Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8TTG5

Protein Details
Accession A0A1V8TTG5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-440QKEAGQKRREEAKERRESGKRQR
Subcellular Location(s) mito 9cyto 9cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSQKYPKIISPVIEEAGEEVDNGDGTTTKLPIDARGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMIAVFEYTERVVNMCRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDKAVQEYHEMMASKGQVVEGASDEKPAKTWDSNAITPGTPFMDILAASLRYWVSYKLSTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRQSPTHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFANDTKPGHCRKCGQPGHMADSCRGTAAPKEGEDKIVKPLKPFIWLHVGVLREYLAVELSVPQQPFAFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPHMGGYVTKDGHVDLARAQTMLQGLAKQEDAIFKRRRQTELQKEAGQKRREEAKERRESGKRQRMSNGPSGFDETVIQRGARGGIRRGVDLAPDINALPTFAPGQAQTANDPRYQKPLTHADIVGEANAANKSAAAAMKERLMQSKNPAANQRAELDALFAQASNGEPAPVLGKRTRDMIDDAADEPSSNPSTPGRNTPNKEVADPLNRGTSGALGGTSADVDVMPEDTVKLWEEGYETRYYEQKFHVGPEDIAFRNKVAADYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPHHYAPFAADFINMESQVVEFKKGKPFRPYEQLMGVMPARSNHTIPAVFHPLMTDEDSPIIEFYPVDFDIDLNGKKFAWQGVALLPWIDEKRLLDAMDTKYPLLTEAEVRRNTIGNEALIFSTRHPLYEEVASSFYTKKATTTPGSKVKISSKISEGLAGKMAKSDSYIPNATLEFPLPTSQDKFTDLEQNEAVTVHYHMPQFPELHKSMLLPGIKFNEPMLDYSDIQTTRDKANKSGRSHGGVQLSQNGDRSDGRRINYSAQNGNGNGHSNGGGYQGNNGYGPNGGYGSGNGYGGPPSQGRLPDLPPQLAAQAARHFPGGIPPQMPQGYPPQQNGRGGGGGYGDRGGYERRDDRGYGGQQNGGGGYGGQRGGGQGGYGGGYRDGGSGYGGYQGGGGYQGGGGGYQGRGGGGGGGRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.55
4 0.54
5 0.5
6 0.48
7 0.45
8 0.4
9 0.34
10 0.31
11 0.25
12 0.24
13 0.2
14 0.13
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.06
21 0.08
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.13
27 0.17
28 0.22
29 0.29
30 0.32
31 0.41
32 0.44
33 0.45
34 0.46
35 0.45
36 0.41
37 0.35
38 0.31
39 0.25
40 0.26
41 0.22
42 0.2
43 0.18
44 0.15
45 0.14
46 0.12
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.31
58 0.39
59 0.45
60 0.53
61 0.53
62 0.53
63 0.53
64 0.53
65 0.44
66 0.38
67 0.32
68 0.24
69 0.21
70 0.15
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.11
81 0.19
82 0.29
83 0.36
84 0.4
85 0.42
86 0.45
87 0.48
88 0.49
89 0.48
90 0.43
91 0.4
92 0.37
93 0.34
94 0.32
95 0.28
96 0.26
97 0.2
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.76
112 0.76
113 0.73
114 0.7
115 0.71
116 0.65
117 0.63
118 0.62
119 0.55
120 0.46
121 0.42
122 0.37
123 0.28
124 0.25
125 0.24
126 0.23
127 0.23
128 0.25
129 0.21
130 0.2
131 0.22
132 0.22
133 0.18
134 0.15
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.14
141 0.13
142 0.16
143 0.18
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.21
148 0.19
149 0.22
150 0.28
151 0.32
152 0.34
153 0.35
154 0.35
155 0.31
156 0.29
157 0.28
158 0.2
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.18
176 0.21
177 0.25
178 0.24
179 0.29
180 0.31
181 0.34
182 0.36
183 0.34
184 0.31
185 0.31
186 0.36
187 0.3
188 0.29
189 0.25
190 0.21
191 0.24
192 0.24
193 0.21
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.13
203 0.15
204 0.16
205 0.18
206 0.22
207 0.31
208 0.34
209 0.36
210 0.39
211 0.45
212 0.51
213 0.55
214 0.6
215 0.61
216 0.64
217 0.65
218 0.64
219 0.66
220 0.59
221 0.52
222 0.43
223 0.34
224 0.28
225 0.27
226 0.21
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.14
244 0.18
245 0.2
246 0.21
247 0.23
248 0.23
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.22
257 0.29
258 0.29
259 0.33
260 0.38
261 0.42
262 0.52
263 0.57
264 0.56
265 0.57
266 0.56
267 0.59
268 0.56
269 0.5
270 0.4
271 0.37
272 0.33
273 0.25
274 0.21
275 0.15
276 0.14
277 0.18
278 0.19
279 0.17
280 0.21
281 0.21
282 0.26
283 0.27
284 0.25
285 0.29
286 0.34
287 0.33
288 0.31
289 0.37
290 0.33
291 0.38
292 0.37
293 0.32
294 0.34
295 0.33
296 0.32
297 0.29
298 0.29
299 0.22
300 0.22
301 0.18
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.12
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.15
352 0.1
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.13
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.13
393 0.15
394 0.22
395 0.27
396 0.3
397 0.37
398 0.41
399 0.44
400 0.47
401 0.56
402 0.58
403 0.62
404 0.64
405 0.62
406 0.66
407 0.7
408 0.71
409 0.64
410 0.54
411 0.49
412 0.53
413 0.51
414 0.53
415 0.54
416 0.56
417 0.62
418 0.65
419 0.68
420 0.65
421 0.69
422 0.71
423 0.72
424 0.65
425 0.59
426 0.6
427 0.6
428 0.59
429 0.59
430 0.5
431 0.42
432 0.38
433 0.38
434 0.33
435 0.26
436 0.22
437 0.14
438 0.14
439 0.13
440 0.12
441 0.08
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.13
446 0.13
447 0.17
448 0.18
449 0.18
450 0.19
451 0.17
452 0.16
453 0.14
454 0.13
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.15
472 0.17
473 0.19
474 0.22
475 0.22
476 0.27
477 0.27
478 0.26
479 0.26
480 0.32
481 0.32
482 0.31
483 0.31
484 0.24
485 0.25
486 0.24
487 0.19
488 0.12
489 0.09
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.1
502 0.12
503 0.12
504 0.15
505 0.16
506 0.16
507 0.19
508 0.25
509 0.26
510 0.27
511 0.31
512 0.3
513 0.3
514 0.3
515 0.27
516 0.21
517 0.19
518 0.16
519 0.13
520 0.11
521 0.09
522 0.08
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.06
533 0.06
534 0.09
535 0.1
536 0.12
537 0.12
538 0.16
539 0.16
540 0.16
541 0.18
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.16
546 0.14
547 0.13
548 0.11
549 0.09
550 0.1
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.13
556 0.14
557 0.21
558 0.26
559 0.32
560 0.36
561 0.4
562 0.46
563 0.44
564 0.43
565 0.39
566 0.36
567 0.34
568 0.32
569 0.27
570 0.21
571 0.2
572 0.2
573 0.18
574 0.14
575 0.09
576 0.07
577 0.06
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.06
597 0.07
598 0.08
599 0.11
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.16
604 0.17
605 0.18
606 0.18
607 0.2
608 0.19
609 0.2
610 0.23
611 0.2
612 0.2
613 0.19
614 0.22
615 0.18
616 0.19
617 0.18
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.12
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.11
626 0.11
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.08
631 0.08
632 0.06
633 0.03
634 0.03
635 0.04
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.14
643 0.17
644 0.16
645 0.19
646 0.21
647 0.27
648 0.3
649 0.34
650 0.31
651 0.27
652 0.27
653 0.26
654 0.25
655 0.19
656 0.16
657 0.12
658 0.1
659 0.11
660 0.11
661 0.09
662 0.07
663 0.07
664 0.06
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.12
669 0.15
670 0.24
671 0.29
672 0.34
673 0.4
674 0.45
675 0.47
676 0.54
677 0.55
678 0.49
679 0.47
680 0.43
681 0.35
682 0.32
683 0.26
684 0.18
685 0.15
686 0.13
687 0.14
688 0.14
689 0.14
690 0.13
691 0.15
692 0.16
693 0.17
694 0.21
695 0.23
696 0.22
697 0.21
698 0.21
699 0.19
700 0.19
701 0.21
702 0.16
703 0.1
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.1
708 0.09
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.08
713 0.08
714 0.09
715 0.09
716 0.08
717 0.1
718 0.13
719 0.14
720 0.11
721 0.12
722 0.11
723 0.12
724 0.13
725 0.12
726 0.11
727 0.11
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.12
732 0.11
733 0.1
734 0.11
735 0.11
736 0.1
737 0.1
738 0.09
739 0.12
740 0.14
741 0.14
742 0.12
743 0.18
744 0.21
745 0.24
746 0.25
747 0.21
748 0.2
749 0.2
750 0.2
751 0.15
752 0.12
753 0.14
754 0.19
755 0.27
756 0.28
757 0.29
758 0.29
759 0.29
760 0.29
761 0.27
762 0.22
763 0.14
764 0.15
765 0.14
766 0.14
767 0.14
768 0.14
769 0.11
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.16
774 0.17
775 0.18
776 0.21
777 0.21
778 0.16
779 0.17
780 0.17
781 0.17
782 0.17
783 0.15
784 0.15
785 0.14
786 0.13
787 0.15
788 0.2
789 0.24
790 0.28
791 0.35
792 0.42
793 0.45
794 0.45
795 0.46
796 0.47
797 0.5
798 0.48
799 0.44
800 0.38
801 0.38
802 0.37
803 0.39
804 0.34
805 0.26
806 0.27
807 0.24
808 0.21
809 0.2
810 0.19
811 0.14
812 0.15
813 0.19
814 0.17
815 0.22
816 0.23
817 0.22
818 0.23
819 0.24
820 0.23
821 0.19
822 0.17
823 0.12
824 0.12
825 0.13
826 0.13
827 0.15
828 0.17
829 0.18
830 0.19
831 0.21
832 0.22
833 0.22
834 0.3
835 0.27
836 0.28
837 0.26
838 0.25
839 0.22
840 0.21
841 0.19
842 0.11
843 0.12
844 0.11
845 0.14
846 0.14
847 0.15
848 0.18
849 0.2
850 0.22
851 0.22
852 0.27
853 0.24
854 0.25
855 0.25
856 0.23
857 0.22
858 0.25
859 0.26
860 0.2
861 0.22
862 0.25
863 0.25
864 0.25
865 0.23
866 0.22
867 0.2
868 0.21
869 0.21
870 0.2
871 0.2
872 0.21
873 0.26
874 0.22
875 0.23
876 0.25
877 0.23
878 0.26
879 0.31
880 0.32
881 0.34
882 0.44
883 0.51
884 0.53
885 0.6
886 0.58
887 0.58
888 0.6
889 0.57
890 0.53
891 0.47
892 0.43
893 0.41
894 0.38
895 0.35
896 0.34
897 0.29
898 0.25
899 0.26
900 0.27
901 0.3
902 0.31
903 0.32
904 0.35
905 0.37
906 0.41
907 0.45
908 0.48
909 0.43
910 0.42
911 0.45
912 0.39
913 0.39
914 0.34
915 0.31
916 0.25
917 0.22
918 0.19
919 0.15
920 0.15
921 0.15
922 0.14
923 0.11
924 0.15
925 0.15
926 0.15
927 0.15
928 0.15
929 0.13
930 0.12
931 0.13
932 0.1
933 0.09
934 0.09
935 0.09
936 0.09
937 0.11
938 0.11
939 0.11
940 0.1
941 0.1
942 0.11
943 0.11
944 0.14
945 0.11
946 0.12
947 0.16
948 0.17
949 0.21
950 0.23
951 0.26
952 0.32
953 0.36
954 0.36
955 0.33
956 0.32
957 0.29
958 0.27
959 0.25
960 0.2
961 0.21
962 0.22
963 0.22
964 0.21
965 0.21
966 0.19
967 0.26
968 0.28
969 0.27
970 0.26
971 0.26
972 0.33
973 0.33
974 0.33
975 0.27
976 0.32
977 0.36
978 0.4
979 0.45
980 0.47
981 0.51
982 0.54
983 0.54
984 0.48
985 0.41
986 0.36
987 0.3
988 0.24
989 0.19
990 0.17
991 0.15
992 0.11
993 0.1
994 0.11
995 0.13
996 0.14
997 0.21
998 0.25
999 0.28
1000 0.32
1001 0.33
1002 0.35
1003 0.42
1004 0.46
1005 0.45
1006 0.44
1007 0.42
1008 0.39
1009 0.39
1010 0.34
1011 0.25
1012 0.19
1013 0.12
1014 0.11
1015 0.12
1016 0.11
1017 0.11
1018 0.11
1019 0.11
1020 0.12
1021 0.12
1022 0.1
1023 0.07
1024 0.07
1025 0.08
1026 0.09
1027 0.09
1028 0.08
1029 0.09
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.09
1033 0.09
1034 0.09
1035 0.09
1036 0.09
1037 0.12
1038 0.11
1039 0.11
1040 0.1
1041 0.1
1042 0.09
1043 0.1
1044 0.09
1045 0.06
1046 0.06
1047 0.06
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.06
1051 0.07
1052 0.07
1053 0.08
1054 0.08
1055 0.07
1056 0.08
1057 0.08
1058 0.1
1059 0.11