Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SCD3

Protein Details
Accession A0A1V8SCD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-67DDAPVESKRAAKRRKNPKKPKDVQDDSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-37KRKRE
41-59APVESKRAAKRRKNPKKPK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MMSDSDDALTGVPLIESVSDAESSTPGTPAGLKRKRENDDAPVESKRAAKRRKNPKKPKDVQDDSLDVEKGVNLALAHMDSRLMADHMAQRTKRFRPDVSLVEAEDLMIPERAILDTTAFTTTRTTDQLPPYLEKFAGWRRSKKGQKLVNAPEPNGAPHTIVVAGAGLRAADLTRQLRKYQTKESMVAKLFAKHIKLSEAVAATRGSRMGIGIGTPQRIIDLLDEGALKSDYVERILIDASHIDQKKRGLLDMKETQVPLVDLLTRPEFRERYGVNDAKVELLFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.06
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.09
14 0.09
15 0.13
16 0.19
17 0.3
18 0.35
19 0.41
20 0.49
21 0.59
22 0.64
23 0.68
24 0.67
25 0.65
26 0.66
27 0.65
28 0.6
29 0.54
30 0.49
31 0.43
32 0.43
33 0.42
34 0.43
35 0.49
36 0.54
37 0.62
38 0.72
39 0.82
40 0.87
41 0.91
42 0.92
43 0.94
44 0.93
45 0.94
46 0.93
47 0.88
48 0.82
49 0.77
50 0.69
51 0.6
52 0.53
53 0.42
54 0.31
55 0.24
56 0.19
57 0.13
58 0.1
59 0.08
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.07
73 0.12
74 0.16
75 0.21
76 0.22
77 0.27
78 0.33
79 0.38
80 0.44
81 0.43
82 0.41
83 0.43
84 0.48
85 0.46
86 0.45
87 0.42
88 0.34
89 0.31
90 0.29
91 0.22
92 0.16
93 0.12
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.14
113 0.17
114 0.19
115 0.23
116 0.24
117 0.25
118 0.24
119 0.24
120 0.21
121 0.16
122 0.18
123 0.2
124 0.28
125 0.3
126 0.33
127 0.37
128 0.47
129 0.54
130 0.58
131 0.6
132 0.57
133 0.6
134 0.64
135 0.66
136 0.66
137 0.61
138 0.54
139 0.47
140 0.41
141 0.34
142 0.27
143 0.2
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.07
160 0.1
161 0.15
162 0.17
163 0.19
164 0.27
165 0.34
166 0.39
167 0.44
168 0.49
169 0.47
170 0.5
171 0.52
172 0.52
173 0.46
174 0.44
175 0.36
176 0.3
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.21
181 0.21
182 0.2
183 0.2
184 0.18
185 0.18
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.18
229 0.2
230 0.2
231 0.23
232 0.26
233 0.3
234 0.31
235 0.33
236 0.32
237 0.33
238 0.41
239 0.45
240 0.46
241 0.45
242 0.43
243 0.39
244 0.33
245 0.31
246 0.22
247 0.16
248 0.15
249 0.12
250 0.17
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.31
255 0.3
256 0.3
257 0.38
258 0.35
259 0.37
260 0.46
261 0.48
262 0.42
263 0.44
264 0.42
265 0.36