FuNGI

A0A1V8SV39

Protein Details

Accession

A0A1V8SV39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-60	VDGQNKKQTSQPPKAWQGPN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain IPR025852 SM_dom_ATX
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD PF14438 SM-ATX

Amino Acid Sequences

MSAATVNGDNSGKASGSKPQQSKSSNGRALEGTRKQAASPVDGQNKKQTSQPPKAWQGPNPITQRTGNQSSMHNGIEKPLPKLPPQSPAGAPSDTHIEQHAHDRLLFLLAHSTGTDATLTLKNGEQFSGVFSGASLEAANKSVYILKMAKRTRLPSSQQLNGERDLPDEYIGEGEDHMMTFDVQDTIDLAVSEVVLASAPTQNGSAASSFRTDTEISTRNRDRPVERELQPWSGGIEMSLDDMALESSGDTKWDQFAVNEEKFGTQTTYDEDEYTTTIDRSRPEYARLAAQAERIEREIFKSTAMNSHVAEERGQNVDEGDGLDEEDKYSGVRREAPVLPKGAAGSYVPPSRRPLTNVPTVPGAPYDPAIISLEKPAHVAAPPTVVEPARTPEPVTTPSSMKQDAPEGANDSLASTTQTPEAAKRPENTTEDHVRGTADAFKQFANTEKLRMHQAREQQRMAKKQEKNVKINDLKKFAENFKLKSRVPDDLVPILAKDHEKQAEIKRKAESSALQEEVRAKEREKERASATPSPQKQPQVAVDPQTSLSLQHSRTRVSQNLRGGPSLTSPRGFAPPRGQNIPYMGRQPGMGPQTQPLPADIRIPTGPMARDSGPLSPASATSATNTRYNVNAKEFKFTPGVSSFTPSGASPSPQRIPISAPVPETNATFFDEKDNKGEMPTRDVNVDCDTIKRLLTADYPADHKKSFINGIPQPFRTPPTWPVAKEFENKSFLDAFPKPRIHSQGPTPRATPIPAGLHMQHQLPQHPQHHGHTPLPSPGQRPPFFGQQGSQHGQQYDHRMQYPGGPGSVQNSPRYAHAQMAGYGPQMGQGPVPQMAQFAGQQGYGMSPGMQFRQMQAPPGGPMMMMPQQHQQSKSYTVSHPEDSQLTNNISVNQMRPNAYPQPGPNGPNAFPPNMHQQPGAHMMSHSSSNSSYHPNNLPHQPQQGYSPMPQHAQPNGYAPSPRPGAQMMQHSGSHQGFQPPHQGQGGYGQGPPQFMRNPSGGGGHGGYAGQMTPRGSFGVPQQQGQPGQQQGNGMSGPDAVASSVDSEQDGEAARDVSPSSRRSSDARLEAFAHASAVRQKSDDSKLVPKPDPKPDTTEYMWF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.2
3	0.29
4	0.38
5	0.43
6	0.47
7	0.55
8	0.57
9	0.64
10	0.65
11	0.67
12	0.64
13	0.59
14	0.57
15	0.52
16	0.54
17	0.55
18	0.51
19	0.47
20	0.46
21	0.45
22	0.42
23	0.44
24	0.41
25	0.37
26	0.38
27	0.41
28	0.46
29	0.49
30	0.53
31	0.57
32	0.58
33	0.54
34	0.53
35	0.54
36	0.54
37	0.6
38	0.66
39	0.66
40	0.72
41	0.8
42	0.8
43	0.76
44	0.77
45	0.73
46	0.72
47	0.68
48	0.62
49	0.56
50	0.53
51	0.52
52	0.5
53	0.49
54	0.45
55	0.41
56	0.41
57	0.42
58	0.44
59	0.4
60	0.35
61	0.28
62	0.28
63	0.32
64	0.32
65	0.32
66	0.34
67	0.36
68	0.37
69	0.45
70	0.45
71	0.46
72	0.47
73	0.47
74	0.43
75	0.44
76	0.44
77	0.37
78	0.33
79	0.27
80	0.31
81	0.26
82	0.25
83	0.23
84	0.21
85	0.21
86	0.29
87	0.31
88	0.26
89	0.26
90	0.26
91	0.24
92	0.25
93	0.23
94	0.16
95	0.15
96	0.13
97	0.14
98	0.13
99	0.13
100	0.1
101	0.11
102	0.11
103	0.07
104	0.1
105	0.13
106	0.14
107	0.15
108	0.17
109	0.19
110	0.2
111	0.21
112	0.18
113	0.15
114	0.17
115	0.17
116	0.15
117	0.12
118	0.11
119	0.12
120	0.11
121	0.11
122	0.09
123	0.07
124	0.08
125	0.1
126	0.1
127	0.08
128	0.09
129	0.12
130	0.12
131	0.16
132	0.2
133	0.24
134	0.33
135	0.37
136	0.43
137	0.46
138	0.51
139	0.53
140	0.58
141	0.59
142	0.6
143	0.64
144	0.63
145	0.64
146	0.65
147	0.61
148	0.54
149	0.5
150	0.4
151	0.35
152	0.3
153	0.24
154	0.18
155	0.15
156	0.14
157	0.12
158	0.12
159	0.1
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.12
198	0.14
199	0.14
200	0.14
201	0.2
202	0.26
203	0.27
204	0.36
205	0.4
206	0.43
207	0.48
208	0.51
209	0.49
210	0.47
211	0.52
212	0.51
213	0.49
214	0.49
215	0.47
216	0.45
217	0.42
218	0.37
219	0.3
220	0.22
221	0.19
222	0.13
223	0.1
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.04
233	0.03
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.16
244	0.23
245	0.23
246	0.23
247	0.23
248	0.22
249	0.22
250	0.23
251	0.18
252	0.1
253	0.11
254	0.14
255	0.17
256	0.17
257	0.17
258	0.16
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.13
263	0.1
264	0.11
265	0.13
266	0.15
267	0.18
268	0.24
269	0.25
270	0.27
271	0.31
272	0.31
273	0.33
274	0.32
275	0.31
276	0.26
277	0.27
278	0.26
279	0.23
280	0.23
281	0.21
282	0.2
283	0.18
284	0.2
285	0.21
286	0.19
287	0.18
288	0.19
289	0.18
290	0.22
291	0.24
292	0.22
293	0.18
294	0.21
295	0.22
296	0.21
297	0.22
298	0.17
299	0.18
300	0.17
301	0.17
302	0.14
303	0.12
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.08
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.08
317	0.11
318	0.12
319	0.16
320	0.17
321	0.23
322	0.27
323	0.32
324	0.32
325	0.31
326	0.3
327	0.26
328	0.25
329	0.2
330	0.16
331	0.12
332	0.11
333	0.14
334	0.18
335	0.18
336	0.2
337	0.24
338	0.27
339	0.28
340	0.31
341	0.35
342	0.36
343	0.44
344	0.43
345	0.4
346	0.39
347	0.37
348	0.32
349	0.25
350	0.2
351	0.12
352	0.11
353	0.1
354	0.08
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.12
360	0.12
361	0.11
362	0.12
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.11
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.11
373	0.12
374	0.12
375	0.15
376	0.14
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.17
381	0.2
382	0.22
383	0.2
384	0.2
385	0.23
386	0.26
387	0.26
388	0.24
389	0.22
390	0.22
391	0.22
392	0.21
393	0.19
394	0.18
395	0.17
396	0.17
397	0.15
398	0.12
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.06
403	0.07
404	0.07
405	0.08
406	0.08
407	0.11
408	0.16
409	0.19
410	0.21
411	0.23
412	0.26
413	0.31
414	0.32
415	0.32
416	0.33
417	0.34
418	0.33
419	0.31
420	0.28
421	0.22
422	0.21
423	0.19
424	0.18
425	0.14
426	0.13
427	0.13
428	0.13
429	0.14
430	0.14
431	0.17
432	0.18
433	0.17
434	0.2
435	0.21
436	0.22
437	0.29
438	0.31
439	0.3
440	0.29
441	0.37
442	0.43
443	0.48
444	0.49
445	0.48
446	0.52
447	0.56
448	0.59
449	0.59
450	0.54
451	0.56
452	0.62
453	0.64
454	0.64
455	0.61
456	0.63
457	0.61
458	0.64
459	0.62
460	0.57
461	0.5
462	0.47
463	0.46
464	0.39
465	0.4
466	0.37
467	0.35
468	0.37
469	0.42
470	0.39
471	0.42
472	0.43
473	0.37
474	0.36
475	0.36
476	0.32
477	0.27
478	0.27
479	0.21
480	0.18
481	0.15
482	0.13
483	0.11
484	0.09
485	0.12
486	0.12
487	0.13
488	0.18
489	0.26
490	0.35
491	0.37
492	0.39
493	0.38
494	0.37
495	0.37
496	0.35
497	0.29
498	0.24
499	0.26
500	0.25
501	0.22
502	0.22
503	0.24
504	0.24
505	0.26
506	0.21
507	0.18
508	0.22
509	0.26
510	0.34
511	0.34
512	0.35
513	0.34
514	0.38
515	0.43
516	0.42
517	0.42
518	0.42
519	0.42
520	0.42
521	0.43
522	0.4
523	0.36
524	0.33
525	0.31
526	0.29
527	0.28
528	0.27
529	0.24
530	0.22
531	0.22
532	0.2
533	0.17
534	0.11
535	0.12
536	0.13
537	0.14
538	0.18
539	0.19
540	0.2
541	0.23
542	0.27
543	0.3
544	0.31
545	0.35
546	0.36
547	0.4
548	0.39
549	0.36
550	0.33
551	0.28
552	0.26
553	0.24
554	0.2
555	0.15
556	0.14
557	0.15
558	0.2
559	0.2
560	0.2
561	0.24
562	0.28
563	0.31
564	0.34
565	0.33
566	0.29
567	0.32
568	0.33
569	0.27
570	0.24
571	0.21
572	0.18
573	0.17
574	0.17
575	0.17
576	0.16
577	0.15
578	0.13
579	0.14
580	0.16
581	0.17
582	0.17
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.15
587	0.15
588	0.15
589	0.14
590	0.14
591	0.14
592	0.14
593	0.14
594	0.12
595	0.14
596	0.12
597	0.14
598	0.14
599	0.14
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.08
608	0.09
609	0.12
610	0.13
611	0.15
612	0.16
613	0.15
614	0.17
615	0.2
616	0.22
617	0.25
618	0.3
619	0.28
620	0.32
621	0.32
622	0.32
623	0.31
624	0.28
625	0.25
626	0.2
627	0.22
628	0.17
629	0.19
630	0.17
631	0.16
632	0.16
633	0.13
634	0.14
635	0.12
636	0.13
637	0.13
638	0.17
639	0.18
640	0.21
641	0.21
642	0.19
643	0.21
644	0.24
645	0.25
646	0.22
647	0.22
648	0.2
649	0.21
650	0.21
651	0.19
652	0.15
653	0.13
654	0.14
655	0.12
656	0.12
657	0.16
658	0.19
659	0.19
660	0.21
661	0.22
662	0.2
663	0.21
664	0.26
665	0.2
666	0.24
667	0.26
668	0.24
669	0.24
670	0.24
671	0.25
672	0.22
673	0.22
674	0.16
675	0.14
676	0.16
677	0.15
678	0.14
679	0.12
680	0.11
681	0.11
682	0.12
683	0.13
684	0.13
685	0.13
686	0.17
687	0.2
688	0.22
689	0.2
690	0.2
691	0.19
692	0.2
693	0.22
694	0.21
695	0.26
696	0.27
697	0.35
698	0.38
699	0.37
700	0.37
701	0.35
702	0.35
703	0.29
704	0.29
705	0.26
706	0.29
707	0.32
708	0.3
709	0.34
710	0.36
711	0.38
712	0.4
713	0.4
714	0.38
715	0.37
716	0.36
717	0.34
718	0.31
719	0.27
720	0.28
721	0.27
722	0.28
723	0.31
724	0.34
725	0.33
726	0.36
727	0.43
728	0.4
729	0.41
730	0.45
731	0.48
732	0.5
733	0.51
734	0.47
735	0.43
736	0.4
737	0.38
738	0.29
739	0.23
740	0.2
741	0.19
742	0.21
743	0.19
744	0.21
745	0.21
746	0.21
747	0.21
748	0.2
749	0.21
750	0.24
751	0.3
752	0.31
753	0.34
754	0.37
755	0.36
756	0.42
757	0.43
758	0.41
759	0.38
760	0.37
761	0.35
762	0.36
763	0.36
764	0.31
765	0.33
766	0.4
767	0.37
768	0.41
769	0.4
770	0.44
771	0.44
772	0.42
773	0.38
774	0.35
775	0.41
776	0.39
777	0.38
778	0.33
779	0.31
780	0.32
781	0.33
782	0.36
783	0.34
784	0.34
785	0.32
786	0.31
787	0.31
788	0.33
789	0.35
790	0.28
791	0.23
792	0.2
793	0.18
794	0.2
795	0.26
796	0.24
797	0.2
798	0.21
799	0.21
800	0.23
801	0.27
802	0.25
803	0.21
804	0.22
805	0.21
806	0.21
807	0.22
808	0.2
809	0.17
810	0.16
811	0.13
812	0.12
813	0.11
814	0.1
815	0.08
816	0.09
817	0.1
818	0.11
819	0.12
820	0.1
821	0.1
822	0.1
823	0.11
824	0.11
825	0.11
826	0.1
827	0.1
828	0.1
829	0.09
830	0.09
831	0.08
832	0.08
833	0.06
834	0.07
835	0.08
836	0.1
837	0.12
838	0.12
839	0.14
840	0.22
841	0.22
842	0.24
843	0.25
844	0.24
845	0.23
846	0.24
847	0.22
848	0.13
849	0.13
850	0.13
851	0.16
852	0.15
853	0.16
854	0.21
855	0.26
856	0.31
857	0.32
858	0.31
859	0.3
860	0.35
861	0.37
862	0.36
863	0.32
864	0.36
865	0.39
866	0.39
867	0.37
868	0.34
869	0.33
870	0.3
871	0.3
872	0.27
873	0.24
874	0.23
875	0.23
876	0.21
877	0.21
878	0.22
879	0.21
880	0.22
881	0.24
882	0.24
883	0.25
884	0.29
885	0.33
886	0.34
887	0.36
888	0.33
889	0.37
890	0.39
891	0.4
892	0.4
893	0.39
894	0.37
895	0.41
896	0.42
897	0.35
898	0.32
899	0.33
900	0.38
901	0.37
902	0.38
903	0.31
904	0.29
905	0.32
906	0.38
907	0.35
908	0.25
909	0.22
910	0.22
911	0.22
912	0.24
913	0.2
914	0.15
915	0.15
916	0.16
917	0.19
918	0.23
919	0.23
920	0.26
921	0.33
922	0.35
923	0.4
924	0.47
925	0.5
926	0.49
927	0.55
928	0.51
929	0.46
930	0.45
931	0.44
932	0.4
933	0.37
934	0.37
935	0.33
936	0.33
937	0.34
938	0.36
939	0.35
940	0.33
941	0.31
942	0.31
943	0.3
944	0.31
945	0.3
946	0.27
947	0.29
948	0.3
949	0.3
950	0.27
951	0.26
952	0.28
953	0.31
954	0.37
955	0.35
956	0.35
957	0.34
958	0.33
959	0.37
960	0.34
961	0.31
962	0.25
963	0.28
964	0.26
965	0.28
966	0.37
967	0.32
968	0.35
969	0.35
970	0.33
971	0.26
972	0.31
973	0.33
974	0.25
975	0.24
976	0.24
977	0.24
978	0.26
979	0.26
980	0.24
981	0.23
982	0.24
983	0.28
984	0.26
985	0.26
986	0.26
987	0.27
988	0.23
989	0.22
990	0.2
991	0.16
992	0.15
993	0.13
994	0.11
995	0.1
996	0.09
997	0.08
998	0.09
999	0.1
1000	0.1
1001	0.11
1002	0.13
1003	0.13
1004	0.15
1005	0.2
1006	0.29
1007	0.3
1008	0.31
1009	0.33
1010	0.37
1011	0.39
1012	0.4
1013	0.41
1014	0.36
1015	0.37
1016	0.37
1017	0.36
1018	0.31
1019	0.32
1020	0.29
1021	0.22
1022	0.17
1023	0.14
1024	0.13
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.08
1031	0.09
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.1
1035	0.1
1036	0.11
1037	0.11
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.12
1044	0.15
1045	0.2
1046	0.22
1047	0.27
1048	0.29
1049	0.32
1050	0.35
1051	0.42
1052	0.47
1053	0.5
1054	0.5
1055	0.47
1056	0.47
1057	0.46
1058	0.43
1059	0.35
1060	0.28
1061	0.19
1062	0.19
1063	0.23
1064	0.24
1065	0.23
1066	0.23
1067	0.25
1068	0.3
1069	0.37
1070	0.41
1071	0.39
1072	0.45
1073	0.51
1074	0.58
1075	0.62
1076	0.64
1077	0.65
1078	0.7
1079	0.71
1080	0.65
1081	0.65
1082	0.62
1083	0.62

A0A1V8SV39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer