FuNGI

A0A1V8SKH4

Protein Details

Accession

A0A1V8SKH4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-36	STSSKKPSSARDSQRNTSTK	Hydrophilic
190-215	TLALEEAKPERKRRKRGWDADESTAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
197-205	KPERKRRKR

Subcellular Location(s)

plas 18, cyto 4.5, cyto_nucl 4, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDAAFEAARKGAAERSTSSKKPSSARDSQRNTSTKVSLSENFDTELYGNGGGDKFAGYNTEIAGEMDVDAESGDDEEDGDEGRLVGQYTATAAQIGEWNSGAAGEEDILDSREKQAQIQSRETDYQRKRFARRLSGGAVQTGEAKSYRETMAERDLEREEERVKRAIEEKTKEQIANGEDDMEVDAKPTLALEEAKPERKRRKRGWDADESTAPVEKEETNGVNGHAAEGEAKRKKTRWDTSGGDGAVAYNAEGELINADGESVAAESKAGKKKSRWDTTAEVEVPTTNGVADTAVSKRRSKWDVAGPASGAGGPVGSATPMQPLTAFGGDQSNRNAPLSDEELDELLPSEGYKILDPPPGYEPLRAPKNRLAVPATPLPTGGFMNQEPVDARSMGKQLPSDIPGVGDLQFFKAEDMQYFGKLVDGADENDLSVDELKTRKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARTFGAGPLFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDELVRPYVHRILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPTLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGDNLNDEQTKVRTVTSLALAALAEASNPFGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYSNYYTSQIMEILIREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTSGVTAGYLKDTVLSDFFKFFWVRRMALDRRNYKQVVETTVDLGNKVGVGEIVERIVGNLKDESEAYRKMTVETIEKVISAMGAADINDRLEERLVDGILHAFQEQSVEDIVLLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAVVMKQCGEDALMGKLGTVLYEYLGEEYPEVLGSILGAMRSIVTVVGINQMQPPIRDLLPRITPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLSTLLNNLRVQDRQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKALSFLFEYIGEMGKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTGAAVVKHMALGVVGLGCEDAMLHLLNLLIPNLFETSPHVIDRVIEAIDAVRVAVGTGAVMNYVWAGLFHPARKVRVPYWRLYNDAYVMSADAMVPYYPPLEEEKLRRKELFVML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.25
3	0.32
4	0.4
5	0.43
6	0.48
7	0.49
8	0.52
9	0.55
10	0.62
11	0.62
12	0.64
13	0.71
14	0.75
15	0.77
16	0.79
17	0.82
18	0.77
19	0.72
20	0.68
21	0.61
22	0.54
23	0.49
24	0.47
25	0.43
26	0.46
27	0.45
28	0.4
29	0.38
30	0.35
31	0.32
32	0.26
33	0.23
34	0.17
35	0.13
36	0.12
37	0.12
38	0.12
39	0.11
40	0.11
41	0.09
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.09
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.11
52	0.1
53	0.09
54	0.08
55	0.08
56	0.06
57	0.06
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.04
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.08
75	0.07
76	0.09
77	0.1
78	0.1
79	0.09
80	0.08
81	0.09
82	0.13
83	0.14
84	0.14
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.12
89	0.11
90	0.08
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.07
95	0.08
96	0.09
97	0.09
98	0.1
99	0.12
100	0.18
101	0.18
102	0.2
103	0.27
104	0.35
105	0.4
106	0.46
107	0.47
108	0.47
109	0.53
110	0.55
111	0.57
112	0.57
113	0.6
114	0.63
115	0.67
116	0.69
117	0.71
118	0.77
119	0.77
120	0.74
121	0.71
122	0.67
123	0.65
124	0.6
125	0.53
126	0.44
127	0.34
128	0.32
129	0.25
130	0.22
131	0.16
132	0.16
133	0.15
134	0.17
135	0.18
136	0.17
137	0.18
138	0.2
139	0.27
140	0.31
141	0.3
142	0.31
143	0.32
144	0.33
145	0.32
146	0.32
147	0.29
148	0.3
149	0.32
150	0.34
151	0.33
152	0.33
153	0.38
154	0.43
155	0.47
156	0.49
157	0.52
158	0.54
159	0.58
160	0.54
161	0.49
162	0.45
163	0.38
164	0.35
165	0.29
166	0.23
167	0.18
168	0.18
169	0.19
170	0.14
171	0.12
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.09
180	0.09
181	0.18
182	0.24
183	0.33
184	0.38
185	0.47
186	0.57
187	0.65
188	0.75
189	0.76
190	0.82
191	0.84
192	0.89
193	0.89
194	0.89
195	0.84
196	0.8
197	0.72
198	0.62
199	0.52
200	0.45
201	0.36
202	0.25
203	0.21
204	0.15
205	0.14
206	0.16
207	0.16
208	0.15
209	0.16
210	0.16
211	0.17
212	0.17
213	0.15
214	0.11
215	0.1
216	0.11
217	0.12
218	0.21
219	0.24
220	0.28
221	0.32
222	0.36
223	0.45
224	0.52
225	0.6
226	0.56
227	0.59
228	0.6
229	0.61
230	0.64
231	0.55
232	0.44
233	0.35
234	0.3
235	0.22
236	0.17
237	0.11
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.06
256	0.14
257	0.21
258	0.25
259	0.31
260	0.35
261	0.46
262	0.56
263	0.64
264	0.59
265	0.58
266	0.6
267	0.6
268	0.63
269	0.54
270	0.44
271	0.35
272	0.32
273	0.26
274	0.2
275	0.15
276	0.07
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.07
282	0.1
283	0.16
284	0.19
285	0.21
286	0.25
287	0.33
288	0.36
289	0.38
290	0.42
291	0.45
292	0.51
293	0.52
294	0.5
295	0.43
296	0.39
297	0.36
298	0.29
299	0.19
300	0.1
301	0.06
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.07
312	0.09
313	0.11
314	0.12
315	0.11
316	0.09
317	0.15
318	0.16
319	0.18
320	0.2
321	0.2
322	0.21
323	0.21
324	0.21
325	0.16
326	0.19
327	0.2
328	0.18
329	0.16
330	0.16
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.11
335	0.07
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.12
344	0.16
345	0.16
346	0.18
347	0.19
348	0.24
349	0.25
350	0.25
351	0.26
352	0.29
353	0.39
354	0.37
355	0.39
356	0.39
357	0.45
358	0.46
359	0.46
360	0.43
361	0.36
362	0.39
363	0.4
364	0.37
365	0.3
366	0.27
367	0.24
368	0.21
369	0.19
370	0.15
371	0.12
372	0.1
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.14
377	0.14
378	0.15
379	0.13
380	0.14
381	0.12
382	0.14
383	0.15
384	0.16
385	0.15
386	0.16
387	0.18
388	0.19
389	0.18
390	0.16
391	0.15
392	0.14
393	0.14
394	0.12
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.09
403	0.09
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.13
408	0.12
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.08
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.07
421	0.07
422	0.06
423	0.07
424	0.08
425	0.09
426	0.12
427	0.13
428	0.16
429	0.18
430	0.24
431	0.28
432	0.38
433	0.44
434	0.47
435	0.52
436	0.52
437	0.5
438	0.5
439	0.48
440	0.44
441	0.44
442	0.41
443	0.41
444	0.44
445	0.43
446	0.41
447	0.47
448	0.49
449	0.45
450	0.42
451	0.41
452	0.44
453	0.49
454	0.47
455	0.37
456	0.29
457	0.27
458	0.26
459	0.24
460	0.17
461	0.11
462	0.1
463	0.1
464	0.11
465	0.1
466	0.09
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.08
476	0.1
477	0.11
478	0.12
479	0.12
480	0.15
481	0.17
482	0.18
483	0.15
484	0.14
485	0.14
486	0.18
487	0.19
488	0.17
489	0.18
490	0.17
491	0.18
492	0.17
493	0.17
494	0.13
495	0.13
496	0.14
497	0.13
498	0.15
499	0.16
500	0.16
501	0.16
502	0.18
503	0.18
504	0.16
505	0.15
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.13
510	0.11
511	0.08
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.05
516	0.04
517	0.03
518	0.04
519	0.05
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.09
526	0.1
527	0.12
528	0.12
529	0.13
530	0.13
531	0.13
532	0.13
533	0.11
534	0.09
535	0.07
536	0.07
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.08
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.12
554	0.13
555	0.14
556	0.15
557	0.13
558	0.11
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.1
563	0.1
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.08
568	0.07
569	0.06
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.09
582	0.12
583	0.17
584	0.22
585	0.26
586	0.28
587	0.36
588	0.46
589	0.5
590	0.57
591	0.58
592	0.62
593	0.64
594	0.69
595	0.63
596	0.57
597	0.51
598	0.46
599	0.44
600	0.37
601	0.32
602	0.25
603	0.23
604	0.19
605	0.17
606	0.12
607	0.08
608	0.06
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.04
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.08
624	0.08
625	0.09
626	0.08
627	0.08
628	0.07
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.1
633	0.1
634	0.09
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.08
641	0.08
642	0.08
643	0.07
644	0.06
645	0.05
646	0.04
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.04
655	0.05
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.06
664	0.05
665	0.06
666	0.08
667	0.14
668	0.22
669	0.24
670	0.26
671	0.31
672	0.34
673	0.36
674	0.37
675	0.38
676	0.32
677	0.31
678	0.3
679	0.24
680	0.2
681	0.18
682	0.15
683	0.08
684	0.05
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.05
693	0.08
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.1
698	0.1
699	0.1
700	0.1
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.07
711	0.09
712	0.09
713	0.11
714	0.13
715	0.13
716	0.13
717	0.15
718	0.17
719	0.15
720	0.16
721	0.15
722	0.14
723	0.16
724	0.2
725	0.2
726	0.18
727	0.17
728	0.16
729	0.16
730	0.14
731	0.11
732	0.08
733	0.06
734	0.06
735	0.07
736	0.06
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.08
744	0.1
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.13
749	0.13
750	0.13
751	0.19
752	0.2
753	0.2
754	0.22
755	0.3
756	0.32
757	0.39
758	0.47
759	0.46
760	0.47
761	0.53
762	0.51
763	0.44
764	0.44
765	0.4
766	0.35
767	0.31
768	0.28
769	0.23
770	0.25
771	0.24
772	0.19
773	0.16
774	0.12
775	0.09
776	0.09
777	0.06
778	0.04
779	0.04
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.09
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.1
793	0.13
794	0.14
795	0.16
796	0.16
797	0.19
798	0.19
799	0.19
800	0.21
801	0.2
802	0.19
803	0.2
804	0.2
805	0.17
806	0.17
807	0.16
808	0.14
809	0.12
810	0.08
811	0.06
812	0.04
813	0.04
814	0.04
815	0.05
816	0.05
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.07
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.08
831	0.07
832	0.05
833	0.05
834	0.06
835	0.06
836	0.06
837	0.06
838	0.05
839	0.05
840	0.06
841	0.06
842	0.05
843	0.05
844	0.04
845	0.03
846	0.03
847	0.03
848	0.03
849	0.03
850	0.03
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.08
855	0.09
856	0.12
857	0.13
858	0.13
859	0.14
860	0.2
861	0.3
862	0.29
863	0.31
864	0.31
865	0.33
866	0.33
867	0.33
868	0.29
869	0.22
870	0.22
871	0.21
872	0.22
873	0.25
874	0.27
875	0.27
876	0.3
877	0.33
878	0.37
879	0.41
880	0.4
881	0.34
882	0.33
883	0.33
884	0.29
885	0.27
886	0.2
887	0.15
888	0.12
889	0.12
890	0.1
891	0.1
892	0.09
893	0.08
894	0.1
895	0.1
896	0.11
897	0.11
898	0.11
899	0.11
900	0.1
901	0.11
902	0.09
903	0.1
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.08
909	0.07
910	0.06
911	0.05
912	0.06
913	0.06
914	0.07
915	0.08
916	0.08
917	0.07
918	0.07
919	0.07
920	0.06
921	0.06
922	0.05
923	0.04
924	0.04
925	0.04
926	0.05
927	0.04
928	0.04
929	0.04
930	0.04
931	0.04
932	0.04
933	0.04
934	0.04
935	0.04
936	0.05
937	0.08
938	0.08
939	0.09
940	0.1
941	0.13
942	0.13
943	0.13
944	0.15
945	0.15
946	0.16
947	0.17
948	0.18
949	0.22
950	0.25
951	0.26
952	0.27
953	0.27
954	0.32
955	0.37
956	0.45
957	0.45
958	0.49
959	0.51
960	0.58
961	0.62
962	0.64
963	0.61
964	0.61
965	0.58
966	0.53
967	0.5
968	0.42
969	0.36
970	0.28
971	0.23
972	0.14
973	0.11
974	0.08
975	0.08
976	0.09
977	0.09
978	0.1
979	0.11
980	0.14
981	0.18
982	0.2
983	0.22
984	0.23
985	0.23
986	0.26
987	0.26
988	0.24
989	0.25
990	0.23
991	0.21
992	0.19
993	0.18
994	0.19
995	0.19
996	0.19
997	0.15
998	0.18
999	0.22
1000	0.22
1001	0.24
1002	0.22
1003	0.27
1004	0.33
1005	0.43
1006	0.5
1007	0.51
1008	0.59
1009	0.66
1010	0.72
1011	0.67
1012	0.6
1013	0.51
1014	0.42
1015	0.37
1016	0.28
1017	0.2
1018	0.12
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.12
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.09
1028	0.09
1029	0.1
1030	0.13
1031	0.15
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.18
1035	0.19
1036	0.22
1037	0.29
1038	0.33
1039	0.37
1040	0.41
1041	0.43
1042	0.42
1043	0.41
1044	0.38
1045	0.29
1046	0.25
1047	0.19
1048	0.15
1049	0.11
1050	0.09
1051	0.08
1052	0.07
1053	0.06
1054	0.04
1055	0.04
1056	0.04
1057	0.05
1058	0.05
1059	0.06
1060	0.09
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.16
1065	0.16
1066	0.18
1067	0.18
1068	0.17
1069	0.18
1070	0.18
1071	0.19
1072	0.21
1073	0.23
1074	0.26
1075	0.26
1076	0.25
1077	0.26
1078	0.25
1079	0.24
1080	0.18
1081	0.14
1082	0.11
1083	0.1
1084	0.11
1085	0.08
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.11
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.1
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.08
1099	0.07
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.08
1105	0.08
1106	0.07
1107	0.06
1108	0.07
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.1
1112	0.11
1113	0.14
1114	0.19
1115	0.21
1116	0.23
1117	0.19
1118	0.2
1119	0.21
1120	0.26
1121	0.28
1122	0.24
1123	0.24
1124	0.22
1125	0.22
1126	0.22
1127	0.2
1128	0.14
1129	0.08
1130	0.07
1131	0.06
1132	0.06
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.04
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.03
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.06
1145	0.07
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.07
1149	0.07
1150	0.08
1151	0.1
1152	0.1
1153	0.09
1154	0.13
1155	0.19
1156	0.21
1157	0.22
1158	0.21
1159	0.19
1160	0.2
1161	0.22
1162	0.2
1163	0.14
1164	0.11
1165	0.11
1166	0.11
1167	0.11
1168	0.1
1169	0.08
1170	0.06
1171	0.05
1172	0.05
1173	0.05
1174	0.05
1175	0.04
1176	0.05
1177	0.05
1178	0.05
1179	0.05
1180	0.05
1181	0.05
1182	0.05
1183	0.05
1184	0.04
1185	0.06
1186	0.11
1187	0.15
1188	0.17
1189	0.25
1190	0.3
1191	0.34
1192	0.4
1193	0.46
1194	0.47
1195	0.54
1196	0.58
1197	0.57
1198	0.63
1199	0.63
1200	0.61
1201	0.58
1202	0.55
1203	0.47
1204	0.43
1205	0.36
1206	0.26
1207	0.22
1208	0.18
1209	0.15
1210	0.11
1211	0.09
1212	0.09
1213	0.08
1214	0.07
1215	0.08
1216	0.08
1217	0.08
1218	0.1
1219	0.15
1220	0.19
1221	0.25
1222	0.35
1223	0.44
1224	0.51
1225	0.57
1226	0.57
1227	0.55

A0A1V8SKH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer