Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SQA1

Protein Details
Accession A0A1V8SQA1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-183VGDLTGKNRRSKQNARQRFYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8.5, cyto_mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLTQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGNDPPTAYGAGKKKAEEEEVEDQFRDAENEEGLFATGNYDRDDDEADRIYQAVDERQDKRRRATREAHEQEQRDQYERDNPKIQQQFADLKRALGAVSDEDWASIPEVGDLTGKNRRSKQNARQRFYAVPDSVLAGARDSTQLGTEVQDDAVMTEANGGDQADGTMTNFADIGAARDRVLAVRLDQAAQGTESVAGTSTSIDPRGYLTSLSMSERKAGEVPVGDIKRARQLLESVIKTNPRHGPGWIAAARLEEFAGKIVAARNVMRRGCEMCPKSEDVWLESIRLHDNQNAKIIAAKAIENNDRSVRLWVEAMKLESVPAAKKRVLRKALDHIPQSVAIWKEAVNLEEDPADARLLLAKATEIIPLSVELWLALARLEDPDNAQKVLNKARQAVPGSYEIWIAAARLQEQVGKSDMVFRVMERGIKSLAKASAMLKREEWITQAEICEEESAPITCQAIIKETLGWSLDEDDDRKQIWLDDAKASTNRGRYETARAIYAYALRVFYNRKSLWLAAADLERTHGTKDALWALLEKAVASCPSSEVLWMQLAREKWSAGSIDDARRVLGLAFQQNPGNENIWLEAVRLEADNGETDKARNLLETARSEANTDRVWIKSITFERQLGNTAVALDLVQDALTKFPTAAKLHMQKGQLYEAQSLLPQARTAYATGTRACPTSTPLWLLSSRLEERMGVVVKARSILDRARLALPKSPELWTESIRLELRAKNSTAAQAKLAQALQACPTSGLIWAERIWHLEPRTQRKPRILEAIQKADNDPILFVTAARIFWGERKLEKADAWFTKAAVLEPDLGDTWGWWWKFLLAHGTVEKRAEVLAKCVAVDPRHGEVWQAVRKGEGGWKMSVEDVLVETARRLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.32
3 0.24
4 0.22
5 0.15
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.38
40 0.37
41 0.33
42 0.34
43 0.36
44 0.39
45 0.38
46 0.37
47 0.28
48 0.29
49 0.3
50 0.25
51 0.24
52 0.25
53 0.31
54 0.34
55 0.35
56 0.38
57 0.4
58 0.43
59 0.39
60 0.39
61 0.41
62 0.43
63 0.44
64 0.39
65 0.35
66 0.32
67 0.29
68 0.23
69 0.16
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.2
97 0.26
98 0.31
99 0.41
100 0.49
101 0.53
102 0.6
103 0.64
104 0.65
105 0.67
106 0.72
107 0.72
108 0.75
109 0.77
110 0.76
111 0.76
112 0.71
113 0.69
114 0.67
115 0.6
116 0.53
117 0.46
118 0.42
119 0.44
120 0.47
121 0.47
122 0.46
123 0.45
124 0.5
125 0.56
126 0.55
127 0.47
128 0.47
129 0.5
130 0.45
131 0.53
132 0.44
133 0.37
134 0.36
135 0.34
136 0.28
137 0.19
138 0.18
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.19
156 0.23
157 0.3
158 0.37
159 0.45
160 0.54
161 0.64
162 0.7
163 0.75
164 0.81
165 0.8
166 0.78
167 0.74
168 0.69
169 0.64
170 0.61
171 0.51
172 0.41
173 0.36
174 0.32
175 0.28
176 0.25
177 0.19
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.13
223 0.11
224 0.09
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.25
270 0.25
271 0.24
272 0.18
273 0.19
274 0.25
275 0.31
276 0.32
277 0.28
278 0.29
279 0.34
280 0.33
281 0.38
282 0.36
283 0.32
284 0.31
285 0.3
286 0.31
287 0.27
288 0.34
289 0.29
290 0.24
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.17
295 0.15
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.12
306 0.16
307 0.22
308 0.23
309 0.23
310 0.24
311 0.26
312 0.27
313 0.34
314 0.31
315 0.28
316 0.31
317 0.33
318 0.32
319 0.32
320 0.3
321 0.23
322 0.25
323 0.23
324 0.2
325 0.17
326 0.18
327 0.16
328 0.17
329 0.16
330 0.17
331 0.2
332 0.21
333 0.24
334 0.23
335 0.21
336 0.22
337 0.21
338 0.19
339 0.16
340 0.15
341 0.13
342 0.16
343 0.2
344 0.18
345 0.2
346 0.19
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.16
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.15
365 0.17
366 0.23
367 0.29
368 0.38
369 0.43
370 0.43
371 0.45
372 0.51
373 0.56
374 0.56
375 0.51
376 0.44
377 0.39
378 0.36
379 0.31
380 0.26
381 0.18
382 0.13
383 0.12
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.07
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.16
430 0.23
431 0.25
432 0.24
433 0.26
434 0.28
435 0.32
436 0.33
437 0.3
438 0.25
439 0.23
440 0.22
441 0.2
442 0.17
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.11
463 0.14
464 0.14
465 0.17
466 0.13
467 0.14
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.17
477 0.19
478 0.19
479 0.17
480 0.17
481 0.17
482 0.17
483 0.16
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.08
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.09
509 0.09
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.09
521 0.12
522 0.13
523 0.14
524 0.16
525 0.16
526 0.18
527 0.19
528 0.2
529 0.2
530 0.21
531 0.21
532 0.2
533 0.22
534 0.23
535 0.29
536 0.32
537 0.3
538 0.27
539 0.25
540 0.23
541 0.21
542 0.21
543 0.15
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.12
548 0.14
549 0.15
550 0.21
551 0.2
552 0.21
553 0.23
554 0.23
555 0.24
556 0.22
557 0.21
558 0.15
559 0.16
560 0.14
561 0.11
562 0.12
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.12
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.13
574 0.12
575 0.12
576 0.11
577 0.09
578 0.07
579 0.07
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.12
593 0.13
594 0.16
595 0.16
596 0.15
597 0.13
598 0.15
599 0.15
600 0.12
601 0.16
602 0.17
603 0.19
604 0.22
605 0.22
606 0.2
607 0.19
608 0.19
609 0.14
610 0.12
611 0.13
612 0.15
613 0.16
614 0.18
615 0.19
616 0.19
617 0.21
618 0.2
619 0.18
620 0.14
621 0.13
622 0.12
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.08
627 0.07
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.08
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.11
641 0.1
642 0.1
643 0.13
644 0.17
645 0.19
646 0.21
647 0.22
648 0.22
649 0.23
650 0.23
651 0.23
652 0.19
653 0.19
654 0.17
655 0.16
656 0.18
657 0.17
658 0.16
659 0.2
660 0.23
661 0.26
662 0.27
663 0.29
664 0.28
665 0.29
666 0.31
667 0.25
668 0.22
669 0.17
670 0.14
671 0.12
672 0.1
673 0.09
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.04
678 0.04
679 0.05
680 0.05
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.08
685 0.14
686 0.15
687 0.17
688 0.25
689 0.31
690 0.35
691 0.4
692 0.4
693 0.37
694 0.38
695 0.39
696 0.34
697 0.29
698 0.27
699 0.22
700 0.21
701 0.19
702 0.18
703 0.16
704 0.13
705 0.11
706 0.1
707 0.11
708 0.12
709 0.12
710 0.14
711 0.15
712 0.17
713 0.19
714 0.21
715 0.21
716 0.2
717 0.21
718 0.18
719 0.19
720 0.2
721 0.21
722 0.21
723 0.2
724 0.23
725 0.23
726 0.24
727 0.22
728 0.24
729 0.24
730 0.22
731 0.22
732 0.19
733 0.2
734 0.23
735 0.22
736 0.17
737 0.18
738 0.18
739 0.18
740 0.19
741 0.19
742 0.14
743 0.16
744 0.19
745 0.22
746 0.23
747 0.25
748 0.29
749 0.33
750 0.33
751 0.36
752 0.37
753 0.35
754 0.35
755 0.34
756 0.3
757 0.3
758 0.31
759 0.28
760 0.27
761 0.24
762 0.27
763 0.26
764 0.28
765 0.28
766 0.28
767 0.31
768 0.32
769 0.33
770 0.3
771 0.31
772 0.36
773 0.36
774 0.33
775 0.31
776 0.3
777 0.3
778 0.31
779 0.29
780 0.24
781 0.2
782 0.2
783 0.21
784 0.18
785 0.17
786 0.14
787 0.14
788 0.13
789 0.14
790 0.14
791 0.12
792 0.13
793 0.13
794 0.16
795 0.16
796 0.19
797 0.19
798 0.23
799 0.24
800 0.28
801 0.37
802 0.43
803 0.53
804 0.59
805 0.64
806 0.67
807 0.72
808 0.72
809 0.74
810 0.69
811 0.68
812 0.68
813 0.7
814 0.64
815 0.58
816 0.53
817 0.45
818 0.42
819 0.32
820 0.24
821 0.16
822 0.15
823 0.14
824 0.12
825 0.14
826 0.13
827 0.13
828 0.13
829 0.13
830 0.12
831 0.17
832 0.22
833 0.22
834 0.23
835 0.29
836 0.31
837 0.34
838 0.35
839 0.36
840 0.39
841 0.39
842 0.42
843 0.38
844 0.34
845 0.34
846 0.33
847 0.28
848 0.22
849 0.2
850 0.17
851 0.16
852 0.18
853 0.16
854 0.15
855 0.14
856 0.12
857 0.13
858 0.16
859 0.16
860 0.15
861 0.15
862 0.17
863 0.19
864 0.21
865 0.26
866 0.21
867 0.26
868 0.31
869 0.34
870 0.34
871 0.34
872 0.32
873 0.25
874 0.24
875 0.26
876 0.21
877 0.22
878 0.24
879 0.23
880 0.24
881 0.27
882 0.3
883 0.26
884 0.3
885 0.31
886 0.3
887 0.32
888 0.31
889 0.3
890 0.29
891 0.37
892 0.38
893 0.36
894 0.32
895 0.31
896 0.32
897 0.32
898 0.34
899 0.32
900 0.28
901 0.28
902 0.29
903 0.29
904 0.29
905 0.27
906 0.21
907 0.15
908 0.13
909 0.13
910 0.13
911 0.12