 0.35
78 0.41
79 0.5
80 0.55
81 0.63
82 0.66
83 0.67
84 0.72
85 0.75
86 0.75
87 0.76
88 0.76
89 0.72
90 0.7
91 0.65
92 0.58
93 0.49
94 0.39
95 0.29
96 0.22
97 0.19
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.19
115 0.22
116 0.23
117 0.22
118 0.23
119 0.26
120 0.31
121 0.3
122 0.33
123 0.41
124 0.5
125 0.57
126 0.65
127 0.72
128 0.76
129 0.79
130 0.76
131 0.7
132 0.64
133 0.62
134 0.57
135 0.52
136 0.44
137 0.41
138 0.39
139 0.38
140 0.33
141 0.29
142 0.25
143 0.22
144 0.27
145 0.29
146 0.31
147 0.31
148 0.32
149 0.3
150 0.29
151 0.27
152 0.21
153 0.19
154 0.16
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.18
160 0.19
161 0.21
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.19
166 0.23
167 0.21
168 0.2
169 0.18
170 0.19
171 0.19
172 0.17
173 0.15
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.09
195 0.07
196 0.06
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.13
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.2
251 0.19
252 0.15
253 0.17
254 0.16
255 0.18
256 0.18
257 0.21
258 0.22
259 0.22
260 0.22
261 0.19
262 0.19
263 0.17
264 0.14
265 0.09
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.09
287 0.1
288 0.14
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.2
293 0.22
294 0.23
295 0.27
296 0.24
297 0.25
298 0.24
299 0.22
300 0.2
301 0.17
302 0.14
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.08
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.09
315 0.1
316 0.12
317 0.15
318 0.16
319 0.21
320 0.22
321 0.24
322 0.27
323 0.27
324 0.27
325 0.24
326 0.23
327 0.18
328 0.16
329 0.14
330 0.1
331 0.08
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.08
352 0.11
353 0.15
354 0.19
355 0.26
356 0.31
357 0.38
358 0.41
359 0.44
360 0.43
361 0.43
362 0.4
363 0.35
364 0.3
365 0.23
366 0.19
367 0.14
368 0.12
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.15
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.25
394 0.28
395 0.36
396 0.33
397 0.37
398 0.39
399 0.45
400 0.51
401 0.48
402 0.49
403 0.4
404 0.37
405 0.3
406 0.27
407 0.21
408 0.16
409 0.13
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.11
432 0.12
433 0.13
434 0.15
435 0.19
436 0.22
437 0.22
438 0.27
439 0.28
440 0.28
441 0.3
442 0.28
443 0.24
444 0.21
445 0.21
446 0.18
447 0.2
448 0.22
449 0.24
450 0.25
451 0.27
452 0.27
453 0.26
454 0.27
455 0.28
456 0.25
457 0.21
458 0.19
459 0.17
460 0.18
461 0.17
462 0.13
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.04
477 0.04
478 0.03
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.09
489 0.12
490 0.21
491 0.28
492 0.38
493 0.39
494 0.41
495 0.41
496 0.43
497 0.43
498 0.35
499 0.28
500 0.18
501 0.18
502 0.18
503 0.2
504 0.2
505 0.2
506 0.18
507 0.17
508 0.18
509 0.17
510 0.16
511 0.13
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.08
517 0.1
518 0.11
519 0.1
520 0.11
521 0.12
522 0.17
523 0.17
524 0.18
525 0.18
526 0.22
527 0.24
528 0.26
529 0.25
530 0.2
531 0.19
532 0.18
533 0.16
534 0.12
535 0.11
536 0.11
537 0.14
538 0.14
539 0.15
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.17
544 0.16
545 0.14
546 0.2
547 0.26
548 0.3
549 0.32
550 0.33
551 0.34
552 0.35
553 0.34
554 0.29
555 0.24
556 0.18
557 0.17
558 0.15
559 0.13
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.07
564 0.08
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.05
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.07
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.1
584 0.1
585 0.11
586 0.09
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.07
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.13
602 0.14
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.15
607 0.21
608 0.27
609 0.32
610 0.35
611 0.37
612 0.39
613 0.41
614 0.46
615 0.45
616 0.49
617 0.52
618 0.55
619 0.53
620 0.52
621 0.52
622 0.45
623 0.47
624 0.42
625 0.34
626 0.29
627 0.28
628 0.28
629 0.27
630 0.25
631 0.18
632 0.13
633 0.11
634 0.1
635 0.11
636 0.15
637 0.15
638 0.2
639 0.27
640 0.29
641 0.29
642 0.28
643 0.29
644 0.28
645 0.26
646 0.22
647 0.14
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.1
652 0.07
653 0.06
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.03
658 0.03
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.05
672 0.06
673 0.09
674 0.1
675 0.14
676 0.19
677 0.27
678 0.34
679 0.42
680 0.51
681 0.59
682 0.67
683 0.68
684 0.7
685 0.69
686 0.73
687 0.74
688 0.69
689 0.61
690 0.54
691 0.55
692 0.51
693 0.46
694 0.42
695 0.36
696 0.33
697 0.32
698 0.34
699 0.38
700 0.37
701 0.37
702 0.31
703 0.29
704 0.3
705 0.35
706 0.4
707 0.43
708 0.5
709 0.57
710 0.63
711 0.66
712 0.66
713 0.6
714 0.53
715 0.46
716 0.37
717 0.28
718 0.23
719 0.2
720 0.18
721 0.17
722 0.14
723 0.1
724 0.09
725 0.09
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.09
733 0.09
734 0.08
735 0.1
736 0.13
737 0.15
738 0.16
739 0.16
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.11
744 0.08
745 0.06
746 0.06
747 0.05
748 0.06
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.09
754 0.1
755 0.11
756 0.11
757 0.1
758 0.11
759 0.11
760 0.1
761 0.09
762 0.07
763 0.07
764 0.06
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.06
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.08
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.08
782 0.08
783 0.08
784 0.08
785 0.07
786 0.05
787 0.05
788 0.06
789 0.06
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.07
794 0.08
795 0.08
796 0.1
797 0.11
798 0.12
799 0.12
800 0.12
801 0.12
802 0.13
803 0.18
804 0.17
805 0.18
806 0.19
807 0.21
808 0.2
809 0.2
810 0.19
811 0.14
812 0.12
813 0.12
814 0.1
815 0.08
816 0.08
817 0.09
818 0.08
819 0.1
820 0.09
821 0.07
822 0.07
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.06
828 0.07
829 0.08
830 0.08
831 0.09
832 0.09
833 0.08
834 0.09
835 0.09
836 0.08
837 0.09
838 0.09
839 0.09
840 0.13
841 0.16
842 0.16
843 0.16
844 0.19
845 0.28
846 0.36
847 0.45
848 0.51
849 0.58
850 0.64
851 0.7
852 0.72
853 0.71
854 0.7
855 0.72
856 0.7
857 0.67
858 0.6
859 0.56
860 0.5
861 0.42
862 0.36
863 0.27
864 0.21
865 0.16
866 0.18
867 0.16
868 0.17
869 0.15
870 0.13
871 0.11
872 0.1
873 0.08
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.05
879 0.05
880 0.04
881 0.04
882 0.04
883 0.03
884 0.04
885 0.05
886 0.08
887 0.09
888 0.14
889 0.14
890 0.15
891 0.16
892 0.16
893 0.17
894 0.18
895 0.21
896 0.19
897 0.19
898 0.19
899 0.19
900 0.19
901 0.18
902 0.15
903 0.1
904 0.09
905 0.11
906 0.14
907 0.16
908 0.2
909 0.22
910 0.24
911 0.26
912 0.26
913 0.25
914 0.22
915 0.2
916 0.17
917 0.15
918 0.13
919 0.12
920 0.11
921 0.1
922 0.1
923 0.09
924 0.08
925 0.09
926 0.13
927 0.13
928 0.13
929 0.16
930 0.2
931 0.23
932 0.23
933 0.23
934 0.21
935 0.28
936 0.28
937 0.25
938 0.21
939 0.19
940 0.19
941 0.17
942 0.15
943 0.08
944 0.08
945 0.08
946 0.08
947 0.1
948 0.08
949 0.08
950 0.08
951 0.09
952 0.1
953 0.1
954 0.11
955 0.08
956 0.13
957 0.14
958 0.15
959 0.16
960 0.17
961 0.17
962 0.2
963 0.23
964 0.27
965 0.29
966 0.28
967 0.27
968 0.27
969 0.26
970 0.23
971 0.21
972 0.13
973 0.12
974 0.12
975 0.11
976 0.1
977 0.12
978 0.13
979 0.12
980 0.13
981 0.12
982 0.11
983 0.18
984 0.2
985 0.21
986 0.22
987 0.28
988 0.27
989 0.28
990 0.3
991 0.32
992 0.36
993 0.38
994 0.41
995 0.43
996 0.45
997 0.48
998 0.47
999 0.4
1000 0.33
1001 0.27
1002 0.23
1003 0.15
1004 0.13
1005 0.09
1006 0.06
1007 0.05
1008 0.05
1009 0.05
1010 0.05
1011 0.05
1012 0.05
1013 0.06