Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TUD9

Protein Details
Accession A0A1V8TUD9    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-163PIQLALPIKKPRKKTEPKSGTGVRPAATKKSRKPKTKSESIILHydrophilic
226-249EEMATTAKPKRKRTVAKKEDDGELHydrophilic
295-314KDVPKARKPRAKKVALPTSDHydrophilic
511-545PPPARKRKSNTDKVDKPAKKPKSPRKKPQTITALAHydrophilic
980-1003GVATAVKKPRGRPRKDKPLSDGATHydrophilic
1071-1094ESPATPSSRRRRRATSSPPTIRPLHydrophilic
1175-1206LSAKGARISVRRPKPKVKGKKKGDEKMAGTERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-157IKKPRKKTEPKSGTGVRPAATKKSRKPKTK
233-243KPKRKRTVAKK
299-307KARKPRAKK
497-538KRRKIELEDSVKMPPPPARKRKSNTDKVDKPAKKPKSPRKKP
593-607KIKKPRKSRAKVPNG
614-627GGKVSKVKAKAKVK
986-1015KKPRGRPRKDKPLSDGATEPMKRARGRPRK
1179-1198GARISVRRPKPKVKGKKKGD
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MGFTTARSLHTLFATVGDAEEDETAVAREQAATDRGKLVRPRKTSRTLGEFAKGPVSPRLAAFAHAEAQSTGTRSPHGPSALRKSTTPSVDAASPGRSRRPSISLSEFSFNGNAAPAVVSPIQLALPIKKPRKKTEPKSGTGVRPAATKKSRKPKTKSESIILNSDESDEALTAEIGDSVATVPEFEEISAEHVRNNEEPPRRTDPAIANFAFHTSALPNPMAPAEEMATTAKPKRKRTVAKKEDDGELVAKRAKVARTKSSTTDPSVGITAGSSALAELSINTIVPPAMQGSEKDVPKARKPRAKKVALPTSDLVTAGDAPELLSKQANTCKPRVRQTTEQSTYFASIAPAMASVAGAAQPQPEPIADITPEEEMNIFSQVNPELDQTLHEKPFADFLGTIESVPGEPATKDLAGEHNPSELAPTRRRSWTPTHEHQLLHNATGDISREVDADSDVDDIPERVSMAQLLQSFTYAAADGQSMPQDKRAGSVEAQPKRRKIELEDSVKMPPPPARKRKSNTDKVDKPAKKPKSPRKKPQTITALATAAYLPVIVPEIAQPTVSSYFDTVKPNSDDFRDPEKPDKGEATEVVAKIKKPRKSRAKVPNGDGTLINGGKVSKVKAKAKVKFKEVDYRPPLCTPGKANAAMMTQDFLFGTSSQLAVEESPTFIREMQLAIRQSEVHSPQRPGRRSKSEGYGTQIVTQMPGANSPTAKSYSRVPTAPHGTDLSILQAERELWCSGSRDYSEGMLEKERAFEARALLDEEPLNVTKTESEALQPLVRATIADLNAPLRTGLPLKTAEVPACIIEAVAPQQMDLLTAPGAVLDPVEHAADKPASGELQSGEPTQLADSVMIDLSYTSPIAEDSAIELPGLSKQDAAMTGMRQPLTNCDQDDDGWALLRSDISLSSEILPDIPAPPLLRHSESFSHKSHSPTTHVPIPGPPRTALRSLDANASMKVMEALPKATTLSTPRSHTSATAGVATAVKKPRGRPRKDKPLSDGATEPMKRARGRPRKDLTATNAPATSEAQLKSAAIPAFLASPPALRKQHSHPFTLSQPAEWANIDEISDLESPATPSSRRRRRATSSPPTIRPLDFSPPISPSTKAPAHAPPTSLSNAALKPTDPEWLSQIPILFPRITATITSSPPSTDLKHPSWHEKILLYDPIVLEDLTADLSAKGARISVRRPKPKVKGKKKGDEKMAGTEREWEVVEEELKGWMVQKWCEEFSICCLWREGLRGGVKGNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.15
3 0.14
4 0.12
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.08
16 0.09
17 0.13
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.26
22 0.27
23 0.33
24 0.41
25 0.47
26 0.52
27 0.59
28 0.66
29 0.68
30 0.76
31 0.77
32 0.77
33 0.77
34 0.72
35 0.67
36 0.63
37 0.57
38 0.5
39 0.47
40 0.39
41 0.33
42 0.33
43 0.32
44 0.29
45 0.26
46 0.3
47 0.25
48 0.26
49 0.27
50 0.23
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.18
55 0.2
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.17
61 0.18
62 0.21
63 0.24
64 0.28
65 0.31
66 0.37
67 0.46
68 0.52
69 0.52
70 0.5
71 0.51
72 0.54
73 0.52
74 0.46
75 0.38
76 0.33
77 0.32
78 0.34
79 0.3
80 0.28
81 0.29
82 0.3
83 0.36
84 0.36
85 0.39
86 0.41
87 0.44
88 0.43
89 0.46
90 0.51
91 0.49
92 0.49
93 0.49
94 0.44
95 0.4
96 0.37
97 0.29
98 0.21
99 0.16
100 0.12
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.22
114 0.32
115 0.41
116 0.47
117 0.55
118 0.63
119 0.73
120 0.8
121 0.82
122 0.84
123 0.84
124 0.82
125 0.84
126 0.81
127 0.76
128 0.73
129 0.66
130 0.56
131 0.52
132 0.5
133 0.51
134 0.52
135 0.55
136 0.57
137 0.65
138 0.74
139 0.77
140 0.82
141 0.84
142 0.85
143 0.86
144 0.83
145 0.79
146 0.78
147 0.71
148 0.69
149 0.59
150 0.5
151 0.4
152 0.34
153 0.28
154 0.19
155 0.16
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.11
177 0.14
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.25
184 0.29
185 0.34
186 0.37
187 0.43
188 0.49
189 0.5
190 0.49
191 0.51
192 0.51
193 0.5
194 0.54
195 0.47
196 0.4
197 0.37
198 0.37
199 0.31
200 0.23
201 0.17
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.15
218 0.21
219 0.26
220 0.32
221 0.4
222 0.48
223 0.57
224 0.67
225 0.75
226 0.8
227 0.84
228 0.85
229 0.86
230 0.8
231 0.73
232 0.64
233 0.54
234 0.46
235 0.37
236 0.3
237 0.25
238 0.22
239 0.2
240 0.23
241 0.26
242 0.3
243 0.35
244 0.42
245 0.47
246 0.5
247 0.53
248 0.56
249 0.56
250 0.53
251 0.5
252 0.4
253 0.35
254 0.32
255 0.27
256 0.2
257 0.15
258 0.11
259 0.08
260 0.07
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.03
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.15
280 0.21
281 0.22
282 0.25
283 0.3
284 0.34
285 0.43
286 0.52
287 0.55
288 0.57
289 0.65
290 0.73
291 0.77
292 0.8
293 0.79
294 0.79
295 0.8
296 0.73
297 0.7
298 0.6
299 0.52
300 0.45
301 0.37
302 0.26
303 0.17
304 0.15
305 0.1
306 0.09
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.12
315 0.2
316 0.26
317 0.29
318 0.35
319 0.43
320 0.48
321 0.57
322 0.63
323 0.63
324 0.66
325 0.7
326 0.75
327 0.71
328 0.66
329 0.58
330 0.51
331 0.44
332 0.35
333 0.27
334 0.16
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.07
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.14
376 0.18
377 0.18
378 0.18
379 0.18
380 0.17
381 0.2
382 0.19
383 0.16
384 0.11
385 0.11
386 0.15
387 0.14
388 0.14
389 0.11
390 0.11
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.12
402 0.14
403 0.17
404 0.16
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.16
409 0.17
410 0.2
411 0.23
412 0.27
413 0.3
414 0.35
415 0.37
416 0.4
417 0.44
418 0.48
419 0.51
420 0.55
421 0.58
422 0.57
423 0.57
424 0.53
425 0.53
426 0.44
427 0.36
428 0.29
429 0.22
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.08
469 0.1
470 0.1
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.17
476 0.17
477 0.16
478 0.24
479 0.3
480 0.35
481 0.43
482 0.45
483 0.47
484 0.49
485 0.5
486 0.45
487 0.42
488 0.45
489 0.46
490 0.49
491 0.48
492 0.45
493 0.45
494 0.45
495 0.39
496 0.3
497 0.26
498 0.28
499 0.35
500 0.43
501 0.48
502 0.55
503 0.61
504 0.71
505 0.77
506 0.78
507 0.77
508 0.78
509 0.77
510 0.75
511 0.8
512 0.73
513 0.7
514 0.7
515 0.68
516 0.66
517 0.7
518 0.75
519 0.75
520 0.82
521 0.85
522 0.86
523 0.89
524 0.84
525 0.83
526 0.81
527 0.73
528 0.65
529 0.56
530 0.45
531 0.35
532 0.32
533 0.22
534 0.13
535 0.09
536 0.06
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.03
541 0.03
542 0.04
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.11
553 0.14
554 0.17
555 0.16
556 0.17
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.21
561 0.2
562 0.2
563 0.28
564 0.29
565 0.29
566 0.34
567 0.37
568 0.35
569 0.34
570 0.32
571 0.25
572 0.22
573 0.21
574 0.18
575 0.18
576 0.17
577 0.18
578 0.18
579 0.17
580 0.24
581 0.31
582 0.33
583 0.37
584 0.47
585 0.55
586 0.61
587 0.71
588 0.73
589 0.78
590 0.78
591 0.75
592 0.72
593 0.62
594 0.56
595 0.45
596 0.35
597 0.27
598 0.21
599 0.17
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.12
606 0.18
607 0.23
608 0.31
609 0.4
610 0.46
611 0.55
612 0.59
613 0.59
614 0.58
615 0.56
616 0.57
617 0.52
618 0.54
619 0.51
620 0.49
621 0.45
622 0.41
623 0.42
624 0.33
625 0.32
626 0.24
627 0.23
628 0.24
629 0.22
630 0.22
631 0.2
632 0.19
633 0.18
634 0.16
635 0.11
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.07
659 0.08
660 0.12
661 0.13
662 0.13
663 0.13
664 0.13
665 0.14
666 0.18
667 0.2
668 0.21
669 0.24
670 0.26
671 0.31
672 0.39
673 0.43
674 0.45
675 0.49
676 0.51
677 0.53
678 0.54
679 0.56
680 0.53
681 0.5
682 0.49
683 0.46
684 0.38
685 0.35
686 0.33
687 0.25
688 0.2
689 0.18
690 0.14
691 0.1
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.13
701 0.18
702 0.22
703 0.25
704 0.26
705 0.26
706 0.29
707 0.34
708 0.34
709 0.3
710 0.25
711 0.22
712 0.22
713 0.2
714 0.15
715 0.1
716 0.09
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.1
725 0.12
726 0.12
727 0.14
728 0.14
729 0.13
730 0.13
731 0.13
732 0.13
733 0.12
734 0.13
735 0.12
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.12
740 0.11
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.1
745 0.11
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.11
753 0.11
754 0.09
755 0.09
756 0.08
757 0.09
758 0.09
759 0.08
760 0.08
761 0.09
762 0.1
763 0.11
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.08
769 0.07
770 0.1
771 0.09
772 0.1
773 0.1
774 0.11
775 0.11
776 0.11
777 0.1
778 0.06
779 0.07
780 0.08
781 0.09
782 0.11
783 0.11
784 0.13
785 0.16
786 0.17
787 0.16
788 0.15
789 0.15
790 0.12
791 0.12
792 0.1
793 0.07
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.07
799 0.06
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.06
805 0.05
806 0.05
807 0.05
808 0.04
809 0.05
810 0.04
811 0.04
812 0.03
813 0.04
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.05
818 0.08
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.08
823 0.08
824 0.08
825 0.09
826 0.07
827 0.09
828 0.1
829 0.1
830 0.1
831 0.09
832 0.09
833 0.09
834 0.09
835 0.07
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.06
845 0.05
846 0.04
847 0.05
848 0.05
849 0.06
850 0.06
851 0.05
852 0.07
853 0.08
854 0.08
855 0.08
856 0.08
857 0.07
858 0.09
859 0.11
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.14
869 0.17
870 0.17
871 0.17
872 0.17
873 0.2
874 0.23
875 0.25
876 0.23
877 0.21
878 0.22
879 0.21
880 0.23
881 0.19
882 0.15
883 0.12
884 0.12
885 0.1
886 0.1
887 0.09
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.08
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.11
896 0.1
897 0.1
898 0.1
899 0.08
900 0.08
901 0.08
902 0.09
903 0.09
904 0.1
905 0.13
906 0.17
907 0.19
908 0.19
909 0.23
910 0.28
911 0.34
912 0.38
913 0.36
914 0.37
915 0.37
916 0.4
917 0.42
918 0.39
919 0.38
920 0.39
921 0.43
922 0.44
923 0.42
924 0.39
925 0.39
926 0.43
927 0.41
928 0.38
929 0.34
930 0.32
931 0.34
932 0.36
933 0.32
934 0.29
935 0.28
936 0.27
937 0.3
938 0.29
939 0.27
940 0.23
941 0.22
942 0.18
943 0.14
944 0.14
945 0.1
946 0.11
947 0.1
948 0.12
949 0.11
950 0.12
951 0.13
952 0.12
953 0.14
954 0.14
955 0.2
956 0.23
957 0.26
958 0.28
959 0.3
960 0.3
961 0.29
962 0.29
963 0.26
964 0.23
965 0.2
966 0.18
967 0.16
968 0.18
969 0.17
970 0.19
971 0.21
972 0.25
973 0.27
974 0.35
975 0.45
976 0.54
977 0.62
978 0.68
979 0.74
980 0.8
981 0.86
982 0.85
983 0.81
984 0.81
985 0.75
986 0.67
987 0.58
988 0.49
989 0.49
990 0.42
991 0.37
992 0.31
993 0.34
994 0.32
995 0.38
996 0.46
997 0.48
998 0.55
999 0.64
1000 0.67
1001 0.71
1002 0.74
1003 0.73
1004 0.7
1005 0.7
1006 0.66
1007 0.58
1008 0.51
1009 0.42
1010 0.38
1011 0.32
1012 0.26
1013 0.2
1014 0.18
1015 0.16
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.15
1019 0.19
1020 0.18
1021 0.13
1022 0.13
1023 0.12
1024 0.14
1025 0.13
1026 0.14
1027 0.09
1028 0.12
1029 0.14
1030 0.22
1031 0.25
1032 0.24
1033 0.29
1034 0.36
1035 0.47
1036 0.47
1037 0.49
1038 0.44
1039 0.46
1040 0.48
1041 0.53
1042 0.45
1043 0.35
1044 0.34
1045 0.31
1046 0.3
1047 0.25
1048 0.23
1049 0.15
1050 0.15
1051 0.15
1052 0.12
1053 0.11
1054 0.12
1055 0.12
1056 0.11
1057 0.1
1058 0.1
1059 0.11
1060 0.12
1061 0.15
1062 0.13
1063 0.22
1064 0.33
1065 0.43
1066 0.51
1067 0.57
1068 0.65
1069 0.71
1070 0.8
1071 0.82
1072 0.82
1073 0.83
1074 0.83
1075 0.81
1076 0.77
1077 0.72
1078 0.61
1079 0.55
1080 0.48
1081 0.45
1082 0.4
1083 0.38
1084 0.36
1085 0.35
1086 0.37
1087 0.35
1088 0.32
1089 0.26
1090 0.31
1091 0.3
1092 0.29
1093 0.31
1094 0.35
1095 0.4
1096 0.41
1097 0.4
1098 0.34
1099 0.35
1100 0.36
1101 0.33
1102 0.26
1103 0.25
1104 0.24
1105 0.25
1106 0.24
1107 0.2
1108 0.21
1109 0.2
1110 0.25
1111 0.21
1112 0.21
1113 0.24
1114 0.25
1115 0.26
1116 0.24
1117 0.24
1118 0.2
1119 0.22
1120 0.24
1121 0.19
1122 0.17
1123 0.18
1124 0.17
1125 0.17
1126 0.16
1127 0.19
1128 0.21
1129 0.23
1130 0.25
1131 0.24
1132 0.23
1133 0.25
1134 0.27
1135 0.26
1136 0.28
1137 0.33
1138 0.35
1139 0.43
1140 0.47
1141 0.54
1142 0.56
1143 0.56
1144 0.51
1145 0.46
1146 0.47
1147 0.44
1148 0.43
1149 0.35
1150 0.33
1151 0.29
1152 0.27
1153 0.26
1154 0.21
1155 0.16
1156 0.11
1157 0.11
1158 0.08
1159 0.08
1160 0.07
1161 0.06
1162 0.07
1163 0.08
1164 0.08
1165 0.08
1166 0.09
1167 0.13
1168 0.18
1169 0.27
1170 0.37
1171 0.47
1172 0.57
1173 0.65
1174 0.74
1175 0.8
1176 0.86
1177 0.89
1178 0.9
1179 0.9
1180 0.9
1181 0.93
1182 0.94
1183 0.93
1184 0.92
1185 0.89
1186 0.82
1187 0.82
1188 0.78
1189 0.7
1190 0.6
1191 0.57
1192 0.48
1193 0.41
1194 0.37
1195 0.27
1196 0.21
1197 0.21
1198 0.22
1199 0.16
1200 0.15
1201 0.14
1202 0.14
1203 0.13
1204 0.13
1205 0.15
1206 0.18
1207 0.2
1208 0.26
1209 0.3
1210 0.31
1211 0.33
1212 0.33
1213 0.3
1214 0.32
1215 0.39
1216 0.34
1217 0.31
1218 0.31
1219 0.31
1220 0.32
1221 0.35
1222 0.32
1223 0.3
1224 0.33
1225 0.33