Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8T6N6

Protein Details
Accession A0A1V8T6N6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-81HISNIRGKRKPKPGLKAQHLACHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-73RGKRKPKPG
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 6, nucl 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MADEDLVKRMQHLGMSPRSRNVRATLSTELLEIDGRTLEGGGQLLRLSLTLSALISRPVHISNIRGKRKPKPGLKAQHLACVQWLARACNTTVVGAEKGSTDLVFTPGKVNGNSPVYTKSITKAVWDSKVEIGTAGSTGLLLQAILPFILFSPPRSETGEAETVRLAVSGGTNVSGAPSYDYIANVLLPTLTSIGFPPVSASLEKRGWSSGRESIGSFTLLIPPRPPGALAAFKLCRQPNETSPQSPSMITAKLIAPPDLHQDFTDAVISFVAWRFGEKHTLFHRNLTIDCEASDSTAHLYLLITSTVTPPPSQPDVASYFLAADHLPERKIPPARQSKYVIDAVTRCVNELCALWTSGARADEHLRDQLVVFQALAEGRSEVFGGDGREISLHARTAEWVAKQMLGVRCQEDGIEGIGFGANCFDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.45
3 0.46
4 0.51
5 0.56
6 0.57
7 0.56
8 0.52
9 0.5
10 0.46
11 0.49
12 0.46
13 0.42
14 0.39
15 0.36
16 0.31
17 0.24
18 0.21
19 0.15
20 0.11
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.09
40 0.09
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.15
45 0.15
46 0.19
47 0.19
48 0.24
49 0.3
50 0.4
51 0.48
52 0.52
53 0.58
54 0.64
55 0.73
56 0.78
57 0.77
58 0.77
59 0.79
60 0.83
61 0.85
62 0.84
63 0.75
64 0.73
65 0.65
66 0.55
67 0.45
68 0.39
69 0.3
70 0.25
71 0.26
72 0.2
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.07
89 0.07
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.15
95 0.18
96 0.17
97 0.18
98 0.2
99 0.23
100 0.24
101 0.23
102 0.23
103 0.22
104 0.24
105 0.23
106 0.2
107 0.21
108 0.2
109 0.21
110 0.24
111 0.27
112 0.31
113 0.31
114 0.32
115 0.3
116 0.3
117 0.27
118 0.21
119 0.17
120 0.12
121 0.11
122 0.08
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.19
143 0.2
144 0.19
145 0.23
146 0.29
147 0.25
148 0.24
149 0.22
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.11
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.13
205 0.09
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.08
215 0.11
216 0.14
217 0.14
218 0.17
219 0.18
220 0.19
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.24
225 0.27
226 0.27
227 0.34
228 0.36
229 0.32
230 0.34
231 0.35
232 0.32
233 0.29
234 0.25
235 0.2
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.13
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.2
246 0.18
247 0.18
248 0.15
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.17
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.19
265 0.19
266 0.24
267 0.29
268 0.37
269 0.37
270 0.38
271 0.4
272 0.34
273 0.34
274 0.33
275 0.28
276 0.2
277 0.2
278 0.19
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.16
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.2
303 0.23
304 0.25
305 0.24
306 0.19
307 0.16
308 0.15
309 0.16
310 0.11
311 0.09
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.14
316 0.16
317 0.22
318 0.3
319 0.32
320 0.39
321 0.48
322 0.51
323 0.56
324 0.59
325 0.56
326 0.54
327 0.55
328 0.45
329 0.38
330 0.36
331 0.34
332 0.34
333 0.3
334 0.26
335 0.22
336 0.22
337 0.19
338 0.18
339 0.16
340 0.12
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.15
349 0.18
350 0.21
351 0.24
352 0.26
353 0.23
354 0.23
355 0.22
356 0.24
357 0.22
358 0.19
359 0.16
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.1
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.13
383 0.15
384 0.18
385 0.22
386 0.21
387 0.23
388 0.22
389 0.23
390 0.23
391 0.29
392 0.29
393 0.29
394 0.31
395 0.29
396 0.28
397 0.28
398 0.27
399 0.21
400 0.17
401 0.16
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.1