Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SQA8

Protein Details
Accession A0A1V8SQA8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-279DEEKTGRKRRREPGLFDAPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-270GRKRRR
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_mito 10, nucl 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MADNKAKYRTEIQQMMFVSGETADPSLETTTMIENIVQQQVIEMLTRATALAARRGTRTITTDDLIFLIRHDRAKVSRLRTFLSWKDVRKSAKDSDDKGAGGGADGVDEFDLGGNDPTLGTGPAVGTRNNKNKKAKVGLPWDVSSFYSEQVPEREDEEDEEEEEMTAATLERLRQADERTRGMNAAEYLHFSECRQASFTFRKGKRFREWAGFGVVTDSKPNDDIVDILGFLTYEIVTLLTEEALKVKASEDATKVEGGDEEKTGRKRRREPGLFDAPEEARKPVGPRHIQEAFRRLQEPELKARYMSHIPKGSWQRPLKLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.42
4 0.33
5 0.24
6 0.17
7 0.16
8 0.1
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.15
23 0.16
24 0.15
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.11
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.08
37 0.09
38 0.15
39 0.19
40 0.21
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.26
45 0.28
46 0.26
47 0.26
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.16
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.19
60 0.21
61 0.27
62 0.34
63 0.37
64 0.4
65 0.4
66 0.42
67 0.42
68 0.46
69 0.43
70 0.45
71 0.44
72 0.43
73 0.46
74 0.5
75 0.5
76 0.49
77 0.51
78 0.48
79 0.51
80 0.53
81 0.51
82 0.5
83 0.49
84 0.44
85 0.38
86 0.32
87 0.22
88 0.16
89 0.13
90 0.07
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.08
111 0.09
112 0.11
113 0.15
114 0.22
115 0.32
116 0.39
117 0.47
118 0.51
119 0.55
120 0.6
121 0.63
122 0.6
123 0.59
124 0.6
125 0.58
126 0.54
127 0.5
128 0.43
129 0.38
130 0.33
131 0.26
132 0.18
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.11
162 0.14
163 0.21
164 0.24
165 0.26
166 0.25
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.21
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.15
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.15
184 0.2
185 0.26
186 0.32
187 0.37
188 0.39
189 0.49
190 0.52
191 0.59
192 0.61
193 0.63
194 0.61
195 0.6
196 0.61
197 0.52
198 0.51
199 0.43
200 0.35
201 0.3
202 0.27
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.04
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.11
236 0.13
237 0.17
238 0.17
239 0.19
240 0.21
241 0.21
242 0.2
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.19
250 0.26
251 0.35
252 0.42
253 0.5
254 0.57
255 0.65
256 0.74
257 0.77
258 0.78
259 0.78
260 0.81
261 0.73
262 0.65
263 0.6
264 0.5
265 0.46
266 0.4
267 0.32
268 0.22
269 0.23
270 0.25
271 0.27
272 0.35
273 0.38
274 0.4
275 0.47
276 0.53
277 0.56
278 0.59
279 0.61
280 0.55
281 0.52
282 0.52
283 0.45
284 0.45
285 0.48
286 0.46
287 0.48
288 0.49
289 0.46
290 0.45
291 0.45
292 0.44
293 0.45
294 0.45
295 0.45
296 0.46
297 0.46
298 0.54
299 0.63
300 0.62
301 0.63
302 0.63