Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SMC8

Protein Details
Accession A0A1V8SMC8    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-140RTEGEERESRKKKKEGRREKARKPKRVRAGEDGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-135KRKRTEGEERESRKKKKEGRREKARKPKRVRA
153-174GKRRRKGKADGGGERVRRIREP
184-193ERRRRALDRK
202-205KPAR
446-459KVAARAKGKGGMGR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDLEQSTSAVPSLDVSPEPQANAEPNDPLDPSIEEENASTPPIANPSADMDLDEDEAPPSDNESELDDLDEAQFDNFDAANIIVPDAPVAVDESNVGLLGVHKRKRTEGEERESRKKKKEGRREKARKPKRVRAGEDGEDEPDFEGGPEMEGKRRRKGKADGGGERVRRIREPENEDDLPPEERRRRALDRKMDDALRTNKPARRRGMGIDLDAAADAELENMRQLMAAACQADQRAREEGKVATAKLKLLPQVTELLNRNTLRSSIIDPDVNILEAVRFYLEPADVDAALPNYQIQRELFAILMGLSMTKEALVASGLGKVIVFYTKSMQPQLGIKRQAEKLEAEWLRIVLGKRKDLRSKAVPTAPYDPLVASQRPTGSQHLDRATLMAEKRKKALAAPIATNRARVEGTVGSYSIMPASNMSSAVLADQGKRQGAVGEAAFRKVAARAKGKGGMGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.18
5 0.2
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.21
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.24
15 0.23
16 0.22
17 0.2
18 0.17
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.16
26 0.16
27 0.13
28 0.11
29 0.12
30 0.15
31 0.16
32 0.14
33 0.14
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.18
38 0.15
39 0.15
40 0.17
41 0.16
42 0.12
43 0.1
44 0.11
45 0.12
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.13
54 0.14
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.09
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.06
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.04
86 0.06
87 0.14
88 0.22
89 0.26
90 0.3
91 0.32
92 0.36
93 0.42
94 0.47
95 0.5
96 0.52
97 0.57
98 0.64
99 0.7
100 0.77
101 0.79
102 0.8
103 0.77
104 0.77
105 0.77
106 0.78
107 0.82
108 0.83
109 0.85
110 0.89
111 0.91
112 0.93
113 0.94
114 0.94
115 0.94
116 0.92
117 0.91
118 0.9
119 0.89
120 0.84
121 0.82
122 0.79
123 0.72
124 0.66
125 0.57
126 0.48
127 0.38
128 0.32
129 0.23
130 0.16
131 0.11
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.08
137 0.08
138 0.14
139 0.22
140 0.26
141 0.33
142 0.41
143 0.44
144 0.49
145 0.56
146 0.61
147 0.63
148 0.67
149 0.65
150 0.64
151 0.67
152 0.6
153 0.56
154 0.49
155 0.41
156 0.34
157 0.34
158 0.34
159 0.36
160 0.42
161 0.44
162 0.48
163 0.47
164 0.46
165 0.42
166 0.37
167 0.31
168 0.26
169 0.27
170 0.24
171 0.25
172 0.29
173 0.34
174 0.41
175 0.48
176 0.55
177 0.59
178 0.58
179 0.61
180 0.6
181 0.56
182 0.48
183 0.45
184 0.42
185 0.36
186 0.35
187 0.36
188 0.36
189 0.42
190 0.48
191 0.45
192 0.43
193 0.42
194 0.41
195 0.44
196 0.42
197 0.36
198 0.29
199 0.26
200 0.21
201 0.19
202 0.15
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.18
230 0.19
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.19
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.18
242 0.17
243 0.2
244 0.21
245 0.2
246 0.24
247 0.24
248 0.23
249 0.2
250 0.2
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.14
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.17
259 0.15
260 0.14
261 0.11
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.05
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.11
315 0.14
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.25
321 0.32
322 0.36
323 0.38
324 0.37
325 0.42
326 0.45
327 0.46
328 0.42
329 0.36
330 0.29
331 0.34
332 0.33
333 0.28
334 0.25
335 0.23
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.2
340 0.24
341 0.31
342 0.36
343 0.44
344 0.52
345 0.53
346 0.59
347 0.6
348 0.62
349 0.63
350 0.62
351 0.58
352 0.54
353 0.55
354 0.49
355 0.42
356 0.35
357 0.28
358 0.25
359 0.27
360 0.24
361 0.2
362 0.21
363 0.21
364 0.23
365 0.26
366 0.27
367 0.29
368 0.32
369 0.37
370 0.37
371 0.37
372 0.35
373 0.32
374 0.29
375 0.27
376 0.26
377 0.29
378 0.32
379 0.33
380 0.36
381 0.38
382 0.38
383 0.36
384 0.42
385 0.42
386 0.41
387 0.45
388 0.49
389 0.54
390 0.53
391 0.53
392 0.44
393 0.38
394 0.32
395 0.26
396 0.23
397 0.18
398 0.21
399 0.2
400 0.19
401 0.18
402 0.17
403 0.17
404 0.15
405 0.12
406 0.09
407 0.09
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.13
416 0.12
417 0.13
418 0.17
419 0.21
420 0.21
421 0.22
422 0.22
423 0.2
424 0.2
425 0.22
426 0.19
427 0.24
428 0.24
429 0.25
430 0.25
431 0.23
432 0.23
433 0.23
434 0.28
435 0.28
436 0.34
437 0.37
438 0.43
439 0.49