Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TGP1

Protein Details
Accession A0A1V8TGP1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-47ILDDPKPRTRLRRTPDEVKQQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
534-583KEKEDAAVAAGRGGRGNARGGPAGRGGAPRGGPAQRGGAQQRGRGAPATR
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 12, nucl 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDDSLTSAFERLRVGADKIESIDSILDDPKPRTRLRRTPDEVKQQLEIDFLTPSTSFSPQWLNKLQQRWDAPTNYSELFSLAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFYPFAPGGLEGVEATAAAEDEFLAAREVNGGRKASKLDRVIDFAAEGGLLSVPPGFERGLRLPEKAEKAEDDAAEEVERVLEEETEQKDEANWVDGADEANGDADVTSDDEGSEEEVDALLPVEFPALAPHAPLLSARNKHGGREWAHMVDVNRDIANFKDLVPDMARTWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRLEFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDSERGVVWEEVIIMLPEHVTLIMLSATVPNTFEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLAHYLWADKRMIKIVDENKHFLEKGWKDANDALSGRDKIIAAEAKAKEKEDAAVAAGRGGRGNARGGPAGRGGAPRGGPAQRGGAQQRGRGAPATRGQGNIARTGRGGGRTSAAQDKTLWVHLVQHLKKEELLPCCIFVFSKKRCEENADALSNLDFSNAAEKSATHMILEKSLARLKADDRDLPQIRRIRELLSRGIAVHHGGLLPIVKECVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKFDNKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVLLVSAGAEEAPPAGRLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQIRLSEADLAKVKRESCETCDKDIEACHDASVMFEQYTQDLHLAMLGTPVGRRMFQPKRIIVFKNQNGVRTVGVLLREGASRGANAGVQTLEVAYKKKTKRQDADFLPFLPRFRRHFTALPQTDAEMDLRLTTVPVNDIEALTANHLQMDVNAVMRKEPTEWAKAKADLLQLCSSWASSTWNELDHLKWLKAMTVRNLLDDRLRFATLAQQCACIHCPNFPRHFAMAHDQWIIKDKIDSIRSLMSDQNLQLLPDYQQRISVLKDLGFIDDNSRVELKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSSFVFQERTDSSPNLTPALEKGIETIIKISENVNRYQTLHQVILSSDDSNDFVSRPRFGLVEVVYEWARGMPFSRITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCRECKNAARIIGDPTLFAKMQSCQELIKRDICATASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.26
4 0.26
5 0.26
6 0.27
7 0.23
8 0.2
9 0.19
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.17
14 0.2
15 0.24
16 0.3
17 0.35
18 0.41
19 0.48
20 0.57
21 0.63
22 0.68
23 0.75
24 0.76
25 0.8
26 0.84
27 0.86
28 0.81
29 0.74
30 0.69
31 0.6
32 0.53
33 0.44
34 0.35
35 0.25
36 0.2
37 0.16
38 0.15
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.27
46 0.28
47 0.36
48 0.41
49 0.46
50 0.5
51 0.58
52 0.61
53 0.6
54 0.62
55 0.62
56 0.63
57 0.59
58 0.55
59 0.49
60 0.48
61 0.41
62 0.36
63 0.29
64 0.22
65 0.19
66 0.16
67 0.18
68 0.15
69 0.18
70 0.19
71 0.2
72 0.25
73 0.28
74 0.29
75 0.31
76 0.36
77 0.37
78 0.38
79 0.39
80 0.39
81 0.39
82 0.39
83 0.35
84 0.34
85 0.3
86 0.29
87 0.31
88 0.27
89 0.25
90 0.23
91 0.21
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.2
99 0.2
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.21
107 0.26
108 0.29
109 0.35
110 0.4
111 0.45
112 0.51
113 0.59
114 0.6
115 0.6
116 0.59
117 0.58
118 0.54
119 0.5
120 0.46
121 0.37
122 0.33
123 0.28
124 0.26
125 0.19
126 0.15
127 0.17
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.19
155 0.21
156 0.21
157 0.23
158 0.29
159 0.29
160 0.36
161 0.37
162 0.39
163 0.4
164 0.44
165 0.42
166 0.38
167 0.33
168 0.25
169 0.2
170 0.14
171 0.1
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.13
183 0.16
184 0.24
185 0.26
186 0.27
187 0.3
188 0.37
189 0.41
190 0.38
191 0.37
192 0.31
193 0.34
194 0.37
195 0.32
196 0.27
197 0.23
198 0.21
199 0.19
200 0.17
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.12
209 0.14
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.18
215 0.18
216 0.16
217 0.14
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.12
260 0.18
261 0.21
262 0.23
263 0.32
264 0.32
265 0.34
266 0.39
267 0.42
268 0.38
269 0.41
270 0.43
271 0.35
272 0.35
273 0.36
274 0.32
275 0.28
276 0.26
277 0.22
278 0.18
279 0.17
280 0.17
281 0.15
282 0.16
283 0.13
284 0.11
285 0.15
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.17
291 0.23
292 0.24
293 0.2
294 0.21
295 0.2
296 0.19
297 0.19
298 0.2
299 0.18
300 0.21
301 0.22
302 0.21
303 0.2
304 0.2
305 0.2
306 0.21
307 0.19
308 0.17
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.1
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.12
345 0.18
346 0.19
347 0.21
348 0.23
349 0.26
350 0.26
351 0.3
352 0.38
353 0.38
354 0.47
355 0.47
356 0.52
357 0.52
358 0.53
359 0.58
360 0.5
361 0.43
362 0.41
363 0.41
364 0.33
365 0.31
366 0.3
367 0.19
368 0.19
369 0.16
370 0.09
371 0.06
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.07
393 0.09
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.09
409 0.07
410 0.06
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.1
418 0.11
419 0.08
420 0.09
421 0.1
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.06
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.16
455 0.2
456 0.24
457 0.28
458 0.32
459 0.36
460 0.37
461 0.42
462 0.4
463 0.42
464 0.46
465 0.52
466 0.51
467 0.51
468 0.49
469 0.46
470 0.45
471 0.39
472 0.31
473 0.28
474 0.33
475 0.3
476 0.32
477 0.32
478 0.32
479 0.33
480 0.34
481 0.29
482 0.21
483 0.19
484 0.2
485 0.18
486 0.17
487 0.23
488 0.28
489 0.34
490 0.36
491 0.37
492 0.34
493 0.36
494 0.35
495 0.29
496 0.3
497 0.24
498 0.28
499 0.31
500 0.3
501 0.3
502 0.33
503 0.33
504 0.27
505 0.26
506 0.21
507 0.2
508 0.2
509 0.18
510 0.17
511 0.15
512 0.12
513 0.15
514 0.15
515 0.11
516 0.18
517 0.19
518 0.22
519 0.23
520 0.24
521 0.21
522 0.2
523 0.2
524 0.13
525 0.12
526 0.09
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.15
555 0.16
556 0.2
557 0.21
558 0.25
559 0.26
560 0.27
561 0.29
562 0.27
563 0.25
564 0.23
565 0.22
566 0.2
567 0.22
568 0.24
569 0.21
570 0.21
571 0.21
572 0.23
573 0.23
574 0.24
575 0.21
576 0.18
577 0.17
578 0.18
579 0.18
580 0.17
581 0.17
582 0.11
583 0.12
584 0.12
585 0.14
586 0.18
587 0.18
588 0.16
589 0.15
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.15
594 0.09
595 0.11
596 0.14
597 0.23
598 0.22
599 0.25
600 0.26
601 0.25
602 0.26
603 0.27
604 0.28
605 0.21
606 0.24
607 0.2
608 0.2
609 0.2
610 0.19
611 0.16
612 0.15
613 0.21
614 0.21
615 0.3
616 0.31
617 0.33
618 0.34
619 0.4
620 0.4
621 0.39
622 0.4
623 0.32
624 0.3
625 0.28
626 0.26
627 0.21
628 0.17
629 0.1
630 0.05
631 0.04
632 0.08
633 0.08
634 0.08
635 0.07
636 0.07
637 0.1
638 0.12
639 0.12
640 0.08
641 0.11
642 0.11
643 0.12
644 0.13
645 0.11
646 0.11
647 0.13
648 0.13
649 0.11
650 0.12
651 0.13
652 0.17
653 0.19
654 0.2
655 0.2
656 0.28
657 0.31
658 0.31
659 0.36
660 0.35
661 0.34
662 0.34
663 0.33
664 0.27
665 0.27
666 0.29
667 0.26
668 0.23
669 0.22
670 0.19
671 0.19
672 0.17
673 0.13
674 0.1
675 0.07
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.09
695 0.08
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.08
706 0.07
707 0.06
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.06
712 0.06
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.1
718 0.13
719 0.17
720 0.18
721 0.19
722 0.21
723 0.23
724 0.27
725 0.33
726 0.32
727 0.33
728 0.34
729 0.34
730 0.35
731 0.35
732 0.31
733 0.24
734 0.22
735 0.18
736 0.15
737 0.15
738 0.11
739 0.11
740 0.09
741 0.08
742 0.09
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.11
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.07
755 0.06
756 0.05
757 0.04
758 0.03
759 0.03
760 0.02
761 0.02
762 0.02
763 0.02
764 0.03
765 0.03
766 0.04
767 0.05
768 0.05
769 0.07
770 0.07
771 0.09
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.17
776 0.18
777 0.19
778 0.19
779 0.2
780 0.19
781 0.21
782 0.2
783 0.2
784 0.24
785 0.29
786 0.32
787 0.37
788 0.35
789 0.38
790 0.38
791 0.36
792 0.32
793 0.25
794 0.22
795 0.15
796 0.13
797 0.09
798 0.07
799 0.06
800 0.05
801 0.06
802 0.06
803 0.07
804 0.09
805 0.11
806 0.13
807 0.14
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.18
812 0.17
813 0.2
814 0.19
815 0.2
816 0.21
817 0.2
818 0.19
819 0.17
820 0.17
821 0.15
822 0.15
823 0.17
824 0.17
825 0.18
826 0.19
827 0.21
828 0.21
829 0.19
830 0.18
831 0.2
832 0.19
833 0.21
834 0.24
835 0.22
836 0.22
837 0.24
838 0.24
839 0.2
840 0.24
841 0.23
842 0.24
843 0.35
844 0.36
845 0.37
846 0.38
847 0.37
848 0.34
849 0.32
850 0.31
851 0.23
852 0.2
853 0.16
854 0.14
855 0.14
856 0.13
857 0.13
858 0.1
859 0.07
860 0.07
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.06
868 0.07
869 0.07
870 0.06
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.08
876 0.08
877 0.08
878 0.1
879 0.19
880 0.26
881 0.34
882 0.42
883 0.44
884 0.49
885 0.54
886 0.56
887 0.55
888 0.59
889 0.55
890 0.57
891 0.54
892 0.5
893 0.46
894 0.45
895 0.36
896 0.27
897 0.23
898 0.16
899 0.15
900 0.13
901 0.12
902 0.11
903 0.11
904 0.1
905 0.1
906 0.09
907 0.08
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.08
912 0.08
913 0.07
914 0.07
915 0.07
916 0.06
917 0.08
918 0.08
919 0.1
920 0.12
921 0.2
922 0.24
923 0.32
924 0.41
925 0.49
926 0.57
927 0.64
928 0.71
929 0.7
930 0.74
931 0.7
932 0.62
933 0.56
934 0.49
935 0.42
936 0.38
937 0.36
938 0.33
939 0.37
940 0.4
941 0.41
942 0.45
943 0.5
944 0.56
945 0.52
946 0.51
947 0.44
948 0.4
949 0.36
950 0.31
951 0.25
952 0.14
953 0.11
954 0.08
955 0.08
956 0.07
957 0.07
958 0.07
959 0.07
960 0.07
961 0.08
962 0.09
963 0.09
964 0.09
965 0.09
966 0.1
967 0.1
968 0.11
969 0.12
970 0.1
971 0.09
972 0.1
973 0.09
974 0.08
975 0.12
976 0.1
977 0.11
978 0.13
979 0.13
980 0.13
981 0.14
982 0.15
983 0.13
984 0.17
985 0.19
986 0.26
987 0.28
988 0.32
989 0.36
990 0.36
991 0.36
992 0.35
993 0.37
994 0.3
995 0.32
996 0.29
997 0.25
998 0.25
999 0.24
1000 0.2
1001 0.14
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.12
1005 0.16
1006 0.16
1007 0.17
1008 0.18
1009 0.19
1010 0.19
1011 0.22
1012 0.25
1013 0.21
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.23
1017 0.27
1018 0.3
1019 0.28
1020 0.34
1021 0.34
1022 0.36
1023 0.37
1024 0.35
1025 0.36
1026 0.33
1027 0.31
1028 0.25
1029 0.25
1030 0.21
1031 0.2
1032 0.28
1033 0.26
1034 0.31
1035 0.27
1036 0.28
1037 0.28
1038 0.31
1039 0.34
1040 0.29
1041 0.26
1042 0.26
1043 0.32
1044 0.37
1045 0.42
1046 0.42
1047 0.45
1048 0.42
1049 0.43
1050 0.4
1051 0.42
1052 0.37
1053 0.35
1054 0.35
1055 0.3
1056 0.29
1057 0.34
1058 0.31
1059 0.24
1060 0.21
1061 0.21
1062 0.26
1063 0.27
1064 0.28
1065 0.25
1066 0.27
1067 0.28
1068 0.29
1069 0.28
1070 0.22
1071 0.24
1072 0.23
1073 0.25
1074 0.22
1075 0.21
1076 0.2
1077 0.19
1078 0.19
1079 0.23
1080 0.26
1081 0.2
1082 0.23
1083 0.24
1084 0.25
1085 0.26
1086 0.28
1087 0.24
1088 0.21
1089 0.24
1090 0.22
1091 0.23
1092 0.22
1093 0.21
1094 0.19
1095 0.21
1096 0.21
1097 0.2
1098 0.2
1099 0.18
1100 0.18
1101 0.2
1102 0.21
1103 0.21
1104 0.21
1105 0.24
1106 0.24
1107 0.25
1108 0.27
1109 0.27
1110 0.25
1111 0.22
1112 0.22
1113 0.17
1114 0.17
1115 0.16
1116 0.13
1117 0.11
1118 0.09
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.07
1122 0.06
1123 0.05
1124 0.04
1125 0.04
1126 0.05
1127 0.04
1128 0.04
1129 0.05
1130 0.06
1131 0.06
1132 0.06
1133 0.06
1134 0.06
1135 0.06
1136 0.06
1137 0.06
1138 0.05
1139 0.05
1140 0.05
1141 0.05
1142 0.06
1143 0.07
1144 0.07
1145 0.11
1146 0.13
1147 0.17
1148 0.21
1149 0.22
1150 0.25
1151 0.29
1152 0.31
1153 0.29
1154 0.27
1155 0.24
1156 0.21
1157 0.26
1158 0.23
1159 0.17
1160 0.17
1161 0.2
1162 0.2
1163 0.2
1164 0.2
1165 0.15
1166 0.15
1167 0.16
1168 0.17
1169 0.19
1170 0.22
1171 0.25
1172 0.27
1173 0.27
1174 0.29
1175 0.32
1176 0.36
1177 0.35
1178 0.33
1179 0.3
1180 0.28
1181 0.26
1182 0.27
1183 0.26
1184 0.2
1185 0.16
1186 0.16
1187 0.16
1188 0.16
1189 0.17
1190 0.13
1191 0.16
1192 0.19
1193 0.2
1194 0.2
1195 0.21
1196 0.2
1197 0.2
1198 0.26
1199 0.22
1200 0.23
1201 0.21
1202 0.23
1203 0.21
1204 0.21
1205 0.2
1206 0.15
1207 0.14
1208 0.11
1209 0.12
1210 0.14
1211 0.19
1212 0.21
1213 0.25
1214 0.25
1215 0.28
1216 0.31
1217 0.3
1218 0.27
1219 0.23
1220 0.2
1221 0.16
1222 0.17
1223 0.13
1224 0.11
1225 0.12
1226 0.1
1227 0.09
1228 0.1
1229 0.1
1230 0.11
1231 0.16
1232 0.17
1233 0.19
1234 0.27
1235 0.32
1236 0.39
1237 0.43
1238 0.44
1239 0.42
1240 0.46
1241 0.5
1242 0.5
1243 0.49
1244 0.45
1245 0.43
1246 0.45
1247 0.48
1248 0.42
1249 0.34
1250 0.29
1251 0.28
1252 0.25
1253 0.23
1254 0.2
1255 0.19
1256 0.24
1257 0.27
1258 0.27
1259 0.27
1260 0.32
1261 0.39
1262 0.41
1263 0.41
1264 0.39
1265 0.36
1266 0.38
1267 0.35
1268 0.32