Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SWX9

Protein Details
Accession A0A1V8SWX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-55TKLAAPPPKPSPPRPKRAPSSPHEDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-48IFAKAKKATKLAAPPPKPSPPRPKRAP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSDSDSDLSSAPEEEIKKLAPIFAKAKKATKLAAPPPKPSPPRPKRAPSSPHEDTIADSHVIAFIVMFRSRFSSAFTTKLAHIGPQDLETGVAGEAPSREVEGLLCAVLGLVMNRKKPVEYERRKFHGELTLKLRHGHYGRALEEAVLSHKSQWPHRWQGANPLHGGKNFNNMPPEDRLYLIRTLIMWSLNSSELISAIIKDSYKQTRHSDDENQPLSVQPWGRDGDKRRYFLIEGQDDTTFRVYREANRYTKNFQWYNMAGNIDELRVLAEKLEKEDGSQVARTLGQRMLNAIPRFEASVEKRYRREYRQARRAAFTRPEPGFSSYEGRTRGKRMRYTYDDEEDSDATSTRRSNRHSERNTPAATGPQYTSSGRQVRPRQVNGEYGTSGLANEVTSADELGQDGDSEDLGRGVARTTRGATNGYAKRKRVPDDDEDDADLSEEDDLPQSGDEWNSDANAAEDEERVPDDREDEDEMEESDEEEQSLIVKLKIGSPKATKVNGESASVPVAESNGISTKDGGVPAHGSLDLRPYPSPLSMSEPAATKHILQPQQRSGAVVGLSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.2
4 0.22
5 0.21
6 0.25
7 0.23
8 0.28
9 0.34
10 0.39
11 0.47
12 0.49
13 0.56
14 0.57
15 0.58
16 0.55
17 0.55
18 0.57
19 0.59
20 0.64
21 0.62
22 0.62
23 0.65
24 0.72
25 0.72
26 0.72
27 0.73
28 0.72
29 0.78
30 0.82
31 0.85
32 0.84
33 0.87
34 0.87
35 0.82
36 0.81
37 0.75
38 0.69
39 0.61
40 0.52
41 0.44
42 0.38
43 0.34
44 0.25
45 0.2
46 0.17
47 0.15
48 0.14
49 0.12
50 0.08
51 0.07
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.16
57 0.18
58 0.18
59 0.21
60 0.25
61 0.26
62 0.29
63 0.3
64 0.3
65 0.28
66 0.32
67 0.28
68 0.23
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.12
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.11
99 0.15
100 0.17
101 0.2
102 0.21
103 0.21
104 0.25
105 0.34
106 0.39
107 0.46
108 0.54
109 0.62
110 0.67
111 0.7
112 0.67
113 0.61
114 0.59
115 0.52
116 0.49
117 0.47
118 0.48
119 0.45
120 0.47
121 0.44
122 0.41
123 0.38
124 0.36
125 0.34
126 0.33
127 0.33
128 0.33
129 0.32
130 0.25
131 0.24
132 0.2
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.19
139 0.24
140 0.31
141 0.37
142 0.44
143 0.5
144 0.54
145 0.51
146 0.59
147 0.6
148 0.55
149 0.49
150 0.44
151 0.4
152 0.37
153 0.4
154 0.3
155 0.31
156 0.3
157 0.3
158 0.29
159 0.28
160 0.3
161 0.29
162 0.32
163 0.25
164 0.24
165 0.23
166 0.23
167 0.23
168 0.2
169 0.17
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.1
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.13
190 0.19
191 0.22
192 0.26
193 0.31
194 0.36
195 0.4
196 0.43
197 0.47
198 0.47
199 0.53
200 0.5
201 0.45
202 0.39
203 0.36
204 0.32
205 0.26
206 0.21
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.17
211 0.23
212 0.28
213 0.35
214 0.4
215 0.41
216 0.39
217 0.4
218 0.39
219 0.38
220 0.4
221 0.32
222 0.27
223 0.27
224 0.27
225 0.24
226 0.24
227 0.22
228 0.14
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.18
233 0.26
234 0.31
235 0.34
236 0.38
237 0.41
238 0.42
239 0.46
240 0.47
241 0.41
242 0.35
243 0.36
244 0.32
245 0.32
246 0.3
247 0.26
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.11
252 0.1
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.14
277 0.16
278 0.2
279 0.2
280 0.18
281 0.17
282 0.15
283 0.16
284 0.14
285 0.16
286 0.13
287 0.22
288 0.27
289 0.31
290 0.33
291 0.4
292 0.45
293 0.46
294 0.54
295 0.56
296 0.61
297 0.67
298 0.73
299 0.69
300 0.67
301 0.63
302 0.59
303 0.54
304 0.46
305 0.43
306 0.36
307 0.36
308 0.33
309 0.35
310 0.29
311 0.26
312 0.27
313 0.21
314 0.24
315 0.26
316 0.26
317 0.25
318 0.3
319 0.35
320 0.38
321 0.44
322 0.45
323 0.5
324 0.54
325 0.59
326 0.57
327 0.55
328 0.49
329 0.43
330 0.39
331 0.31
332 0.26
333 0.19
334 0.14
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.16
339 0.21
340 0.24
341 0.33
342 0.42
343 0.53
344 0.57
345 0.63
346 0.64
347 0.66
348 0.63
349 0.55
350 0.46
351 0.4
352 0.35
353 0.28
354 0.23
355 0.18
356 0.19
357 0.18
358 0.2
359 0.23
360 0.28
361 0.29
362 0.37
363 0.43
364 0.5
365 0.57
366 0.58
367 0.56
368 0.53
369 0.56
370 0.49
371 0.45
372 0.36
373 0.28
374 0.25
375 0.19
376 0.16
377 0.11
378 0.08
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.14
405 0.16
406 0.17
407 0.19
408 0.2
409 0.27
410 0.33
411 0.41
412 0.45
413 0.45
414 0.51
415 0.55
416 0.59
417 0.57
418 0.56
419 0.54
420 0.54
421 0.57
422 0.52
423 0.47
424 0.41
425 0.34
426 0.28
427 0.2
428 0.13
429 0.09
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.14
457 0.14
458 0.17
459 0.19
460 0.19
461 0.19
462 0.18
463 0.18
464 0.17
465 0.16
466 0.14
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.09
474 0.1
475 0.09
476 0.11
477 0.12
478 0.18
479 0.25
480 0.26
481 0.31
482 0.34
483 0.42
484 0.46
485 0.49
486 0.46
487 0.43
488 0.49
489 0.44
490 0.42
491 0.36
492 0.3
493 0.28
494 0.26
495 0.22
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.14
505 0.16
506 0.17
507 0.19
508 0.17
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.16
514 0.14
515 0.13
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.21
520 0.22
521 0.24
522 0.25
523 0.27
524 0.22
525 0.28
526 0.28
527 0.3
528 0.3
529 0.3
530 0.29
531 0.3
532 0.29
533 0.24
534 0.27
535 0.33
536 0.38
537 0.42
538 0.49
539 0.54
540 0.6
541 0.58
542 0.54
543 0.46
544 0.42