Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TRD8

Protein Details
Accession A0A1V8TRD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-114PTTTGTGKLKRKRGEKRKLGRPRKEGSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-111KLKRKRGEKRKLGRPRKE
241-244KKRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
Amino Acid Sequences MASPPPPSSSPPAPGGLTLPRQRPALTLPTASALASRKPSTASTATLSSHPLRQTSFPPEGQTSPRYSPSVTPDFSDSEITSAISGPTTTGTGKLKRKRGEKRKLGRPRKEGSLLPDPELRSSPSHPPPPQDDPSSDSDASADDPLASRSHLDAAYRQQQSDQKSMLALMPEWQRAQYAQWHAFKLNKADVRKLVNQTLSQSVPANVVNVVSSYLKIFAGQVVEGAREVQGERMWEEGLRKKRRVDKTMAGVKKEGGVKTEGNGQEMLGSDDTQPDSESTIQGQHGDGQDDMPDAALGWSREIDELDRGPLQPDHLREAVRRMKKSRAGGSVGFTGLSLEGREVAAPRMGGRRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.33
4 0.37
5 0.39
6 0.4
7 0.4
8 0.42
9 0.41
10 0.4
11 0.39
12 0.38
13 0.35
14 0.32
15 0.29
16 0.3
17 0.3
18 0.27
19 0.25
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.25
24 0.24
25 0.26
26 0.27
27 0.3
28 0.3
29 0.29
30 0.26
31 0.28
32 0.29
33 0.27
34 0.31
35 0.27
36 0.29
37 0.28
38 0.27
39 0.26
40 0.27
41 0.31
42 0.34
43 0.38
44 0.34
45 0.37
46 0.38
47 0.39
48 0.4
49 0.39
50 0.37
51 0.36
52 0.38
53 0.35
54 0.34
55 0.34
56 0.37
57 0.4
58 0.35
59 0.33
60 0.31
61 0.32
62 0.31
63 0.3
64 0.22
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.1
78 0.15
79 0.23
80 0.32
81 0.4
82 0.47
83 0.54
84 0.64
85 0.71
86 0.78
87 0.81
88 0.83
89 0.85
90 0.88
91 0.92
92 0.93
93 0.91
94 0.89
95 0.83
96 0.79
97 0.74
98 0.65
99 0.61
100 0.6
101 0.51
102 0.45
103 0.44
104 0.37
105 0.34
106 0.32
107 0.28
108 0.2
109 0.22
110 0.28
111 0.31
112 0.38
113 0.39
114 0.41
115 0.45
116 0.5
117 0.5
118 0.45
119 0.4
120 0.35
121 0.38
122 0.39
123 0.33
124 0.26
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.15
129 0.11
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.16
142 0.24
143 0.24
144 0.24
145 0.25
146 0.29
147 0.32
148 0.34
149 0.29
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.18
154 0.15
155 0.11
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.17
166 0.22
167 0.25
168 0.26
169 0.27
170 0.29
171 0.3
172 0.28
173 0.28
174 0.26
175 0.25
176 0.27
177 0.3
178 0.32
179 0.36
180 0.36
181 0.34
182 0.31
183 0.31
184 0.3
185 0.29
186 0.24
187 0.2
188 0.18
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.14
224 0.2
225 0.3
226 0.36
227 0.39
228 0.45
229 0.54
230 0.63
231 0.65
232 0.65
233 0.63
234 0.66
235 0.72
236 0.7
237 0.62
238 0.54
239 0.48
240 0.45
241 0.41
242 0.32
243 0.24
244 0.23
245 0.21
246 0.21
247 0.29
248 0.24
249 0.22
250 0.21
251 0.19
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.14
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.2
297 0.19
298 0.23
299 0.24
300 0.25
301 0.28
302 0.29
303 0.32
304 0.31
305 0.39
306 0.45
307 0.48
308 0.53
309 0.53
310 0.59
311 0.64
312 0.71
313 0.7
314 0.67
315 0.64
316 0.59
317 0.59
318 0.53
319 0.45
320 0.36
321 0.28
322 0.22
323 0.16
324 0.14
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.16
335 0.22
336 0.25