Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V8SZM3

Protein Details
Accession A0A1V8SZM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-179KTPYSKAKYSLRKAKKYLKRFTVHydrophilic
363-391QTYKSGKKGTYYKKRRRWARCKTIVDDARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-378KRR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MARCYGRILPTTYIFLRLPSDIVKLIELKPNTIIEVGKYGTFPSNLLIGRPYYTTFEILDKREGEAHVRLRYVPAKELNAEVVAEYDAEVKDGDVGSEAAELEEERVAAVEKDNRLTVDNATRQNLSHLEIEELKQTASGREIIDTIMANHNALDEKTPYSKAKYSLRKAKKYLKRFTVLPMEIGTLQDYVREKEPGRILEMREESLALITAWSNAHFSEALTGASADMQSGRWLAVDDSGGLIVAALAERMGILRKDEAVANVVSGLQNRAHSMPDAAAPSEDGPNHRDFPLPATSNTITNLHSMVQQNVSLLKFFGYDSNTPDTDHPLHDRLLPISWLQLLHPDQDPTYREPEVVNESTLQTYKSGKKGTYYKKRRRWARCKTIVDDARAGGFEGLVMASHMDPANTLPHLIPLIRGGGHVVIYSPVIEPLVSLMDLYSRERRAAYISALSQRPDKLPSTEDFPLDPRLLLAPTLQTSRIREWQVLPGRTHPLMTSKGGSEGFVFMARRVIPLEGGVEARGNFGRKRKAPGDTGGTVPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.28
4 0.25
5 0.24
6 0.2
7 0.23
8 0.2
9 0.21
10 0.22
11 0.22
12 0.24
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.27
19 0.25
20 0.23
21 0.17
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.15
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.18
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.19
40 0.21
41 0.22
42 0.21
43 0.26
44 0.29
45 0.3
46 0.34
47 0.3
48 0.3
49 0.32
50 0.31
51 0.29
52 0.32
53 0.35
54 0.34
55 0.34
56 0.33
57 0.35
58 0.4
59 0.38
60 0.37
61 0.36
62 0.35
63 0.35
64 0.36
65 0.33
66 0.28
67 0.25
68 0.19
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.1
97 0.14
98 0.16
99 0.18
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.22
105 0.26
106 0.3
107 0.32
108 0.33
109 0.33
110 0.32
111 0.34
112 0.31
113 0.26
114 0.22
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.12
144 0.14
145 0.18
146 0.19
147 0.23
148 0.26
149 0.3
150 0.38
151 0.45
152 0.52
153 0.6
154 0.68
155 0.72
156 0.76
157 0.81
158 0.81
159 0.81
160 0.82
161 0.79
162 0.73
163 0.66
164 0.65
165 0.64
166 0.55
167 0.46
168 0.37
169 0.3
170 0.26
171 0.25
172 0.19
173 0.1
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.16
181 0.21
182 0.26
183 0.24
184 0.27
185 0.29
186 0.28
187 0.31
188 0.32
189 0.27
190 0.23
191 0.22
192 0.18
193 0.14
194 0.14
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.11
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.17
279 0.22
280 0.21
281 0.19
282 0.23
283 0.23
284 0.23
285 0.24
286 0.22
287 0.16
288 0.15
289 0.15
290 0.1
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.15
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.22
313 0.2
314 0.21
315 0.21
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.21
320 0.17
321 0.16
322 0.15
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.13
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.15
334 0.19
335 0.21
336 0.18
337 0.22
338 0.2
339 0.19
340 0.19
341 0.21
342 0.24
343 0.22
344 0.2
345 0.17
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.11
351 0.16
352 0.19
353 0.24
354 0.27
355 0.26
356 0.32
357 0.41
358 0.51
359 0.57
360 0.64
361 0.69
362 0.76
363 0.85
364 0.89
365 0.9
366 0.9
367 0.9
368 0.91
369 0.9
370 0.87
371 0.82
372 0.82
373 0.75
374 0.68
375 0.59
376 0.48
377 0.38
378 0.31
379 0.28
380 0.17
381 0.12
382 0.08
383 0.06
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.09
426 0.13
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.2
431 0.21
432 0.23
433 0.25
434 0.24
435 0.23
436 0.26
437 0.31
438 0.33
439 0.33
440 0.33
441 0.32
442 0.32
443 0.31
444 0.3
445 0.26
446 0.28
447 0.29
448 0.32
449 0.33
450 0.32
451 0.29
452 0.29
453 0.31
454 0.28
455 0.25
456 0.19
457 0.18
458 0.17
459 0.16
460 0.15
461 0.14
462 0.15
463 0.18
464 0.2
465 0.22
466 0.25
467 0.3
468 0.37
469 0.36
470 0.37
471 0.38
472 0.45
473 0.51
474 0.52
475 0.49
476 0.46
477 0.5
478 0.47
479 0.45
480 0.37
481 0.33
482 0.32
483 0.32
484 0.3
485 0.25
486 0.29
487 0.28
488 0.27
489 0.23
490 0.2
491 0.18
492 0.19
493 0.19
494 0.14
495 0.19
496 0.18
497 0.18
498 0.18
499 0.18
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.13
508 0.16
509 0.17
510 0.2
511 0.23
512 0.3
513 0.4
514 0.43
515 0.52
516 0.56
517 0.6
518 0.62
519 0.65
520 0.65
521 0.58