Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TRU1

Protein Details
Accession A0A1V8TRU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-68TASSIVQSKPPPRPKKPNYQHIHRFPLPLHydrophilic
166-185DATRRRRDERKAFKLERAREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-184RRRRDERKAFKLERAR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039924  ICln/Lot5/Saf5  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR036167  tRNA_intron_Endo_cat-like_sf  
IPR006677  tRNA_intron_Endonuc_cat-like  
IPR006676  tRNA_splic  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000213  F:tRNA-intron endonuclease activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01974  tRNA_int_endo  
PF03517  Voldacs  
CDD cd22363  tRNA-intron_lyase_C  
Amino Acid Sequences MGETKVIAPEANGEVGHATDLNGYAIGSGPHQSSQTNEHTASSIVQSKPPPRPKKPNYQHIHRFPLPLQTYPLPIFHPTNPLSLLQLAYTYLSHLLSPPFSHPPRLYKATFHHESRSCHVTDPESIKALWEMGFFGKGTLSRSELTWEVRERAKRASGIGFTAAEDATRRRRDERKAFKLERAREGAEKVALQRERERESEQVEGEAGLDEAEEVEAHDELPKHDARAEDKSRVDDRVDSAEPEAWTKTGSAAGDGERTPLLASINGEAKSKSLALPPKPDSLEDNVINEAAFANEEHLQLTLEEGFFLAYGLGVLDIALPPEFKPREEASPLLGPAATFSHLLHTFAAHSAFPIQPSDQSLSPANPFFLHYATYHHFRSLGWVVRPGTKFSCDYLLYNRGPVFSHAEFAVIIIPAFEDEYWRTPDGIALRGDQKERDWWWLHCINRVQSQVKKTLVLCYVEVPAPMEEGRDRCLDSISSPPAGEDFTALSAHQEQTPTTFFASKPVLHFHTLQPASLHVRSEDLSAQPDFKSLAGDNATQDGDNTTIPNIDVWVTSTSLLLYSTSTSAGLSLPYPHITVHALSGSSVLLELSLSDPNTASDDEDFQHLTLHITPASSTSPDQSAEALYRAIGDCQELNPDPDDEDEAGMPGEGGWITSENMGSFVGEDGEFRAPEGVTVYGDDEEDEEEGASGGALGPGAGRTRGVDEVDGDDDGGAGEGSKWIRTADEDQPTSEHRTNGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.14
4 0.1
5 0.09
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.17
21 0.23
22 0.28
23 0.31
24 0.31
25 0.3
26 0.3
27 0.3
28 0.29
29 0.27
30 0.28
31 0.24
32 0.28
33 0.34
34 0.4
35 0.5
36 0.59
37 0.65
38 0.68
39 0.78
40 0.82
41 0.87
42 0.89
43 0.9
44 0.89
45 0.89
46 0.9
47 0.87
48 0.88
49 0.8
50 0.75
51 0.66
52 0.66
53 0.58
54 0.5
55 0.46
56 0.39
57 0.4
58 0.37
59 0.37
60 0.29
61 0.3
62 0.31
63 0.28
64 0.34
65 0.3
66 0.31
67 0.32
68 0.3
69 0.28
70 0.25
71 0.23
72 0.16
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.18
86 0.26
87 0.27
88 0.34
89 0.36
90 0.41
91 0.47
92 0.52
93 0.49
94 0.47
95 0.52
96 0.55
97 0.58
98 0.54
99 0.55
100 0.55
101 0.57
102 0.56
103 0.54
104 0.46
105 0.42
106 0.41
107 0.35
108 0.36
109 0.36
110 0.34
111 0.31
112 0.29
113 0.27
114 0.25
115 0.24
116 0.17
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.19
131 0.2
132 0.22
133 0.25
134 0.26
135 0.27
136 0.33
137 0.37
138 0.36
139 0.39
140 0.4
141 0.36
142 0.36
143 0.38
144 0.33
145 0.3
146 0.3
147 0.25
148 0.21
149 0.21
150 0.17
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.21
155 0.25
156 0.28
157 0.34
158 0.42
159 0.52
160 0.61
161 0.68
162 0.7
163 0.76
164 0.77
165 0.79
166 0.81
167 0.76
168 0.73
169 0.67
170 0.59
171 0.51
172 0.49
173 0.43
174 0.35
175 0.3
176 0.25
177 0.28
178 0.27
179 0.27
180 0.31
181 0.34
182 0.36
183 0.38
184 0.39
185 0.35
186 0.35
187 0.37
188 0.31
189 0.26
190 0.22
191 0.19
192 0.16
193 0.13
194 0.1
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.17
213 0.19
214 0.28
215 0.32
216 0.34
217 0.35
218 0.39
219 0.39
220 0.39
221 0.36
222 0.29
223 0.27
224 0.27
225 0.26
226 0.22
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.2
231 0.18
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.14
261 0.2
262 0.22
263 0.3
264 0.32
265 0.36
266 0.36
267 0.36
268 0.33
269 0.32
270 0.34
271 0.27
272 0.25
273 0.21
274 0.2
275 0.19
276 0.16
277 0.11
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.04
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.16
313 0.18
314 0.21
315 0.23
316 0.24
317 0.21
318 0.22
319 0.22
320 0.18
321 0.16
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.08
326 0.06
327 0.06
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.1
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.12
360 0.14
361 0.18
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.19
367 0.2
368 0.21
369 0.18
370 0.22
371 0.23
372 0.28
373 0.29
374 0.27
375 0.24
376 0.22
377 0.22
378 0.19
379 0.22
380 0.17
381 0.18
382 0.2
383 0.24
384 0.22
385 0.24
386 0.23
387 0.2
388 0.19
389 0.2
390 0.21
391 0.15
392 0.16
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.11
398 0.06
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.08
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.14
413 0.14
414 0.16
415 0.15
416 0.14
417 0.17
418 0.19
419 0.2
420 0.18
421 0.18
422 0.2
423 0.2
424 0.25
425 0.24
426 0.23
427 0.29
428 0.33
429 0.33
430 0.34
431 0.37
432 0.34
433 0.37
434 0.41
435 0.39
436 0.38
437 0.41
438 0.41
439 0.38
440 0.38
441 0.33
442 0.33
443 0.31
444 0.28
445 0.25
446 0.2
447 0.21
448 0.19
449 0.18
450 0.14
451 0.11
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.13
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.15
471 0.13
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.12
484 0.14
485 0.14
486 0.13
487 0.14
488 0.13
489 0.17
490 0.2
491 0.2
492 0.2
493 0.23
494 0.25
495 0.25
496 0.28
497 0.24
498 0.31
499 0.3
500 0.28
501 0.24
502 0.24
503 0.27
504 0.26
505 0.25
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.18
510 0.17
511 0.13
512 0.15
513 0.15
514 0.16
515 0.15
516 0.15
517 0.14
518 0.12
519 0.13
520 0.1
521 0.14
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.16
526 0.17
527 0.14
528 0.14
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.09
560 0.1
561 0.11
562 0.12
563 0.11
564 0.13
565 0.14
566 0.13
567 0.13
568 0.12
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.08
574 0.07
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.12
586 0.11
587 0.11
588 0.1
589 0.12
590 0.13
591 0.15
592 0.15
593 0.13
594 0.14
595 0.13
596 0.14
597 0.13
598 0.14
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.14
604 0.14
605 0.14
606 0.14
607 0.16
608 0.16
609 0.17
610 0.16
611 0.16
612 0.15
613 0.15
614 0.13
615 0.11
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.1
620 0.11
621 0.11
622 0.11
623 0.17
624 0.16
625 0.18
626 0.19
627 0.19
628 0.18
629 0.18
630 0.2
631 0.15
632 0.15
633 0.14
634 0.12
635 0.12
636 0.1
637 0.09
638 0.06
639 0.06
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.09
647 0.08
648 0.09
649 0.09
650 0.09
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.1
657 0.12
658 0.12
659 0.12
660 0.13
661 0.12
662 0.12
663 0.14
664 0.12
665 0.1
666 0.11
667 0.12
668 0.11
669 0.11
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.09
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.05
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.06
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.1
691 0.13
692 0.16
693 0.17
694 0.17
695 0.17
696 0.2
697 0.21
698 0.2
699 0.17
700 0.14
701 0.12
702 0.11
703 0.1
704 0.06
705 0.04
706 0.05
707 0.08
708 0.09
709 0.1
710 0.11
711 0.11
712 0.13
713 0.17
714 0.23
715 0.28
716 0.37
717 0.38
718 0.38
719 0.41
720 0.44
721 0.47
722 0.45