Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TGA4

Protein Details
Accession A0A1V8TGA4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-202RELRKVAKPVRRRALKHRSIMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-198RKVAKPVRRRALKH
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10, cyto 6.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR025721  Exosome_cplx_N_dom  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14382  ECR1_N  
PF10447  EXOSC1  
Amino Acid Sequences MSSPTIVLPGQPLGPSATNIPGAGSHIHAGHIYSSLAGPLSKSSTSKATSQATLTVSRPSGILIPETGTTVLGRITRTNPRQANLSILALGPSGEHTCRDSFPAIIRQQDIRATEIDKVKVAESFRVGDVVRATVISLGDERSYFCSTAKNELGVVMAVSESGNQMVPVSWREFLDEKTEARELRKVAKPVRRRALKHRSIMAVPFGLEDVKFRVITLADSPVEDAKRTETAWSKMSASDATSIIDAFLDSRSASMRQERNTLERILDRHMSTVIKRWSGKNKKQRCAVLEKSWDGDMHSTNRASWIDSSVNNARVLLHRDAWLWPEINKEGLCNKQDLLTFLEARARHDPLVFTTMDVNSMDLIGSDVDSHMPTSIDNHFVVFRLLLLEVQERNMRFLVGCVMGILHDIKGNALMDSALEVYTLDVSTHNAEQESLARIVAQVPYQAPKGMDLARLRSLLSARYDATTDHICSLREDPAYYEESIQESASYRWEVIPGQDGVFPARESSDHALWNAAINDDVVGSCIALEQWVELKQQVNALQVLRKQCSGDESSQAYVQSLLRFRHFVLEVAAKLIVDIERLLGVSAPFHDFVRMNSDRTRPQSRVGRPLDKAREFLDLSCTAISEWGRVTLQHGRPGVIDELQLAIDTDSRLGAPIAPGVAVKLAGLGAMTECIRVLQLNQPLSSSYIQRHEQIAASMKADFAAFEKRCLSVKVTVALGLKDIGYGGHPEGRRLYYPIEQRRTQANVDALRAAEAVLDLVWSEFDSKIGPFSEKLAGMATGRLLSKPRSLYRTAPRVERLQASTRVSPPVYKLGDSITFGVTPLNTADGTSDYSAAVPKTKPKTKGIPNPALQPAEVDSSDSDGDVVPKVFRLNARALKVFNTMFFVVGADRTPGEVSWREILYGMAAMGFSSEKLRGSEWRFAHPERRPIIVHDPHPKSNIPYERLRRVGRRMNRVYGWEAGMFELA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.19
4 0.2
5 0.19
6 0.19
7 0.19
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.19
31 0.25
32 0.28
33 0.31
34 0.35
35 0.36
36 0.36
37 0.36
38 0.38
39 0.35
40 0.36
41 0.34
42 0.32
43 0.28
44 0.26
45 0.24
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.19
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.17
54 0.16
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.21
63 0.31
64 0.37
65 0.46
66 0.48
67 0.48
68 0.52
69 0.5
70 0.51
71 0.44
72 0.4
73 0.31
74 0.26
75 0.24
76 0.19
77 0.17
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.22
87 0.21
88 0.21
89 0.25
90 0.33
91 0.34
92 0.36
93 0.37
94 0.36
95 0.37
96 0.4
97 0.36
98 0.29
99 0.28
100 0.25
101 0.29
102 0.32
103 0.3
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.27
108 0.27
109 0.24
110 0.22
111 0.23
112 0.21
113 0.23
114 0.22
115 0.21
116 0.21
117 0.18
118 0.15
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.15
130 0.18
131 0.17
132 0.17
133 0.22
134 0.23
135 0.31
136 0.32
137 0.28
138 0.26
139 0.25
140 0.26
141 0.19
142 0.17
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.12
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.19
160 0.2
161 0.2
162 0.25
163 0.24
164 0.23
165 0.25
166 0.29
167 0.27
168 0.28
169 0.32
170 0.28
171 0.34
172 0.4
173 0.43
174 0.48
175 0.56
176 0.62
177 0.67
178 0.75
179 0.76
180 0.75
181 0.79
182 0.82
183 0.81
184 0.79
185 0.75
186 0.69
187 0.62
188 0.59
189 0.51
190 0.41
191 0.32
192 0.25
193 0.19
194 0.15
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.16
215 0.16
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.27
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.22
225 0.18
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.19
243 0.24
244 0.26
245 0.32
246 0.35
247 0.38
248 0.4
249 0.39
250 0.33
251 0.31
252 0.31
253 0.29
254 0.3
255 0.26
256 0.24
257 0.25
258 0.24
259 0.22
260 0.28
261 0.28
262 0.29
263 0.31
264 0.36
265 0.45
266 0.54
267 0.63
268 0.65
269 0.72
270 0.74
271 0.79
272 0.8
273 0.74
274 0.73
275 0.7
276 0.68
277 0.64
278 0.58
279 0.52
280 0.46
281 0.41
282 0.32
283 0.27
284 0.21
285 0.18
286 0.2
287 0.18
288 0.17
289 0.21
290 0.2
291 0.19
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.24
300 0.23
301 0.21
302 0.21
303 0.26
304 0.23
305 0.2
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.21
311 0.16
312 0.15
313 0.17
314 0.16
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.18
319 0.23
320 0.23
321 0.21
322 0.2
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.2
328 0.19
329 0.18
330 0.22
331 0.19
332 0.22
333 0.24
334 0.22
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.17
339 0.2
340 0.17
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.08
363 0.09
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.09
371 0.08
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.13
380 0.12
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.09
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.12
438 0.12
439 0.16
440 0.15
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.18
445 0.17
446 0.17
447 0.14
448 0.15
449 0.14
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.11
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.15
462 0.15
463 0.14
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.16
468 0.15
469 0.14
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.1
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.1
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.12
497 0.13
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.11
504 0.08
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.04
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.09
525 0.11
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.14
530 0.15
531 0.17
532 0.2
533 0.19
534 0.19
535 0.17
536 0.16
537 0.19
538 0.2
539 0.19
540 0.19
541 0.2
542 0.2
543 0.21
544 0.2
545 0.17
546 0.15
547 0.14
548 0.13
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.17
554 0.2
555 0.19
556 0.17
557 0.16
558 0.18
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.07
566 0.05
567 0.05
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.05
572 0.05
573 0.04
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.08
578 0.08
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.18
583 0.19
584 0.2
585 0.23
586 0.27
587 0.3
588 0.36
589 0.41
590 0.34
591 0.4
592 0.47
593 0.48
594 0.54
595 0.56
596 0.56
597 0.54
598 0.61
599 0.62
600 0.54
601 0.51
602 0.43
603 0.41
604 0.35
605 0.32
606 0.28
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.16
611 0.11
612 0.13
613 0.13
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.13
620 0.19
621 0.22
622 0.27
623 0.27
624 0.26
625 0.26
626 0.29
627 0.26
628 0.18
629 0.15
630 0.1
631 0.1
632 0.09
633 0.09
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.05
650 0.06
651 0.05
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.04
660 0.05
661 0.04
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.07
667 0.12
668 0.17
669 0.2
670 0.2
671 0.2
672 0.21
673 0.23
674 0.23
675 0.2
676 0.17
677 0.21
678 0.23
679 0.24
680 0.25
681 0.24
682 0.23
683 0.24
684 0.26
685 0.21
686 0.2
687 0.18
688 0.17
689 0.15
690 0.15
691 0.12
692 0.08
693 0.16
694 0.16
695 0.18
696 0.19
697 0.2
698 0.22
699 0.24
700 0.25
701 0.21
702 0.24
703 0.24
704 0.23
705 0.25
706 0.25
707 0.23
708 0.2
709 0.15
710 0.12
711 0.1
712 0.09
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.08
717 0.13
718 0.13
719 0.15
720 0.18
721 0.2
722 0.21
723 0.22
724 0.24
725 0.26
726 0.35
727 0.43
728 0.47
729 0.47
730 0.48
731 0.52
732 0.52
733 0.47
734 0.42
735 0.39
736 0.35
737 0.35
738 0.34
739 0.27
740 0.24
741 0.23
742 0.17
743 0.11
744 0.08
745 0.06
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.06
753 0.06
754 0.06
755 0.07
756 0.08
757 0.1
758 0.11
759 0.13
760 0.12
761 0.15
762 0.18
763 0.17
764 0.18
765 0.16
766 0.16
767 0.15
768 0.15
769 0.13
770 0.11
771 0.11
772 0.12
773 0.14
774 0.16
775 0.21
776 0.27
777 0.32
778 0.35
779 0.38
780 0.45
781 0.52
782 0.59
783 0.58
784 0.57
785 0.56
786 0.56
787 0.56
788 0.53
789 0.49
790 0.46
791 0.48
792 0.47
793 0.48
794 0.45
795 0.46
796 0.41
797 0.38
798 0.35
799 0.36
800 0.33
801 0.29
802 0.27
803 0.26
804 0.28
805 0.28
806 0.26
807 0.19
808 0.17
809 0.17
810 0.17
811 0.13
812 0.11
813 0.1
814 0.1
815 0.08
816 0.08
817 0.09
818 0.1
819 0.12
820 0.12
821 0.12
822 0.11
823 0.11
824 0.13
825 0.13
826 0.16
827 0.15
828 0.23
829 0.33
830 0.4
831 0.45
832 0.5
833 0.59
834 0.66
835 0.75
836 0.77
837 0.77
838 0.73
839 0.75
840 0.74
841 0.65
842 0.55
843 0.45
844 0.37
845 0.31
846 0.27
847 0.21
848 0.15
849 0.16
850 0.17
851 0.15
852 0.13
853 0.1
854 0.11
855 0.11
856 0.12
857 0.1
858 0.11
859 0.12
860 0.15
861 0.17
862 0.21
863 0.28
864 0.34
865 0.39
866 0.41
867 0.41
868 0.41
869 0.44
870 0.41
871 0.33
872 0.31
873 0.26
874 0.23
875 0.21
876 0.19
877 0.14
878 0.14
879 0.14
880 0.1
881 0.1
882 0.11
883 0.11
884 0.11
885 0.15
886 0.17
887 0.2
888 0.23
889 0.23
890 0.22
891 0.22
892 0.22
893 0.18
894 0.16
895 0.12
896 0.07
897 0.07
898 0.06
899 0.07
900 0.07
901 0.06
902 0.08
903 0.1
904 0.11
905 0.12
906 0.15
907 0.22
908 0.28
909 0.36
910 0.36
911 0.44
912 0.48
913 0.51
914 0.59
915 0.58
916 0.62
917 0.56
918 0.59
919 0.52
920 0.52
921 0.58
922 0.56
923 0.57
924 0.59
925 0.62
926 0.62
927 0.64
928 0.6
929 0.55
930 0.57
931 0.57
932 0.52
933 0.55
934 0.6
935 0.65
936 0.71
937 0.74
938 0.72
939 0.73
940 0.78
941 0.77
942 0.79
943 0.78
944 0.78
945 0.75
946 0.72
947 0.66
948 0.6
949 0.53
950 0.44
951 0.36