Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TKA1

Protein Details
Accession A0A1V8TKA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-142SANNREHQPDRPKHKRRRTNPKSAKKQPNHEVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-135DRPKHKRRRTNPKSAKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MPGNPNSIRPNRMAIETRVHNLWNNLIESASHATGSLLIWDTGEYEVLPSRKVRRQAATDDEDSDCSESDSDSRGASEKLSASFRARHIRLRLHGTRLPSQYTVNLRLPSANNREHQPDRPKHKRRRTNPKSAKKQPNHEVETDSEDSTTGKLNPMQAEDTYESKQANQAAVASDLENDTDPETIRATNAYPGATNTIGSVHQRHWFLTLDRPNSGLRRSTSGLDKGRWIGDWEPFHVLGRDLERSVITGRLAGDIMNDEGVEGFVGRQGWRGIVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.44
4 0.45
5 0.41
6 0.4
7 0.37
8 0.34
9 0.34
10 0.29
11 0.27
12 0.24
13 0.22
14 0.2
15 0.21
16 0.22
17 0.18
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.07
32 0.07
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.17
37 0.23
38 0.29
39 0.36
40 0.42
41 0.45
42 0.5
43 0.55
44 0.59
45 0.58
46 0.54
47 0.5
48 0.45
49 0.38
50 0.34
51 0.27
52 0.19
53 0.14
54 0.12
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.14
67 0.16
68 0.17
69 0.18
70 0.22
71 0.27
72 0.33
73 0.34
74 0.38
75 0.41
76 0.46
77 0.48
78 0.52
79 0.51
80 0.49
81 0.5
82 0.48
83 0.49
84 0.45
85 0.43
86 0.35
87 0.32
88 0.3
89 0.32
90 0.33
91 0.3
92 0.28
93 0.26
94 0.27
95 0.28
96 0.3
97 0.32
98 0.31
99 0.29
100 0.31
101 0.37
102 0.37
103 0.43
104 0.46
105 0.48
106 0.54
107 0.63
108 0.71
109 0.75
110 0.83
111 0.86
112 0.86
113 0.9
114 0.88
115 0.89
116 0.9
117 0.9
118 0.9
119 0.9
120 0.91
121 0.85
122 0.85
123 0.82
124 0.8
125 0.72
126 0.62
127 0.54
128 0.44
129 0.43
130 0.36
131 0.28
132 0.19
133 0.16
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.08
138 0.07
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.12
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.17
153 0.16
154 0.14
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.19
190 0.2
191 0.2
192 0.21
193 0.22
194 0.22
195 0.29
196 0.34
197 0.33
198 0.32
199 0.34
200 0.35
201 0.35
202 0.36
203 0.32
204 0.26
205 0.29
206 0.31
207 0.32
208 0.35
209 0.4
210 0.42
211 0.39
212 0.4
213 0.37
214 0.36
215 0.33
216 0.31
217 0.26
218 0.28
219 0.29
220 0.28
221 0.29
222 0.29
223 0.29
224 0.26
225 0.25
226 0.21
227 0.22
228 0.22
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.12
256 0.13