Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SHB6

Protein Details
Accession A0A1V8SHB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80ETFCCDPKSRARTQPRIPHATPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR021711  DUF3295  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF11702  DUF3295  
Amino Acid Sequences MPFRPEHSLLRVEVPALHTIDTSSVETLFGMWSLFSKTAHAMEDGKRLENMSWRLWNRETFCCDPKSRARTQPRIPHATPPNAASDDIPVPALSSSLDSAASDDFDVASRSTTSLPQARPELSCHLSTESRSRRVEKHMTPIDLENMIISIKETQSLEPIDLPMPISLKSSEVTPPPQPALAARHASSEDFDTPLQSSSRAALESSSSTFATEDSQDSRTRADSEESSCTEVSTHSIIRGFTPGGAPSSYRSQTNLAALPTPILKTSSQYQPPQARRKAPMFQIGTSSGEEESSLDSHMHSYKGSSLSASLRLREARKQTSLKEEVTVALPAPIHSPVFESEDEDDDVSESAIEDDDDSSDWEDSDEPHSGPSSVNETQLFQRVDSRPNLTSRTSMLTTMMHEPDRAKALANAASRSTLGLRRSRLTSPNGPSVATTPESTSQLSRAAHGTTSPLPIIMTTSNTHQQLSLSPRTTRRNMLSTELTESLRKNLLWERQHKSNGNLKAMKRNYTSGDVKNLRQQPEPGPVLSHREGGIGVNNTFFDIGLQEYHTKGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.11
16 0.08
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.1
21 0.12
22 0.11
23 0.13
24 0.16
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.22
29 0.25
30 0.33
31 0.33
32 0.32
33 0.31
34 0.31
35 0.3
36 0.33
37 0.34
38 0.31
39 0.38
40 0.39
41 0.45
42 0.47
43 0.52
44 0.48
45 0.52
46 0.53
47 0.5
48 0.53
49 0.54
50 0.53
51 0.54
52 0.59
53 0.59
54 0.6
55 0.64
56 0.69
57 0.73
58 0.8
59 0.82
60 0.82
61 0.83
62 0.77
63 0.76
64 0.74
65 0.71
66 0.63
67 0.55
68 0.51
69 0.43
70 0.42
71 0.32
72 0.28
73 0.22
74 0.2
75 0.19
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.11
99 0.12
100 0.17
101 0.23
102 0.24
103 0.28
104 0.31
105 0.32
106 0.32
107 0.34
108 0.35
109 0.31
110 0.31
111 0.28
112 0.28
113 0.27
114 0.28
115 0.35
116 0.36
117 0.41
118 0.44
119 0.47
120 0.47
121 0.54
122 0.61
123 0.56
124 0.59
125 0.57
126 0.55
127 0.53
128 0.5
129 0.44
130 0.34
131 0.3
132 0.19
133 0.13
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.13
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.15
160 0.19
161 0.19
162 0.22
163 0.22
164 0.22
165 0.2
166 0.2
167 0.22
168 0.23
169 0.24
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.23
174 0.21
175 0.19
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.21
213 0.21
214 0.22
215 0.21
216 0.19
217 0.17
218 0.15
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.2
242 0.2
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.13
254 0.19
255 0.24
256 0.25
257 0.31
258 0.38
259 0.46
260 0.53
261 0.55
262 0.53
263 0.53
264 0.56
265 0.55
266 0.49
267 0.5
268 0.43
269 0.38
270 0.36
271 0.32
272 0.29
273 0.24
274 0.21
275 0.13
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.19
296 0.19
297 0.17
298 0.18
299 0.21
300 0.23
301 0.27
302 0.32
303 0.3
304 0.36
305 0.39
306 0.39
307 0.44
308 0.46
309 0.41
310 0.36
311 0.32
312 0.26
313 0.23
314 0.21
315 0.13
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.12
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.06
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.15
361 0.15
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.26
367 0.25
368 0.19
369 0.26
370 0.26
371 0.3
372 0.32
373 0.34
374 0.3
375 0.33
376 0.36
377 0.3
378 0.29
379 0.26
380 0.28
381 0.25
382 0.22
383 0.21
384 0.18
385 0.19
386 0.22
387 0.23
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.2
392 0.22
393 0.2
394 0.16
395 0.15
396 0.18
397 0.22
398 0.24
399 0.23
400 0.2
401 0.21
402 0.2
403 0.19
404 0.19
405 0.18
406 0.21
407 0.25
408 0.28
409 0.3
410 0.34
411 0.38
412 0.41
413 0.43
414 0.47
415 0.46
416 0.51
417 0.48
418 0.45
419 0.41
420 0.37
421 0.34
422 0.27
423 0.22
424 0.17
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.2
429 0.18
430 0.21
431 0.21
432 0.2
433 0.19
434 0.19
435 0.18
436 0.17
437 0.2
438 0.17
439 0.19
440 0.17
441 0.15
442 0.14
443 0.14
444 0.16
445 0.13
446 0.13
447 0.12
448 0.17
449 0.23
450 0.24
451 0.24
452 0.22
453 0.22
454 0.25
455 0.31
456 0.34
457 0.32
458 0.36
459 0.43
460 0.5
461 0.54
462 0.55
463 0.54
464 0.52
465 0.51
466 0.53
467 0.51
468 0.46
469 0.47
470 0.42
471 0.38
472 0.34
473 0.33
474 0.3
475 0.27
476 0.25
477 0.24
478 0.29
479 0.36
480 0.42
481 0.5
482 0.53
483 0.59
484 0.67
485 0.67
486 0.67
487 0.67
488 0.66
489 0.66
490 0.67
491 0.62
492 0.64
493 0.65
494 0.66
495 0.61
496 0.57
497 0.53
498 0.53
499 0.56
500 0.5
501 0.56
502 0.53
503 0.53
504 0.58
505 0.6
506 0.56
507 0.53
508 0.53
509 0.48
510 0.53
511 0.53
512 0.44
513 0.41
514 0.4
515 0.44
516 0.41
517 0.38
518 0.29
519 0.27
520 0.26
521 0.24
522 0.27
523 0.24
524 0.22
525 0.21
526 0.21
527 0.2
528 0.2
529 0.18
530 0.12
531 0.09
532 0.1
533 0.1
534 0.13
535 0.15